MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_020062	ACG	2	6	2004846	2004851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224802
39003	NC_020062	ATC	2	6	2004899	2004904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224802
39004	NC_020062	GAC	2	6	2004961	2004966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224802
39005	NC_020062	GCTGGC	2	12	2004991	2005002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440224802
39006	NC_020062	CGT	2	6	2005021	2005026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224802
39007	NC_020062	TGC	2	6	2005068	2005073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224802
39008	NC_020062	CGT	2	6	2005114	2005119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224802
39009	NC_020062	CGG	2	6	2005177	2005182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224802
39010	NC_020062	GCG	2	6	2005305	2005310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224802
39011	NC_020062	ATC	2	6	2005340	2005345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224802
39012	NC_020062	CGG	2	6	2005393	2005398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224802
39013	NC_020062	GAA	2	6	2005610	2005615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224803
39014	NC_020062	CAA	2	6	2005699	2005704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224803
39015	NC_020062	GCC	2	6	2005749	2005754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224803
39016	NC_020062	GCTG	2	8	2005755	2005762	0 %	25 %	50 %	25 %	440224803
39017	NC_020062	TCG	2	6	2005764	2005769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224803
39018	NC_020062	AC	3	6	2005784	2005789	50 %	0 %	0 %	50 %	440224803
39019	NC_020062	GCG	2	6	2005811	2005816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224803
39020	NC_020062	GGC	2	6	2005832	2005837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224803
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39022	NC_020062	TCC	2	6	2005858	2005863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224804
39023	NC_020062	CTC	2	6	2005954	2005959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224804
39024	NC_020062	ATC	2	6	2005997	2006002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224804
39025	NC_020062	CG	3	6	2006006	2006011	0 %	0 %	50 %	50 %	440224804
39026	NC_020062	CGG	2	6	2006021	2006026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224804
39027	NC_020062	GCC	2	6	2006029	2006034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224804
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39032	NC_020062	CGG	2	6	2006396	2006401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224804
39033	NC_020062	CGG	2	6	2006448	2006453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224804
39034	NC_020062	CGC	2	6	2006477	2006482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224804
39035	NC_020062	CAT	2	6	2006646	2006651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224804
39036	NC_020062	CAAG	2	8	2006655	2006662	50 %	0 %	25 %	25 %	440224804
39037	NC_020062	GGC	2	6	2006704	2006709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224804
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39041	NC_020062	TCG	2	6	2006867	2006872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224804
39042	NC_020062	CG	3	6	2006876	2006881	0 %	0 %	50 %	50 %	440224804
39043	NC_020062	GGC	2	6	2006899	2006904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224804
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39051	NC_020062	CG	3	6	2007282	2007287	0 %	0 %	50 %	50 %	440224804
39052	NC_020062	GCAAAG	2	12	2007308	2007319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440224804
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39055	NC_020062	GCCG	2	8	2007495	2007502	0 %	0 %	50 %	50 %	440224804
39056	NC_020062	GC	3	6	2007592	2007597	0 %	0 %	50 %	50 %	440224804
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39062	NC_020062	CAT	2	6	2007870	2007875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224804
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39066	NC_020062	GCC	2	6	2007964	2007969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224804
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39070	NC_020062	TC	3	6	2008157	2008162	0 %	50 %	0 %	50 %	440224804
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39087	NC_020062	GCCA	2	8	2009608	2009615	25 %	0 %	25 %	50 %	440224806
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39097	NC_020062	CG	3	6	2009939	2009944	0 %	0 %	50 %	50 %	440224806
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39099	NC_020062	TCA	2	6	2010005	2010010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224806
39100	NC_020062	CCCG	2	8	2010152	2010159	0 %	0 %	25 %	75 %	440224807
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39115	NC_020062	GC	3	6	2012001	2012006	0 %	0 %	50 %	50 %	440224808
39116	NC_020062	TCT	2	6	2012124	2012129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224808
39117	NC_020062	CG	3	6	2012145	2012150	0 %	0 %	50 %	50 %	440224808
39118	NC_020062	CTG	2	6	2012179	2012184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224808
39119	NC_020062	CTG	2	6	2012212	2012217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224808
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39218	NC_020062	CCCT	2	8	2019407	2019414	0 %	25 %	0 %	75 %	440224813
39219	NC_020062	A	6	6	2019417	2019422	100 %	0 %	0 %	0 %	440224813
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39221	NC_020062	TGGG	2	8	2019532	2019539	0 %	25 %	75 %	0 %	440224814
39222	NC_020062	GGT	2	6	2019554	2019559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224814
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39226	NC_020062	CG	3	6	2019731	2019736	0 %	0 %	50 %	50 %	440224814
39227	NC_020062	TCG	2	6	2019904	2019909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224814
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39230	NC_020062	TTG	2	6	2019986	2019991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224814
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39232	NC_020062	ACG	2	6	2020108	2020113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224814
39233	NC_020062	GCC	2	6	2020183	2020188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224814
39234	NC_020062	AGGCGG	2	12	2020229	2020240	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	440224814
39235	NC_020062	GCC	2	6	2020265	2020270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224814
39236	NC_020062	GCA	2	6	2020294	2020299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224814
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39462	NC_020062	CGG	2	6	2030791	2030796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224822
39463	NC_020062	CTG	2	6	2030818	2030823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224822
39464	NC_020062	CGAGA	2	10	2030844	2030853	40 %	0 %	40 %	20 %	440224822
39465	NC_020062	CGT	2	6	2030856	2030861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224822
39466	NC_020062	CAC	2	6	2030862	2030867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224822
39467	NC_020062	GCC	2	6	2030898	2030903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224822
39468	NC_020062	ACG	2	6	2030971	2030976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224822
39469	NC_020062	TCG	2	6	2030996	2031001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224822
39470	NC_020062	CG	3	6	2031000	2031005	0 %	0 %	50 %	50 %	440224822
39471	NC_020062	GCCGC	2	10	2031037	2031046	0 %	0 %	40 %	60 %	440224822
39472	NC_020062	GACCGT	2	12	2031067	2031078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39473	NC_020062	ACG	2	6	2031083	2031088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39474	NC_020062	CGG	2	6	2031114	2031119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224823
39475	NC_020062	ACG	2	6	2031131	2031136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39476	NC_020062	CCG	2	6	2031189	2031194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224823
39477	NC_020062	CTGG	2	8	2031222	2031229	0 %	25 %	50 %	25 %	440224823
39478	NC_020062	GACG	2	8	2031414	2031421	25 %	0 %	50 %	25 %	440224823
39479	NC_020062	TCG	2	6	2031447	2031452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39480	NC_020062	CTT	2	6	2031474	2031479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224823
39481	NC_020062	GC	3	6	2031513	2031518	0 %	0 %	50 %	50 %	440224823
39482	NC_020062	TTC	2	6	2031548	2031553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224823
39483	NC_020062	CTG	2	6	2031601	2031606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39484	NC_020062	CGC	2	6	2031616	2031621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224823
39485	NC_020062	CTG	2	6	2031622	2031627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39486	NC_020062	GCT	3	9	2031663	2031671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39487	NC_020062	CCT	2	6	2031681	2031686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224823
39488	NC_020062	GCC	2	6	2031755	2031760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224823
39489	NC_020062	GGC	2	6	2031931	2031936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224823
39490	NC_020062	CGA	2	6	2031957	2031962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39491	NC_020062	CGTC	2	8	2031969	2031976	0 %	25 %	25 %	50 %	440224823
39492	NC_020062	CGG	2	6	2032017	2032022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224823
39493	NC_020062	ACC	2	6	2032031	2032036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224823
39494	NC_020062	GAAG	3	12	2032077	2032088	50 %	0 %	50 %	0 %	440224823
39495	NC_020062	CTG	2	6	2032141	2032146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224823
39496	NC_020062	GATT	2	8	2032181	2032188	25 %	50 %	25 %	0 %	440224823
39497	NC_020062	CATGA	2	10	2032195	2032204	40 %	20 %	20 %	20 %	440224823
39498	NC_020062	GC	3	6	2032272	2032277	0 %	0 %	50 %	50 %	440224824
39499	NC_020062	GGC	2	6	2032302	2032307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224824
39500	NC_020062	TTTC	2	8	2032312	2032319	0 %	75 %	0 %	25 %	440224824

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