MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32119	NC_020125	AGA	2	6	1618968	1618973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315217
32120	NC_020125	CAA	2	6	1618981	1618986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315217
32121	NC_020125	A	6	6	1619068	1619073	100 %	0 %	0 %	0 %	442315217
32122	NC_020125	ACCT	2	8	1619159	1619166	25 %	25 %	0 %	50 %	442315217
32123	NC_020125	TGC	2	6	1619172	1619177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315217
32124	NC_020125	ACCA	2	8	1619212	1619219	50 %	0 %	0 %	50 %	442315217
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32134	NC_020125	CTA	2	6	1619890	1619895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315219
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32203	NC_020125	ATTT	2	8	1623432	1623439	25 %	75 %	0 %	0 %	442315220
32204	NC_020125	AAT	2	6	1623443	1623448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315220
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32210	NC_020125	TTGTTC	2	12	1623649	1623660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442315220
32211	NC_020125	AAAC	3	12	1623680	1623691	75 %	0 %	0 %	25 %	442315220
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32219	NC_020125	TAA	2	6	1623911	1623916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315221
32220	NC_020125	GCC	2	6	1623919	1623924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442315221
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32222	NC_020125	AGTA	2	8	1623978	1623985	50 %	25 %	25 %	0 %	442315221
32223	NC_020125	TA	3	6	1624002	1624007	50 %	50 %	0 %	0 %	442315221
32224	NC_020125	ATC	2	6	1624012	1624017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315221
32225	NC_020125	AAC	2	6	1624047	1624052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315221
32226	NC_020125	A	7	7	1624116	1624122	100 %	0 %	0 %	0 %	442315221
32227	NC_020125	TGA	3	9	1624202	1624210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315221
32228	NC_020125	T	6	6	1624219	1624224	0 %	100 %	0 %	0 %	442315221
32229	NC_020125	GAT	2	6	1624290	1624295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315221
32230	NC_020125	CAT	3	9	1624320	1624328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315221
32231	NC_020125	AAT	2	6	1624415	1624420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315221
32232	NC_020125	ATA	2	6	1624465	1624470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315221
32233	NC_020125	TAT	2	6	1624527	1624532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315221
32234	NC_020125	TTTCTT	2	12	1624583	1624594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442315221
32235	NC_020125	CACT	2	8	1624595	1624602	25 %	25 %	0 %	50 %	442315221
32236	NC_020125	CTT	2	6	1624732	1624737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315222
32237	NC_020125	CTT	2	6	1624747	1624752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315222
32238	NC_020125	TCA	2	6	1624809	1624814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315222
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32242	NC_020125	GAC	2	6	1624935	1624940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315222
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32338	NC_020125	TTC	2	6	1629136	1629141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315226
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32340	NC_020125	TGGT	2	8	1629252	1629259	0 %	50 %	50 %	0 %	442315226
32341	NC_020125	CCTA	2	8	1629308	1629315	25 %	25 %	0 %	50 %	442315226
32342	NC_020125	ATTTT	2	10	1629339	1629348	20 %	80 %	0 %	0 %	442315226
32343	NC_020125	GACTTT	2	12	1629352	1629363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442315226
32344	NC_020125	ACT	2	6	1629377	1629382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315226
32345	NC_020125	GA	3	6	1629498	1629503	50 %	0 %	50 %	0 %	442315226
32346	NC_020125	CAAA	2	8	1629550	1629557	75 %	0 %	0 %	25 %	442315226
32347	NC_020125	T	6	6	1629563	1629568	0 %	100 %	0 %	0 %	442315226
32348	NC_020125	AG	3	6	1629581	1629586	50 %	0 %	50 %	0 %	442315226
32349	NC_020125	TATC	2	8	1629589	1629596	25 %	50 %	0 %	25 %	442315226
32350	NC_020125	A	6	6	1629798	1629803	100 %	0 %	0 %	0 %	442315226
32351	NC_020125	TCT	2	6	1629838	1629843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315226
32352	NC_020125	CCA	2	6	1629903	1629908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315226
32353	NC_020125	ACT	2	6	1629930	1629935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315226
32354	NC_020125	TTC	2	6	1629938	1629943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315226
32355	NC_020125	CATC	2	8	1629982	1629989	25 %	25 %	0 %	50 %	442315226
32356	NC_020125	AGA	2	6	1630013	1630018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315226
32357	NC_020125	TAT	2	6	1630054	1630059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315226
32358	NC_020125	T	6	6	1630137	1630142	0 %	100 %	0 %	0 %	442315226
32359	NC_020125	AGT	2	6	1630151	1630156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315226
32360	NC_020125	TTA	2	6	1630206	1630211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315226
32361	NC_020125	CGGAA	2	10	1630253	1630262	40 %	0 %	40 %	20 %	442315226
32362	NC_020125	GAA	2	6	1630339	1630344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315226
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32364	NC_020125	CTC	2	6	1630445	1630450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315226
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32366	NC_020125	TTC	2	6	1630586	1630591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315226
32367	NC_020125	CTTG	2	8	1630605	1630612	0 %	50 %	25 %	25 %	442315226
32368	NC_020125	CTA	2	6	1630648	1630653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315226
32369	NC_020125	ATT	2	6	1630667	1630672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315226
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32371	NC_020125	TCT	3	9	1630698	1630706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315227
32372	NC_020125	A	6	6	1630717	1630722	100 %	0 %	0 %	0 %	442315227
32373	NC_020125	ACT	2	6	1630745	1630750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315227
32374	NC_020125	AAAAT	2	10	1630759	1630768	80 %	20 %	0 %	0 %	442315227
32375	NC_020125	TATC	2	8	1630779	1630786	25 %	50 %	0 %	25 %	442315227
32376	NC_020125	ATG	2	6	1630810	1630815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315227
32377	NC_020125	AAT	2	6	1630839	1630844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315227
32378	NC_020125	AACA	2	8	1630906	1630913	75 %	0 %	0 %	25 %	442315227
32379	NC_020125	CCT	2	6	1631012	1631017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315227
32380	NC_020125	CTAAAT	2	12	1631028	1631039	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442315227
32381	NC_020125	CCA	2	6	1631046	1631051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315227
32382	NC_020125	AAC	2	6	1631081	1631086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315227
32383	NC_020125	CAA	2	6	1631092	1631097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315227
32384	NC_020125	A	7	7	1631114	1631120	100 %	0 %	0 %	0 %	442315227
32385	NC_020125	TCC	2	6	1631134	1631139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315227
32386	NC_020125	CTC	2	6	1631200	1631205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315227
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32388	NC_020125	AAC	2	6	1631246	1631251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315227
32389	NC_020125	TAT	2	6	1631313	1631318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315227
32390	NC_020125	T	6	6	1631407	1631412	0 %	100 %	0 %	0 %	442315227
32391	NC_020125	AAT	2	6	1631414	1631419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315227
32392	NC_020125	ATT	2	6	1631440	1631445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315228
32393	NC_020125	TTTTAT	2	12	1631446	1631457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442315228
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32402	NC_020125	TCA	2	6	1631737	1631742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315228
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32407	NC_020125	ATC	2	6	1631879	1631884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315228
32408	NC_020125	AAT	2	6	1631904	1631909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442315228
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32412	NC_020125	CAT	2	6	1632107	1632112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315229
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32415	NC_020125	ACA	2	6	1632220	1632225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442315229
32416	NC_020125	TCA	2	6	1632229	1632234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315229
32417	NC_020125	TCT	2	6	1632248	1632253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315229
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32419	NC_020125	CATA	2	8	1632302	1632309	50 %	25 %	0 %	25 %	442315229
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32423	NC_020125	TAT	2	6	1632476	1632481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315229
32424	NC_020125	A	7	7	1632520	1632526	100 %	0 %	0 %	0 %	442315229
32425	NC_020125	CAG	2	6	1632548	1632553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315229
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32427	NC_020125	ACT	2	6	1632583	1632588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315229
32428	NC_020125	ATAAGC	2	12	1632651	1632662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442315229
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32433	NC_020125	TACC	2	8	1633095	1633102	25 %	25 %	0 %	50 %	442315230
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32435	NC_020125	GTG	2	6	1633271	1633276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442315230
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32441	NC_020125	TAT	2	6	1633563	1633568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315230
32442	NC_020125	CGAA	2	8	1633591	1633598	50 %	0 %	25 %	25 %	442315230
32443	NC_020125	AGTA	2	8	1633623	1633630	50 %	25 %	25 %	0 %	442315230
32444	NC_020125	AATC	2	8	1633656	1633663	50 %	25 %	0 %	25 %	442315230
32445	NC_020125	CCTT	2	8	1633688	1633695	0 %	50 %	0 %	50 %	442315230
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32450	NC_020125	AGA	2	6	1633814	1633819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315230
32451	NC_020125	AT	3	6	1633821	1633826	50 %	50 %	0 %	0 %	442315230
32452	NC_020125	CAG	2	6	1633869	1633874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442315230
32453	NC_020125	TGC	2	6	1633900	1633905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442315230
32454	NC_020125	CCT	2	6	1633961	1633966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315230
32455	NC_020125	TCCTAA	2	12	1634056	1634067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315230
32456	NC_020125	AGT	2	6	1634069	1634074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315230
32457	NC_020125	T	7	7	1634074	1634080	0 %	100 %	0 %	0 %	442315230
32458	NC_020125	T	6	6	1634113	1634118	0 %	100 %	0 %	0 %	442315231
32459	NC_020125	AGA	2	6	1634129	1634134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442315231
32460	NC_020125	TGAT	2	8	1634151	1634158	25 %	50 %	25 %	0 %	442315231
32461	NC_020125	ATC	2	6	1634213	1634218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315231
32462	NC_020125	TTA	2	6	1634385	1634390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315231
32463	NC_020125	TAC	2	6	1634423	1634428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315231
32464	NC_020125	TCC	2	6	1634436	1634441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442315231
32465	NC_020125	ATT	2	6	1634483	1634488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315231
32466	NC_020125	CA	3	6	1634591	1634596	50 %	0 %	0 %	50 %	442315231
32467	NC_020125	TCCC	2	8	1634603	1634610	0 %	25 %	0 %	75 %	442315231
32468	NC_020125	ATC	2	6	1634714	1634719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315231
32469	NC_020125	TAT	2	6	1634779	1634784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315231
32470	NC_020125	AGG	2	6	1634804	1634809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442315231
32471	NC_020125	ACC	2	6	1634840	1634845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315231
32472	NC_020125	CATC	2	8	1634872	1634879	25 %	25 %	0 %	50 %	442315231
32473	NC_020125	CCA	2	6	1635039	1635044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442315231
32474	NC_020125	ATT	2	6	1635047	1635052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442315231
32475	NC_020125	T	7	7	1635058	1635064	0 %	100 %	0 %	0 %	442315231
32476	NC_020125	CTA	2	6	1635091	1635096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315231
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32480	NC_020125	T	6	6	1635353	1635358	0 %	100 %	0 %	0 %	442315231
32481	NC_020125	GAAT	2	8	1635374	1635381	50 %	25 %	25 %	0 %	442315231
32482	NC_020125	TCT	2	6	1635389	1635394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442315231
32483	NC_020125	CTA	2	6	1635417	1635422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315231
32484	NC_020125	ATC	2	6	1635429	1635434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442315231
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32486	NC_020125	TC	3	6	1635469	1635474	0 %	50 %	0 %	50 %	442315231
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32491	NC_020125	CCCA	2	8	1635610	1635617	25 %	0 %	0 %	75 %	442315231
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32495	NC_020125	CAAA	2	8	1635787	1635794	75 %	0 %	0 %	25 %	442315231
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32499	NC_020125	GTA	2	6	1635917	1635922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442315231
32500	NC_020125	TATC	2	8	1635934	1635941	25 %	50 %	0 %	25 %	442315231

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