MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_020062	GT	3	6	1502019	1502024	0 %	50 %	50 %	0 %	440224343
29002	NC_020062	TCG	2	6	1502050	1502055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224343
29003	NC_020062	GCC	2	6	1502082	1502087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224343
29004	NC_020062	CCG	2	6	1502092	1502097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224343
29005	NC_020062	GGT	2	6	1502130	1502135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224343
29006	NC_020062	CGGC	2	8	1502137	1502144	0 %	0 %	50 %	50 %	440224343
29007	NC_020062	CGT	2	6	1502208	1502213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224343
29008	NC_020062	CCG	2	6	1502215	1502220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224343
29009	NC_020062	TTCAA	2	10	1502259	1502268	40 %	40 %	0 %	20 %	440224344
29010	NC_020062	ATCGGC	2	12	1502284	1502295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224344
29011	NC_020062	CGA	2	6	1502319	1502324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224344
29012	NC_020062	GTC	2	6	1502353	1502358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224344
29013	NC_020062	CGG	2	6	1502361	1502366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224344
29014	NC_020062	TGA	2	6	1502384	1502389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224344
29015	NC_020062	GGT	2	6	1502478	1502483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224344
29016	NC_020062	CTT	2	6	1502502	1502507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224344
29017	NC_020062	CTC	2	6	1502574	1502579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224344
29018	NC_020062	GAC	2	6	1502622	1502627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224344
29019	NC_020062	TC	3	6	1502631	1502636	0 %	50 %	0 %	50 %	440224344
29020	NC_020062	ACGG	2	8	1502642	1502649	25 %	0 %	50 %	25 %	440224344
29021	NC_020062	GCCG	2	8	1502680	1502687	0 %	0 %	50 %	50 %	440224344
29022	NC_020062	CGA	2	6	1502709	1502714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224344
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29024	NC_020062	CTG	2	6	1502740	1502745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224344
29025	NC_020062	GGC	2	6	1502794	1502799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224344
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29027	NC_020062	GC	3	6	1502897	1502902	0 %	0 %	50 %	50 %	440224344
29028	NC_020062	CGA	2	6	1502931	1502936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224344
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29030	NC_020062	GC	3	6	1503087	1503092	0 %	0 %	50 %	50 %	440224344
29031	NC_020062	GC	3	6	1503124	1503129	0 %	0 %	50 %	50 %	440224344
29032	NC_020062	CGC	2	6	1503210	1503215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224344
29033	NC_020062	GGC	4	12	1503235	1503246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224344
29034	NC_020062	GCC	2	6	1503268	1503273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224344
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29038	NC_020062	CGC	2	6	1503358	1503363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224344
29039	NC_020062	GGC	2	6	1503364	1503369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224344
29040	NC_020062	GC	4	8	1503391	1503398	0 %	0 %	50 %	50 %	440224344
29041	NC_020062	GGC	2	6	1503425	1503430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224344
29042	NC_020062	ATG	2	6	1503471	1503476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224344
29043	NC_020062	GCC	2	6	1503524	1503529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224345
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29045	NC_020062	GCCC	2	8	1503624	1503631	0 %	0 %	25 %	75 %	440224345
29046	NC_020062	CAT	2	6	1503640	1503645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224345
29047	NC_020062	CG	3	6	1503718	1503723	0 %	0 %	50 %	50 %	440224345
29048	NC_020062	TC	3	6	1503739	1503744	0 %	50 %	0 %	50 %	440224345
29049	NC_020062	AGC	2	6	1503783	1503788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224345
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29051	NC_020062	CGG	2	6	1503870	1503875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224345
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29053	NC_020062	TCG	2	6	1504008	1504013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224345
29054	NC_020062	CGC	2	6	1504023	1504028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224345
29055	NC_020062	TCG	2	6	1504056	1504061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224345
29056	NC_020062	GCC	2	6	1504127	1504132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224345
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29058	NC_020062	GCTC	2	8	1504200	1504207	0 %	25 %	25 %	50 %	440224345
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29069	NC_020062	GACG	2	8	1504641	1504648	25 %	0 %	50 %	25 %	440224346
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29097	NC_020062	GCGTTC	2	12	1507241	1507252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224348
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29099	NC_020062	CG	3	6	1507269	1507274	0 %	0 %	50 %	50 %	440224348
29100	NC_020062	ATA	2	6	1507284	1507289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224348
29101	NC_020062	TCG	2	6	1507314	1507319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224348
29102	NC_020062	GCAA	2	8	1507320	1507327	50 %	0 %	25 %	25 %	440224348
29103	NC_020062	CGC	2	6	1507340	1507345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224348
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29106	NC_020062	ACG	2	6	1507485	1507490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224348
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29111	NC_020062	CAT	3	9	1507750	1507758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224348
29112	NC_020062	TGCC	2	8	1507902	1507909	0 %	25 %	25 %	50 %	440224348
29113	NC_020062	GCAT	2	8	1507941	1507948	25 %	25 %	25 %	25 %	440224348
29114	NC_020062	GGC	2	6	1508014	1508019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224348
29115	NC_020062	AGG	2	6	1508025	1508030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224348
29116	NC_020062	GCC	2	6	1508054	1508059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224348
29117	NC_020062	TCA	3	9	1508061	1508069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224348
29118	NC_020062	AGG	2	6	1508180	1508185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224348
29119	NC_020062	ATG	2	6	1508220	1508225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224349
29120	NC_020062	CCG	2	6	1508301	1508306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224349
29121	NC_020062	CGA	2	6	1508408	1508413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224349
29122	NC_020062	AC	3	6	1508428	1508433	50 %	0 %	0 %	50 %	440224349
29123	NC_020062	CCTT	2	8	1508473	1508480	0 %	50 %	0 %	50 %	440224349
29124	NC_020062	AGC	2	6	1508485	1508490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224349
29125	NC_020062	ACA	2	6	1508491	1508496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224349
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29127	NC_020062	CTT	2	6	1508585	1508590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224349
29128	NC_020062	GGC	2	6	1508647	1508652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224349
29129	NC_020062	TCA	2	6	1508662	1508667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224349
29130	NC_020062	TCA	2	6	1508683	1508688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224349
29131	NC_020062	CGG	2	6	1508723	1508728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224349
29132	NC_020062	CTC	2	6	1508733	1508738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224349
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29134	NC_020062	ATC	2	6	1508775	1508780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224349
29135	NC_020062	ACG	2	6	1508784	1508789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224349
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29137	NC_020062	CCG	2	6	1508839	1508844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224349
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29139	NC_020062	GAC	2	6	1509465	1509470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224350
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29143	NC_020062	GCA	2	6	1509655	1509660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224350
29144	NC_020062	CTT	2	6	1509699	1509704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224350
29145	NC_020062	ACG	2	6	1509794	1509799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224350
29146	NC_020062	CCA	2	6	1509867	1509872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224350
29147	NC_020062	GCC	2	6	1509921	1509926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224350
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29149	NC_020062	T	6	6	1509951	1509956	0 %	100 %	0 %	0 %	440224350
29150	NC_020062	TGC	2	6	1509992	1509997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224350
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29152	NC_020062	CTGG	2	8	1510083	1510090	0 %	25 %	50 %	25 %	440224350
29153	NC_020062	GCTGAT	2	12	1510143	1510154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440224350
29154	NC_020062	CTG	2	6	1510201	1510206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224350
29155	NC_020062	GGC	2	6	1510213	1510218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224350
29156	NC_020062	GTC	2	6	1510231	1510236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224350
29157	NC_020062	ACC	2	6	1510238	1510243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224350
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29161	NC_020062	GAT	2	6	1510425	1510430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224350
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29166	NC_020062	GCC	2	6	1510601	1510606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224351
29167	NC_020062	CGA	2	6	1510615	1510620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224351
29168	NC_020062	GACG	2	8	1510646	1510653	25 %	0 %	50 %	25 %	440224351
29169	NC_020062	ATT	2	6	1510686	1510691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224351
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29172	NC_020062	GAG	2	6	1510887	1510892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224351
29173	NC_020062	CGC	2	6	1510943	1510948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224352
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29176	NC_020062	ATCG	2	8	1511102	1511109	25 %	25 %	25 %	25 %	440224352
29177	NC_020062	CAC	2	6	1511123	1511128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224352
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29179	NC_020062	TGC	2	6	1511269	1511274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224352
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29184	NC_020062	GCG	2	6	1511434	1511439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224352
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29189	NC_020062	TCG	2	6	1511593	1511598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224352
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29191	NC_020062	TGC	2	6	1511718	1511723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224352
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29200	NC_020062	CGC	2	6	1512074	1512079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224352
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29211	NC_020062	TCG	2	6	1512675	1512680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224353
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29217	NC_020062	CG	4	8	1513047	1513054	0 %	0 %	50 %	50 %	440224354
29218	NC_020062	AGC	2	6	1513086	1513091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29219	NC_020062	CTG	2	6	1513115	1513120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29220	NC_020062	TCG	3	9	1513134	1513142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29221	NC_020062	TCG	2	6	1513161	1513166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29222	NC_020062	TGG	2	6	1513209	1513214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224354
29223	NC_020062	CTG	2	6	1513217	1513222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29224	NC_020062	GGC	2	6	1513254	1513259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224354
29225	NC_020062	TGGC	2	8	1513262	1513269	0 %	25 %	50 %	25 %	440224354
29226	NC_020062	TCG	2	6	1513284	1513289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29227	NC_020062	TGC	2	6	1513293	1513298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29228	NC_020062	GCG	2	6	1513317	1513322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224354
29229	NC_020062	GCT	2	6	1513360	1513365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
29230	NC_020062	GTG	2	6	1513442	1513447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224354
29231	NC_020062	CGC	2	6	1513488	1513493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224354
29232	NC_020062	ATT	2	6	1513551	1513556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224354
29233	NC_020062	GGT	2	6	1513588	1513593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224354
29234	NC_020062	GC	3	6	1513668	1513673	0 %	0 %	50 %	50 %	440224354
29235	NC_020062	GC	3	6	1513686	1513691	0 %	0 %	50 %	50 %	440224354
29236	NC_020062	TCG	2	6	1513695	1513700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224354
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29331	NC_020062	GCTCG	2	10	1517506	1517515	0 %	20 %	40 %	40 %	440224357
29332	NC_020062	ACG	2	6	1517516	1517521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224357
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29334	NC_020062	GC	3	6	1517713	1517718	0 %	0 %	50 %	50 %	440224357
29335	NC_020062	ATCCG	2	10	1517834	1517843	20 %	20 %	20 %	40 %	440224357
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29338	NC_020062	GC	3	6	1518054	1518059	0 %	0 %	50 %	50 %	440224357
29339	NC_020062	GCTC	2	8	1518068	1518075	0 %	25 %	25 %	50 %	440224357
29340	NC_020062	GCA	2	6	1518098	1518103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224357
29341	NC_020062	GCAT	2	8	1518208	1518215	25 %	25 %	25 %	25 %	440224358
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29343	NC_020062	CAA	2	6	1518275	1518280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224358
29344	NC_020062	GCC	2	6	1518301	1518306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224358
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29462	NC_020062	CCTG	2	8	1524248	1524255	0 %	25 %	25 %	50 %	440224364
29463	NC_020062	GCGT	2	8	1524343	1524350	0 %	25 %	50 %	25 %	440224364
29464	NC_020062	TCG	2	6	1524397	1524402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224364
29465	NC_020062	CG	3	6	1524547	1524552	0 %	0 %	50 %	50 %	440224364
29466	NC_020062	GCC	2	6	1524582	1524587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224364
29467	NC_020062	CTC	2	6	1524665	1524670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224364
29468	NC_020062	CT	3	6	1524706	1524711	0 %	50 %	0 %	50 %	440224364
29469	NC_020062	CAA	2	6	1524809	1524814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224364
29470	NC_020062	GGC	2	6	1524818	1524823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224364
29471	NC_020062	GGCTCT	2	12	1524926	1524937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224364
29472	NC_020062	GC	3	6	1524979	1524984	0 %	0 %	50 %	50 %	440224364
29473	NC_020062	CCT	2	6	1525004	1525009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224364
29474	NC_020062	GCGT	2	8	1525024	1525031	0 %	25 %	50 %	25 %	440224364
29475	NC_020062	GCA	2	6	1525076	1525081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224365
29476	NC_020062	TGG	3	9	1525115	1525123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224365
29477	NC_020062	GCC	2	6	1525164	1525169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224365
29478	NC_020062	GGC	2	6	1525209	1525214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224365
29479	NC_020062	ACA	2	6	1525220	1525225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224365
29480	NC_020062	GAC	2	6	1525292	1525297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224365
29481	NC_020062	GAA	2	6	1525318	1525323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224365
29482	NC_020062	GCCG	2	8	1525388	1525395	0 %	0 %	50 %	50 %	440224365
29483	NC_020062	GAT	2	6	1525440	1525445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224365
29484	NC_020062	GC	3	6	1525469	1525474	0 %	0 %	50 %	50 %	440224365
29485	NC_020062	CGC	2	6	1525580	1525585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224365
29486	NC_020062	ACGC	2	8	1525587	1525594	25 %	0 %	25 %	50 %	440224365
29487	NC_020062	CGA	2	6	1525616	1525621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224365
29488	NC_020062	AGC	2	6	1525623	1525628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224365
29489	NC_020062	TGT	2	6	1525712	1525717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224365
29490	NC_020062	GTC	2	6	1525734	1525739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224365
29491	NC_020062	GAAA	2	8	1525769	1525776	75 %	0 %	25 %	0 %	440224365
29492	NC_020062	A	6	6	1525774	1525779	100 %	0 %	0 %	0 %	440224365
29493	NC_020062	T	7	7	1525858	1525864	0 %	100 %	0 %	0 %	440224365
29494	NC_020062	AGTC	2	8	1525878	1525885	25 %	25 %	25 %	25 %	440224365
29495	NC_020062	GGC	3	9	1525908	1525916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224365
29496	NC_020062	GAC	3	9	1525950	1525958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224365
29497	NC_020062	TTC	2	6	1526020	1526025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224365
29498	NC_020062	T	6	6	1526048	1526053	0 %	100 %	0 %	0 %	440224365
29499	NC_020062	GGTC	2	8	1526060	1526067	0 %	25 %	50 %	25 %	440224365
29500	NC_020062	TGA	2	6	1526427	1526432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224366

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