MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_020062	AGG	2	6	1477274	1477279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224319
28503	NC_020062	CGG	2	6	1477298	1477303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224319
28504	NC_020062	A	6	6	1477395	1477400	100 %	0 %	0 %	0 %	440224319
28505	NC_020062	GCG	3	9	1477401	1477409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224319
28506	NC_020062	TCA	2	6	1477802	1477807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224320
28507	NC_020062	CGG	2	6	1477818	1477823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224320
28508	NC_020062	TCC	2	6	1477859	1477864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224320
28509	NC_020062	TGT	2	6	1477944	1477949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224320
28510	NC_020062	CGG	2	6	1477968	1477973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224320
28511	NC_020062	TGC	2	6	1478021	1478026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28512	NC_020062	GCCTGA	2	12	1478039	1478050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28513	NC_020062	CGGC	2	8	1478080	1478087	0 %	0 %	50 %	50 %	440224320
28514	NC_020062	CAA	2	6	1478100	1478105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224320
28515	NC_020062	CCT	2	6	1478106	1478111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224320
28516	NC_020062	GCC	2	6	1478116	1478121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224320
28517	NC_020062	CG	3	6	1478131	1478136	0 %	0 %	50 %	50 %	440224320
28518	NC_020062	TGC	2	6	1478232	1478237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28519	NC_020062	GAC	2	6	1478259	1478264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28520	NC_020062	TTGC	2	8	1478272	1478279	0 %	50 %	25 %	25 %	440224320
28521	NC_020062	GGCGCC	2	12	1478284	1478295	0 %	0 %	50 %	50 %	440224320
28522	NC_020062	CGG	2	6	1478325	1478330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224320
28523	NC_020062	TC	3	6	1478356	1478361	0 %	50 %	0 %	50 %	440224320
28524	NC_020062	GCC	2	6	1478416	1478421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224320
28525	NC_020062	CGCC	2	8	1478451	1478458	0 %	0 %	25 %	75 %	440224320
28526	NC_020062	GCCCC	2	10	1478612	1478621	0 %	0 %	20 %	80 %	440224320
28527	NC_020062	CTCG	2	8	1478622	1478629	0 %	25 %	25 %	50 %	440224320
28528	NC_020062	GAC	2	6	1478664	1478669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28529	NC_020062	GTC	2	6	1478689	1478694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28530	NC_020062	TCG	2	6	1478696	1478701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28531	NC_020062	TCG	2	6	1478786	1478791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28532	NC_020062	AAG	2	6	1478845	1478850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224320
28533	NC_020062	CGAT	2	8	1478885	1478892	25 %	25 %	25 %	25 %	440224320
28534	NC_020062	GC	3	6	1478910	1478915	0 %	0 %	50 %	50 %	440224320
28535	NC_020062	CCT	2	6	1479027	1479032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224320
28536	NC_020062	GTC	2	6	1479070	1479075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224320
28537	NC_020062	AAGC	2	8	1479095	1479102	50 %	0 %	25 %	25 %	440224320
28538	NC_020062	CCG	2	6	1479194	1479199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224320
28539	NC_020062	AGGC	2	8	1479287	1479294	25 %	0 %	50 %	25 %	440224320
28540	NC_020062	GGC	3	9	1479292	1479300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224320
28541	NC_020062	CG	3	6	1479498	1479503	0 %	0 %	50 %	50 %	440224320
28542	NC_020062	TC	3	6	1479628	1479633	0 %	50 %	0 %	50 %	440224321
28543	NC_020062	CGC	2	6	1479637	1479642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224321
28544	NC_020062	TTTGCC	2	12	1479665	1479676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440224321
28545	NC_020062	ATCGTC	2	12	1479701	1479712	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224321
28546	NC_020062	GC	3	6	1479717	1479722	0 %	0 %	50 %	50 %	440224321
28547	NC_020062	TCGC	2	8	1479809	1479816	0 %	25 %	25 %	50 %	440224321
28548	NC_020062	CGA	2	6	1479817	1479822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224321
28549	NC_020062	CGC	3	9	1479826	1479834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224321
28550	NC_020062	GGC	2	6	1479890	1479895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224321
28551	NC_020062	TCA	2	6	1479900	1479905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224321
28552	NC_020062	GCAG	2	8	1480007	1480014	25 %	0 %	50 %	25 %	440224321
28553	NC_020062	CGC	2	6	1480072	1480077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224321
28554	NC_020062	GCC	2	6	1480085	1480090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224321
28555	NC_020062	GCC	2	6	1480148	1480153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224321
28556	NC_020062	CCTG	2	8	1480175	1480182	0 %	25 %	25 %	50 %	440224321
28557	NC_020062	GAA	2	6	1480189	1480194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224321
28558	NC_020062	TCG	2	6	1480206	1480211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224321
28559	NC_020062	GCGAC	2	10	1480272	1480281	20 %	0 %	40 %	40 %	440224321
28560	NC_020062	GCC	2	6	1480331	1480336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224321
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28562	NC_020062	TTCCG	2	10	1480606	1480615	0 %	40 %	20 %	40 %	440224322
28563	NC_020062	GCT	2	6	1480642	1480647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224322
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28572	NC_020062	GTC	2	6	1481000	1481005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224322
28573	NC_020062	GC	3	6	1481019	1481024	0 %	0 %	50 %	50 %	440224322
28574	NC_020062	TGC	2	6	1481055	1481060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224322
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28578	NC_020062	GCA	2	6	1481296	1481301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224323
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28583	NC_020062	GCATG	2	10	1481528	1481537	20 %	20 %	40 %	20 %	440224323
28584	NC_020062	ACC	2	6	1481583	1481588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224323
28585	NC_020062	CGA	2	6	1481653	1481658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224323
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28587	NC_020062	CGC	2	6	1481795	1481800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224323
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28589	NC_020062	CGT	2	6	1481848	1481853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224323
28590	NC_020062	GC	3	6	1481934	1481939	0 %	0 %	50 %	50 %	440224323
28591	NC_020062	AGCG	2	8	1482024	1482031	25 %	0 %	50 %	25 %	440224323
28592	NC_020062	GGC	2	6	1482100	1482105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224323
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28595	NC_020062	CGA	2	6	1482220	1482225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224323
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28598	NC_020062	GCC	3	9	1482436	1482444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224324
28599	NC_020062	AT	3	6	1482463	1482468	50 %	50 %	0 %	0 %	440224324
28600	NC_020062	AGC	2	6	1482490	1482495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224324
28601	NC_020062	TTG	2	6	1482496	1482501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224324
28602	NC_020062	GCA	2	6	1482502	1482507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224324
28603	NC_020062	GCC	2	6	1482552	1482557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224324
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28605	NC_020062	GCC	2	6	1482581	1482586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224324
28606	NC_020062	CGG	2	6	1482666	1482671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224324
28607	NC_020062	TCCG	2	8	1482703	1482710	0 %	25 %	25 %	50 %	440224324
28608	NC_020062	CTG	2	6	1482758	1482763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224324
28609	NC_020062	CGA	2	6	1482869	1482874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224324
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28612	NC_020062	CGG	2	6	1482965	1482970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224324
28613	NC_020062	GCCG	2	8	1483029	1483036	0 %	0 %	50 %	50 %	440224324
28614	NC_020062	TCA	2	6	1483060	1483065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224324
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28616	NC_020062	GCG	2	6	1483105	1483110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224324
28617	NC_020062	GCCCT	2	10	1483288	1483297	0 %	20 %	20 %	60 %	440224324
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28847	NC_020062	CTG	2	6	1496376	1496381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224337
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28960	NC_020062	CGA	2	6	1500688	1500693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224341
28961	NC_020062	CTGG	2	8	1500729	1500736	0 %	25 %	50 %	25 %	440224341
28962	NC_020062	GAC	2	6	1500798	1500803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224342
28963	NC_020062	GCTG	2	8	1500813	1500820	0 %	25 %	50 %	25 %	440224342
28964	NC_020062	TACGGT	2	12	1500844	1500855	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440224342
28965	NC_020062	CGA	2	6	1500882	1500887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224342
28966	NC_020062	CGT	2	6	1500975	1500980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224342
28967	NC_020062	GGC	2	6	1500985	1500990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224342
28968	NC_020062	GGC	2	6	1501011	1501016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224342
28969	NC_020062	CGAT	2	8	1501031	1501038	25 %	25 %	25 %	25 %	440224342
28970	NC_020062	TCG	2	6	1501073	1501078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224342
28971	NC_020062	GC	3	6	1501111	1501116	0 %	0 %	50 %	50 %	440224342
28972	NC_020062	GTC	2	6	1501193	1501198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224342
28973	NC_020062	GC	3	6	1501293	1501298	0 %	0 %	50 %	50 %	440224342
28974	NC_020062	GCCG	2	8	1501339	1501346	0 %	0 %	50 %	50 %	440224342
28975	NC_020062	CGA	2	6	1501350	1501355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224342
28976	NC_020062	ATG	2	6	1501360	1501365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224342
28977	NC_020062	GGCTC	2	10	1501368	1501377	0 %	20 %	40 %	40 %	440224342
28978	NC_020062	TCA	2	6	1501418	1501423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224342
28979	NC_020062	TCGGC	2	10	1501424	1501433	0 %	20 %	40 %	40 %	440224342
28980	NC_020062	CAT	2	6	1501443	1501448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224342
28981	NC_020062	CGC	2	6	1501481	1501486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224342
28982	NC_020062	TCA	2	6	1501490	1501495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224342
28983	NC_020062	AAG	2	6	1501496	1501501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224342
28984	NC_020062	GATC	2	8	1501511	1501518	25 %	25 %	25 %	25 %	440224342
28985	NC_020062	ACC	2	6	1501546	1501551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224343
28986	NC_020062	CGG	2	6	1501559	1501564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224343
28987	NC_020062	GC	3	6	1501570	1501575	0 %	0 %	50 %	50 %	440224343
28988	NC_020062	CAC	3	9	1501637	1501645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224343
28989	NC_020062	CGA	2	6	1501655	1501660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224343
28990	NC_020062	GCA	2	6	1501682	1501687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224343
28991	NC_020062	TCC	2	6	1501699	1501704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224343
28992	NC_020062	GCG	2	6	1501754	1501759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224343
28993	NC_020062	AAT	2	6	1501787	1501792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224343
28994	NC_020062	TGC	2	6	1501795	1501800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224343
28995	NC_020062	GCG	2	6	1501804	1501809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224343
28996	NC_020062	CCT	2	6	1501823	1501828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224343
28997	NC_020062	GCCG	2	8	1501829	1501836	0 %	0 %	50 %	50 %	440224343
28998	NC_020062	GCG	2	6	1501873	1501878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224343
28999	NC_020062	ATC	2	6	1501911	1501916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224343
29000	NC_020062	AGC	3	9	1501974	1501982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224343

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