MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_020125	GGA	2	6	1658780	1658785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442315253
33003	NC_020125	A	6	6	1658832	1658837	100 %	0 %	0 %	0 %	442315253
33004	NC_020125	ACC	2	6	1658889	1658894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315253
33005	NC_020125	CCA	2	6	1658895	1658900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315253
33006	NC_020125	TAC	2	6	1659041	1659046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315253
33007	NC_020125	AGC	2	6	1659056	1659061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315253
33008	NC_020125	A	6	6	1659087	1659092	100 %	0 %	0 %	0 %	442315253
33009	NC_020125	ACC	2	6	1659261	1659266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315254
33010	NC_020125	AGC	2	6	1659346	1659351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315254
33011	NC_020125	TAT	2	6	1659379	1659384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315254
33012	NC_020125	ACC	3	9	1659644	1659652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315254
33013	NC_020125	CTAC	2	8	1659681	1659688	25 %	25 %	0 %	50 %	442315254
33014	NC_020125	TGA	2	6	1659711	1659716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315254
33015	NC_020125	GATG	2	8	1659726	1659733	25 %	25 %	50 %	0 %	442315254
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33017	NC_020125	GAA	2	6	1659881	1659886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315254
33018	NC_020125	CTTC	2	8	1660101	1660108	0 %	50 %	0 %	50 %	442315255
33019	NC_020125	CCT	2	6	1660143	1660148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315255
33020	NC_020125	ATT	2	6	1660208	1660213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315255
33021	NC_020125	TA	4	8	1660226	1660233	50 %	50 %	0 %	0 %	442315255
33022	NC_020125	CAT	2	6	1660273	1660278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315255
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33027	NC_020125	TAT	2	6	1660465	1660470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315255
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33029	NC_020125	ATT	2	6	1660535	1660540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315255
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33033	NC_020125	TGC	2	6	1660790	1660795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315256
33034	NC_020125	CTT	2	6	1660810	1660815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315256
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33038	NC_020125	GA	3	6	1660865	1660870	50 %	0 %	50 %	0 %	442315256
33039	NC_020125	ACCA	2	8	1660878	1660885	50 %	0 %	0 %	50 %	442315256
33040	NC_020125	A	7	7	1660900	1660906	100 %	0 %	0 %	0 %	442315257
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33046	NC_020125	TAT	2	6	1661096	1661101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315257
33047	NC_020125	TAG	2	6	1661102	1661107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315257
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33049	NC_020125	CAT	2	6	1661228	1661233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315257
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33051	NC_020125	AAG	2	6	1661394	1661399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315257
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33054	NC_020125	TC	3	6	1661459	1661464	0 %	50 %	0 %	50 %	442315258
33055	NC_020125	CA	3	6	1661493	1661498	50 %	0 %	0 %	50 %	442315258
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33064	NC_020125	TA	3	6	1661877	1661882	50 %	50 %	0 %	0 %	442315258
33065	NC_020125	TAT	2	6	1661948	1661953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315258
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33107	NC_020125	ATCT	2	8	1664082	1664089	25 %	50 %	0 %	25 %	442315261
33108	NC_020125	TCAC	2	8	1664128	1664135	25 %	25 %	0 %	50 %	442315261
33109	NC_020125	TC	3	6	1664211	1664216	0 %	50 %	0 %	50 %	442315261
33110	NC_020125	TTC	2	6	1664246	1664251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315261
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33113	NC_020125	AGA	2	6	1664391	1664396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315261
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33115	NC_020125	GTC	2	6	1664493	1664498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315261
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33117	NC_020125	T	6	6	1664555	1664560	0 %	100 %	0 %	0 %	442315261
33118	NC_020125	TGA	2	6	1664567	1664572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315261
33119	NC_020125	TCT	2	6	1664587	1664592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315261
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33126	NC_020125	TCTA	2	8	1664961	1664968	25 %	50 %	0 %	25 %	442315261
33127	NC_020125	T	6	6	1664996	1665001	0 %	100 %	0 %	0 %	442315261
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33154	NC_020125	AAG	2	6	1666487	1666492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315263
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33219	NC_020125	TTTC	2	8	1669890	1669897	0 %	75 %	0 %	25 %	442315265
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33223	NC_020125	A	6	6	1670123	1670128	100 %	0 %	0 %	0 %	442315265
33224	NC_020125	GATA	2	8	1670166	1670173	50 %	25 %	25 %	0 %	442315265
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33226	NC_020125	TCA	2	6	1670208	1670213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315265
33227	NC_020125	TCC	2	6	1670255	1670260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315265
33228	NC_020125	CAT	2	6	1670302	1670307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315265
33229	NC_020125	T	6	6	1670321	1670326	0 %	100 %	0 %	0 %	442315265
33230	NC_020125	CAA	2	6	1670362	1670367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315265
33231	NC_020125	T	7	7	1670491	1670497	0 %	100 %	0 %	0 %	442315265
33232	NC_020125	TA	3	6	1670499	1670504	50 %	50 %	0 %	0 %	442315266
33233	NC_020125	TAA	2	6	1670534	1670539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315266
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33472	NC_020125	CCA	2	6	1682658	1682663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315282
33473	NC_020125	GGCTAT	2	12	1682672	1682683	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	442315282
33474	NC_020125	GAATC	2	10	1682695	1682704	40 %	20 %	20 %	20 %	442315282
33475	NC_020125	AGT	2	6	1682760	1682765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315282
33476	NC_020125	AAT	2	6	1682781	1682786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315282
33477	NC_020125	TA	3	6	1682871	1682876	50 %	50 %	0 %	0 %	442315282
33478	NC_020125	TAA	2	6	1682904	1682909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315282
33479	NC_020125	ATA	2	6	1683151	1683156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315282
33480	NC_020125	TTA	2	6	1683157	1683162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315282
33481	NC_020125	ATA	3	9	1683180	1683188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315282
33482	NC_020125	AT	3	6	1683197	1683202	50 %	50 %	0 %	0 %	442315282
33483	NC_020125	TCA	2	6	1683208	1683213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315282
33484	NC_020125	ACC	2	6	1683257	1683262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315282
33485	NC_020125	CAC	2	6	1683272	1683277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315282
33486	NC_020125	AGA	2	6	1683291	1683296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315282
33487	NC_020125	AATA	2	8	1683308	1683315	75 %	25 %	0 %	0 %	442315282
33488	NC_020125	ATC	2	6	1683336	1683341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315282
33489	NC_020125	AT	3	6	1683384	1683389	50 %	50 %	0 %	0 %	442315282
33490	NC_020125	CCT	2	6	1683391	1683396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315282
33491	NC_020125	CTG	2	6	1683407	1683412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315282
33492	NC_020125	CAGACA	2	12	1683669	1683680	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	442315283
33493	NC_020125	T	6	6	1683715	1683720	0 %	100 %	0 %	0 %	442315283
33494	NC_020125	TAT	2	6	1683744	1683749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315283
33495	NC_020125	TAT	2	6	1683792	1683797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315283
33496	NC_020125	ATC	2	6	1683805	1683810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315283
33497	NC_020125	TGA	2	6	1683823	1683828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315283
33498	NC_020125	ATT	3	9	1683892	1683900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315283
33499	NC_020125	TTC	2	6	1683906	1683911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315283
33500	NC_020125	AGA	2	6	1683913	1683918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315283

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