MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_020062	GC	3	6	1958875	1958880	0 %	0 %	50 %	50 %	440224761
38003	NC_020062	CG	3	6	1958902	1958907	0 %	0 %	50 %	50 %	440224761
38004	NC_020062	GCC	2	6	1958924	1958929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224761
38005	NC_020062	ATC	2	6	1958938	1958943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224761
38006	NC_020062	TGA	2	6	1958951	1958956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224761
38007	NC_020062	CCA	2	6	1958994	1958999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224761
38008	NC_020062	GCT	2	6	1959114	1959119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224761
38009	NC_020062	TCT	2	6	1959129	1959134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224761
38010	NC_020062	CGG	2	6	1959135	1959140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224761
38011	NC_020062	GCG	2	6	1959354	1959359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224761
38012	NC_020062	GCG	2	6	1959363	1959368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224761
38013	NC_020062	CGAT	2	8	1959460	1959467	25 %	25 %	25 %	25 %	440224761
38014	NC_020062	CG	3	6	1959495	1959500	0 %	0 %	50 %	50 %	440224761
38015	NC_020062	TTCCAT	2	12	1959525	1959536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440224761
38016	NC_020062	CGC	2	6	1959809	1959814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224762
38017	NC_020062	CG	3	6	1959860	1959865	0 %	0 %	50 %	50 %	440224762
38018	NC_020062	TCG	2	6	1959866	1959871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224762
38019	NC_020062	CGC	2	6	1959900	1959905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224762
38020	NC_020062	TGA	2	6	1959935	1959940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224762
38021	NC_020062	CGG	2	6	1959965	1959970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224762
38022	NC_020062	GAA	2	6	1960060	1960065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224762
38023	NC_020062	GCCC	2	8	1960098	1960105	0 %	0 %	25 %	75 %	440224762
38024	NC_020062	CAC	2	6	1960134	1960139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224762
38025	NC_020062	GCC	2	6	1960159	1960164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224762
38026	NC_020062	GC	3	6	1960181	1960186	0 %	0 %	50 %	50 %	440224762
38027	NC_020062	TGC	2	6	1960192	1960197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224762
38028	NC_020062	TGC	2	6	1960210	1960215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224762
38029	NC_020062	CGA	2	6	1960220	1960225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224762
38030	NC_020062	GCC	2	6	1960257	1960262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224762
38031	NC_020062	CAG	2	6	1960272	1960277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224762
38032	NC_020062	GCG	2	6	1960357	1960362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224763
38033	NC_020062	GCA	2	6	1960381	1960386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224763
38034	NC_020062	ATGGCG	2	12	1960401	1960412	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440224763
38035	NC_020062	GCAAA	2	10	1960413	1960422	60 %	0 %	20 %	20 %	440224763
38036	NC_020062	GCG	2	6	1960451	1960456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224763
38037	NC_020062	GCA	2	6	1960509	1960514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224763
38038	NC_020062	TGA	2	6	1960675	1960680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224763
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38040	NC_020062	TCC	2	6	1960728	1960733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224763
38041	NC_020062	CGA	2	6	1960756	1960761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224763
38042	NC_020062	GCG	2	6	1960766	1960771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224763
38043	NC_020062	CCA	2	6	1960788	1960793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224763
38044	NC_020062	A	6	6	1960815	1960820	100 %	0 %	0 %	0 %	440224763
38045	NC_020062	CCG	2	6	1960840	1960845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224763
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38049	NC_020062	TCAG	2	8	1961090	1961097	25 %	25 %	25 %	25 %	440224764
38050	NC_020062	TCG	2	6	1961120	1961125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224764
38051	NC_020062	GAG	2	6	1961260	1961265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224764
38052	NC_020062	GCC	2	6	1961296	1961301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224764
38053	NC_020062	TCAGC	2	10	1961315	1961324	20 %	20 %	20 %	40 %	440224764
38054	NC_020062	CGCT	2	8	1961329	1961336	0 %	25 %	25 %	50 %	440224764
38055	NC_020062	TGC	2	6	1961402	1961407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224764
38056	NC_020062	GA	3	6	1961540	1961545	50 %	0 %	50 %	0 %	440224764
38057	NC_020062	CCG	2	6	1961598	1961603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224764
38058	NC_020062	CCGGG	2	10	1961609	1961618	0 %	0 %	60 %	40 %	440224764
38059	NC_020062	CAT	2	6	1961631	1961636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224764
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38061	NC_020062	TTGCC	2	10	1961643	1961652	0 %	40 %	20 %	40 %	440224764
38062	NC_020062	GTT	2	6	1961691	1961696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224764
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38064	NC_020062	CAT	2	6	1961736	1961741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224764
38065	NC_020062	GATC	2	8	1961747	1961754	25 %	25 %	25 %	25 %	440224764
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38067	NC_020062	AAT	2	6	1961906	1961911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224764
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38069	NC_020062	G	6	6	1962069	1962074	0 %	0 %	100 %	0 %	440224765
38070	NC_020062	GCC	3	9	1962099	1962107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224765
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38082	NC_020062	TG	3	6	1962443	1962448	0 %	50 %	50 %	0 %	440224765
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38092	NC_020062	ACG	2	6	1962785	1962790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
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38098	NC_020062	GCG	2	6	1963092	1963097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
38099	NC_020062	TC	3	6	1963118	1963123	0 %	50 %	0 %	50 %	440224766
38100	NC_020062	AGCG	2	8	1963124	1963131	25 %	0 %	50 %	25 %	440224766
38101	NC_020062	GCA	2	6	1963245	1963250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
38102	NC_020062	GC	3	6	1963334	1963339	0 %	0 %	50 %	50 %	440224766
38103	NC_020062	CGCC	2	8	1963341	1963348	0 %	0 %	25 %	75 %	440224766
38104	NC_020062	TGAGC	2	10	1963464	1963473	20 %	20 %	40 %	20 %	440224766
38105	NC_020062	ATC	2	6	1963507	1963512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224766
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38108	NC_020062	AGGA	2	8	1963577	1963584	50 %	0 %	50 %	0 %	440224766
38109	NC_020062	GCGG	2	8	1963589	1963596	0 %	0 %	75 %	25 %	440224766
38110	NC_020062	CGG	2	6	1963623	1963628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224766
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38116	NC_020062	TCC	3	9	1963868	1963876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224766
38117	NC_020062	GAC	3	9	1963906	1963914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224766
38118	NC_020062	GC	3	6	1963918	1963923	0 %	0 %	50 %	50 %	440224766
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38231	NC_020062	CGGC	2	8	1969107	1969114	0 %	0 %	50 %	50 %	440224770
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38461	NC_020062	CGT	2	6	1980007	1980012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224777
38462	NC_020062	ATC	2	6	1980062	1980067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224778
38463	NC_020062	CGC	2	6	1980116	1980121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
38464	NC_020062	TGA	2	6	1980151	1980156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224778
38465	NC_020062	CGC	2	6	1980165	1980170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
38466	NC_020062	GTC	2	6	1980251	1980256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224778
38467	NC_020062	CTG	2	6	1980362	1980367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224778
38468	NC_020062	GCC	2	6	1980395	1980400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
38469	NC_020062	GAT	2	6	1980412	1980417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224778
38470	NC_020062	TCGCT	2	10	1980441	1980450	0 %	40 %	20 %	40 %	440224778
38471	NC_020062	TTCG	2	8	1980473	1980480	0 %	50 %	25 %	25 %	440224778
38472	NC_020062	CTG	2	6	1980488	1980493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224778
38473	NC_020062	GCTC	2	8	1980546	1980553	0 %	25 %	25 %	50 %	440224778
38474	NC_020062	CCA	2	6	1980564	1980569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224778
38475	NC_020062	GCC	2	6	1980574	1980579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
38476	NC_020062	CCG	2	6	1980581	1980586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224778
38477	NC_020062	CGA	2	6	1980701	1980706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224779
38478	NC_020062	CTC	2	6	1980788	1980793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224779
38479	NC_020062	CAG	2	6	1980929	1980934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224779
38480	NC_020062	CGT	2	6	1980937	1980942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224779
38481	NC_020062	CATC	2	8	1980987	1980994	25 %	25 %	0 %	50 %	440224780
38482	NC_020062	GCA	2	6	1981018	1981023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224780
38483	NC_020062	CAG	2	6	1981084	1981089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224780
38484	NC_020062	GGAC	2	8	1981142	1981149	25 %	0 %	50 %	25 %	440224780
38485	NC_020062	AAG	2	6	1981157	1981162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224780
38486	NC_020062	TGA	2	6	1981330	1981335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224781
38487	NC_020062	ACG	2	6	1981351	1981356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38488	NC_020062	ATC	2	6	1981380	1981385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224781
38489	NC_020062	GTCG	2	8	1981412	1981419	0 %	25 %	50 %	25 %	440224781
38490	NC_020062	AGC	2	6	1981420	1981425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38491	NC_020062	CGG	2	6	1981463	1981468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224781
38492	NC_020062	CGT	2	6	1981484	1981489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38493	NC_020062	GCC	2	6	1981583	1981588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224781
38494	NC_020062	GCA	2	6	1981616	1981621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
38495	NC_020062	GAT	2	6	1981652	1981657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224781
38496	NC_020062	CGA	2	6	1981673	1981678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224781
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38499	NC_020062	GAA	2	6	1981865	1981870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224781
38500	NC_020062	TCG	2	6	1981882	1981887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224781

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