MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_020062	GC	3	6	1451143	1451148	0 %	0 %	50 %	50 %	440224293
28002	NC_020062	GC	3	6	1451248	1451253	0 %	0 %	50 %	50 %	440224293
28003	NC_020062	TCA	2	6	1451300	1451305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224293
28004	NC_020062	CTG	2	6	1451326	1451331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224293
28005	NC_020062	GCC	2	6	1451332	1451337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224293
28006	NC_020062	AAG	2	6	1451347	1451352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224293
28007	NC_020062	GCTT	2	8	1451367	1451374	0 %	50 %	25 %	25 %	440224293
28008	NC_020062	AGCCGG	2	12	1451388	1451399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224293
28009	NC_020062	ATG	2	6	1451402	1451407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224293
28010	NC_020062	CG	3	6	1451418	1451423	0 %	0 %	50 %	50 %	440224293
28011	NC_020062	CTC	2	6	1451437	1451442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224293
28012	NC_020062	GTG	2	6	1451458	1451463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224293
28013	NC_020062	GCG	2	6	1451497	1451502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224293
28014	NC_020062	TGC	2	6	1451505	1451510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224293
28015	NC_020062	GTC	2	6	1451528	1451533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224293
28016	NC_020062	GCA	2	6	1451608	1451613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224294
28017	NC_020062	CTC	2	6	1451655	1451660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224294
28018	NC_020062	TTCTT	2	10	1451662	1451671	0 %	80 %	0 %	20 %	440224294
28019	NC_020062	GCC	2	6	1451808	1451813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224294
28020	NC_020062	GGA	2	6	1451871	1451876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224294
28021	NC_020062	TCGCT	2	10	1451881	1451890	0 %	40 %	20 %	40 %	440224294
28022	NC_020062	CCTG	2	8	1451904	1451911	0 %	25 %	25 %	50 %	440224294
28023	NC_020062	GCT	2	6	1452002	1452007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224294
28024	NC_020062	CGG	3	9	1452059	1452067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224294
28025	NC_020062	GCT	2	6	1452074	1452079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224294
28026	NC_020062	AGC	2	6	1452123	1452128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224294
28027	NC_020062	CCG	2	6	1452390	1452395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224295
28028	NC_020062	CGAG	2	8	1452439	1452446	25 %	0 %	50 %	25 %	440224295
28029	NC_020062	GCC	2	6	1452452	1452457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224295
28030	NC_020062	GAT	2	6	1452476	1452481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224295
28031	NC_020062	TG	4	8	1452486	1452493	0 %	50 %	50 %	0 %	440224295
28032	NC_020062	GCT	3	9	1452512	1452520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224295
28033	NC_020062	GAG	2	6	1452606	1452611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224295
28034	NC_020062	CAA	2	6	1452618	1452623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224295
28035	NC_020062	TGA	2	6	1452633	1452638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224295
28036	NC_020062	CTG	2	6	1452659	1452664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224295
28037	NC_020062	GTCG	2	8	1452692	1452699	0 %	25 %	50 %	25 %	440224295
28038	NC_020062	GTC	2	6	1452725	1452730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224295
28039	NC_020062	CAT	2	6	1452731	1452736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224295
28040	NC_020062	AGA	2	6	1452815	1452820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224296
28041	NC_020062	CTG	2	6	1452864	1452869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224296
28042	NC_020062	CAT	2	6	1452882	1452887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224296
28043	NC_020062	GCC	2	6	1452924	1452929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224296
28044	NC_020062	GCG	2	6	1452934	1452939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224296
28045	NC_020062	CGGC	2	8	1452976	1452983	0 %	0 %	50 %	50 %	440224296
28046	NC_020062	AG	3	6	1453052	1453057	50 %	0 %	50 %	0 %	440224296
28047	NC_020062	CTTC	2	8	1453079	1453086	0 %	50 %	0 %	50 %	440224296
28048	NC_020062	TCC	2	6	1453129	1453134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224296
28049	NC_020062	CGC	2	6	1453202	1453207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224296
28050	NC_020062	ACC	2	6	1453221	1453226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224296
28051	NC_020062	TCT	2	6	1453280	1453285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224296
28052	NC_020062	GCTC	2	8	1453292	1453299	0 %	25 %	25 %	50 %	440224296
28053	NC_020062	GAA	2	6	1453485	1453490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224296
28054	NC_020062	TCG	2	6	1453492	1453497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224296
28055	NC_020062	AGA	2	6	1453520	1453525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224296
28056	NC_020062	GCC	2	6	1453539	1453544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224296
28057	NC_020062	CGT	3	9	1453602	1453610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224296
28058	NC_020062	CGG	2	6	1453704	1453709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224296
28059	NC_020062	GAAGC	2	10	1453742	1453751	40 %	0 %	40 %	20 %	440224296
28060	NC_020062	TGA	2	6	1453772	1453777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224296
28061	NC_020062	CGG	2	6	1453790	1453795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224296
28062	NC_020062	GGC	2	6	1453818	1453823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224296
28063	NC_020062	CGA	2	6	1453859	1453864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224296
28064	NC_020062	AGG	2	6	1453943	1453948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224296
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28067	NC_020062	GGT	2	6	1454100	1454105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224296
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28069	NC_020062	GCG	2	6	1454152	1454157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224296
28070	NC_020062	TCG	2	6	1454170	1454175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224296
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28077	NC_020062	TGC	2	6	1454630	1454635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224297
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28081	NC_020062	CAG	2	6	1454749	1454754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224297
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28083	NC_020062	GAT	2	6	1454940	1454945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224297
28084	NC_020062	GTG	2	6	1454960	1454965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224297
28085	NC_020062	TCG	2	6	1455026	1455031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224297
28086	NC_020062	CAGA	2	8	1455077	1455084	50 %	0 %	25 %	25 %	440224297
28087	NC_020062	TCG	2	6	1455119	1455124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224297
28088	NC_020062	GCGCC	2	10	1455131	1455140	0 %	0 %	40 %	60 %	440224297
28089	NC_020062	GCAG	2	8	1455174	1455181	25 %	0 %	50 %	25 %	440224297
28090	NC_020062	TCC	2	6	1455308	1455313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224297
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28099	NC_020062	GCG	2	6	1456050	1456055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224298
28100	NC_020062	CAG	2	6	1456064	1456069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224298
28101	NC_020062	GCT	2	6	1456109	1456114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224298
28102	NC_020062	CGG	3	9	1456217	1456225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224298
28103	NC_020062	TCGC	2	8	1456236	1456243	0 %	25 %	25 %	50 %	440224298
28104	NC_020062	CAT	2	6	1456250	1456255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224298
28105	NC_020062	TTTC	2	8	1456298	1456305	0 %	75 %	0 %	25 %	440224298
28106	NC_020062	CCT	2	6	1456333	1456338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224298
28107	NC_020062	CGGC	2	8	1456360	1456367	0 %	0 %	50 %	50 %	440224298
28108	NC_020062	GC	3	6	1456462	1456467	0 %	0 %	50 %	50 %	440224298
28109	NC_020062	TGGC	2	8	1456521	1456528	0 %	25 %	50 %	25 %	440224298
28110	NC_020062	CG	3	6	1456538	1456543	0 %	0 %	50 %	50 %	440224298
28111	NC_020062	CCT	2	6	1456550	1456555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224298
28112	NC_020062	ATG	2	6	1456564	1456569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224298
28113	NC_020062	CTGC	2	8	1456665	1456672	0 %	25 %	25 %	50 %	440224298
28114	NC_020062	CAT	2	6	1456908	1456913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224299
28115	NC_020062	GCC	2	6	1457027	1457032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224299
28116	NC_020062	GTC	2	6	1457050	1457055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224299
28117	NC_020062	CGG	2	6	1457060	1457065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224299
28118	NC_020062	TCT	2	6	1457081	1457086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224299
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28121	NC_020062	ATC	2	6	1457432	1457437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224300
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28144	NC_020062	CGG	2	6	1458834	1458839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224301
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28219	NC_020062	TCTCGA	2	12	1463069	1463080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224304
28220	NC_020062	TC	3	6	1463084	1463089	0 %	50 %	0 %	50 %	440224304
28221	NC_020062	GCC	2	6	1463103	1463108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224304
28222	NC_020062	CTGC	2	8	1463139	1463146	0 %	25 %	25 %	50 %	440224304
28223	NC_020062	TAT	2	6	1463179	1463184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224304
28224	NC_020062	GCA	2	6	1463186	1463191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224304
28225	NC_020062	ATG	2	6	1463260	1463265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224304
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28228	NC_020062	GAC	2	6	1463411	1463416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224305
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28230	NC_020062	ATG	2	6	1463442	1463447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224305
28231	NC_020062	GCC	2	6	1463521	1463526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224305
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28233	NC_020062	GC	3	6	1463568	1463573	0 %	0 %	50 %	50 %	440224305
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28342	NC_020062	GCCGAA	2	12	1468194	1468205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224307
28343	NC_020062	GAG	2	6	1468231	1468236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224307
28344	NC_020062	CGA	2	6	1468247	1468252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224307
28345	NC_020062	CGC	2	6	1468260	1468265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224307
28346	NC_020062	GCC	2	6	1468374	1468379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224307
28347	NC_020062	GCG	2	6	1468493	1468498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224307
28348	NC_020062	TCA	2	6	1468514	1468519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224307
28349	NC_020062	TCT	2	6	1468675	1468680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224308
28350	NC_020062	TGT	2	6	1468709	1468714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224308
28351	NC_020062	GATC	2	8	1468793	1468800	25 %	25 %	25 %	25 %	440224308
28352	NC_020062	CAT	2	6	1468803	1468808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224308
28353	NC_020062	CGA	2	6	1468817	1468822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224308
28354	NC_020062	GCT	2	6	1468950	1468955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224309
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28356	NC_020062	CGG	2	6	1468993	1468998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224309
28357	NC_020062	GAT	2	6	1469042	1469047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224309
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28359	NC_020062	GCA	2	6	1469064	1469069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224309
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28374	NC_020062	ATCGC	2	10	1469810	1469819	20 %	20 %	20 %	40 %	440224310
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28379	NC_020062	CG	3	6	1470205	1470210	0 %	0 %	50 %	50 %	440224310
28380	NC_020062	CGT	2	6	1470237	1470242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224310
28381	NC_020062	CGA	2	6	1470303	1470308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224310
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28432	NC_020062	GTC	2	6	1473177	1473182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224314
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28445	NC_020062	GAA	2	6	1474355	1474360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224317
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28451	NC_020062	TCT	2	6	1474639	1474644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224317
28452	NC_020062	GC	3	6	1474664	1474669	0 %	0 %	50 %	50 %	440224317
28453	NC_020062	GCA	2	6	1474717	1474722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224317
28454	NC_020062	ATC	2	6	1474742	1474747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224317
28455	NC_020062	GC	3	6	1474758	1474763	0 %	0 %	50 %	50 %	440224317
28456	NC_020062	GGC	2	6	1474805	1474810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224317
28457	NC_020062	GCG	2	6	1474875	1474880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224317
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28459	NC_020062	GAT	2	6	1475009	1475014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224317
28460	NC_020062	GAC	2	6	1475027	1475032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224317
28461	NC_020062	ATCG	2	8	1475084	1475091	25 %	25 %	25 %	25 %	440224317
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