MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_020125	TGC	2	6	2153702	2153707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315731
42503	NC_020125	AAAC	2	8	2153752	2153759	75 %	0 %	0 %	25 %	442315731
42504	NC_020125	T	6	6	2153798	2153803	0 %	100 %	0 %	0 %	442315731
42505	NC_020125	TCC	2	6	2153838	2153843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315731
42506	NC_020125	AAC	2	6	2153844	2153849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315731
42507	NC_020125	CTC	2	6	2153909	2153914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315731
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42509	NC_020125	TC	3	6	2154100	2154105	0 %	50 %	0 %	50 %	442315731
42510	NC_020125	TTC	2	6	2154203	2154208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315731
42511	NC_020125	AAATC	2	10	2154252	2154261	60 %	20 %	0 %	20 %	442315731
42512	NC_020125	AAT	2	6	2154265	2154270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315731
42513	NC_020125	GT	3	6	2154341	2154346	0 %	50 %	50 %	0 %	442315731
42514	NC_020125	TAA	2	6	2154433	2154438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315731
42515	NC_020125	TA	3	6	2154503	2154508	50 %	50 %	0 %	0 %	442315731
42516	NC_020125	ACT	2	6	2154564	2154569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315731
42517	NC_020125	TGA	2	6	2154613	2154618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315731
42518	NC_020125	TCA	2	6	2154741	2154746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315731
42519	NC_020125	T	6	6	2154866	2154871	0 %	100 %	0 %	0 %	442315731
42520	NC_020125	AAT	2	6	2154884	2154889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315731
42521	NC_020125	GAAT	2	8	2154929	2154936	50 %	25 %	25 %	0 %	442315731
42522	NC_020125	TCC	3	9	2154939	2154947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315731
42523	NC_020125	TTC	2	6	2155096	2155101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315731
42524	NC_020125	ATAAC	2	10	2155104	2155113	60 %	20 %	0 %	20 %	442315731
42525	NC_020125	ACT	2	6	2155182	2155187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315731
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42528	NC_020125	CATA	2	8	2155313	2155320	50 %	25 %	0 %	25 %	442315731
42529	NC_020125	GGT	2	6	2155435	2155440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442315731
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42535	NC_020125	AGT	2	6	2155744	2155749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315731
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42537	NC_020125	GGTA	2	8	2155792	2155799	25 %	25 %	50 %	0 %	442315731
42538	NC_020125	TC	3	6	2155800	2155805	0 %	50 %	0 %	50 %	442315731
42539	NC_020125	CAT	2	6	2155810	2155815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315731
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42544	NC_020125	A	6	6	2156013	2156018	100 %	0 %	0 %	0 %	442315731
42545	NC_020125	CTG	2	6	2156030	2156035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315731
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42552	NC_020125	CCTT	2	8	2156502	2156509	0 %	50 %	0 %	50 %	442315732
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42559	NC_020125	AAG	2	6	2156897	2156902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315732
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42567	NC_020125	AC	3	6	2157418	2157423	50 %	0 %	0 %	50 %	442315733
42568	NC_020125	CCTT	2	8	2157448	2157455	0 %	50 %	0 %	50 %	442315733
42569	NC_020125	ATG	2	6	2157529	2157534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315733
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42592	NC_020125	AT	3	6	2158740	2158745	50 %	50 %	0 %	0 %	442315734
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42599	NC_020125	A	6	6	2159095	2159100	100 %	0 %	0 %	0 %	442315735
42600	NC_020125	A	6	6	2159135	2159140	100 %	0 %	0 %	0 %	442315735
42601	NC_020125	ACC	2	6	2159143	2159148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315735
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42603	NC_020125	AG	3	6	2159193	2159198	50 %	0 %	50 %	0 %	442315735
42604	NC_020125	A	6	6	2159290	2159295	100 %	0 %	0 %	0 %	442315735
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42609	NC_020125	CCAA	2	8	2159945	2159952	50 %	0 %	0 %	50 %	442315735
42610	NC_020125	CCTT	2	8	2159958	2159965	0 %	50 %	0 %	50 %	442315735
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42616	NC_020125	AACC	2	8	2160324	2160331	50 %	0 %	0 %	50 %	442315735
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.