MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_020062	GCA	2	6	1908345	1908350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37003	NC_020062	CTGC	2	8	1908387	1908394	0 %	25 %	25 %	50 %	440224716
37004	NC_020062	GCCG	2	8	1908457	1908464	0 %	0 %	50 %	50 %	440224716
37005	NC_020062	GAA	2	6	1908478	1908483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224716
37006	NC_020062	CG	3	6	1908532	1908537	0 %	0 %	50 %	50 %	440224716
37007	NC_020062	CCG	2	6	1908642	1908647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224716
37008	NC_020062	GTA	2	6	1908649	1908654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224716
37009	NC_020062	CGA	2	6	1908828	1908833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37010	NC_020062	CGAT	2	8	1908842	1908849	25 %	25 %	25 %	25 %	440224716
37011	NC_020062	CG	3	6	1908873	1908878	0 %	0 %	50 %	50 %	440224716
37012	NC_020062	GAA	2	6	1908907	1908912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224716
37013	NC_020062	GTT	2	6	1908922	1908927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224716
37014	NC_020062	CGA	2	6	1908942	1908947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37015	NC_020062	GAC	2	6	1908970	1908975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37016	NC_020062	CGG	2	6	1908988	1908993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224716
37017	NC_020062	CAG	2	6	1909024	1909029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37018	NC_020062	GGC	2	6	1909081	1909086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224716
37019	NC_020062	GGC	2	6	1909114	1909119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224716
37020	NC_020062	ACG	2	6	1909124	1909129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37021	NC_020062	GCC	2	6	1909185	1909190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224716
37022	NC_020062	GTC	2	6	1909193	1909198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37023	NC_020062	GCC	2	6	1909204	1909209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224716
37024	NC_020062	TGA	2	6	1909233	1909238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224716
37025	NC_020062	TCA	2	6	1909421	1909426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224716
37026	NC_020062	CAT	2	6	1909443	1909448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224716
37027	NC_020062	TCCAGG	2	12	1909497	1909508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224716
37028	NC_020062	CGC	2	6	1909539	1909544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224716
37029	NC_020062	GGC	2	6	1909606	1909611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224716
37030	NC_020062	TCA	2	6	1909682	1909687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224716
37031	NC_020062	GGCC	2	8	1909722	1909729	0 %	0 %	50 %	50 %	440224716
37032	NC_020062	GCG	2	6	1909753	1909758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224716
37033	NC_020062	AGA	2	6	1910021	1910026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224717
37034	NC_020062	CGAG	2	8	1910028	1910035	25 %	0 %	50 %	25 %	440224717
37035	NC_020062	CGT	2	6	1910068	1910073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37036	NC_020062	CGA	2	6	1910118	1910123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37037	NC_020062	GAT	2	6	1910281	1910286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224717
37038	NC_020062	GC	3	6	1910352	1910357	0 %	0 %	50 %	50 %	440224717
37039	NC_020062	GCG	2	6	1910386	1910391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224717
37040	NC_020062	AGC	2	6	1910417	1910422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37041	NC_020062	ATC	2	6	1910440	1910445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224717
37042	NC_020062	CTG	2	6	1910533	1910538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37043	NC_020062	GAA	2	6	1910572	1910577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224717
37044	NC_020062	CAG	2	6	1910641	1910646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37045	NC_020062	GGC	2	6	1910679	1910684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224717
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37047	NC_020062	TG	3	6	1910748	1910753	0 %	50 %	50 %	0 %	440224717
37048	NC_020062	GAC	2	6	1910779	1910784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37049	NC_020062	GCT	2	6	1910794	1910799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224717
37050	NC_020062	GCC	3	9	1910801	1910809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224717
37051	NC_020062	CG	3	6	1910865	1910870	0 %	0 %	50 %	50 %	440224717
37052	NC_020062	GCG	2	6	1911395	1911400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224718
37053	NC_020062	GCGG	2	8	1911410	1911417	0 %	0 %	75 %	25 %	440224718
37054	NC_020062	GAG	2	6	1911474	1911479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224718
37055	NC_020062	TCG	2	6	1911481	1911486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224718
37056	NC_020062	GCCG	2	8	1911512	1911519	0 %	0 %	50 %	50 %	440224718
37057	NC_020062	GGA	2	6	1911521	1911526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224718
37058	NC_020062	CGA	2	6	1911541	1911546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224718
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37060	NC_020062	GCT	2	6	1911724	1911729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224718
37061	NC_020062	TCG	2	6	1911745	1911750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224718
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37069	NC_020062	GC	3	6	1912084	1912089	0 %	0 %	50 %	50 %	440224718
37070	NC_020062	GCG	2	6	1912126	1912131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224718
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37087	NC_020062	TCG	2	6	1912720	1912725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224718
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37089	NC_020062	ACG	2	6	1912795	1912800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224718
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37100	NC_020062	CGC	2	6	1913899	1913904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224719
37101	NC_020062	ATGCG	2	10	1914042	1914051	20 %	20 %	40 %	20 %	440224719
37102	NC_020062	GAG	2	6	1914052	1914057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224719
37103	NC_020062	CG	3	6	1914088	1914093	0 %	0 %	50 %	50 %	440224719
37104	NC_020062	CGA	2	6	1914106	1914111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224719
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37106	NC_020062	CTC	2	6	1914227	1914232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224719
37107	NC_020062	CGA	3	9	1914244	1914252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224719
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37231	NC_020062	CGT	2	6	1919731	1919736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224724
37232	NC_020062	GCC	2	6	1919777	1919782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224724
37233	NC_020062	TGC	3	9	1919787	1919795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224724
37234	NC_020062	TCT	2	6	1919842	1919847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224724
37235	NC_020062	CAC	2	6	1919911	1919916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224724
37236	NC_020062	CGG	2	6	1919978	1919983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224724
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37238	NC_020062	ACA	2	6	1919994	1919999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224724
37239	NC_020062	GAG	2	6	1920020	1920025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224724
37240	NC_020062	ACG	2	6	1920029	1920034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224724
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37243	NC_020062	CGG	2	6	1920185	1920190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224724
37244	NC_020062	TGC	2	6	1920308	1920313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224725
37245	NC_020062	TGG	2	6	1920330	1920335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224725
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37252	NC_020062	GT	3	6	1920588	1920593	0 %	50 %	50 %	0 %	440224726
37253	NC_020062	CGG	2	6	1920625	1920630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224726
37254	NC_020062	GCA	2	6	1920663	1920668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224726
37255	NC_020062	CGCC	2	8	1920697	1920704	0 %	0 %	25 %	75 %	440224726
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37258	NC_020062	CGGCG	2	10	1920899	1920908	0 %	0 %	60 %	40 %	440224726
37259	NC_020062	CAG	2	6	1921176	1921181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224727
37260	NC_020062	AGC	2	6	1921203	1921208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224727
37261	NC_020062	CAGC	2	8	1921227	1921234	25 %	0 %	25 %	50 %	440224727
37262	NC_020062	GCAG	2	8	1921245	1921252	25 %	0 %	50 %	25 %	440224727
37263	NC_020062	GA	3	6	1921273	1921278	50 %	0 %	50 %	0 %	440224727
37264	NC_020062	CG	3	6	1921280	1921285	0 %	0 %	50 %	50 %	440224727
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37267	NC_020062	GAC	2	6	1921351	1921356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224727
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37300	NC_020062	GC	3	6	1923112	1923117	0 %	0 %	50 %	50 %	440224731
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37330	NC_020062	GA	3	6	1924412	1924417	50 %	0 %	50 %	0 %	440224733
37331	NC_020062	CGA	3	9	1924433	1924441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224733
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37335	NC_020062	GCCA	2	8	1924654	1924661	25 %	0 %	25 %	50 %	440224733
37336	NC_020062	AAG	2	6	1924668	1924673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224733
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37339	NC_020062	GAT	2	6	1924855	1924860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224733
37340	NC_020062	CGG	2	6	1924882	1924887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224733
37341	NC_020062	GAT	2	6	1924902	1924907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224733
37342	NC_020062	ATG	2	6	1924930	1924935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224733
37343	NC_020062	GAT	2	6	1924951	1924956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224733
37344	NC_020062	GCA	2	6	1925563	1925568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224734
37345	NC_020062	CT	3	6	1925571	1925576	0 %	50 %	0 %	50 %	440224734
37346	NC_020062	CGA	2	6	1925794	1925799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224734
37347	NC_020062	TCG	2	6	1925856	1925861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224734
37348	NC_020062	CATC	2	8	1925917	1925924	25 %	25 %	0 %	50 %	440224734
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37462	NC_020062	TTA	2	6	1931661	1931666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224738
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