MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020125	GCT	2	6	327972	327977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442314015
6502	NC_020125	GGT	2	6	328238	328243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314016
6503	NC_020125	CTA	2	6	328254	328259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314016
6504	NC_020125	TAG	2	6	328266	328271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314016
6505	NC_020125	ATA	2	6	328285	328290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314016
6506	NC_020125	ATA	2	6	328323	328328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314016
6507	NC_020125	TAC	2	6	328392	328397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314016
6508	NC_020125	AAC	2	6	328449	328454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314016
6509	NC_020125	AAAAAT	2	12	328546	328557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	442314016
6510	NC_020125	CGA	2	6	328709	328714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442314017
6511	NC_020125	TAA	2	6	328751	328756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314017
6512	NC_020125	AGA	2	6	328847	328852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314017
6513	NC_020125	A	6	6	328927	328932	100 %	0 %	0 %	0 %	442314017
6514	NC_020125	TAG	2	6	328954	328959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314017
6515	NC_020125	TTTA	2	8	328963	328970	25 %	75 %	0 %	0 %	442314017
6516	NC_020125	TAA	2	6	328988	328993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314017
6517	NC_020125	AGT	2	6	329114	329119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314017
6518	NC_020125	TAC	2	6	329130	329135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314017
6519	NC_020125	ATC	2	6	329188	329193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314017
6520	NC_020125	GA	3	6	329231	329236	50 %	0 %	50 %	0 %	442314017
6521	NC_020125	ATT	2	6	329261	329266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314017
6522	NC_020125	AAGAC	2	10	329345	329354	60 %	0 %	20 %	20 %	442314017
6523	NC_020125	ATGG	2	8	329694	329701	25 %	25 %	50 %	0 %	442314018
6524	NC_020125	ATC	2	6	329735	329740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314018
6525	NC_020125	A	6	6	329782	329787	100 %	0 %	0 %	0 %	442314018
6526	NC_020125	A	6	6	329818	329823	100 %	0 %	0 %	0 %	442314018
6527	NC_020125	GTA	2	6	329954	329959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314018
6528	NC_020125	GTGG	2	8	329961	329968	0 %	25 %	75 %	0 %	442314018
6529	NC_020125	AGG	2	6	330009	330014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314018
6530	NC_020125	CTT	2	6	330068	330073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314018
6531	NC_020125	ACT	2	6	330113	330118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314018
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6533	NC_020125	TGA	2	6	330159	330164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314018
6534	NC_020125	A	6	6	330190	330195	100 %	0 %	0 %	0 %	442314018
6535	NC_020125	CTA	2	6	330197	330202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314018
6536	NC_020125	CAA	2	6	330204	330209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314018
6537	NC_020125	A	6	6	330227	330232	100 %	0 %	0 %	0 %	442314018
6538	NC_020125	AAT	2	6	330247	330252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442314018
6539	NC_020125	A	6	6	330350	330355	100 %	0 %	0 %	0 %	442314018
6540	NC_020125	GGAA	2	8	330384	330391	50 %	0 %	50 %	0 %	442314018
6541	NC_020125	A	6	6	331006	331011	100 %	0 %	0 %	0 %	442314019
6542	NC_020125	GAA	2	6	331013	331018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314019
6543	NC_020125	ATT	2	6	331021	331026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314019
6544	NC_020125	ACT	2	6	331064	331069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314019
6545	NC_020125	ACGGA	2	10	331174	331183	40 %	0 %	40 %	20 %	442314020
6546	NC_020125	GAA	2	6	331218	331223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314020
6547	NC_020125	A	6	6	331233	331238	100 %	0 %	0 %	0 %	442314020
6548	NC_020125	T	6	6	331319	331324	0 %	100 %	0 %	0 %	442314020
6549	NC_020125	AAG	2	6	331336	331341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314020
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6552	NC_020125	GGA	2	6	331403	331408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314020
6553	NC_020125	GTG	2	6	331413	331418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442314020
6554	NC_020125	A	7	7	331499	331505	100 %	0 %	0 %	0 %	442314020
6555	NC_020125	A	6	6	331533	331538	100 %	0 %	0 %	0 %	442314020
6556	NC_020125	GAA	2	6	331539	331544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314020
6557	NC_020125	AAAG	2	8	331548	331555	75 %	0 %	25 %	0 %	442314020
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6559	NC_020125	ATT	2	6	331578	331583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314020
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6562	NC_020125	AT	3	6	331643	331648	50 %	50 %	0 %	0 %	442314021
6563	NC_020125	TTCA	2	8	331653	331660	25 %	50 %	0 %	25 %	442314021
6564	NC_020125	CTC	2	6	331671	331676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442314021
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6569	NC_020125	CTA	2	6	331823	331828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314021
6570	NC_020125	TTC	2	6	331878	331883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442314021
6571	NC_020125	GA	4	8	331929	331936	50 %	0 %	50 %	0 %	442314021
6572	NC_020125	AAG	2	6	331981	331986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442314021
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6577	NC_020125	AT	3	6	332186	332191	50 %	50 %	0 %	0 %	442314021
6578	NC_020125	AAAAC	2	10	332219	332228	80 %	0 %	0 %	20 %	442314021
6579	NC_020125	CCG	2	6	332318	332323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442314021
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6589	NC_020125	TA	3	6	333078	333083	50 %	50 %	0 %	0 %	442314022
6590	NC_020125	GGGTAT	2	12	333129	333140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	442314022
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6594	NC_020125	TTA	2	6	333428	333433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314022
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6601	NC_020125	A	7	7	333557	333563	100 %	0 %	0 %	0 %	442314022
6602	NC_020125	A	6	6	333590	333595	100 %	0 %	0 %	0 %	442314022
6603	NC_020125	TTTGT	2	10	333781	333790	0 %	80 %	20 %	0 %	442314023
6604	NC_020125	CAT	2	6	333887	333892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442314023
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6606	NC_020125	GA	3	6	334040	334045	50 %	0 %	50 %	0 %	442314023
6607	NC_020125	CTTC	2	8	334086	334093	0 %	50 %	0 %	50 %	442314023
6608	NC_020125	TAT	2	6	334165	334170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314023
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6611	NC_020125	TAAA	2	8	334311	334318	75 %	25 %	0 %	0 %	442314023
6612	NC_020125	TTGG	2	8	334332	334339	0 %	50 %	50 %	0 %	442314023
6613	NC_020125	TAG	2	6	334356	334361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442314023
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6619	NC_020125	ACA	2	6	334722	334727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314023
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6748	NC_020125	T	6	6	341132	341137	0 %	100 %	0 %	0 %	442314030
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6994	NC_020125	T	6	6	354370	354375	0 %	100 %	0 %	0 %	442314046
6995	NC_020125	TA	3	6	354418	354423	50 %	50 %	0 %	0 %	442314046
6996	NC_020125	TCTT	2	8	354478	354485	0 %	75 %	0 %	25 %	442314046
6997	NC_020125	GGA	2	6	354528	354533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442314046
6998	NC_020125	ATT	2	6	354611	354616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442314046
6999	NC_020125	CAA	2	6	354687	354692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442314046
7000	NC_020125	TAACC	2	10	354707	354716	40 %	20 %	0 %	40 %	442314046

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