MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_020062	AGA	2	6	1676525	1676530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224494
32503	NC_020062	CGA	2	6	1676552	1676557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224494
32504	NC_020062	TGC	2	6	1676566	1676571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224494
32505	NC_020062	TGA	2	6	1676612	1676617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224494
32506	NC_020062	CCG	2	6	1676627	1676632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224494
32507	NC_020062	TCA	2	6	1676639	1676644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224494
32508	NC_020062	GCA	2	6	1676672	1676677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224494
32509	NC_020062	TGA	2	6	1676711	1676716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224494
32510	NC_020062	CG	3	6	1676723	1676728	0 %	0 %	50 %	50 %	440224494
32511	NC_020062	GGCA	2	8	1676841	1676848	25 %	0 %	50 %	25 %	440224494
32512	NC_020062	GCC	2	6	1676877	1676882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224494
32513	NC_020062	ATA	2	6	1676883	1676888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224494
32514	NC_020062	GCA	2	6	1676924	1676929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224494
32515	NC_020062	GCC	2	6	1676967	1676972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224494
32516	NC_020062	GCC	2	6	1677143	1677148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224495
32517	NC_020062	ACC	2	6	1677159	1677164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224495
32518	NC_020062	GATA	2	8	1677178	1677185	50 %	25 %	25 %	0 %	440224495
32519	NC_020062	GGCC	2	8	1677187	1677194	0 %	0 %	50 %	50 %	440224495
32520	NC_020062	TGC	2	6	1677223	1677228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224495
32521	NC_020062	CGA	2	6	1677259	1677264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224495
32522	NC_020062	CGA	2	6	1677284	1677289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224495
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32524	NC_020062	GCG	2	6	1677379	1677384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224495
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32532	NC_020062	CGC	2	6	1677574	1677579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224495
32533	NC_020062	A	6	6	1677581	1677586	100 %	0 %	0 %	0 %	440224495
32534	NC_020062	TGA	2	6	1677589	1677594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224495
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32541	NC_020062	TTGCC	2	10	1678223	1678232	0 %	40 %	20 %	40 %	440224496
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32550	NC_020062	CCAA	2	8	1678639	1678646	50 %	0 %	0 %	50 %	440224496
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32554	NC_020062	GCT	2	6	1678999	1679004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224497
32555	NC_020062	CGT	2	6	1679078	1679083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224497
32556	NC_020062	CTGC	2	8	1679278	1679285	0 %	25 %	25 %	50 %	440224497
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32558	NC_020062	CAT	3	9	1679323	1679331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224497
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32560	NC_020062	GCCT	2	8	1679492	1679499	0 %	25 %	25 %	50 %	440224497
32561	NC_020062	AGC	2	6	1679525	1679530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224497
32562	NC_020062	CATC	2	8	1679554	1679561	25 %	25 %	0 %	50 %	440224497
32563	NC_020062	GA	3	6	1679603	1679608	50 %	0 %	50 %	0 %	440224497
32564	NC_020062	CAG	2	6	1679661	1679666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224498
32565	NC_020062	TCAG	2	8	1679765	1679772	25 %	25 %	25 %	25 %	440224498
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32568	NC_020062	CGT	2	6	1679964	1679969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224498
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32584	NC_020062	GC	3	6	1680565	1680570	0 %	0 %	50 %	50 %	440224498
32585	NC_020062	CCT	2	6	1680759	1680764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224499
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32587	NC_020062	GGC	2	6	1680838	1680843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224499
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32589	NC_020062	GCT	2	6	1680949	1680954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224499
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32597	NC_020062	GACAAG	2	12	1681259	1681270	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440224499
32598	NC_020062	CAC	2	6	1681271	1681276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224499
32599	NC_020062	CG	3	6	1681327	1681332	0 %	0 %	50 %	50 %	440224499
32600	NC_020062	ATC	2	6	1681352	1681357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224499
32601	NC_020062	GGCG	2	8	1681363	1681370	0 %	0 %	75 %	25 %	440224499
32602	NC_020062	GGC	2	6	1681393	1681398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224499
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32605	NC_020062	CCGAGG	2	12	1681548	1681559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224499
32606	NC_020062	GCG	2	6	1681647	1681652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224499
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32608	NC_020062	CG	4	8	1681707	1681714	0 %	0 %	50 %	50 %	440224499
32609	NC_020062	CGA	2	6	1681720	1681725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224499
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32613	NC_020062	CGGT	2	8	1682129	1682136	0 %	25 %	50 %	25 %	440224500
32614	NC_020062	TCC	2	6	1682230	1682235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224500
32615	NC_020062	CAG	2	6	1682293	1682298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224500
32616	NC_020062	GACG	2	8	1682323	1682330	25 %	0 %	50 %	25 %	440224500
32617	NC_020062	GGT	2	6	1682360	1682365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224500
32618	NC_020062	GCC	2	6	1682383	1682388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224500
32619	NC_020062	GCT	2	6	1682508	1682513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224500
32620	NC_020062	GGC	2	6	1682524	1682529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224500
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32622	NC_020062	TGA	2	6	1682553	1682558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224500
32623	NC_020062	GGCAAA	2	12	1682614	1682625	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440224501
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32626	NC_020062	GAC	2	6	1682714	1682719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224501
32627	NC_020062	CAGC	3	12	1682780	1682791	25 %	0 %	25 %	50 %	440224501
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32633	NC_020062	CCAG	2	8	1683120	1683127	25 %	0 %	25 %	50 %	440224501
32634	NC_020062	AGC	2	6	1683164	1683169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224501
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32641	NC_020062	GCCG	2	8	1683424	1683431	0 %	0 %	50 %	50 %	440224501
32642	NC_020062	GGC	2	6	1683484	1683489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224501
32643	NC_020062	GCA	2	6	1683501	1683506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224501
32644	NC_020062	TGT	2	6	1683545	1683550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224501
32645	NC_020062	GCA	2	6	1683573	1683578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224501
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32649	NC_020062	GC	3	6	1683858	1683863	0 %	0 %	50 %	50 %	440224502
32650	NC_020062	GGC	2	6	1683883	1683888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224502
32651	NC_020062	CGA	2	6	1683897	1683902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224502
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32654	NC_020062	CGA	2	6	1684011	1684016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224502
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32667	NC_020062	TCGACA	2	12	1684637	1684648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440224502
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32704	NC_020062	GATC	2	8	1686280	1686287	25 %	25 %	25 %	25 %	440224505
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32719	NC_020062	ACC	2	6	1687071	1687076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224506
32720	NC_020062	GGC	2	6	1687152	1687157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224506
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32722	NC_020062	GA	3	6	1687236	1687241	50 %	0 %	50 %	0 %	440224506
32723	NC_020062	GGC	2	6	1687266	1687271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224506
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32725	NC_020062	CCG	2	6	1687354	1687359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224506
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32727	NC_020062	GAT	2	6	1687451	1687456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224506
32728	NC_020062	GTT	2	6	1687473	1687478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224506
32729	NC_020062	GA	3	6	1687489	1687494	50 %	0 %	50 %	0 %	440224506
32730	NC_020062	GCC	2	6	1687536	1687541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224506
32731	NC_020062	TTC	2	6	1688165	1688170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224507
32732	NC_020062	CGG	2	6	1688199	1688204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224507
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32804	NC_020062	CGA	2	6	1692312	1692317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224512
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32828	NC_020062	GCCC	2	8	1693362	1693369	0 %	0 %	25 %	75 %	440224513
32829	NC_020062	TCA	2	6	1693425	1693430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224513
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32833	NC_020062	AGC	2	6	1693550	1693555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224513
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32841	NC_020062	GC	3	6	1693943	1693948	0 %	0 %	50 %	50 %	440224513
32842	NC_020062	AAGCC	2	10	1693967	1693976	40 %	0 %	20 %	40 %	440224513
32843	NC_020062	TTG	2	6	1694057	1694062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224513
32844	NC_020062	GTA	2	6	1694197	1694202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224514
32845	NC_020062	CTTC	2	8	1694223	1694230	0 %	50 %	0 %	50 %	440224514
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32847	NC_020062	CGG	2	6	1694262	1694267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224514
32848	NC_020062	CGA	2	6	1694280	1694285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224514
32849	NC_020062	CGG	2	6	1694391	1694396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224514
32850	NC_020062	TTG	2	6	1694408	1694413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224514
32851	NC_020062	GCA	2	6	1694434	1694439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224514
32852	NC_020062	CAT	2	6	1694485	1694490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224514
32853	NC_020062	GCT	2	6	1694510	1694515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224514
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32855	NC_020062	AAGG	2	8	1694701	1694708	50 %	0 %	50 %	0 %	440224514
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32933	NC_020062	AATC	2	8	1698615	1698622	50 %	25 %	0 %	25 %	440224517
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32950	NC_020062	CAG	2	6	1700025	1700030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224519
32951	NC_020062	TC	3	6	1700066	1700071	0 %	50 %	0 %	50 %	440224519
32952	NC_020062	CGCC	2	8	1700117	1700124	0 %	0 %	25 %	75 %	440224519
32953	NC_020062	GAT	2	6	1700172	1700177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224519
32954	NC_020062	ATC	2	6	1700200	1700205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224519
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32956	NC_020062	GCG	2	6	1700296	1700301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224519
32957	NC_020062	GCCCC	2	10	1700342	1700351	0 %	0 %	20 %	80 %	440224519
32958	NC_020062	CTT	2	6	1700393	1700398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224520
32959	NC_020062	TGG	2	6	1700499	1700504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224520
32960	NC_020062	AGCG	2	8	1700585	1700592	25 %	0 %	50 %	25 %	440224520
32961	NC_020062	TGA	2	6	1700617	1700622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224520
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32963	NC_020062	GAG	2	6	1700792	1700797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224520
32964	NC_020062	GAT	2	6	1700825	1700830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224520
32965	NC_020062	GCCG	2	8	1700935	1700942	0 %	0 %	50 %	50 %	440224521
32966	NC_020062	CG	3	6	1700970	1700975	0 %	0 %	50 %	50 %	440224521
32967	NC_020062	CAG	2	6	1700993	1700998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224521
32968	NC_020062	GGC	2	6	1701019	1701024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224521
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32970	NC_020062	GAT	2	6	1701218	1701223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224521
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32972	NC_020062	GCC	2	6	1701339	1701344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224522
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32974	NC_020062	CTG	2	6	1701386	1701391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224522
32975	NC_020062	GGCGT	2	10	1701510	1701519	0 %	20 %	60 %	20 %	440224522
32976	NC_020062	GCA	2	6	1701546	1701551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224522
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32981	NC_020062	ATGG	2	8	1701895	1701902	25 %	25 %	50 %	0 %	440224522
32982	NC_020062	CTCGTA	2	12	1701998	1702009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224522
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32986	NC_020062	GAT	2	6	1702211	1702216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224523
32987	NC_020062	TCG	2	6	1702371	1702376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224523
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32991	NC_020062	C	6	6	1702534	1702539	0 %	0 %	0 %	100 %	440224523
32992	NC_020062	GC	3	6	1702558	1702563	0 %	0 %	50 %	50 %	440224523
32993	NC_020062	CCA	2	6	1702675	1702680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224523
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32999	NC_020062	GTC	2	6	1703080	1703085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224524
33000	NC_020062	GCC	2	6	1703154	1703159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224524

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