MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_020125	ATC	2	6	522566	522571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314207
10502	NC_020125	TTTC	2	8	522573	522580	0 %	75 %	0 %	25 %	442314207
10503	NC_020125	TTC	2	6	522628	522633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314207
10504	NC_020125	CAAT	2	8	522634	522641	50 %	25 %	0 %	25 %	442314207
10505	NC_020125	TA	3	6	522649	522654	50 %	50 %	0 %	0 %	442314207
10506	NC_020125	TAT	2	6	522754	522759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314207
10507	NC_020125	ATTG	2	8	522858	522865	25 %	50 %	25 %	0 %	442314207
10508	NC_020125	TG	3	6	522867	522872	0 %	50 %	50 %	0 %	442314207
10509	NC_020125	AAC	2	6	523008	523013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314208
10510	NC_020125	AT	3	6	523023	523028	50 %	50 %	0 %	0 %	442314208
10511	NC_020125	T	6	6	523054	523059	0 %	100 %	0 %	0 %	442314208
10512	NC_020125	AGA	2	6	523086	523091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314208
10513	NC_020125	CTG	2	6	523135	523140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314208
10514	NC_020125	CT	3	6	523190	523195	0 %	50 %	0 %	50 %	442314208
10515	NC_020125	AAG	2	6	523211	523216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314208
10516	NC_020125	TTC	2	6	523388	523393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314208
10517	NC_020125	ATTT	2	8	523603	523610	25 %	75 %	0 %	0 %	442314208
10518	NC_020125	TC	3	6	523717	523722	0 %	50 %	0 %	50 %	442314208
10519	NC_020125	CCG	2	6	523804	523809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442314208
10520	NC_020125	AT	3	6	523823	523828	50 %	50 %	0 %	0 %	442314208
10521	NC_020125	ATC	2	6	523858	523863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314208
10522	NC_020125	TAT	2	6	523874	523879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314208
10523	NC_020125	CAT	2	6	524288	524293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314209
10524	NC_020125	TTC	2	6	524299	524304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314209
10525	NC_020125	ATC	3	9	524336	524344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314209
10526	NC_020125	TAT	2	6	524356	524361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314209
10527	NC_020125	AAT	2	6	524363	524368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314209
10528	NC_020125	A	6	6	524406	524411	100 %	0 %	0 %	0 %	442314209
10529	NC_020125	ATC	2	6	524432	524437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314209
10530	NC_020125	T	7	7	524444	524450	0 %	100 %	0 %	0 %	442314209
10531	NC_020125	AAATT	2	10	524454	524463	60 %	40 %	0 %	0 %	442314209
10532	NC_020125	TA	3	6	524479	524484	50 %	50 %	0 %	0 %	442314209
10533	NC_020125	TAT	2	6	524642	524647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314209
10534	NC_020125	ATT	2	6	524652	524657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314209
10535	NC_020125	T	7	7	524656	524662	0 %	100 %	0 %	0 %	442314209
10536	NC_020125	T	6	6	524665	524670	0 %	100 %	0 %	0 %	442314209
10537	NC_020125	TTA	2	6	524712	524717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314210
10538	NC_020125	ATT	2	6	524747	524752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314210
10539	NC_020125	TCATC	2	10	524785	524794	20 %	40 %	0 %	40 %	442314210
10540	NC_020125	CAG	2	6	524902	524907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314210
10541	NC_020125	ATTGAT	2	12	525131	525142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442314210
10542	NC_020125	CTC	2	6	525260	525265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314210
10543	NC_020125	T	6	6	525307	525312	0 %	100 %	0 %	0 %	442314210
10544	NC_020125	TGG	2	6	525338	525343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314210
10545	NC_020125	ACC	2	6	525356	525361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314210
10546	NC_020125	CAT	2	6	525376	525381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314210
10547	NC_020125	CATA	2	8	525397	525404	50 %	25 %	0 %	25 %	442314210
10548	NC_020125	CCT	3	9	525411	525419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314210
10549	NC_020125	ACC	2	6	525470	525475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314210
10550	NC_020125	CCA	3	9	525477	525485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314210
10551	NC_020125	ATA	2	6	525510	525515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314210
10552	NC_020125	CA	3	6	525527	525532	50 %	0 %	0 %	50 %	442314210
10553	NC_020125	ATA	2	6	525539	525544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314210
10554	NC_020125	T	7	7	525552	525558	0 %	100 %	0 %	0 %	442314210
10555	NC_020125	ATT	2	6	525590	525595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314210
10556	NC_020125	ACC	2	6	525746	525751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442314210
10557	NC_020125	TAC	2	6	525767	525772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314210
10558	NC_020125	CAA	2	6	525793	525798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314210
10559	NC_020125	TA	3	6	525824	525829	50 %	50 %	0 %	0 %	442314210
10560	NC_020125	AGCTTC	2	12	525830	525841	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442314210
10561	NC_020125	CTG	2	6	525844	525849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314210
10562	NC_020125	TTC	2	6	525993	525998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314210
10563	NC_020125	CTT	2	6	526013	526018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314210
10564	NC_020125	GTC	2	6	526055	526060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314210
10565	NC_020125	TAA	2	6	526076	526081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314210
10566	NC_020125	CAGAC	2	10	526085	526094	40 %	0 %	20 %	40 %	442314210
10567	NC_020125	CCT	2	6	526284	526289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314211
10568	NC_020125	GTTA	2	8	526316	526323	25 %	50 %	25 %	0 %	442314211
10569	NC_020125	TTG	2	6	526373	526378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314211
10570	NC_020125	GCA	2	6	526458	526463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314211
10571	NC_020125	GTT	2	6	526513	526518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314211
10572	NC_020125	AGG	2	6	526524	526529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314211
10573	NC_020125	TGA	2	6	526531	526536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314211
10574	NC_020125	GCG	2	6	526557	526562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442314211
10575	NC_020125	CCT	2	6	526651	526656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314211
10576	NC_020125	CCCG	2	8	526669	526676	0 %	0 %	25 %	75 %	442314211
10577	NC_020125	CTTTA	2	10	526706	526715	20 %	60 %	0 %	20 %	442314211
10578	NC_020125	T	6	6	526757	526762	0 %	100 %	0 %	0 %	442314211
10579	NC_020125	TCT	2	6	526767	526772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314211
10580	NC_020125	TGT	2	6	527215	527220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314212
10581	NC_020125	A	6	6	527269	527274	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10582	NC_020125	CAA	2	6	527370	527375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314212
10583	NC_020125	A	6	6	527423	527428	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10584	NC_020125	ACA	2	6	527538	527543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314212
10585	NC_020125	A	6	6	527543	527548	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10586	NC_020125	TTA	2	6	527566	527571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314212
10587	NC_020125	T	6	6	527609	527614	0 %	100 %	0 %	0 %	442314212
10588	NC_020125	A	6	6	527712	527717	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10589	NC_020125	AGA	2	6	527723	527728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314212
10590	NC_020125	A	6	6	527734	527739	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10591	NC_020125	GCT	2	6	527754	527759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314212
10592	NC_020125	ACA	2	6	527781	527786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314212
10593	NC_020125	GTG	2	6	527848	527853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314212
10594	NC_020125	TAG	2	6	527864	527869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314212
10595	NC_020125	TGT	2	6	527900	527905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442314212
10596	NC_020125	AGA	2	6	527918	527923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314212
10597	NC_020125	AATC	2	8	527969	527976	50 %	25 %	0 %	25 %	442314212
10598	NC_020125	CAATA	2	10	528017	528026	60 %	20 %	0 %	20 %	442314212
10599	NC_020125	TAC	2	6	528041	528046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314212
10600	NC_020125	TTA	2	6	528130	528135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314212
10601	NC_020125	ATG	2	6	528138	528143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314212
10602	NC_020125	A	6	6	528162	528167	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10603	NC_020125	TAT	2	6	528191	528196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314212
10604	NC_020125	ATACA	2	10	528318	528327	60 %	20 %	0 %	20 %	442314212
10605	NC_020125	A	6	6	528399	528404	100 %	0 %	0 %	0 %	442314212
10606	NC_020125	GCT	2	6	528468	528473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314212
10607	NC_020125	TGA	2	6	528566	528571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314212
10608	NC_020125	GCGA	2	8	528615	528622	25 %	0 %	50 %	25 %	442314212
10609	NC_020125	CT	3	6	528848	528853	0 %	50 %	0 %	50 %	442314213
10610	NC_020125	CTG	2	6	528886	528891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314213
10611	NC_020125	ATT	2	6	528905	528910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314213
10612	NC_020125	ACA	2	6	528915	528920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314213
10613	NC_020125	TAT	2	6	528922	528927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314213
10614	NC_020125	TGC	2	6	528931	528936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314213
10615	NC_020125	CTGTT	2	10	528937	528946	0 %	60 %	20 %	20 %	442314213
10616	NC_020125	GGTT	2	8	528951	528958	0 %	50 %	50 %	0 %	442314213
10617	NC_020125	CGG	2	6	529008	529013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442314213
10618	NC_020125	AGT	2	6	529052	529057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314213
10619	NC_020125	CAG	2	6	529165	529170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314213
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10984	NC_020125	T	7	7	548466	548472	0 %	100 %	0 %	0 %	442314229
10985	NC_020125	CTT	2	6	548542	548547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314229
10986	NC_020125	T	6	6	548580	548585	0 %	100 %	0 %	0 %	442314229
10987	NC_020125	T	6	6	548667	548672	0 %	100 %	0 %	0 %	442314229
10988	NC_020125	CT	3	6	548704	548709	0 %	50 %	0 %	50 %	442314229
10989	NC_020125	GAA	2	6	548739	548744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314229
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10991	NC_020125	TACC	2	8	548798	548805	25 %	25 %	0 %	50 %	442314229
10992	NC_020125	TAA	3	9	548880	548888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314229
10993	NC_020125	T	6	6	548892	548897	0 %	100 %	0 %	0 %	442314229
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10999	NC_020125	CTG	2	6	549179	549184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314230
11000	NC_020125	CTG	2	6	549273	549278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314230

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