MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_020062	TGC	2	6	1622734	1622739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224443
31502	NC_020062	GAG	2	6	1622740	1622745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224443
31503	NC_020062	CGAG	2	8	1622807	1622814	25 %	0 %	50 %	25 %	440224443
31504	NC_020062	TCT	2	6	1622879	1622884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224443
31505	NC_020062	CCG	2	6	1622902	1622907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224443
31506	NC_020062	GCGG	2	8	1622924	1622931	0 %	0 %	75 %	25 %	440224443
31507	NC_020062	GGC	2	6	1622967	1622972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224443
31508	NC_020062	ACC	2	6	1623021	1623026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224443
31509	NC_020062	GAT	2	6	1623042	1623047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224443
31510	NC_020062	GC	3	6	1623090	1623095	0 %	0 %	50 %	50 %	440224443
31511	NC_020062	GGCTC	2	10	1623113	1623122	0 %	20 %	40 %	40 %	440224443
31512	NC_020062	CG	3	6	1623191	1623196	0 %	0 %	50 %	50 %	440224443
31513	NC_020062	GCG	2	6	1623232	1623237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224443
31514	NC_020062	TGA	2	6	1623344	1623349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224443
31515	NC_020062	CGG	2	6	1623398	1623403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224443
31516	NC_020062	CG	3	6	1623431	1623436	0 %	0 %	50 %	50 %	440224443
31517	NC_020062	ATA	2	6	1623444	1623449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224443
31518	NC_020062	CAG	2	6	1623458	1623463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224443
31519	NC_020062	TTG	2	6	1623466	1623471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224443
31520	NC_020062	TCC	2	6	1623508	1623513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224443
31521	NC_020062	TGC	2	6	1623549	1623554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224443
31522	NC_020062	GAC	2	6	1623692	1623697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224443
31523	NC_020062	CAT	2	6	1623741	1623746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224443
31524	NC_020062	CG	3	6	1623790	1623795	0 %	0 %	50 %	50 %	440224444
31525	NC_020062	GCC	2	6	1623821	1623826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224444
31526	NC_020062	GCTT	2	8	1623857	1623864	0 %	50 %	25 %	25 %	440224444
31527	NC_020062	TGG	2	6	1623934	1623939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224444
31528	NC_020062	CCG	2	6	1623945	1623950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224444
31529	NC_020062	GCA	2	6	1624020	1624025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224444
31530	NC_020062	AGGT	2	8	1624056	1624063	25 %	25 %	50 %	0 %	440224444
31531	NC_020062	GCG	2	6	1624077	1624082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224444
31532	NC_020062	CAG	2	6	1624099	1624104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224444
31533	NC_020062	CGC	2	6	1624114	1624119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224444
31534	NC_020062	AGG	2	6	1624158	1624163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224444
31535	NC_020062	ATC	2	6	1624169	1624174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224444
31536	NC_020062	CCA	2	6	1624201	1624206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224444
31537	NC_020062	AGG	2	6	1624249	1624254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224444
31538	NC_020062	TCGC	2	8	1624266	1624273	0 %	25 %	25 %	50 %	440224444
31539	NC_020062	CGC	2	6	1624300	1624305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224444
31540	NC_020062	TTG	2	6	1624338	1624343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224444
31541	NC_020062	TCG	2	6	1624411	1624416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224444
31542	NC_020062	GCC	2	6	1624440	1624445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224444
31543	NC_020062	GC	3	6	1624522	1624527	0 %	0 %	50 %	50 %	440224444
31544	NC_020062	GA	3	6	1624572	1624577	50 %	0 %	50 %	0 %	440224444
31545	NC_020062	AGC	2	6	1624653	1624658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224444
31546	NC_020062	GCC	2	6	1624677	1624682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224444
31547	NC_020062	GGC	2	6	1624685	1624690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224444
31548	NC_020062	GC	3	6	1624707	1624712	0 %	0 %	50 %	50 %	440224444
31549	NC_020062	CAT	2	6	1624730	1624735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224444
31550	NC_020062	CCG	2	6	1624758	1624763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224445
31551	NC_020062	AT	3	6	1624808	1624813	50 %	50 %	0 %	0 %	440224445
31552	NC_020062	CCG	2	6	1624863	1624868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224445
31553	NC_020062	GCC	2	6	1624925	1624930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224445
31554	NC_020062	TCG	2	6	1624974	1624979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224445
31555	NC_020062	GCG	2	6	1625003	1625008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224445
31556	NC_020062	CTT	2	6	1625083	1625088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224445
31557	NC_020062	AGC	2	6	1625126	1625131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224445
31558	NC_020062	ATGG	2	8	1625188	1625195	25 %	25 %	50 %	0 %	440224445
31559	NC_020062	CTTG	2	8	1625764	1625771	0 %	50 %	25 %	25 %	440224446
31560	NC_020062	GAC	2	6	1625861	1625866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224446
31561	NC_020062	GAT	2	6	1625867	1625872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224446
31562	NC_020062	AGG	2	6	1625971	1625976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224446
31563	NC_020062	ATC	2	6	1626006	1626011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224446
31564	NC_020062	GCT	2	6	1626192	1626197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224447
31565	NC_020062	CGTC	2	8	1626236	1626243	0 %	25 %	25 %	50 %	440224447
31566	NC_020062	CGG	2	6	1626272	1626277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224447
31567	NC_020062	TCG	2	6	1626328	1626333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224447
31568	NC_020062	CTT	2	6	1626353	1626358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224447
31569	NC_020062	GCG	2	6	1626417	1626422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224447
31570	NC_020062	TCGCG	2	10	1626723	1626732	0 %	20 %	40 %	40 %	440224448
31571	NC_020062	TCCT	2	8	1626750	1626757	0 %	50 %	0 %	50 %	440224448
31572	NC_020062	CCTT	2	8	1626760	1626767	0 %	50 %	0 %	50 %	440224448
31573	NC_020062	GTG	2	6	1626825	1626830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224448
31574	NC_020062	CCGA	2	8	1626918	1626925	25 %	0 %	25 %	50 %	440224448
31575	NC_020062	CTT	2	6	1626977	1626982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224448
31576	NC_020062	CGAG	2	8	1626998	1627005	25 %	0 %	50 %	25 %	440224448
31577	NC_020062	CGATGT	2	12	1627007	1627018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440224448
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31579	NC_020062	GCA	2	6	1627070	1627075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224448
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31581	NC_020062	GCG	2	6	1627390	1627395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224448
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31583	NC_020062	CGC	2	6	1627763	1627768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224449
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31585	NC_020062	GTG	2	6	1627867	1627872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224449
31586	NC_020062	GCCG	2	8	1627903	1627910	0 %	0 %	50 %	50 %	440224449
31587	NC_020062	ACG	2	6	1627918	1627923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224449
31588	NC_020062	CGC	2	6	1627965	1627970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224449
31589	NC_020062	GCG	2	6	1628080	1628085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224449
31590	NC_020062	CGG	2	6	1628129	1628134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224449
31591	NC_020062	TC	3	6	1628142	1628147	0 %	50 %	0 %	50 %	440224449
31592	NC_020062	AAG	2	6	1628153	1628158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224449
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31596	NC_020062	CAG	2	6	1628325	1628330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224450
31597	NC_020062	TCG	2	6	1628416	1628421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
31598	NC_020062	TCG	3	9	1628494	1628502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
31599	NC_020062	CGG	2	6	1628558	1628563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224450
31600	NC_020062	GC	3	6	1628608	1628613	0 %	0 %	50 %	50 %	440224450
31601	NC_020062	GCC	3	9	1628637	1628645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224450
31602	NC_020062	AGCG	2	8	1628738	1628745	25 %	0 %	50 %	25 %	440224450
31603	NC_020062	CAAA	2	8	1628797	1628804	75 %	0 %	0 %	25 %	440224450
31604	NC_020062	AGGCA	2	10	1628858	1628867	40 %	0 %	40 %	20 %	440224450
31605	NC_020062	GCC	2	6	1628907	1628912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224450
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31607	NC_020062	AGC	2	6	1628965	1628970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224450
31608	NC_020062	GTC	2	6	1629024	1629029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
31609	NC_020062	TGG	2	6	1629039	1629044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224450
31610	NC_020062	GCC	2	6	1629066	1629071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224450
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31612	NC_020062	CGT	2	6	1629239	1629244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
31613	NC_020062	CAT	2	6	1629273	1629278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224450
31614	NC_020062	GCC	2	6	1629290	1629295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224450
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31616	NC_020062	GGC	2	6	1629514	1629519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224450
31617	NC_020062	GAG	3	9	1629543	1629551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224450
31618	NC_020062	GGC	2	6	1629578	1629583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224450
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31622	NC_020062	GCT	2	6	1629896	1629901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224450
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31647	NC_020062	CGC	2	6	1630788	1630793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224451
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31703	NC_020062	TGGG	2	8	1633981	1633988	0 %	25 %	75 %	0 %	440224453
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31719	NC_020062	CGTT	2	8	1635683	1635690	0 %	50 %	25 %	25 %	440224455
31720	NC_020062	GCC	2	6	1635721	1635726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224455
31721	NC_020062	TCA	2	6	1635751	1635756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224455
31722	NC_020062	GAC	2	6	1635774	1635779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224455
31723	NC_020062	CGA	2	6	1635812	1635817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224455
31724	NC_020062	GCGA	2	8	1635889	1635896	25 %	0 %	50 %	25 %	440224455
31725	NC_020062	TCA	2	6	1635955	1635960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224455
31726	NC_020062	ATTGC	2	10	1635978	1635987	20 %	40 %	20 %	20 %	440224455
31727	NC_020062	CG	3	6	1636049	1636054	0 %	0 %	50 %	50 %	440224455
31728	NC_020062	TGCC	3	12	1636070	1636081	0 %	25 %	25 %	50 %	440224455
31729	NC_020062	GGA	2	6	1636142	1636147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224455
31730	NC_020062	CTT	2	6	1636163	1636168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224455
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31732	NC_020062	GC	3	6	1636233	1636238	0 %	0 %	50 %	50 %	440224456
31733	NC_020062	CGT	2	6	1636258	1636263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224456
31734	NC_020062	TGC	3	9	1636275	1636283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224456
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31844	NC_020062	GGCGAA	2	12	1641645	1641656	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440224462
31845	NC_020062	GCG	2	6	1641657	1641662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224462
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31848	NC_020062	GTC	2	6	1641753	1641758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224462
31849	NC_020062	CCG	2	6	1641781	1641786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224462
31850	NC_020062	GCG	2	6	1641793	1641798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224462
31851	NC_020062	CG	3	6	1641829	1641834	0 %	0 %	50 %	50 %	440224462
31852	NC_020062	CCGA	2	8	1641861	1641868	25 %	0 %	25 %	50 %	440224462
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31874	NC_020062	TCA	2	6	1643020	1643025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224463
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31958	NC_020062	AT	3	6	1648133	1648138	50 %	50 %	0 %	0 %	440224467
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31960	NC_020062	TCG	2	6	1648201	1648206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224467
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31991	NC_020062	GC	3	6	1649699	1649704	0 %	0 %	50 %	50 %	440224468
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32000	NC_020062	ACG	2	6	1650036	1650041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224468

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