MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_020062	CGA	2	6	1527192	1527197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29503	NC_020062	T	6	6	1527214	1527219	0 %	100 %	0 %	0 %	440224367
29504	NC_020062	TGG	2	6	1527253	1527258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224367
29505	NC_020062	TCA	2	6	1527309	1527314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224367
29506	NC_020062	CTG	3	9	1527326	1527334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29507	NC_020062	TGC	2	6	1527336	1527341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29508	NC_020062	TCT	2	6	1527369	1527374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224367
29509	NC_020062	CCG	2	6	1527382	1527387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224367
29510	NC_020062	GTC	2	6	1527437	1527442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29511	NC_020062	TGC	2	6	1527456	1527461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29512	NC_020062	GGA	2	6	1527493	1527498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224367
29513	NC_020062	CAC	2	6	1527538	1527543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224367
29514	NC_020062	CAT	2	6	1527598	1527603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224367
29515	NC_020062	CGT	2	6	1527619	1527624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29516	NC_020062	GGT	2	6	1527637	1527642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224367
29517	NC_020062	TAT	2	6	1527680	1527685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224367
29518	NC_020062	ACG	2	6	1527735	1527740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29519	NC_020062	CAG	2	6	1527796	1527801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224367
29520	NC_020062	ATC	2	6	1527812	1527817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224367
29521	NC_020062	CG	3	6	1527846	1527851	0 %	0 %	50 %	50 %	440224367
29522	NC_020062	TGA	2	6	1527860	1527865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224367
29523	NC_020062	CGA	2	6	1527964	1527969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224368
29524	NC_020062	CGCTG	2	10	1527991	1528000	0 %	20 %	40 %	40 %	440224368
29525	NC_020062	ATC	2	6	1528069	1528074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224368
29526	NC_020062	GAC	2	6	1528229	1528234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224368
29527	NC_020062	CGG	3	9	1528412	1528420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224368
29528	NC_020062	CCGAT	2	10	1528427	1528436	20 %	20 %	20 %	40 %	440224368
29529	NC_020062	GC	3	6	1528452	1528457	0 %	0 %	50 %	50 %	440224368
29530	NC_020062	TCA	2	6	1528462	1528467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224368
29531	NC_020062	GTC	2	6	1528485	1528490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224368
29532	NC_020062	GCC	2	6	1528507	1528512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224368
29533	NC_020062	GC	3	6	1528527	1528532	0 %	0 %	50 %	50 %	440224368
29534	NC_020062	AGC	2	6	1528585	1528590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224368
29535	NC_020062	CGAG	2	8	1528615	1528622	25 %	0 %	50 %	25 %	440224368
29536	NC_020062	GAC	2	6	1528655	1528660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224368
29537	NC_020062	GAA	3	9	1528721	1528729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224368
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29539	NC_020062	CCG	2	6	1528828	1528833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224368
29540	NC_020062	AAC	2	6	1528834	1528839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224368
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29543	NC_020062	CAA	2	6	1528907	1528912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224368
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29545	NC_020062	CAT	2	6	1529111	1529116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224368
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29548	NC_020062	GCA	2	6	1529262	1529267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224369
29549	NC_020062	CTC	2	6	1529320	1529325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224369
29550	NC_020062	CTA	2	6	1529353	1529358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224369
29551	NC_020062	ATG	2	6	1529381	1529386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224369
29552	NC_020062	CTT	2	6	1529443	1529448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224369
29553	NC_020062	TCT	2	6	1529463	1529468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224369
29554	NC_020062	GGTC	2	8	1529469	1529476	0 %	25 %	50 %	25 %	440224369
29555	NC_020062	C	6	6	1529479	1529484	0 %	0 %	0 %	100 %	440224369
29556	NC_020062	GAC	2	6	1529485	1529490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224369
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29566	NC_020062	GAT	2	6	1529767	1529772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224369
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29568	NC_020062	GAC	2	6	1529842	1529847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224369
29569	NC_020062	TAT	2	6	1529881	1529886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224369
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29574	NC_020062	GT	3	6	1530222	1530227	0 %	50 %	50 %	0 %	440224369
29575	NC_020062	CTG	2	6	1530245	1530250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224369
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29582	NC_020062	TCA	2	6	1530656	1530661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224370
29583	NC_020062	GAGC	2	8	1530672	1530679	25 %	0 %	50 %	25 %	440224370
29584	NC_020062	CGC	2	6	1530692	1530697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224370
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29586	NC_020062	TGG	2	6	1530776	1530781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224370
29587	NC_020062	AT	3	6	1530815	1530820	50 %	50 %	0 %	0 %	440224370
29588	NC_020062	GCT	2	6	1530828	1530833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224370
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29591	NC_020062	TCG	2	6	1530995	1531000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224370
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29597	NC_020062	TCCC	2	8	1531280	1531287	0 %	25 %	0 %	75 %	440224370
29598	NC_020062	ATCT	2	8	1531318	1531325	25 %	50 %	0 %	25 %	440224370
29599	NC_020062	GCT	2	6	1531359	1531364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224370
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29604	NC_020062	ACGATG	2	12	1531762	1531773	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440224371
29605	NC_020062	TGA	2	6	1531787	1531792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224371
29606	NC_020062	CAG	2	6	1531818	1531823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224371
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29609	NC_020062	GCGAG	2	10	1531982	1531991	20 %	0 %	60 %	20 %	440224371
29610	NC_020062	CGA	2	6	1532000	1532005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224371
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29612	NC_020062	GTTGAC	2	12	1532052	1532063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440224371
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29725	NC_020062	CG	3	6	1537606	1537611	0 %	0 %	50 %	50 %	440224375
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29844	NC_020062	GCA	2	6	1543685	1543690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224379
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29953	NC_020062	TCG	2	6	1548250	1548255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224382
29954	NC_020062	CGG	2	6	1548260	1548265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224382
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29957	NC_020062	GCT	2	6	1548347	1548352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224382
29958	NC_020062	GGC	2	6	1548372	1548377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224382
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30000	NC_020062	CTCGAT	2	12	1550247	1550258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224383

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