MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_020062	GCAT	2	8	1981939	1981946	25 %	25 %	25 %	25 %	440224781
38502	NC_020062	TCC	2	6	1981996	1982001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224781
38503	NC_020062	AGGC	2	8	1982017	1982024	25 %	0 %	50 %	25 %	440224781
38504	NC_020062	CGA	2	6	1982054	1982059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38505	NC_020062	TCG	2	6	1982113	1982118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38506	NC_020062	CGA	2	6	1982126	1982131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38507	NC_020062	CGG	2	6	1982146	1982151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224781
38508	NC_020062	GGT	2	6	1982196	1982201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224781
38509	NC_020062	GCG	3	9	1982313	1982321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224781
38510	NC_020062	GCT	2	6	1982360	1982365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38511	NC_020062	ACGA	2	8	1982388	1982395	50 %	0 %	25 %	25 %	440224781
38512	NC_020062	CGA	2	6	1982402	1982407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38513	NC_020062	GA	3	6	1982443	1982448	50 %	0 %	50 %	0 %	440224781
38514	NC_020062	TCA	2	6	1982621	1982626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224782
38515	NC_020062	TCG	2	6	1982653	1982658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224782
38516	NC_020062	GT	3	6	1982663	1982668	0 %	50 %	50 %	0 %	440224782
38517	NC_020062	GTC	2	6	1982682	1982687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224782
38518	NC_020062	TTG	2	6	1982710	1982715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224782
38519	NC_020062	TCG	2	6	1982860	1982865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224782
38520	NC_020062	TCG	2	6	1982917	1982922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224782
38521	NC_020062	GC	3	6	1982938	1982943	0 %	0 %	50 %	50 %	440224782
38522	NC_020062	CAGG	2	8	1982944	1982951	25 %	0 %	50 %	25 %	440224782
38523	NC_020062	AGAT	2	8	1982965	1982972	50 %	25 %	25 %	0 %	440224782
38524	NC_020062	CGA	2	6	1983014	1983019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224782
38525	NC_020062	GGC	2	6	1983020	1983025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224782
38526	NC_020062	GAT	2	6	1983092	1983097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224782
38527	NC_020062	AG	3	6	1983231	1983236	50 %	0 %	50 %	0 %	440224782
38528	NC_020062	CG	3	6	1983242	1983247	0 %	0 %	50 %	50 %	440224782
38529	NC_020062	GCC	2	6	1983263	1983268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224782
38530	NC_020062	GC	3	6	1983307	1983312	0 %	0 %	50 %	50 %	440224782
38531	NC_020062	CTT	2	6	1983320	1983325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224782
38532	NC_020062	CGC	2	6	1983328	1983333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224782
38533	NC_020062	CCGA	2	8	1983360	1983367	25 %	0 %	25 %	50 %	440224782
38534	NC_020062	CGC	2	6	1983397	1983402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224782
38535	NC_020062	CGTGC	2	10	1983465	1983474	0 %	20 %	40 %	40 %	440224782
38536	NC_020062	CTG	2	6	1983626	1983631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38537	NC_020062	CTG	2	6	1983635	1983640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38538	NC_020062	TGC	3	9	1983651	1983659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38539	NC_020062	CAT	2	6	1983673	1983678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224783
38540	NC_020062	GCC	2	6	1983692	1983697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224783
38541	NC_020062	TCG	2	6	1983741	1983746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38542	NC_020062	GC	3	6	1983788	1983793	0 %	0 %	50 %	50 %	440224783
38543	NC_020062	TGT	2	6	1983840	1983845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224783
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38545	NC_020062	GC	5	10	1983902	1983911	0 %	0 %	50 %	50 %	440224783
38546	NC_020062	GCA	2	6	1983926	1983931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224783
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38548	NC_020062	GGC	2	6	1984019	1984024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224783
38549	NC_020062	TCG	2	6	1984035	1984040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38550	NC_020062	CGG	2	6	1984051	1984056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224783
38551	NC_020062	GTA	2	6	1984095	1984100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224783
38552	NC_020062	TCA	2	6	1984107	1984112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224783
38553	NC_020062	CTG	2	6	1984238	1984243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38554	NC_020062	TGG	2	6	1984314	1984319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224783
38555	NC_020062	CTT	2	6	1984322	1984327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224783
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38558	NC_020062	CGG	2	6	1984411	1984416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224783
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38560	NC_020062	CTG	2	6	1984441	1984446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
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38564	NC_020062	CGCCT	2	10	1984569	1984578	0 %	20 %	20 %	60 %	440224783
38565	NC_020062	TG	3	6	1984616	1984621	0 %	50 %	50 %	0 %	440224783
38566	NC_020062	TGCTC	2	10	1984639	1984648	0 %	40 %	20 %	40 %	440224783
38567	NC_020062	TCA	2	6	1984686	1984691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224783
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38569	NC_020062	GCCGGC	2	12	1984787	1984798	0 %	0 %	50 %	50 %	440224783
38570	NC_020062	GCA	2	6	1984819	1984824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224783
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38572	NC_020062	TC	3	6	1984897	1984902	0 %	50 %	0 %	50 %	440224783
38573	NC_020062	CTG	2	6	1984949	1984954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224783
38574	NC_020062	GCAGC	2	10	1984981	1984990	20 %	0 %	40 %	40 %	440224783
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38581	NC_020062	GGCGCC	2	12	1985389	1985400	0 %	0 %	50 %	50 %	440224784
38582	NC_020062	ACG	2	6	1985451	1985456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224784
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38587	NC_020062	TCG	2	6	1985640	1985645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224784
38588	NC_020062	AG	3	6	1985709	1985714	50 %	0 %	50 %	0 %	440224784
38589	NC_020062	ATC	2	6	1985765	1985770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224784
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38592	NC_020062	GAA	3	9	1985911	1985919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224784
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38596	NC_020062	CG	3	6	1985985	1985990	0 %	0 %	50 %	50 %	440224784
38597	NC_020062	CCG	2	6	1986000	1986005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
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38599	NC_020062	GCC	2	6	1986043	1986048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
38600	NC_020062	GCC	2	6	1986064	1986069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
38601	NC_020062	CGG	2	6	1986109	1986114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224784
38602	NC_020062	CAG	2	6	1986115	1986120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224784
38603	NC_020062	GA	3	6	1986137	1986142	50 %	0 %	50 %	0 %	440224784
38604	NC_020062	GAT	2	6	1986172	1986177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224784
38605	NC_020062	GCACGA	2	12	1986186	1986197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224784
38606	NC_020062	GAT	2	6	1986259	1986264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224784
38607	NC_020062	CCG	2	6	1986278	1986283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
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38609	NC_020062	GA	3	6	1986340	1986345	50 %	0 %	50 %	0 %	440224784
38610	NC_020062	GCG	2	6	1986360	1986365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224784
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38612	NC_020062	TCG	2	6	1986410	1986415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224784
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38614	NC_020062	CCG	3	9	1986519	1986527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224784
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38760	NC_020062	CATG	2	8	1994019	1994026	25 %	25 %	25 %	25 %	440224791
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