MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020125	TTA	2	6	228327	228332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313929
4502	NC_020125	TGA	2	6	228363	228368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313929
4503	NC_020125	TTAA	2	8	228369	228376	50 %	50 %	0 %	0 %	442313929
4504	NC_020125	TGA	2	6	228408	228413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313929
4505	NC_020125	TCT	3	9	228438	228446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313929
4506	NC_020125	ATT	2	6	228458	228463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313929
4507	NC_020125	A	6	6	228529	228534	100 %	0 %	0 %	0 %	442313929
4508	NC_020125	A	8	8	228539	228546	100 %	0 %	0 %	0 %	442313929
4509	NC_020125	AAT	2	6	228549	228554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313929
4510	NC_020125	ACTA	2	8	228619	228626	50 %	25 %	0 %	25 %	442313930
4511	NC_020125	T	6	6	228672	228677	0 %	100 %	0 %	0 %	442313930
4512	NC_020125	ATTT	2	8	228713	228720	25 %	75 %	0 %	0 %	442313930
4513	NC_020125	TAA	2	6	228757	228762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313930
4514	NC_020125	ACA	2	6	228764	228769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313930
4515	NC_020125	TTA	2	6	228781	228786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313930
4516	NC_020125	ATT	2	6	228807	228812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313930
4517	NC_020125	A	6	6	228834	228839	100 %	0 %	0 %	0 %	442313930
4518	NC_020125	GTT	3	9	228899	228907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313930
4519	NC_020125	A	6	6	228939	228944	100 %	0 %	0 %	0 %	442313930
4520	NC_020125	CACAAG	2	12	228947	228958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	442313930
4521	NC_020125	GAAT	2	8	229091	229098	50 %	25 %	25 %	0 %	442313930
4522	NC_020125	A	6	6	229107	229112	100 %	0 %	0 %	0 %	442313930
4523	NC_020125	ATA	2	6	229123	229128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313930
4524	NC_020125	T	8	8	229306	229313	0 %	100 %	0 %	0 %	442313931
4525	NC_020125	TGC	2	6	229327	229332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313931
4526	NC_020125	A	6	6	229345	229350	100 %	0 %	0 %	0 %	442313931
4527	NC_020125	TTA	2	6	229363	229368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313931
4528	NC_020125	T	6	6	229373	229378	0 %	100 %	0 %	0 %	442313931
4529	NC_020125	ACTT	2	8	229410	229417	25 %	50 %	0 %	25 %	442313931
4530	NC_020125	ATT	2	6	229434	229439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313931
4531	NC_020125	T	6	6	229452	229457	0 %	100 %	0 %	0 %	442313931
4532	NC_020125	TAG	2	6	229511	229516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313931
4533	NC_020125	CAT	2	6	229568	229573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313931
4534	NC_020125	AT	3	6	229585	229590	50 %	50 %	0 %	0 %	442313931
4535	NC_020125	AAAAT	2	10	229647	229656	80 %	20 %	0 %	0 %	442313931
4536	NC_020125	CTT	2	6	229657	229662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313931
4537	NC_020125	AT	3	6	229722	229727	50 %	50 %	0 %	0 %	442313931
4538	NC_020125	AC	3	6	229789	229794	50 %	0 %	0 %	50 %	442313931
4539	NC_020125	TTC	2	6	229812	229817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313931
4540	NC_020125	TCT	2	6	229837	229842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313931
4541	NC_020125	T	7	7	230215	230221	0 %	100 %	0 %	0 %	442313932
4542	NC_020125	T	6	6	230349	230354	0 %	100 %	0 %	0 %	442313932
4543	NC_020125	TAG	2	6	230376	230381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313932
4544	NC_020125	A	6	6	230405	230410	100 %	0 %	0 %	0 %	442313932
4545	NC_020125	ATC	2	6	230427	230432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313932
4546	NC_020125	GCA	2	6	230444	230449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313932
4547	NC_020125	ATT	2	6	230483	230488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313932
4548	NC_020125	GA	3	6	230552	230557	50 %	0 %	50 %	0 %	442313932
4549	NC_020125	A	6	6	230584	230589	100 %	0 %	0 %	0 %	442313932
4550	NC_020125	TAG	2	6	230802	230807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313932
4551	NC_020125	AGA	2	6	230851	230856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313932
4552	NC_020125	ATT	2	6	230906	230911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313932
4553	NC_020125	AGA	2	6	230917	230922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313932
4554	NC_020125	TGG	2	6	231003	231008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313932
4555	NC_020125	A	6	6	231036	231041	100 %	0 %	0 %	0 %	442313932
4556	NC_020125	A	6	6	231064	231069	100 %	0 %	0 %	0 %	442313932
4557	NC_020125	GAAAA	3	15	231128	231142	80 %	0 %	20 %	0 %	442313932
4558	NC_020125	TCT	2	6	231170	231175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313932
4559	NC_020125	AGA	2	6	231187	231192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313932
4560	NC_020125	A	6	6	231270	231275	100 %	0 %	0 %	0 %	442313932
4561	NC_020125	TCA	2	6	231297	231302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313932
4562	NC_020125	ACA	2	6	231358	231363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313932
4563	NC_020125	GCA	2	6	231447	231452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313933
4564	NC_020125	A	7	7	231463	231469	100 %	0 %	0 %	0 %	442313933
4565	NC_020125	AAG	2	6	231698	231703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313933
4566	NC_020125	AGA	2	6	231728	231733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313933
4567	NC_020125	AGC	2	6	231750	231755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313933
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4569	NC_020125	AGA	2	6	231845	231850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313933
4570	NC_020125	GGT	2	6	231956	231961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313933
4571	NC_020125	AC	3	6	231974	231979	50 %	0 %	0 %	50 %	442313933
4572	NC_020125	ATA	2	6	231982	231987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313933
4573	NC_020125	ACC	2	6	232018	232023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313933
4574	NC_020125	GAA	2	6	232122	232127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313933
4575	NC_020125	GAA	2	6	232207	232212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313933
4576	NC_020125	A	6	6	232278	232283	100 %	0 %	0 %	0 %	442313933
4577	NC_020125	AATC	2	8	232333	232340	50 %	25 %	0 %	25 %	442313934
4578	NC_020125	TTA	2	6	232395	232400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313934
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4580	NC_020125	TAA	2	6	232438	232443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313934
4581	NC_020125	T	6	6	232481	232486	0 %	100 %	0 %	0 %	442313934
4582	NC_020125	TCAT	2	8	232507	232514	25 %	50 %	0 %	25 %	442313934
4583	NC_020125	GAA	2	6	232595	232600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313934
4584	NC_020125	A	6	6	232683	232688	100 %	0 %	0 %	0 %	442313934
4585	NC_020125	TA	3	6	232712	232717	50 %	50 %	0 %	0 %	442313934
4586	NC_020125	A	6	6	232763	232768	100 %	0 %	0 %	0 %	442313934
4587	NC_020125	ATG	2	6	232770	232775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313934
4588	NC_020125	T	8	8	232782	232789	0 %	100 %	0 %	0 %	442313934
4589	NC_020125	A	6	6	232816	232821	100 %	0 %	0 %	0 %	442313934
4590	NC_020125	TAC	2	6	232861	232866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313934
4591	NC_020125	ATG	2	6	232988	232993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313935
4592	NC_020125	CCT	2	6	233045	233050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313935
4593	NC_020125	GAT	2	6	233056	233061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313935
4594	NC_020125	CAGG	2	8	233066	233073	25 %	0 %	50 %	25 %	442313935
4595	NC_020125	GA	3	6	233101	233106	50 %	0 %	50 %	0 %	442313935
4596	NC_020125	TTC	2	6	233117	233122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313935
4597	NC_020125	TGC	2	6	233191	233196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313935
4598	NC_020125	TAG	2	6	233217	233222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313935
4599	NC_020125	GAAA	2	8	233254	233261	75 %	0 %	25 %	0 %	442313935
4600	NC_020125	AAGGCA	2	12	233451	233462	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	442313935
4601	NC_020125	CAA	2	6	233498	233503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313935
4602	NC_020125	GGC	2	6	233509	233514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313935
4603	NC_020125	A	6	6	233529	233534	100 %	0 %	0 %	0 %	442313935
4604	NC_020125	ACC	2	6	233543	233548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313935
4605	NC_020125	AAAG	2	8	233562	233569	75 %	0 %	25 %	0 %	442313935
4606	NC_020125	GGT	2	6	233612	233617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313935
4607	NC_020125	AGA	2	6	233629	233634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313935
4608	NC_020125	CAG	2	6	233663	233668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313935
4609	NC_020125	GTA	2	6	233702	233707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313935
4610	NC_020125	GGA	2	6	233734	233739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313935
4611	NC_020125	CT	3	6	233747	233752	0 %	50 %	0 %	50 %	442313935
4612	NC_020125	ATA	2	6	233892	233897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313935
4613	NC_020125	GGT	2	6	233995	234000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313935
4614	NC_020125	CA	3	6	234218	234223	50 %	0 %	0 %	50 %	442313936
4615	NC_020125	TGA	2	6	234227	234232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313936
4616	NC_020125	CA	3	6	234376	234381	50 %	0 %	0 %	50 %	442313936
4617	NC_020125	GTT	2	6	234444	234449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313936
4618	NC_020125	TGC	2	6	234617	234622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313937
4619	NC_020125	AAAC	2	8	234634	234641	75 %	0 %	0 %	25 %	442313937
4620	NC_020125	AAC	2	6	234657	234662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313937
4621	NC_020125	GAA	2	6	234705	234710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313937
4622	NC_020125	GAC	2	6	234715	234720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313937
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4624	NC_020125	TCA	2	6	234754	234759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313937
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4748	NC_020125	CAT	2	6	241435	241440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313944
4749	NC_020125	TCC	2	6	241670	241675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313945
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4753	NC_020125	GTT	2	6	241807	241812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313945
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4756	NC_020125	TAC	2	6	241867	241872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313945
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4762	NC_020125	CT	3	6	242077	242082	0 %	50 %	0 %	50 %	442313945
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4767	NC_020125	A	7	7	242220	242226	100 %	0 %	0 %	0 %	442313945
4768	NC_020125	ATTT	2	8	242267	242274	25 %	75 %	0 %	0 %	442313945
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4993	NC_020125	CAT	2	6	254284	254289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
4994	NC_020125	CAA	2	6	254297	254302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313955
4995	NC_020125	GTT	2	6	254321	254326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313955
4996	NC_020125	TTC	2	6	254327	254332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
4997	NC_020125	TCT	2	6	254338	254343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313955
4998	NC_020125	CAT	2	6	254414	254419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313955
4999	NC_020125	TC	3	6	254429	254434	0 %	50 %	0 %	50 %	442313955
5000	NC_020125	AAT	2	6	254564	254569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313955

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