MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 22374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020992	AGAT	2	8	22444	22451	50 %	25 %	25 %	0 %	478692451
502	NC_020992	ATT	2	6	22486	22491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692451
503	NC_020992	T	6	6	22533	22538	0 %	100 %	0 %	0 %	478692451
504	NC_020992	ACC	2	6	22632	22637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692451
505	NC_020992	T	6	6	22643	22648	0 %	100 %	0 %	0 %	478692451
506	NC_020992	TAA	2	6	22673	22678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692451
507	NC_020992	TTC	2	6	22690	22695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692451
508	NC_020992	AGT	2	6	22723	22728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692451
509	NC_020992	ATAA	2	8	22762	22769	75 %	25 %	0 %	0 %	478692451
510	NC_020992	TCA	2	6	22865	22870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692451
511	NC_020992	ACT	2	6	22913	22918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692451
512	NC_020992	ATA	2	6	22934	22939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692451
513	NC_020992	AT	3	6	22976	22981	50 %	50 %	0 %	0 %	478692451
514	NC_020992	CTT	2	6	22983	22988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692451
515	NC_020992	CTT	2	6	23087	23092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692451
516	NC_020992	CAT	2	6	23109	23114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692451
517	NC_020992	T	6	6	23216	23221	0 %	100 %	0 %	0 %	478692451
518	NC_020992	T	7	7	23270	23276	0 %	100 %	0 %	0 %	478692451
519	NC_020992	TCAA	2	8	23282	23289	50 %	25 %	0 %	25 %	478692451
520	NC_020992	CTA	2	6	23304	23309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692451
521	NC_020992	TTCT	2	8	23327	23334	0 %	75 %	0 %	25 %	478692451
522	NC_020992	TTC	2	6	23337	23342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692451
523	NC_020992	TAT	2	6	23343	23348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692451
524	NC_020992	TAT	2	6	23370	23375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692451
525	NC_020992	ATT	2	6	24244	24249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692452
526	NC_020992	ACTT	2	8	24280	24287	25 %	50 %	0 %	25 %	478692452
527	NC_020992	TCT	2	6	24294	24299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692452
528	NC_020992	T	7	7	24308	24314	0 %	100 %	0 %	0 %	478692452
529	NC_020992	TCA	2	6	24342	24347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692452
530	NC_020992	T	6	6	24413	24418	0 %	100 %	0 %	0 %	478692452
531	NC_020992	ACT	2	6	24438	24443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692452
532	NC_020992	T	6	6	24454	24459	0 %	100 %	0 %	0 %	478692452
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534	NC_020992	GCA	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692452
535	NC_020992	GCT	2	6	24564	24569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692452
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537	NC_020992	TTC	2	6	24596	24601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692452
538	NC_020992	TAG	2	6	24885	24890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692453
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540	NC_020992	AT	3	6	24978	24983	50 %	50 %	0 %	0 %	478692453
541	NC_020992	ACT	2	6	25040	25045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692453
542	NC_020992	AAAT	2	8	25099	25106	75 %	25 %	0 %	0 %	478692453
543	NC_020992	TTTGC	2	10	25128	25137	0 %	60 %	20 %	20 %	478692453
544	NC_020992	ACT	2	6	25163	25168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692453
545	NC_020992	CTT	2	6	25179	25184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692453
546	NC_020992	TTC	2	6	25195	25200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692453
547	NC_020992	TAA	2	6	25245	25250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692453
548	NC_020992	TCT	2	6	25286	25291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692453
549	NC_020992	TAG	2	6	25449	25454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692454
550	NC_020992	AT	3	6	25462	25467	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
551	NC_020992	AAT	2	6	25476	25481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692454
552	NC_020992	T	6	6	25538	25543	0 %	100 %	0 %	0 %	478692454
553	NC_020992	ATC	2	6	25730	25735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692454
554	NC_020992	CAT	2	6	25738	25743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692454
555	NC_020992	TACA	2	8	25758	25765	50 %	25 %	0 %	25 %	478692454
556	NC_020992	AATT	2	8	25770	25777	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
557	NC_020992	TCA	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692454
558	NC_020992	ATA	2	6	25799	25804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692454
559	NC_020992	CTT	3	9	25842	25850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692454
560	NC_020992	TCT	2	6	25856	25861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692454
561	NC_020992	TACCAG	2	12	25890	25901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	478692454
562	NC_020992	ATG	2	6	25998	26003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478692454
563	NC_020992	TA	3	6	26037	26042	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
564	NC_020992	T	7	7	26079	26085	0 %	100 %	0 %	0 %	478692454
565	NC_020992	TAAT	2	8	26124	26131	50 %	50 %	0 %	0 %	478692454
566	NC_020992	CTA	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692455
567	NC_020992	GCA	2	6	26158	26163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478692455
568	NC_020992	AAT	2	6	26172	26177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692455
569	NC_020992	TGC	2	6	26184	26189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692455
570	NC_020992	T	6	6	26197	26202	0 %	100 %	0 %	0 %	478692455
571	NC_020992	ATC	2	6	26244	26249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692455
572	NC_020992	ACCA	2	8	26262	26269	50 %	0 %	0 %	50 %	478692455
573	NC_020992	CTT	2	6	26273	26278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692455
574	NC_020992	T	6	6	26277	26282	0 %	100 %	0 %	0 %	478692455
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589	NC_020992	A	7	7	27126	27132	100 %	0 %	0 %	0 %	478692456
590	NC_020992	TAC	2	6	27207	27212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692456
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592	NC_020992	AT	3	6	27248	27253	50 %	50 %	0 %	0 %	478692456
593	NC_020992	TCTGT	2	10	27263	27272	0 %	60 %	20 %	20 %	478692456
594	NC_020992	ATTAT	2	10	27319	27328	40 %	60 %	0 %	0 %	478692457
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598	NC_020992	TA	3	6	27467	27472	50 %	50 %	0 %	0 %	478692457
599	NC_020992	ACT	2	6	28002	28007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692458
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601	NC_020992	TCA	2	6	28086	28091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692458
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606	NC_020992	ATT	2	6	28286	28291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478692458
607	NC_020992	TA	3	6	28313	28318	50 %	50 %	0 %	0 %	478692458
608	NC_020992	CAC	2	6	28333	28338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692458
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610	NC_020992	TTTTAT	2	12	28366	28377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	478692458
611	NC_020992	AAT	2	6	28418	28423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478692458
612	NC_020992	CAC	2	6	28447	28452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478692458
613	NC_020992	T	6	6	28460	28465	0 %	100 %	0 %	0 %	478692458
614	NC_020992	TGT	2	6	28490	28495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478692458
615	NC_020992	GAG	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478692458
616	NC_020992	CT	3	6	28550	28555	0 %	50 %	0 %	50 %	478692458
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618	NC_020992	TCT	2	6	28653	28658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478692458
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621	NC_020992	CTG	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478692458
622	NC_020992	TTCT	2	8	28753	28760	0 %	75 %	0 %	25 %	478692458
623	NC_020992	CTA	2	6	28828	28833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478692458
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629	NC_020992	T	6	6	28900	28905	0 %	100 %	0 %	0 %	478692458
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