MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_020062	GCG	2	6	1703217	1703222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224524
33003	NC_020062	CGGC	2	8	1703309	1703316	0 %	0 %	50 %	50 %	440224524
33004	NC_020062	GGC	2	6	1703337	1703342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224524
33005	NC_020062	GC	3	6	1703395	1703400	0 %	0 %	50 %	50 %	440224524
33006	NC_020062	GTC	2	6	1703446	1703451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224524
33007	NC_020062	GAACT	2	10	1703487	1703496	40 %	20 %	20 %	20 %	440224524
33008	NC_020062	ACG	2	6	1703605	1703610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224524
33009	NC_020062	CGG	2	6	1703669	1703674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224524
33010	NC_020062	CGA	2	6	1703713	1703718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224524
33011	NC_020062	GCGG	2	8	1703777	1703784	0 %	0 %	75 %	25 %	440224525
33012	NC_020062	ATT	2	6	1703850	1703855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224525
33013	NC_020062	CGA	2	6	1703857	1703862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224525
33014	NC_020062	AGC	2	6	1703874	1703879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224525
33015	NC_020062	GCA	2	6	1703943	1703948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224525
33016	NC_020062	TGA	2	6	1703962	1703967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224525
33017	NC_020062	CAAG	2	8	1704190	1704197	50 %	0 %	25 %	25 %	440224525
33018	NC_020062	GTA	2	6	1704206	1704211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224525
33019	NC_020062	GAC	2	6	1704212	1704217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224525
33020	NC_020062	GCG	2	6	1704235	1704240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224525
33021	NC_020062	GAT	2	6	1704267	1704272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224525
33022	NC_020062	GC	3	6	1704302	1704307	0 %	0 %	50 %	50 %	440224525
33023	NC_020062	CCG	2	6	1704336	1704341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224525
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33028	NC_020062	TCGC	2	8	1704664	1704671	0 %	25 %	25 %	50 %	440224526
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33030	NC_020062	CGC	3	9	1704766	1704774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224526
33031	NC_020062	GAT	2	6	1704776	1704781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224526
33032	NC_020062	GAT	2	6	1704818	1704823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224526
33033	NC_020062	GAA	2	6	1704878	1704883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224526
33034	NC_020062	GAC	2	6	1704911	1704916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224526
33035	NC_020062	CGA	2	6	1704919	1704924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224526
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33040	NC_020062	GACCGA	2	12	1705242	1705253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224527
33041	NC_020062	TGC	2	6	1705254	1705259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224527
33042	NC_020062	CCG	2	6	1705349	1705354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224527
33043	NC_020062	TCG	2	6	1705411	1705416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224527
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33051	NC_020062	GTA	2	6	1705815	1705820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224527
33052	NC_020062	TCAGCC	2	12	1705844	1705855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440224527
33053	NC_020062	GCCC	2	8	1705869	1705876	0 %	0 %	25 %	75 %	440224527
33054	NC_020062	TCG	2	6	1705987	1705992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224528
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33056	NC_020062	CGGTG	2	10	1706017	1706026	0 %	20 %	60 %	20 %	440224528
33057	NC_020062	CG	3	6	1706067	1706072	0 %	0 %	50 %	50 %	440224528
33058	NC_020062	TGA	2	6	1706131	1706136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224528
33059	NC_020062	GCA	2	6	1706188	1706193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224528
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33061	NC_020062	CGT	2	6	1706396	1706401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224528
33062	NC_020062	TTC	2	6	1706405	1706410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224528
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33065	NC_020062	GCG	2	6	1706531	1706536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224528
33066	NC_020062	TGC	2	6	1706557	1706562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224528
33067	NC_020062	GACGC	2	10	1706599	1706608	20 %	0 %	40 %	40 %	440224528
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33087	NC_020062	CGA	2	6	1708128	1708133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224530
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33099	NC_020062	GCG	2	6	1708532	1708537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224530
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33115	NC_020062	CGG	2	6	1709686	1709691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224532
33116	NC_020062	CGG	2	6	1709711	1709716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224532
33117	NC_020062	C	6	6	1709778	1709783	0 %	0 %	0 %	100 %	440224532
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33224	NC_020062	GTC	2	6	1714820	1714825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224536
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33226	NC_020062	CTA	2	6	1714873	1714878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224536
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33228	NC_020062	CGC	2	6	1714974	1714979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224536
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33230	NC_020062	GCC	3	9	1715036	1715044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224536
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33233	NC_020062	CGG	3	9	1715176	1715184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224536
33234	NC_020062	CCA	2	6	1715196	1715201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224536
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33237	NC_020062	ATC	2	6	1715297	1715302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224536
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33244	NC_020062	CTG	2	6	1715425	1715430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224537
33245	NC_020062	TCT	2	6	1715477	1715482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224537
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33348	NC_020062	CCG	2	6	1720341	1720346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224541
33349	NC_020062	GC	3	6	1720636	1720641	0 %	0 %	50 %	50 %	440224542
33350	NC_020062	GCG	2	6	1720737	1720742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224542
33351	NC_020062	AAGG	2	8	1720762	1720769	50 %	0 %	50 %	0 %	440224542
33352	NC_020062	GCG	2	6	1720921	1720926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224542
33353	NC_020062	GCT	2	6	1720936	1720941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224542
33354	NC_020062	CAA	2	6	1720973	1720978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224542
33355	NC_020062	CAG	2	6	1721008	1721013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224542
33356	NC_020062	TTC	2	6	1721023	1721028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224542
33357	NC_020062	GAT	2	6	1721224	1721229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224542
33358	NC_020062	CCG	2	6	1721253	1721258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224542
33359	NC_020062	A	6	6	1721265	1721270	100 %	0 %	0 %	0 %	440224542
33360	NC_020062	CGC	2	6	1721324	1721329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224542
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33364	NC_020062	AAG	3	9	1721515	1721523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224543
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33368	NC_020062	CG	3	6	1721626	1721631	0 %	0 %	50 %	50 %	440224543
33369	NC_020062	GGC	2	6	1721641	1721646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224543
33370	NC_020062	CAT	2	6	1721655	1721660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224543
33371	NC_020062	TGC	2	6	1721715	1721720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224543
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33375	NC_020062	CAA	2	6	1722147	1722152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224543
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33377	NC_020062	GCCC	2	8	1722243	1722250	0 %	0 %	25 %	75 %	440224543
33378	NC_020062	CGT	2	6	1722270	1722275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224543
33379	NC_020062	GAC	2	6	1722290	1722295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224543
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33384	NC_020062	GCC	2	6	1722838	1722843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224544
33385	NC_020062	GCG	2	6	1722844	1722849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224544
33386	NC_020062	CGGG	2	8	1722850	1722857	0 %	0 %	75 %	25 %	440224544
33387	NC_020062	TCG	2	6	1722887	1722892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224544
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33401	NC_020062	GCC	2	6	1723740	1723745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224545
33402	NC_020062	A	6	6	1723777	1723782	100 %	0 %	0 %	0 %	440224545
33403	NC_020062	TGA	2	6	1723916	1723921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224545
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33405	NC_020062	ACC	2	6	1723987	1723992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224545
33406	NC_020062	CTG	2	6	1724065	1724070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224545
33407	NC_020062	AG	3	6	1724079	1724084	50 %	0 %	50 %	0 %	440224545
33408	NC_020062	CAGA	2	8	1724103	1724110	50 %	0 %	25 %	25 %	440224545
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33411	NC_020062	TGA	2	6	1724398	1724403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224545
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33414	NC_020062	CG	3	6	1724524	1724529	0 %	0 %	50 %	50 %	440224545
33415	NC_020062	CGGC	2	8	1724546	1724553	0 %	0 %	50 %	50 %	440224545
33416	NC_020062	CGC	2	6	1724567	1724572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224545
33417	NC_020062	TGGCG	2	10	1724615	1724624	0 %	20 %	60 %	20 %	440224545
33418	NC_020062	TGA	2	6	1724871	1724876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224546
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33432	NC_020062	TGC	2	6	1725427	1725432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224546
33433	NC_020062	CCG	2	6	1725443	1725448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224546
33434	NC_020062	CGC	2	6	1725475	1725480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224546
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33440	NC_020062	ATC	2	6	1725764	1725769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224546
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33447	NC_020062	CAG	2	6	1726221	1726226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224547
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33450	NC_020062	CCG	2	6	1726541	1726546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224547
33451	NC_020062	CGC	2	6	1726556	1726561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224547
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33453	NC_020062	CGA	2	6	1726656	1726661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224547
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33456	NC_020062	GCT	2	6	1726962	1726967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224547
33457	NC_020062	GGC	2	6	1726995	1727000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224547
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33461	NC_020062	TTCA	2	8	1727801	1727808	25 %	50 %	0 %	25 %	440224548
33462	NC_020062	TGA	2	6	1727812	1727817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224548
33463	NC_020062	GCA	2	6	1727820	1727825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224548
33464	NC_020062	GC	3	6	1727857	1727862	0 %	0 %	50 %	50 %	440224548
33465	NC_020062	AGA	2	6	1727889	1727894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224548
33466	NC_020062	CCGG	2	8	1728090	1728097	0 %	0 %	50 %	50 %	440224549
33467	NC_020062	TGC	2	6	1728164	1728169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224549
33468	NC_020062	GAGCG	2	10	1728223	1728232	20 %	0 %	60 %	20 %	440224549
33469	NC_020062	TCG	2	6	1728268	1728273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224549
33470	NC_020062	ACA	2	6	1728402	1728407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224550
33471	NC_020062	GC	3	6	1728508	1728513	0 %	0 %	50 %	50 %	440224550
33472	NC_020062	CCG	2	6	1728535	1728540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224550
33473	NC_020062	CG	4	8	1728539	1728546	0 %	0 %	50 %	50 %	440224550
33474	NC_020062	TGC	2	6	1728582	1728587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224550
33475	NC_020062	GAA	3	9	1728595	1728603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224550
33476	NC_020062	GAC	2	6	1728734	1728739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224551
33477	NC_020062	AGA	3	9	1728784	1728792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224551
33478	NC_020062	CG	3	6	1728804	1728809	0 %	0 %	50 %	50 %	440224551
33479	NC_020062	GCCTGC	2	12	1728827	1728838	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224551
33480	NC_020062	A	6	6	1728848	1728853	100 %	0 %	0 %	0 %	440224551
33481	NC_020062	TCGC	2	8	1729094	1729101	0 %	25 %	25 %	50 %	440224552
33482	NC_020062	TCA	2	6	1729171	1729176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224552
33483	NC_020062	GCA	2	6	1729525	1729530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33484	NC_020062	CGT	2	6	1729537	1729542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33485	NC_020062	GAC	2	6	1729570	1729575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33486	NC_020062	TCC	2	6	1729591	1729596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224553
33487	NC_020062	GCC	2	6	1729781	1729786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33488	NC_020062	CGC	2	6	1729827	1729832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33489	NC_020062	CGT	2	6	1729837	1729842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224553
33490	NC_020062	ATG	2	6	1729893	1729898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224553
33491	NC_020062	T	6	6	1729902	1729907	0 %	100 %	0 %	0 %	440224553
33492	NC_020062	GGT	2	6	1729930	1729935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224553
33493	NC_020062	GCC	2	6	1729972	1729977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33494	NC_020062	GCC	2	6	1730023	1730028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224553
33495	NC_020062	CGG	2	6	1730118	1730123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224553
33496	NC_020062	GC	3	6	1730128	1730133	0 %	0 %	50 %	50 %	440224553
33497	NC_020062	AGC	2	6	1730160	1730165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224553
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33499	NC_020062	AT	3	6	1730344	1730349	50 %	50 %	0 %	0 %	440224553
33500	NC_020062	GCAA	2	8	1730354	1730361	50 %	0 %	25 %	25 %	440224553

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