MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020125	TTTC	2	8	549335	549342	0 %	75 %	0 %	25 %	442314230
11002	NC_020125	CTT	2	6	549373	549378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314230
11003	NC_020125	ATG	2	6	549439	549444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314230
11004	NC_020125	ATA	2	6	549449	549454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314230
11005	NC_020125	ATT	2	6	549466	549471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314230
11006	NC_020125	ATT	2	6	549856	549861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314231
11007	NC_020125	CCAA	2	8	549884	549891	50 %	0 %	0 %	50 %	442314231
11008	NC_020125	GGT	2	6	549906	549911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314231
11009	NC_020125	GTA	2	6	549928	549933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314231
11010	NC_020125	TCA	2	6	549983	549988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314231
11011	NC_020125	AGT	2	6	550017	550022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314231
11012	NC_020125	ACGCC	2	10	550071	550080	20 %	0 %	20 %	60 %	442314231
11013	NC_020125	CTA	2	6	550121	550126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314231
11014	NC_020125	A	6	6	550189	550194	100 %	0 %	0 %	0 %	442314231
11015	NC_020125	GAA	2	6	550195	550200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314231
11016	NC_020125	TA	3	6	550222	550227	50 %	50 %	0 %	0 %	442314231
11017	NC_020125	AGG	2	6	550250	550255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314231
11018	NC_020125	ATTT	2	8	550295	550302	25 %	75 %	0 %	0 %	442314231
11019	NC_020125	ATG	2	6	550424	550429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314231
11020	NC_020125	TCT	2	6	550458	550463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314231
11021	NC_020125	AT	3	6	550478	550483	50 %	50 %	0 %	0 %	442314231
11022	NC_020125	AGA	2	6	550521	550526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314231
11023	NC_020125	GAGAG	2	10	550584	550593	40 %	0 %	60 %	0 %	442314231
11024	NC_020125	T	6	6	550618	550623	0 %	100 %	0 %	0 %	442314231
11025	NC_020125	CAA	2	6	550675	550680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314231
11026	NC_020125	CGT	2	6	550691	550696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314231
11027	NC_020125	A	6	6	550751	550756	100 %	0 %	0 %	0 %	442314231
11028	NC_020125	AAATT	2	10	550760	550769	60 %	40 %	0 %	0 %	442314231
11029	NC_020125	TAG	2	6	550932	550937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314231
11030	NC_020125	TAGA	2	8	550961	550968	50 %	25 %	25 %	0 %	442314231
11031	NC_020125	CAG	2	6	550984	550989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314231
11032	NC_020125	CAG	2	6	551051	551056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314231
11033	NC_020125	ATTT	2	8	551072	551079	25 %	75 %	0 %	0 %	442314231
11034	NC_020125	TGA	2	6	551094	551099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314231
11035	NC_020125	GAG	2	6	551141	551146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314231
11036	NC_020125	GAA	2	6	551171	551176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314231
11037	NC_020125	GTT	2	6	551188	551193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314231
11038	NC_020125	CGAA	2	8	551196	551203	50 %	0 %	25 %	25 %	442314231
11039	NC_020125	A	6	6	551212	551217	100 %	0 %	0 %	0 %	442314231
11040	NC_020125	ACT	2	6	551238	551243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314231
11041	NC_020125	GAC	2	6	551341	551346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314231
11042	NC_020125	GAA	2	6	551446	551451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314231
11043	NC_020125	TCT	2	6	551510	551515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314231
11044	NC_020125	GAT	2	6	551535	551540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314231
11045	NC_020125	AC	3	6	551573	551578	50 %	0 %	0 %	50 %	442314231
11046	NC_020125	A	7	7	551586	551592	100 %	0 %	0 %	0 %	442314231
11047	NC_020125	GAA	2	6	551622	551627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314231
11048	NC_020125	ACC	2	6	551673	551678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314232
11049	NC_020125	ATC	3	9	551695	551703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314232
11050	NC_020125	CAG	2	6	551738	551743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314232
11051	NC_020125	GGA	2	6	551827	551832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314232
11052	NC_020125	GAA	2	6	551904	551909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314232
11053	NC_020125	T	6	6	551926	551931	0 %	100 %	0 %	0 %	442314232
11054	NC_020125	TAT	2	6	551971	551976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314232
11055	NC_020125	CAA	2	6	552051	552056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314232
11056	NC_020125	CTT	2	6	552059	552064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314232
11057	NC_020125	GAA	2	6	552086	552091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314232
11058	NC_020125	TGA	2	6	552093	552098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314232
11059	NC_020125	ACA	2	6	552111	552116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314232
11060	NC_020125	TAA	2	6	552122	552127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314232
11061	NC_020125	GT	3	6	552161	552166	0 %	50 %	50 %	0 %	442314232
11062	NC_020125	TATT	2	8	552270	552277	25 %	75 %	0 %	0 %	442314232
11063	NC_020125	AT	3	6	552345	552350	50 %	50 %	0 %	0 %	442314232
11064	NC_020125	ATG	2	6	552408	552413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314233
11065	NC_020125	AAT	2	6	552425	552430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314233
11066	NC_020125	TATT	2	8	552433	552440	25 %	75 %	0 %	0 %	442314233
11067	NC_020125	ATG	2	6	552477	552482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314233
11068	NC_020125	CCG	2	6	552495	552500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442314233
11069	NC_020125	T	6	6	552521	552526	0 %	100 %	0 %	0 %	442314233
11070	NC_020125	TGTT	2	8	552570	552577	0 %	75 %	25 %	0 %	442314233
11071	NC_020125	AG	3	6	552598	552603	50 %	0 %	50 %	0 %	442314233
11072	NC_020125	GGT	2	6	552698	552703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314233
11073	NC_020125	CAT	2	6	552750	552755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314233
11074	NC_020125	TC	3	6	552766	552771	0 %	50 %	0 %	50 %	442314233
11075	NC_020125	ATT	2	6	552777	552782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314233
11076	NC_020125	AGA	2	6	552809	552814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314233
11077	NC_020125	AGAAA	2	10	552834	552843	80 %	0 %	20 %	0 %	442314233
11078	NC_020125	TTCTA	2	10	552858	552867	20 %	60 %	0 %	20 %	442314233
11079	NC_020125	TA	3	6	552927	552932	50 %	50 %	0 %	0 %	442314233
11080	NC_020125	TAAA	2	8	552994	553001	75 %	25 %	0 %	0 %	442314233
11081	NC_020125	GAA	2	6	553038	553043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314233
11082	NC_020125	TAT	3	9	553188	553196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314233
11083	NC_020125	CTT	2	6	553220	553225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314233
11084	NC_020125	AGC	2	6	553527	553532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314234
11085	NC_020125	GTA	2	6	553543	553548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314234
11086	NC_020125	CA	4	8	553633	553640	50 %	0 %	0 %	50 %	442314234
11087	NC_020125	TGT	2	6	553661	553666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314234
11088	NC_020125	T	6	6	553666	553671	0 %	100 %	0 %	0 %	442314234
11089	NC_020125	TGG	2	6	553772	553777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314234
11090	NC_020125	CTG	2	6	553778	553783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314234
11091	NC_020125	TGA	2	6	553787	553792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314234
11092	NC_020125	TTA	2	6	553844	553849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314234
11093	NC_020125	TTG	2	6	553876	553881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314234
11094	NC_020125	AGT	2	6	554021	554026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
11095	NC_020125	TGG	2	6	554041	554046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
11096	NC_020125	GAA	2	6	554070	554075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
11097	NC_020125	A	6	6	554129	554134	100 %	0 %	0 %	0 %	442314235
11098	NC_020125	AGCAA	2	10	554186	554195	60 %	0 %	20 %	20 %	442314235
11099	NC_020125	GGT	2	6	554220	554225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
11100	NC_020125	CTT	2	6	554230	554235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314235
11101	NC_020125	TGG	2	6	554275	554280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
11102	NC_020125	CTA	2	6	554308	554313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314235
11103	NC_020125	A	6	6	554313	554318	100 %	0 %	0 %	0 %	442314235
11104	NC_020125	AAAT	2	8	554332	554339	75 %	25 %	0 %	0 %	442314235
11105	NC_020125	ATT	2	6	554367	554372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314235
11106	NC_020125	TAAAA	2	10	554435	554444	80 %	20 %	0 %	0 %	442314235
11107	NC_020125	GTA	2	6	554451	554456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
11108	NC_020125	GGC	2	6	554489	554494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442314235
11109	NC_020125	ATG	2	6	554509	554514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
11110	NC_020125	TGA	2	6	554612	554617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
11111	NC_020125	AGA	2	6	554630	554635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
11112	NC_020125	AGA	2	6	554771	554776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
11113	NC_020125	GTG	2	6	554803	554808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314235
11114	NC_020125	GAT	2	6	554871	554876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314235
11115	NC_020125	AAG	2	6	554894	554899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314235
11116	NC_020125	CTG	2	6	554927	554932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314235
11117	NC_020125	AGC	2	6	554960	554965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314235
11118	NC_020125	ATA	2	6	555086	555091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314236
11119	NC_020125	AAG	2	6	555222	555227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314236
11120	NC_020125	AG	3	6	555324	555329	50 %	0 %	50 %	0 %	442314236
11121	NC_020125	CCT	2	6	555384	555389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314236
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11239	NC_020125	TAG	2	6	560817	560822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314241
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11246	NC_020125	TTA	2	6	561124	561129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314242
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11486	NC_020125	T	7	7	578380	578386	0 %	100 %	0 %	0 %	442314255
11487	NC_020125	TCT	2	6	578402	578407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314255
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11489	NC_020125	T	6	6	578659	578664	0 %	100 %	0 %	0 %	442314255
11490	NC_020125	TCC	2	6	578743	578748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314255
11491	NC_020125	TTC	2	6	578769	578774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314255
11492	NC_020125	T	6	6	578861	578866	0 %	100 %	0 %	0 %	442314255
11493	NC_020125	T	6	6	578899	578904	0 %	100 %	0 %	0 %	442314255
11494	NC_020125	TCAAA	2	10	578955	578964	60 %	20 %	0 %	20 %	442314255
11495	NC_020125	A	6	6	579002	579007	100 %	0 %	0 %	0 %	442314255
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11498	NC_020125	CAT	2	6	579144	579149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314255
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