MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_020062	TGA	2	6	1730389	1730394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224553
33502	NC_020062	GA	3	6	1730393	1730398	50 %	0 %	50 %	0 %	440224553
33503	NC_020062	GCC	2	6	1730399	1730404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33504	NC_020062	TCG	2	6	1730424	1730429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33505	NC_020062	ACG	2	6	1730462	1730467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33506	NC_020062	TCCA	2	8	1730495	1730502	25 %	25 %	0 %	50 %	440224553
33507	NC_020062	TCG	2	6	1730511	1730516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33508	NC_020062	CAC	2	6	1730614	1730619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224553
33509	NC_020062	CTG	2	6	1730654	1730659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33510	NC_020062	T	6	6	1730666	1730671	0 %	100 %	0 %	0 %	440224553
33511	NC_020062	CCT	2	6	1730682	1730687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224553
33512	NC_020062	CTTT	2	8	1730695	1730702	0 %	75 %	0 %	25 %	440224553
33513	NC_020062	G	6	6	1730705	1730710	0 %	0 %	100 %	0 %	440224553
33514	NC_020062	GATC	2	8	1730745	1730752	25 %	25 %	25 %	25 %	440224553
33515	NC_020062	GCG	2	6	1730800	1730805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224553
33516	NC_020062	GCG	2	6	1730812	1730817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224553
33517	NC_020062	GCT	2	6	1730845	1730850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33518	NC_020062	CATCG	2	10	1730852	1730861	20 %	20 %	20 %	40 %	440224553
33519	NC_020062	TCG	2	6	1730919	1730924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33520	NC_020062	GAG	2	6	1730951	1730956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224553
33521	NC_020062	CGT	2	6	1730971	1730976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33522	NC_020062	GCT	2	6	1730992	1730997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33523	NC_020062	CCA	2	6	1731010	1731015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224553
33524	NC_020062	CGCC	2	8	1731148	1731155	0 %	0 %	25 %	75 %	440224553
33525	NC_020062	CGA	2	6	1731163	1731168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33526	NC_020062	CG	3	6	1731187	1731192	0 %	0 %	50 %	50 %	440224553
33527	NC_020062	CG	3	6	1731301	1731306	0 %	0 %	50 %	50 %	440224553
33528	NC_020062	CGG	2	6	1731360	1731365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224553
33529	NC_020062	TGC	2	6	1731369	1731374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33530	NC_020062	TCT	2	6	1731385	1731390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224553
33531	NC_020062	GGT	2	6	1731445	1731450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224553
33532	NC_020062	CGA	2	6	1731454	1731459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33533	NC_020062	CCG	2	6	1731474	1731479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33534	NC_020062	AGC	2	6	1731542	1731547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33535	NC_020062	TCA	2	6	1731555	1731560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224553
33536	NC_020062	GCC	2	6	1731563	1731568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33537	NC_020062	CGA	2	6	1731629	1731634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33538	NC_020062	TCG	2	6	1731645	1731650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33539	NC_020062	GGA	2	6	1731661	1731666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224553
33540	NC_020062	CAC	2	6	1731839	1731844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224554
33541	NC_020062	TGA	2	6	1731895	1731900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224554
33542	NC_020062	ATG	2	6	1731927	1731932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224554
33543	NC_020062	TCG	2	6	1731967	1731972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224554
33544	NC_020062	CAT	2	6	1731974	1731979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224554
33545	NC_020062	GTG	2	6	1732052	1732057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224554
33546	NC_020062	GCG	2	6	1732076	1732081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224554
33547	NC_020062	CGGTGC	2	12	1732116	1732127	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440224554
33548	NC_020062	GA	3	6	1732154	1732159	50 %	0 %	50 %	0 %	440224554
33549	NC_020062	CTGAC	2	10	1732315	1732324	20 %	20 %	20 %	40 %	440224554
33550	NC_020062	ACG	2	6	1732339	1732344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224554
33551	NC_020062	CTGC	2	8	1732365	1732372	0 %	25 %	25 %	50 %	440224554
33552	NC_020062	GCC	2	6	1732374	1732379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224554
33553	NC_020062	GCG	2	6	1732396	1732401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224554
33554	NC_020062	CCG	2	6	1732418	1732423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224554
33555	NC_020062	CGG	2	6	1732481	1732486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224554
33556	NC_020062	ATC	2	6	1732713	1732718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224554
33557	NC_020062	ACC	2	6	1732731	1732736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224554
33558	NC_020062	CGG	2	6	1732784	1732789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224554
33559	NC_020062	AGC	2	6	1732810	1732815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224554
33560	NC_020062	CAAA	2	8	1732848	1732855	75 %	0 %	0 %	25 %	440224554
33561	NC_020062	CAAT	2	8	1733501	1733508	50 %	25 %	0 %	25 %	440224555
33562	NC_020062	GTC	2	6	1733535	1733540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224555
33563	NC_020062	CGG	2	6	1733608	1733613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
33564	NC_020062	GC	3	6	1733633	1733638	0 %	0 %	50 %	50 %	440224555
33565	NC_020062	GAA	2	6	1733667	1733672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224555
33566	NC_020062	GGTTC	2	10	1733691	1733700	0 %	40 %	40 %	20 %	440224555
33567	NC_020062	GCA	2	6	1733781	1733786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224555
33568	NC_020062	TGA	2	6	1733848	1733853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224555
33569	NC_020062	GCT	2	6	1733870	1733875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224555
33570	NC_020062	GCG	2	6	1733898	1733903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
33571	NC_020062	GAA	2	6	1733936	1733941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224555
33572	NC_020062	GGCTG	2	10	1733975	1733984	0 %	20 %	60 %	20 %	440224555
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33574	NC_020062	CTGT	2	8	1734015	1734022	0 %	50 %	25 %	25 %	440224555
33575	NC_020062	CGG	2	6	1734047	1734052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
33576	NC_020062	CGG	2	6	1734214	1734219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224555
33577	NC_020062	GC	3	6	1734288	1734293	0 %	0 %	50 %	50 %	440224555
33578	NC_020062	GAA	2	6	1734321	1734326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224555
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33582	NC_020062	GA	3	6	1734586	1734591	50 %	0 %	50 %	0 %	440224555
33583	NC_020062	GA	3	6	1734631	1734636	50 %	0 %	50 %	0 %	440224555
33584	NC_020062	GGCT	2	8	1734693	1734700	0 %	25 %	50 %	25 %	440224555
33585	NC_020062	GCGA	2	8	1734763	1734770	25 %	0 %	50 %	25 %	440224555
33586	NC_020062	GC	3	6	1734818	1734823	0 %	0 %	50 %	50 %	440224555
33587	NC_020062	CCA	2	6	1734829	1734834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224555
33588	NC_020062	CGC	3	9	1734842	1734850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224555
33589	NC_020062	ATC	2	6	1735350	1735355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224556
33590	NC_020062	CGT	2	6	1735383	1735388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224556
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33592	NC_020062	ATC	2	6	1735432	1735437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224556
33593	NC_020062	GCGG	2	8	1735463	1735470	0 %	0 %	75 %	25 %	440224556
33594	NC_020062	GGC	2	6	1735472	1735477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224556
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33598	NC_020062	AGG	2	6	1735642	1735647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224556
33599	NC_020062	CT	3	6	1735674	1735679	0 %	50 %	0 %	50 %	440224556
33600	NC_020062	AG	3	6	1735702	1735707	50 %	0 %	50 %	0 %	440224556
33601	NC_020062	GACC	2	8	1735873	1735880	25 %	0 %	25 %	50 %	440224557
33602	NC_020062	CTG	2	6	1735886	1735891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224557
33603	NC_020062	GCCG	2	8	1735910	1735917	0 %	0 %	50 %	50 %	440224557
33604	NC_020062	GCT	2	6	1736062	1736067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224557
33605	NC_020062	GCA	2	6	1736071	1736076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224557
33606	NC_020062	TGA	2	6	1736109	1736114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224557
33607	NC_020062	GC	3	6	1736120	1736125	0 %	0 %	50 %	50 %	440224557
33608	NC_020062	TTCC	2	8	1736337	1736344	0 %	50 %	0 %	50 %	440224557
33609	NC_020062	GCC	2	6	1736378	1736383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224557
33610	NC_020062	CGT	2	6	1736392	1736397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224557
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33612	NC_020062	TCG	2	6	1736511	1736516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224557
33613	NC_020062	CGA	2	6	1736527	1736532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224557
33614	NC_020062	GGC	2	6	1736633	1736638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224557
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33616	NC_020062	CGC	2	6	1736734	1736739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224557
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33727	NC_020062	TGC	2	6	1741931	1741936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224562
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33730	NC_020062	GC	3	6	1742130	1742135	0 %	0 %	50 %	50 %	440224562
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