MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_020062	CTG	2	6	1858435	1858440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36002	NC_020062	CCT	2	6	1858491	1858496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224668
36003	NC_020062	AC	3	6	1858514	1858519	50 %	0 %	0 %	50 %	440224668
36004	NC_020062	GACG	2	8	1858520	1858527	25 %	0 %	50 %	25 %	440224668
36005	NC_020062	GCCG	2	8	1858534	1858541	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
36006	NC_020062	GGA	2	6	1858560	1858565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224668
36007	NC_020062	TCA	2	6	1858571	1858576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224668
36008	NC_020062	GCC	2	6	1858588	1858593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224668
36009	NC_020062	CAA	2	6	1858653	1858658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224668
36010	NC_020062	ATCG	2	8	1858666	1858673	25 %	25 %	25 %	25 %	440224668
36011	NC_020062	ATCT	2	8	1858717	1858724	25 %	50 %	0 %	25 %	440224668
36012	NC_020062	GC	3	6	1858754	1858759	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
36013	NC_020062	TGA	2	6	1858769	1858774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224668
36014	NC_020062	GCG	2	6	1858804	1858809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224668
36015	NC_020062	CGA	2	6	1858995	1859000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36016	NC_020062	CCG	2	6	1859040	1859045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224668
36017	NC_020062	TGC	3	9	1859132	1859140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36018	NC_020062	CAG	2	6	1859149	1859154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36019	NC_020062	GCT	2	6	1859173	1859178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36020	NC_020062	GTT	2	6	1859194	1859199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224668
36021	NC_020062	CGA	2	6	1859219	1859224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36022	NC_020062	GGGATC	2	12	1859229	1859240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440224668
36023	NC_020062	CGA	2	6	1859243	1859248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36024	NC_020062	ACGT	2	8	1859312	1859319	25 %	25 %	25 %	25 %	440224668
36025	NC_020062	TGC	2	6	1859382	1859387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36026	NC_020062	GAC	2	6	1859388	1859393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36027	NC_020062	TCA	2	6	1859405	1859410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224668
36028	NC_020062	CGAGAA	2	12	1859418	1859429	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440224668
36029	NC_020062	GGC	2	6	1859472	1859477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224668
36030	NC_020062	GCTC	2	8	1859498	1859505	0 %	25 %	25 %	50 %	440224668
36031	NC_020062	GGCC	2	8	1859511	1859518	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
36032	NC_020062	TCG	2	6	1859528	1859533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36033	NC_020062	ACG	2	6	1859539	1859544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36034	NC_020062	CAC	2	6	1859574	1859579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224668
36035	NC_020062	GCG	3	9	1859615	1859623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224668
36036	NC_020062	CGA	2	6	1859678	1859683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36037	NC_020062	TCG	2	6	1859765	1859770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224668
36038	NC_020062	CTA	2	6	1859778	1859783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224668
36039	NC_020062	CAGG	2	8	1859868	1859875	25 %	0 %	50 %	25 %	440224668
36040	NC_020062	CGTC	2	8	1859961	1859968	0 %	25 %	25 %	50 %	440224668
36041	NC_020062	GCG	2	6	1859985	1859990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224668
36042	NC_020062	CG	3	6	1860069	1860074	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
36043	NC_020062	GC	3	6	1860097	1860102	0 %	0 %	50 %	50 %	440224668
36044	NC_020062	TCA	2	6	1860131	1860136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224668
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36047	NC_020062	CGC	2	6	1860230	1860235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224668
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36049	NC_020062	AGGA	2	8	1861262	1861269	50 %	0 %	50 %	0 %	440224669
36050	NC_020062	ACG	2	6	1861303	1861308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224669
36051	NC_020062	GGA	2	6	1861345	1861350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224669
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36053	NC_020062	AC	4	8	1861399	1861406	50 %	0 %	0 %	50 %	440224669
36054	NC_020062	CTG	2	6	1861484	1861489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224669
36055	NC_020062	GGA	2	6	1861510	1861515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224669
36056	NC_020062	CCGA	2	8	1861529	1861536	25 %	0 %	25 %	50 %	440224669
36057	NC_020062	GCG	2	6	1861539	1861544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224669
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36062	NC_020062	GC	3	6	1861677	1861682	0 %	0 %	50 %	50 %	440224669
36063	NC_020062	CAT	2	6	1861684	1861689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224669
36064	NC_020062	CGA	2	6	1861725	1861730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224669
36065	NC_020062	GTC	2	6	1861784	1861789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224669
36066	NC_020062	TC	3	6	1861798	1861803	0 %	50 %	0 %	50 %	440224669
36067	NC_020062	GA	3	6	1861910	1861915	50 %	0 %	50 %	0 %	440224670
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36072	NC_020062	TCG	2	6	1862299	1862304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224671
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36074	NC_020062	GCCC	2	8	1862405	1862412	0 %	0 %	25 %	75 %	440224671
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36099	NC_020062	CCGCT	2	10	1863565	1863574	0 %	20 %	20 %	60 %	440224672
36100	NC_020062	GAC	2	6	1863590	1863595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224672
36101	NC_020062	GC	3	6	1863601	1863606	0 %	0 %	50 %	50 %	440224672
36102	NC_020062	CGG	2	6	1863656	1863661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224672
36103	NC_020062	CGGAC	2	10	1863725	1863734	20 %	0 %	40 %	40 %	440224672
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36106	NC_020062	GTT	3	9	1863834	1863842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224672
36107	NC_020062	CG	3	6	1863892	1863897	0 %	0 %	50 %	50 %	440224672
36108	NC_020062	ATC	2	6	1863903	1863908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224672
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36111	NC_020062	GAT	2	6	1864100	1864105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224672
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36113	NC_020062	GGC	2	6	1864266	1864271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224673
36114	NC_020062	CTG	2	6	1864301	1864306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224673
36115	NC_020062	GATG	2	8	1864324	1864331	25 %	25 %	50 %	0 %	440224673
36116	NC_020062	CAA	2	6	1864387	1864392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224673
36117	NC_020062	TCGGCA	2	12	1864395	1864406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224673
36118	NC_020062	CCGG	2	8	1864413	1864420	0 %	0 %	50 %	50 %	440224673
36119	NC_020062	GGC	2	6	1864444	1864449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224673
36120	NC_020062	GGC	2	6	1864514	1864519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224673
36121	NC_020062	GCA	2	6	1864543	1864548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224673
36122	NC_020062	GCG	2	6	1864583	1864588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224673
36123	NC_020062	CG	3	6	1864590	1864595	0 %	0 %	50 %	50 %	440224673
36124	NC_020062	GGA	2	6	1864600	1864605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224673
36125	NC_020062	TTC	2	6	1864670	1864675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224673
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36127	NC_020062	GC	3	6	1864696	1864701	0 %	0 %	50 %	50 %	440224673
36128	NC_020062	GC	4	8	1864718	1864725	0 %	0 %	50 %	50 %	440224673
36129	NC_020062	CGCA	2	8	1864733	1864740	25 %	0 %	25 %	50 %	440224673
36130	NC_020062	GAC	2	6	1864763	1864768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224673
36131	NC_020062	ATC	2	6	1864793	1864798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224673
36132	NC_020062	ACG	2	6	1864829	1864834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224673
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36136	NC_020062	GAG	2	6	1865028	1865033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224673
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36143	NC_020062	CGA	2	6	1865262	1865267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224674
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36146	NC_020062	CAG	2	6	1865529	1865534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224674
36147	NC_020062	CGGA	2	8	1865558	1865565	25 %	0 %	50 %	25 %	440224674
36148	NC_020062	CAA	2	6	1865604	1865609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224674
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36152	NC_020062	TC	3	6	1865736	1865741	0 %	50 %	0 %	50 %	440224674
36153	NC_020062	CCA	2	6	1865894	1865899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224675
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36217	NC_020062	CGGA	2	8	1869165	1869172	25 %	0 %	50 %	25 %	440224677
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36219	NC_020062	TCG	2	6	1869226	1869231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224677
36220	NC_020062	GATC	2	8	1869257	1869264	25 %	25 %	25 %	25 %	440224677
36221	NC_020062	CAG	2	6	1869484	1869489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224678
36222	NC_020062	ACCAC	2	10	1869509	1869518	40 %	0 %	0 %	60 %	440224678
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36224	NC_020062	ATA	2	6	1869569	1869574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224678
36225	NC_020062	GCTG	2	8	1869579	1869586	0 %	25 %	50 %	25 %	440224678
36226	NC_020062	GTC	2	6	1869763	1869768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224678
36227	NC_020062	GCC	2	6	1869799	1869804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224678
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36229	NC_020062	TTG	2	6	1869955	1869960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224678
36230	NC_020062	CGC	2	6	1869984	1869989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224678
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36232	NC_020062	CAT	2	6	1870149	1870154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224678
36233	NC_020062	GCC	2	6	1870246	1870251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224678
36234	NC_020062	GCC	2	6	1870273	1870278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224678
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36237	NC_020062	GCC	2	6	1870432	1870437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224678
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36336	NC_020062	CAT	2	6	1876423	1876428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224682
36337	NC_020062	ACC	2	6	1876445	1876450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224682
36338	NC_020062	GAT	2	6	1876528	1876533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224682
36339	NC_020062	GCGA	2	8	1876569	1876576	25 %	0 %	50 %	25 %	440224682
36340	NC_020062	GTT	2	6	1876620	1876625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224682
36341	NC_020062	CCG	3	9	1876674	1876682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224682
36342	NC_020062	GCAT	2	8	1876713	1876720	25 %	25 %	25 %	25 %	440224682
36343	NC_020062	GCG	2	6	1876851	1876856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224683
36344	NC_020062	CGA	2	6	1876866	1876871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224683
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36346	NC_020062	GAC	2	6	1876936	1876941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224683
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36348	NC_020062	GCT	3	9	1877082	1877090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224683
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36462	NC_020062	TC	3	6	1884031	1884036	0 %	50 %	0 %	50 %	440224690
36463	NC_020062	CG	3	6	1884048	1884053	0 %	0 %	50 %	50 %	440224690
36464	NC_020062	CGG	2	6	1884096	1884101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224690
36465	NC_020062	GCA	2	6	1884106	1884111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
36466	NC_020062	CGG	2	6	1884205	1884210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224690
36467	NC_020062	CAT	2	6	1884262	1884267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224690
36468	NC_020062	ACG	2	6	1884288	1884293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
36469	NC_020062	GC	3	6	1884315	1884320	0 %	0 %	50 %	50 %	440224690
36470	NC_020062	CGAG	2	8	1884397	1884404	25 %	0 %	50 %	25 %	440224690
36471	NC_020062	TCG	2	6	1884412	1884417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224690
36472	NC_020062	GCC	2	6	1884506	1884511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224690
36473	NC_020062	CGG	2	6	1884559	1884564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224690
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36475	NC_020062	GCG	2	6	1884619	1884624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224690
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36482	NC_020062	TCG	2	6	1884778	1884783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224690
36483	NC_020062	CAG	2	6	1884833	1884838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
36484	NC_020062	AGC	2	6	1884875	1884880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224690
36485	NC_020062	TCC	2	6	1884885	1884890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224690
36486	NC_020062	CG	3	6	1884893	1884898	0 %	0 %	50 %	50 %	440224690
36487	NC_020062	CGAT	2	8	1885018	1885025	25 %	25 %	25 %	25 %	440224690
36488	NC_020062	GCG	2	6	1885087	1885092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224691
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36490	NC_020062	GC	3	6	1885145	1885150	0 %	0 %	50 %	50 %	440224691
36491	NC_020062	CCG	2	6	1885163	1885168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224691
36492	NC_020062	CCGGG	2	10	1885206	1885215	0 %	0 %	60 %	40 %	440224691
36493	NC_020062	GCC	2	6	1885229	1885234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224691
36494	NC_020062	AGT	2	6	1885248	1885253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224691
36495	NC_020062	CG	3	6	1885316	1885321	0 %	0 %	50 %	50 %	440224691
36496	NC_020062	CCA	2	6	1885348	1885353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224691
36497	NC_020062	GAG	2	6	1885378	1885383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224691
36498	NC_020062	ACC	2	6	1885414	1885419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224691
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36500	NC_020062	ATC	2	6	1885532	1885537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224691

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