MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_020062	GATC	2	8	1575551	1575558	25 %	25 %	25 %	25 %	440224403
30502	NC_020062	GCC	2	6	1575590	1575595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224403
30503	NC_020062	CGA	2	6	1575608	1575613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224403
30504	NC_020062	CCG	2	6	1575762	1575767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30505	NC_020062	GAC	2	6	1575779	1575784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30506	NC_020062	CGCC	2	8	1575796	1575803	0 %	0 %	25 %	75 %	440224404
30507	NC_020062	GCCGA	2	10	1575819	1575828	20 %	0 %	40 %	40 %	440224404
30508	NC_020062	CGC	2	6	1575889	1575894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30509	NC_020062	CG	3	6	1575955	1575960	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30510	NC_020062	GCC	2	6	1576007	1576012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30511	NC_020062	TCC	2	6	1576035	1576040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224404
30512	NC_020062	CCG	2	6	1576138	1576143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30513	NC_020062	GTA	2	6	1576166	1576171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224404
30514	NC_020062	CGT	2	6	1576180	1576185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30515	NC_020062	ACG	2	6	1576290	1576295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30516	NC_020062	GAT	3	9	1576334	1576342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224404
30517	NC_020062	CGA	2	6	1576387	1576392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30518	NC_020062	CGG	2	6	1576414	1576419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224404
30519	NC_020062	CG	3	6	1576420	1576425	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30520	NC_020062	GCG	2	6	1576435	1576440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224404
30521	NC_020062	CTTGTC	2	12	1576499	1576510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440224404
30522	NC_020062	GAC	2	6	1576523	1576528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30523	NC_020062	CCG	2	6	1576603	1576608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30524	NC_020062	CGA	2	6	1576639	1576644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30525	NC_020062	ATC	2	6	1576665	1576670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224404
30526	NC_020062	TTC	2	6	1576671	1576676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224404
30527	NC_020062	GGC	2	6	1576700	1576705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224404
30528	NC_020062	GC	3	6	1576757	1576762	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30529	NC_020062	CAG	2	6	1576769	1576774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30530	NC_020062	CTC	3	9	1576841	1576849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224404
30531	NC_020062	GCG	2	6	1576864	1576869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224404
30532	NC_020062	GCC	2	6	1576889	1576894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30533	NC_020062	ATG	2	6	1576904	1576909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224404
30534	NC_020062	TCT	2	6	1576936	1576941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224404
30535	NC_020062	TCG	2	6	1576950	1576955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30536	NC_020062	GTCAG	2	10	1576974	1576983	20 %	20 %	40 %	20 %	440224404
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30538	NC_020062	ATGA	2	8	1577036	1577043	50 %	25 %	25 %	0 %	440224404
30539	NC_020062	GCG	2	6	1577107	1577112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224404
30540	NC_020062	TTG	2	6	1577241	1577246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224404
30541	NC_020062	TGCC	2	8	1577348	1577355	0 %	25 %	25 %	50 %	440224404
30542	NC_020062	GGTTC	2	10	1577380	1577389	0 %	40 %	40 %	20 %	440224404
30543	NC_020062	GAT	3	9	1577390	1577398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224404
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30545	NC_020062	CGAAGC	2	12	1577611	1577622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30546	NC_020062	CG	3	6	1577658	1577663	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30547	NC_020062	ATC	2	6	1577666	1577671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224404
30548	NC_020062	CAA	2	6	1577699	1577704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224404
30549	NC_020062	GC	4	8	1577731	1577738	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30550	NC_020062	AGT	2	6	1577756	1577761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224404
30551	NC_020062	CGC	2	6	1577797	1577802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30552	NC_020062	CAT	2	6	1577842	1577847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224404
30553	NC_020062	CAGG	2	8	1577972	1577979	25 %	0 %	50 %	25 %	440224404
30554	NC_020062	GCC	2	6	1577996	1578001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30555	NC_020062	CGTCA	2	10	1578023	1578032	20 %	20 %	20 %	40 %	440224404
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30558	NC_020062	GAA	2	6	1578218	1578223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224404
30559	NC_020062	GCC	2	6	1578275	1578280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
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30561	NC_020062	CAT	2	6	1578395	1578400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224404
30562	NC_020062	GCAC	2	8	1578405	1578412	25 %	0 %	25 %	50 %	440224404
30563	NC_020062	CGCC	2	8	1578418	1578425	0 %	0 %	25 %	75 %	440224404
30564	NC_020062	GC	3	6	1578441	1578446	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30565	NC_020062	GCC	2	6	1578485	1578490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
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30569	NC_020062	CCCG	2	8	1578614	1578621	0 %	0 %	25 %	75 %	440224404
30570	NC_020062	CAT	2	6	1578626	1578631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224404
30571	NC_020062	CG	4	8	1578640	1578647	0 %	0 %	50 %	50 %	440224404
30572	NC_020062	CGC	2	6	1578736	1578741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
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30574	NC_020062	CGAT	2	8	1578799	1578806	25 %	25 %	25 %	25 %	440224404
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30576	NC_020062	GCAT	2	8	1578852	1578859	25 %	25 %	25 %	25 %	440224404
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30583	NC_020062	AGC	2	6	1579116	1579121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
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30585	NC_020062	CGT	2	6	1579136	1579141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224404
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30587	NC_020062	GA	3	6	1579254	1579259	50 %	0 %	50 %	0 %	440224404
30588	NC_020062	CGA	2	6	1579297	1579302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224404
30589	NC_020062	GCC	2	6	1579316	1579321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224404
30590	NC_020062	CGAT	2	8	1579323	1579330	25 %	25 %	25 %	25 %	440224404
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30594	NC_020062	GAT	2	6	1579397	1579402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224404
30595	NC_020062	AT	3	6	1579404	1579409	50 %	50 %	0 %	0 %	440224404
30596	NC_020062	CCG	2	6	1579538	1579543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224405
30597	NC_020062	CGG	2	6	1579564	1579569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224405
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30599	NC_020062	GA	3	6	1579633	1579638	50 %	0 %	50 %	0 %	440224405
30600	NC_020062	CGT	2	6	1579713	1579718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224405
30601	NC_020062	AGC	2	6	1579872	1579877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224405
30602	NC_020062	GC	3	6	1580159	1580164	0 %	0 %	50 %	50 %	440224406
30603	NC_020062	GCT	2	6	1580174	1580179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224406
30604	NC_020062	CGA	2	6	1580180	1580185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224406
30605	NC_020062	GCC	2	6	1580227	1580232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224406
30606	NC_020062	CTC	2	6	1580238	1580243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224406
30607	NC_020062	AGC	2	6	1580281	1580286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224406
30608	NC_020062	GGC	2	6	1580297	1580302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224406
30609	NC_020062	CTG	2	6	1580331	1580336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224406
30610	NC_020062	CGC	2	6	1580339	1580344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224406
30611	NC_020062	GCTG	2	8	1580351	1580358	0 %	25 %	50 %	25 %	440224406
30612	NC_020062	CGGC	2	8	1580424	1580431	0 %	0 %	50 %	50 %	440224406
30613	NC_020062	GA	3	6	1580446	1580451	50 %	0 %	50 %	0 %	440224406
30614	NC_020062	TCC	2	6	1580455	1580460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224406
30615	NC_020062	CG	3	6	1580483	1580488	0 %	0 %	50 %	50 %	440224406
30616	NC_020062	GCG	2	6	1580520	1580525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224406
30617	NC_020062	CAT	2	6	1580573	1580578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224406
30618	NC_020062	AGC	2	6	1580608	1580613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224406
30619	NC_020062	GCCG	2	8	1580651	1580658	0 %	0 %	50 %	50 %	440224406
30620	NC_020062	CCGG	2	8	1580659	1580666	0 %	0 %	50 %	50 %	440224406
30621	NC_020062	GCCG	2	8	1580709	1580716	0 %	0 %	50 %	50 %	440224406
30622	NC_020062	GCG	2	6	1580735	1580740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224406
30623	NC_020062	GAT	2	6	1580821	1580826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224407
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30634	NC_020062	GCA	2	6	1581180	1581185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224407
30635	NC_020062	CGGC	2	8	1581204	1581211	0 %	0 %	50 %	50 %	440224407
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30643	NC_020062	CGA	2	6	1581587	1581592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224408
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30646	NC_020062	GA	3	6	1581733	1581738	50 %	0 %	50 %	0 %	440224408
30647	NC_020062	CGA	2	6	1581749	1581754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224408
30648	NC_020062	GCC	2	6	1581780	1581785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224408
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30653	NC_020062	TTG	2	6	1582066	1582071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224408
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30713	NC_020062	GAG	2	6	1585011	1585016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224411
30714	NC_020062	CCG	4	12	1585017	1585028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224411
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30716	NC_020062	ATC	2	6	1585101	1585106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224411
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30720	NC_020062	CGC	2	6	1585243	1585248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224411
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30722	NC_020062	GATCGC	2	12	1585337	1585348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224411
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30724	NC_020062	GCA	2	6	1585468	1585473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224411
30725	NC_020062	TGCCGT	2	12	1585592	1585603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224411
30726	NC_020062	TGC	2	6	1585683	1585688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224411
30727	NC_020062	GCT	2	6	1585707	1585712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224411
30728	NC_020062	AG	3	6	1585718	1585723	50 %	0 %	50 %	0 %	440224411
30729	NC_020062	GAT	2	6	1585798	1585803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224411
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30731	NC_020062	CCTT	2	8	1585890	1585897	0 %	50 %	0 %	50 %	440224412
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30760	NC_020062	GC	3	6	1587347	1587352	0 %	0 %	50 %	50 %	440224414
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30951	NC_020062	GC	3	6	1595996	1596001	0 %	0 %	50 %	50 %	440224423
30952	NC_020062	ATCG	2	8	1596010	1596017	25 %	25 %	25 %	25 %	440224423
30953	NC_020062	TCG	2	6	1596032	1596037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224423
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30955	NC_020062	GAT	2	6	1596223	1596228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224424
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30957	NC_020062	CGA	2	6	1596291	1596296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224424
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30959	NC_020062	CG	3	6	1596345	1596350	0 %	0 %	50 %	50 %	440224424
30960	NC_020062	CTG	2	6	1596361	1596366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224424
30961	NC_020062	ACG	2	6	1596394	1596399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224424
30962	NC_020062	TGA	2	6	1596476	1596481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224424
30963	NC_020062	CGG	2	6	1596486	1596491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224424
30964	NC_020062	CG	4	8	1596506	1596513	0 %	0 %	50 %	50 %	440224424
30965	NC_020062	ACC	2	6	1596571	1596576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224424
30966	NC_020062	TCA	2	6	1596590	1596595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224424
30967	NC_020062	TGA	2	6	1596602	1596607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224424
30968	NC_020062	CCGT	2	8	1596698	1596705	0 %	25 %	25 %	50 %	440224424
30969	NC_020062	ATC	2	6	1596757	1596762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224424
30970	NC_020062	TCG	2	6	1596800	1596805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224424
30971	NC_020062	CG	3	6	1596821	1596826	0 %	0 %	50 %	50 %	440224424
30972	NC_020062	AAG	2	6	1596868	1596873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224424
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30974	NC_020062	TCA	2	6	1596932	1596937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224424
30975	NC_020062	AGC	3	9	1596948	1596956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224424
30976	NC_020062	A	6	6	1596958	1596963	100 %	0 %	0 %	0 %	440224424
30977	NC_020062	GGCGG	2	10	1596994	1597003	0 %	0 %	80 %	20 %	440224424
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30979	NC_020062	TGC	2	6	1597142	1597147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224424
30980	NC_020062	GAC	2	6	1597168	1597173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224424
30981	NC_020062	GC	3	6	1597174	1597179	0 %	0 %	50 %	50 %	440224424
30982	NC_020062	CGG	2	6	1597191	1597196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224424
30983	NC_020062	GC	3	6	1597234	1597239	0 %	0 %	50 %	50 %	440224424
30984	NC_020062	CGG	2	6	1597275	1597280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224424
30985	NC_020062	CCA	2	6	1597295	1597300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224424
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30987	NC_020062	GCT	2	6	1597601	1597606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224425
30988	NC_020062	AGCC	2	8	1597618	1597625	25 %	0 %	25 %	50 %	440224425
30989	NC_020062	CAGG	2	8	1597674	1597681	25 %	0 %	50 %	25 %	440224425
30990	NC_020062	GCCA	2	8	1597710	1597717	25 %	0 %	25 %	50 %	440224425
30991	NC_020062	ATC	2	6	1597733	1597738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224425
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30993	NC_020062	TCCC	2	8	1597756	1597763	0 %	25 %	0 %	75 %	440224425
30994	NC_020062	TCTT	2	8	1597860	1597867	0 %	75 %	0 %	25 %	440224425
30995	NC_020062	CGGC	2	8	1597926	1597933	0 %	0 %	50 %	50 %	440224425
30996	NC_020062	TGC	2	6	1597963	1597968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224425
30997	NC_020062	TCG	2	6	1598079	1598084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224425
30998	NC_020062	TCG	2	6	1598136	1598141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224425
30999	NC_020062	CAT	2	6	1598149	1598154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224425
31000	NC_020062	CGA	2	6	1598155	1598160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224425

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