MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 42690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	TAG	2	6	432	437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313697
2	NC_020125	CCG	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313697
3	NC_020125	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313697
4	NC_020125	TA	3	6	608	613	50 %	50 %	0 %	0 %	442313697
5	NC_020125	T	6	6	614	619	0 %	100 %	0 %	0 %	442313697
6	NC_020125	GTAGC	2	10	736	745	20 %	20 %	40 %	20 %	442313697
7	NC_020125	TCC	2	6	746	751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313697
8	NC_020125	CTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313697
9	NC_020125	CCT	2	6	792	797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313697
10	NC_020125	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313697
11	NC_020125	GTG	2	6	834	839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313697
12	NC_020125	TAAACC	2	12	1064	1075	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442313697
13	NC_020125	ATA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313697
14	NC_020125	TGA	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313698
15	NC_020125	A	7	7	1258	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	442313698
16	NC_020125	C	6	6	1270	1275	0 %	0 %	0 %	100 %	442313698
17	NC_020125	AC	4	8	1281	1288	50 %	0 %	0 %	50 %	442313698
18	NC_020125	GAG	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313698
19	NC_020125	CAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313698
20	NC_020125	A	6	6	1824	1829	100 %	0 %	0 %	0 %	442313699
21	NC_020125	AC	3	6	1831	1836	50 %	0 %	0 %	50 %	442313699
22	NC_020125	AAG	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
23	NC_020125	CTT	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313699
24	NC_020125	TAT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313699
25	NC_020125	TAA	2	6	2077	2082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313699
26	NC_020125	TGT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313699
27	NC_020125	TTA	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313699
28	NC_020125	AGA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
29	NC_020125	CTT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313699
30	NC_020125	CTAT	2	8	2313	2320	25 %	50 %	0 %	25 %	442313699
31	NC_020125	GA	4	8	2378	2385	50 %	0 %	50 %	0 %	442313699
32	NC_020125	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313699
33	NC_020125	ACC	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313699
34	NC_020125	TTA	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313699
35	NC_020125	AAAG	2	8	2446	2453	75 %	0 %	25 %	0 %	442313699
36	NC_020125	ATCAC	2	10	2457	2466	40 %	20 %	0 %	40 %	442313699
37	NC_020125	CA	3	6	2482	2487	50 %	0 %	0 %	50 %	442313699
38	NC_020125	CCA	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313699
39	NC_020125	GCC	2	6	2578	2583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313699
40	NC_020125	ACC	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313699
41	NC_020125	A	6	6	2831	2836	100 %	0 %	0 %	0 %	442313699
42	NC_020125	TGG	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313699
43	NC_020125	TCCG	2	8	2871	2878	0 %	25 %	25 %	50 %	442313699
44	NC_020125	AGA	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
45	NC_020125	AGA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
46	NC_020125	CAT	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
47	NC_020125	TATC	2	8	3014	3021	25 %	50 %	0 %	25 %	442313700
48	NC_020125	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313700
49	NC_020125	CAA	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313700
50	NC_020125	GAG	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313700
51	NC_020125	GTT	3	9	3279	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313700
52	NC_020125	CCT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313700
53	NC_020125	ATAG	2	8	3394	3401	50 %	25 %	25 %	0 %	442313700
54	NC_020125	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313700
55	NC_020125	GAC	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313700
56	NC_020125	AC	3	6	3669	3674	50 %	0 %	0 %	50 %	442313700
57	NC_020125	ATG	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313700
58	NC_020125	TCA	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
59	NC_020125	TCA	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
60	NC_020125	ACC	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313700
61	NC_020125	GAA	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313700
62	NC_020125	A	6	6	3875	3880	100 %	0 %	0 %	0 %	442313700
63	NC_020125	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313700
64	NC_020125	GAG	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313700
65	NC_020125	GGT	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313700
66	NC_020125	ATC	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
67	NC_020125	TCT	2	6	4033	4038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313700
68	NC_020125	A	6	6	4045	4050	100 %	0 %	0 %	0 %	442313700
69	NC_020125	CTA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
70	NC_020125	TGA	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313700
71	NC_020125	AG	3	6	4213	4218	50 %	0 %	50 %	0 %	442313700
72	NC_020125	AGC	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313700
73	NC_020125	TAA	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313700
74	NC_020125	AAAC	2	8	4434	4441	75 %	0 %	0 %	25 %	442313701
75	NC_020125	TTC	2	6	4474	4479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313701
76	NC_020125	AAC	2	6	4560	4565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313701
77	NC_020125	GTA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
78	NC_020125	TGA	3	9	4595	4603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
79	NC_020125	ATT	2	6	4605	4610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313701
80	NC_020125	GGGGC	2	10	4668	4677	0 %	0 %	80 %	20 %	442313701
81	NC_020125	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313701
82	NC_020125	A	7	7	4698	4704	100 %	0 %	0 %	0 %	442313701
83	NC_020125	GAA	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313701
84	NC_020125	AC	3	6	4766	4771	50 %	0 %	0 %	50 %	442313701
85	NC_020125	TAA	2	6	4973	4978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313701
86	NC_020125	GCA	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313701
87	NC_020125	TAC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313701
88	NC_020125	AAT	2	6	5190	5195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313701
89	NC_020125	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313701
90	NC_020125	TCTT	2	8	5223	5230	0 %	75 %	0 %	25 %	442313701
91	NC_020125	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
92	NC_020125	CTA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313701
93	NC_020125	CAAAAA	2	12	5307	5318	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	442313701
94	NC_020125	AAG	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313701
95	NC_020125	GTA	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
96	NC_020125	A	7	7	5372	5378	100 %	0 %	0 %	0 %	442313701
97	NC_020125	TAC	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313701
98	NC_020125	A	6	6	5439	5444	100 %	0 %	0 %	0 %	442313701
99	NC_020125	A	6	6	5596	5601	100 %	0 %	0 %	0 %	442313701
100	NC_020125	GGC	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313701
101	NC_020125	AG	3	6	5659	5664	50 %	0 %	50 %	0 %	442313701
102	NC_020125	A	6	6	5689	5694	100 %	0 %	0 %	0 %	442313701
103	NC_020125	TGG	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313701
104	NC_020125	GGTTT	2	10	5773	5782	0 %	60 %	40 %	0 %	442313701
105	NC_020125	CAA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
106	NC_020125	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
107	NC_020125	GAA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
108	NC_020125	AG	3	6	5990	5995	50 %	0 %	50 %	0 %	442313702
109	NC_020125	AGA	3	9	6025	6033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
110	NC_020125	GAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
111	NC_020125	ACT	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313702
112	NC_020125	TGA	3	9	6175	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
113	NC_020125	CAA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
114	NC_020125	ATG	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
115	NC_020125	AG	3	6	6332	6337	50 %	0 %	50 %	0 %	442313702
116	NC_020125	GAT	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
117	NC_020125	GAA	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
118	NC_020125	GAA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
119	NC_020125	A	7	7	6581	6587	100 %	0 %	0 %	0 %	442313702
120	NC_020125	GAA	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
121	NC_020125	AAG	2	6	6624	6629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
122	NC_020125	GGT	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313702
123	NC_020125	ATT	2	6	6707	6712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313702
124	NC_020125	ATA	2	6	6738	6743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313702
125	NC_020125	CTC	2	6	6750	6755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313702
126	NC_020125	CAC	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313702
127	NC_020125	TCA	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313702
128	NC_020125	ACA	2	6	6964	6969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
129	NC_020125	TGA	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
130	NC_020125	AGT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
131	NC_020125	TAC	2	6	7107	7112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313702
132	NC_020125	AAG	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
133	NC_020125	TAG	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
134	NC_020125	TGA	2	6	7231	7236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
135	NC_020125	ACA	2	6	7269	7274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
136	NC_020125	AGA	2	6	7280	7285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
137	NC_020125	AAGAA	2	10	7333	7342	80 %	0 %	20 %	0 %	442313702
138	NC_020125	T	6	6	7609	7614	0 %	100 %	0 %	0 %	442313703
139	NC_020125	CAT	2	6	7727	7732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
140	NC_020125	TTA	2	6	7785	7790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313703
141	NC_020125	GGCA	2	8	7868	7875	25 %	0 %	50 %	25 %	442313703
142	NC_020125	TGA	3	9	7888	7896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313703
143	NC_020125	T	6	6	7934	7939	0 %	100 %	0 %	0 %	442313703
144	NC_020125	CTT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313703
145	NC_020125	GCG	2	6	8016	8021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313703
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147	NC_020125	AGA	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313703
148	NC_020125	ACA	2	6	8086	8091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313703
149	NC_020125	AAC	2	6	8151	8156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313703
150	NC_020125	GAA	2	6	8256	8261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313703
151	NC_020125	TGG	2	6	8291	8296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313703
152	NC_020125	CATG	2	8	8313	8320	25 %	25 %	25 %	25 %	442313703
153	NC_020125	AT	3	6	8379	8384	50 %	50 %	0 %	0 %	442313703
154	NC_020125	AAT	2	6	8402	8407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
155	NC_020125	CAA	2	6	8439	8444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313703
156	NC_020125	ACTAC	3	15	8499	8513	40 %	20 %	0 %	40 %	442313703
157	NC_020125	AGACA	2	10	8544	8553	60 %	0 %	20 %	20 %	442313703
158	NC_020125	TCA	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
159	NC_020125	A	7	7	8627	8633	100 %	0 %	0 %	0 %	442313703
160	NC_020125	TAC	2	6	8724	8729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
161	NC_020125	ACACGA	2	12	8774	8785	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	442313703
162	NC_020125	AGA	2	6	8921	8926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313703
163	NC_020125	TAA	2	6	8939	8944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
164	NC_020125	TTC	2	6	8955	8960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313703
165	NC_020125	TTTC	2	8	9006	9013	0 %	75 %	0 %	25 %	442313703
166	NC_020125	AG	3	6	9030	9035	50 %	0 %	50 %	0 %	442313703
167	NC_020125	AAT	2	6	9057	9062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
168	NC_020125	CAC	2	6	9134	9139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313703
169	NC_020125	CTA	2	6	9146	9151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
170	NC_020125	TCA	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
171	NC_020125	ATG	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313703
172	NC_020125	AGT	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313703
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176	NC_020125	TA	3	6	9465	9470	50 %	50 %	0 %	0 %	442313703
177	NC_020125	ATA	2	6	9487	9492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
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223	NC_020125	CAT	2	6	17682	17687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313707
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231	NC_020125	CTTT	2	8	18268	18275	0 %	75 %	0 %	25 %	442313708
232	NC_020125	TA	3	6	18282	18287	50 %	50 %	0 %	0 %	442313708
233	NC_020125	T	6	6	18327	18332	0 %	100 %	0 %	0 %	442313708
234	NC_020125	ATT	2	6	18430	18435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313708
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249	NC_020125	A	6	6	19455	19460	100 %	0 %	0 %	0 %	442313709
250	NC_020125	TTA	2	6	19473	19478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313709
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253	NC_020125	ATA	2	6	19609	19614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313710
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257	NC_020125	CT	3	6	19890	19895	0 %	50 %	0 %	50 %	442313710
258	NC_020125	TAAA	2	8	19914	19921	75 %	25 %	0 %	0 %	442313710
259	NC_020125	TA	4	8	19947	19954	50 %	50 %	0 %	0 %	442313710
260	NC_020125	T	6	6	19968	19973	0 %	100 %	0 %	0 %	442313710
261	NC_020125	AATC	2	8	19976	19983	50 %	25 %	0 %	25 %	442313710
262	NC_020125	TAT	2	6	19994	19999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313710
263	NC_020125	AAG	2	6	20088	20093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313710
264	NC_020125	TCT	2	6	20174	20179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313710
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266	NC_020125	TCC	2	6	20338	20343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313710
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