MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_020062	GAA	2	6	1755265	1755270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224574
34003	NC_020062	GCT	2	6	1755559	1755564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224575
34004	NC_020062	ATC	2	6	1755576	1755581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224575
34005	NC_020062	CGG	2	6	1755652	1755657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224575
34006	NC_020062	GCC	2	6	1755695	1755700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224575
34007	NC_020062	CCTT	2	8	1755723	1755730	0 %	50 %	0 %	50 %	440224575
34008	NC_020062	GCA	2	6	1755736	1755741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224575
34009	NC_020062	GAG	2	6	1755816	1755821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224575
34010	NC_020062	CG	3	6	1755877	1755882	0 %	0 %	50 %	50 %	440224575
34011	NC_020062	AGTTGA	2	12	1755940	1755951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224575
34012	NC_020062	CGG	2	6	1755970	1755975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224575
34013	NC_020062	CAG	2	6	1755980	1755985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224575
34014	NC_020062	GCG	2	6	1756051	1756056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224575
34015	NC_020062	CTT	2	6	1756097	1756102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224575
34016	NC_020062	TGA	2	6	1756105	1756110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224575
34017	NC_020062	GACG	2	8	1756141	1756148	25 %	0 %	50 %	25 %	440224575
34018	NC_020062	TCA	2	6	1756159	1756164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224575
34019	NC_020062	CTGA	2	8	1756196	1756203	25 %	25 %	25 %	25 %	440224575
34020	NC_020062	ATC	2	6	1756209	1756214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224575
34021	NC_020062	CTG	2	6	1756250	1756255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224575
34022	NC_020062	GCC	2	6	1756326	1756331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224575
34023	NC_020062	TGC	2	6	1756383	1756388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224575
34024	NC_020062	CCA	2	6	1756397	1756402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224575
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34029	NC_020062	GAG	2	6	1756586	1756591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224575
34030	NC_020062	TCGATC	2	12	1756614	1756625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224575
34031	NC_020062	GCG	2	6	1756678	1756683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224575
34032	NC_020062	GC	3	6	1756698	1756703	0 %	0 %	50 %	50 %	440224575
34033	NC_020062	TCC	2	6	1756722	1756727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224575
34034	NC_020062	CGT	2	6	1756759	1756764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224575
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34036	NC_020062	CG	3	6	1756933	1756938	0 %	0 %	50 %	50 %	440224575
34037	NC_020062	CG	3	6	1757261	1757266	0 %	0 %	50 %	50 %	440224576
34038	NC_020062	CAG	2	6	1757283	1757288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224576
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34043	NC_020062	CG	3	6	1757567	1757572	0 %	0 %	50 %	50 %	440224576
34044	NC_020062	GAG	2	6	1757605	1757610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224576
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34049	NC_020062	CGA	2	6	1757787	1757792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224576
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34052	NC_020062	GGA	2	6	1757874	1757879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224576
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34054	NC_020062	TCA	2	6	1758265	1758270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224577
34055	NC_020062	CAA	2	6	1758283	1758288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224577
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34059	NC_020062	AGCC	2	8	1758609	1758616	25 %	0 %	25 %	50 %	440224577
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34061	NC_020062	T	7	7	1758648	1758654	0 %	100 %	0 %	0 %	440224577
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34064	NC_020062	GC	3	6	1758786	1758791	0 %	0 %	50 %	50 %	440224577
34065	NC_020062	GGCA	2	8	1758814	1758821	25 %	0 %	50 %	25 %	440224577
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34089	NC_020062	ACG	2	6	1760835	1760840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224581
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34092	NC_020062	GC	3	6	1760912	1760917	0 %	0 %	50 %	50 %	440224581
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34098	NC_020062	CGACGG	2	12	1761241	1761252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224581
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34105	NC_020062	ACG	2	6	1761576	1761581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224581
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34114	NC_020062	CAC	2	6	1762081	1762086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224582
34115	NC_020062	AAG	2	6	1762128	1762133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224582
34116	NC_020062	CTC	2	6	1762161	1762166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224582
34117	NC_020062	ATCC	2	8	1762187	1762194	25 %	25 %	0 %	50 %	440224582
34118	NC_020062	GCAA	2	8	1762214	1762221	50 %	0 %	25 %	25 %	440224582
34119	NC_020062	GCC	2	6	1762233	1762238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224582
34120	NC_020062	AAG	2	6	1762239	1762244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224582
34121	NC_020062	GCA	2	6	1762325	1762330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224582
34122	NC_020062	CCGG	2	8	1762359	1762366	0 %	0 %	50 %	50 %	440224582
34123	NC_020062	CGG	2	6	1762421	1762426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224582
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34126	NC_020062	CCGG	2	8	1762635	1762642	0 %	0 %	50 %	50 %	440224582
34127	NC_020062	CGA	2	6	1762717	1762722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224582
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34129	NC_020062	GAC	2	6	1762739	1762744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224582
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34138	NC_020062	TGA	2	6	1763023	1763028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224582
34139	NC_020062	CTG	2	6	1763045	1763050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224582
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34141	NC_020062	CTG	2	6	1763196	1763201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224583
34142	NC_020062	CGT	2	6	1763213	1763218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224583
34143	NC_020062	CTGG	2	8	1763261	1763268	0 %	25 %	50 %	25 %	440224583
34144	NC_020062	GC	3	6	1763284	1763289	0 %	0 %	50 %	50 %	440224583
34145	NC_020062	CTG	2	6	1763358	1763363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224583
34146	NC_020062	CGGG	2	8	1763435	1763442	0 %	0 %	75 %	25 %	440224583
34147	NC_020062	CGC	2	6	1763489	1763494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224583
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34152	NC_020062	TCG	2	6	1763671	1763676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224583
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34186	NC_020062	CTC	2	6	1765350	1765355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224585
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34200	NC_020062	CAAGC	2	10	1765996	1766005	40 %	0 %	20 %	40 %	440224586
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34216	NC_020062	TCG	2	6	1766918	1766923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224586
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34219	NC_020062	ATC	2	6	1767031	1767036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224586
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34227	NC_020062	CGG	2	6	1767373	1767378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224587
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34229	NC_020062	GGC	2	6	1767442	1767447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224587
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34231	NC_020062	GCG	2	6	1767522	1767527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224587
34232	NC_020062	CTGG	2	8	1767670	1767677	0 %	25 %	50 %	25 %	440224587
34233	NC_020062	TCG	2	6	1767776	1767781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224587
34234	NC_020062	AGC	2	6	1767788	1767793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224587
34235	NC_020062	GCA	2	6	1767798	1767803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224587
34236	NC_020062	CTGGCG	2	12	1767818	1767829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440224587
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34344	NC_020062	TCT	2	6	1773608	1773613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224592
34345	NC_020062	GCAA	2	8	1773631	1773638	50 %	0 %	25 %	25 %	440224592
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34347	NC_020062	TGC	2	6	1773680	1773685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224592
34348	NC_020062	GAC	2	6	1773705	1773710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224592
34349	NC_020062	GAT	2	6	1773725	1773730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224592
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34351	NC_020062	GT	3	6	1773830	1773835	0 %	50 %	50 %	0 %	440224592
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34463	NC_020062	TGC	2	6	1780961	1780966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224600
34464	NC_020062	CGAT	2	8	1780975	1780982	25 %	25 %	25 %	25 %	440224600
34465	NC_020062	CGAC	2	8	1780992	1780999	25 %	0 %	25 %	50 %	440224600
34466	NC_020062	GA	3	6	1781003	1781008	50 %	0 %	50 %	0 %	440224600
34467	NC_020062	CGT	2	6	1781379	1781384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224601
34468	NC_020062	TGC	2	6	1781591	1781596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224601
34469	NC_020062	GGC	2	6	1781664	1781669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224601
34470	NC_020062	GC	3	6	1781767	1781772	0 %	0 %	50 %	50 %	440224601
34471	NC_020062	GCC	2	6	1781860	1781865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224601
34472	NC_020062	TCG	2	6	1781896	1781901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224601
34473	NC_020062	GCC	3	9	1781932	1781940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224601
34474	NC_020062	GCC	2	6	1782009	1782014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224601
34475	NC_020062	TCGG	2	8	1782028	1782035	0 %	25 %	50 %	25 %	440224601
34476	NC_020062	CGG	2	6	1782045	1782050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224601
34477	NC_020062	TCGAAG	2	12	1782086	1782097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440224601
34478	NC_020062	GCA	2	6	1782124	1782129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224601
34479	NC_020062	GAG	2	6	1782193	1782198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224601
34480	NC_020062	CTG	2	6	1782250	1782255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224601
34481	NC_020062	TCGC	2	8	1782362	1782369	0 %	25 %	25 %	50 %	440224601
34482	NC_020062	CA	3	6	1782371	1782376	50 %	0 %	0 %	50 %	440224601
34483	NC_020062	CGAA	2	8	1782380	1782387	50 %	0 %	25 %	25 %	440224601
34484	NC_020062	CACG	2	8	1782396	1782403	25 %	0 %	25 %	50 %	440224601
34485	NC_020062	CGT	2	6	1782442	1782447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224601
34486	NC_020062	CGC	2	6	1782514	1782519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
34487	NC_020062	CGTC	2	8	1782584	1782591	0 %	25 %	25 %	50 %	440224602
34488	NC_020062	GAC	2	6	1782634	1782639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224602
34489	NC_020062	ATG	2	6	1782763	1782768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224602
34490	NC_020062	CCT	2	6	1782815	1782820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224602
34491	NC_020062	CAGC	2	8	1782825	1782832	25 %	0 %	25 %	50 %	440224602
34492	NC_020062	GCC	2	6	1782871	1782876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
34493	NC_020062	CGC	2	6	1782880	1782885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
34494	NC_020062	CCT	2	6	1783059	1783064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224602
34495	NC_020062	CGA	2	6	1783074	1783079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224602
34496	NC_020062	CTG	2	6	1783177	1783182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224602
34497	NC_020062	CTG	2	6	1783282	1783287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224602
34498	NC_020062	CGC	2	6	1783289	1783294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224602
34499	NC_020062	ACA	2	6	1783343	1783348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224602
34500	NC_020062	TCG	2	6	1783385	1783390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224602

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