MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_020062	CG	3	6	1404047	1404052	0 %	0 %	50 %	50 %	440224254
27003	NC_020062	CAA	2	6	1404109	1404114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224254
27004	NC_020062	GGC	2	6	1404164	1404169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
27005	NC_020062	TCG	2	6	1404170	1404175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224254
27006	NC_020062	CG	4	8	1404181	1404188	0 %	0 %	50 %	50 %	440224254
27007	NC_020062	GGC	2	6	1404193	1404198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
27008	NC_020062	GC	3	6	1404197	1404202	0 %	0 %	50 %	50 %	440224254
27009	NC_020062	AC	3	6	1404231	1404236	50 %	0 %	0 %	50 %	440224254
27010	NC_020062	ATC	2	6	1404371	1404376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224254
27011	NC_020062	GAAGGC	2	12	1404446	1404457	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440224254
27012	NC_020062	TCC	2	6	1404470	1404475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224254
27013	NC_020062	CGT	2	6	1404550	1404555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224254
27014	NC_020062	TCC	2	6	1404585	1404590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224254
27015	NC_020062	GCG	2	6	1404665	1404670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
27016	NC_020062	TGG	2	6	1404928	1404933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224255
27017	NC_020062	TTGC	2	8	1404963	1404970	0 %	50 %	25 %	25 %	440224255
27018	NC_020062	CGG	2	6	1404995	1405000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224255
27019	NC_020062	CAT	2	6	1405055	1405060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224255
27020	NC_020062	GCG	2	6	1405105	1405110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224255
27021	NC_020062	CGG	2	6	1405142	1405147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224255
27022	NC_020062	GTC	2	6	1405251	1405256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224255
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27024	NC_020062	GC	3	6	1405317	1405322	0 %	0 %	50 %	50 %	440224255
27025	NC_020062	GGA	2	6	1405325	1405330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224255
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27115	NC_020062	GCCG	2	8	1409369	1409376	0 %	0 %	50 %	50 %	440224259
27116	NC_020062	GCC	2	6	1409482	1409487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224259
27117	NC_020062	GGA	2	6	1409510	1409515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224259
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27224	NC_020062	TCG	3	9	1414453	1414461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224264
27225	NC_020062	GCC	2	6	1414467	1414472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224264
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27230	NC_020062	CAT	2	6	1414568	1414573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224264
27231	NC_020062	ACG	2	6	1414632	1414637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224264
27232	NC_020062	CTG	2	6	1414674	1414679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224264
27233	NC_020062	GCC	2	6	1414794	1414799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224264
27234	NC_020062	CGG	2	6	1414805	1414810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224264
27235	NC_020062	TCG	2	6	1414984	1414989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224264
27236	NC_020062	CTA	2	6	1415000	1415005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224264
27237	NC_020062	GCC	2	6	1415028	1415033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224264
27238	NC_020062	GCC	3	9	1415039	1415047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224264
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27240	NC_020062	CGG	2	6	1415117	1415122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224264
27241	NC_020062	CAT	2	6	1415169	1415174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224265
27242	NC_020062	CGC	2	6	1415193	1415198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224265
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27248	NC_020062	GCC	2	6	1415437	1415442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224265
27249	NC_020062	CGT	2	6	1415454	1415459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224265
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27252	NC_020062	GAG	2	6	1415644	1415649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224265
27253	NC_020062	CGA	2	6	1415655	1415660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224265
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27258	NC_020062	GC	3	6	1415753	1415758	0 %	0 %	50 %	50 %	440224265
27259	NC_020062	TGCCGA	2	12	1415814	1415825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224265
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27264	NC_020062	CGCC	2	8	1415946	1415953	0 %	0 %	25 %	75 %	440224265
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27327	NC_020062	CATG	2	8	1419234	1419241	25 %	25 %	25 %	25 %	440224268
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27331	NC_020062	TGC	2	6	1419508	1419513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224268
27332	NC_020062	CGA	2	6	1419606	1419611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224268
27333	NC_020062	AGC	2	6	1419620	1419625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224268
27334	NC_020062	GCC	2	6	1419645	1419650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224268
27335	NC_020062	CGGTG	2	10	1419795	1419804	0 %	20 %	60 %	20 %	440224268
27336	NC_020062	TCGC	2	8	1419823	1419830	0 %	25 %	25 %	50 %	440224268
27337	NC_020062	GCCATA	2	12	1419883	1419894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440224268
27338	NC_020062	TCG	2	6	1419992	1419997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224268
27339	NC_020062	GGC	2	6	1420272	1420277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224269
27340	NC_020062	CTT	2	6	1420374	1420379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224269
27341	NC_020062	GCG	2	6	1420381	1420386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224269
27342	NC_020062	GCAA	2	8	1420400	1420407	50 %	0 %	25 %	25 %	440224269
27343	NC_020062	GCAT	2	8	1420421	1420428	25 %	25 %	25 %	25 %	440224269
27344	NC_020062	CAT	2	6	1420545	1420550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224269
27345	NC_020062	GA	3	6	1420567	1420572	50 %	0 %	50 %	0 %	440224269
27346	NC_020062	ATC	2	6	1420603	1420608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224269
27347	NC_020062	GCG	2	6	1420624	1420629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224269
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27456	NC_020062	TGA	2	6	1425327	1425332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224272
27457	NC_020062	AT	3	6	1425355	1425360	50 %	50 %	0 %	0 %	440224272
27458	NC_020062	CAC	2	6	1425365	1425370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224272
27459	NC_020062	TCA	2	6	1425399	1425404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224272
27460	NC_020062	GGCG	2	8	1425431	1425438	0 %	0 %	75 %	25 %	440224272
27461	NC_020062	GCG	2	6	1425473	1425478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224272
27462	NC_020062	CTC	2	6	1425503	1425508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224272
27463	NC_020062	ATG	2	6	1425525	1425530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224272
27464	NC_020062	GC	4	8	1425567	1425574	0 %	0 %	50 %	50 %	440224272
27465	NC_020062	CGC	2	6	1425625	1425630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224272
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27467	NC_020062	ATC	2	6	1425675	1425680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224272
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27469	NC_020062	CGA	2	6	1425814	1425819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224272
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27472	NC_020062	CTT	2	6	1425895	1425900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224272
27473	NC_020062	TGC	2	6	1425933	1425938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224272
27474	NC_020062	TGG	2	6	1425954	1425959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224272
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27476	NC_020062	TGC	2	6	1425999	1426004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224272
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27488	NC_020062	CGA	2	6	1426578	1426583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224272
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27491	NC_020062	GC	3	6	1426691	1426696	0 %	0 %	50 %	50 %	440224272
27492	NC_020062	GC	3	6	1426722	1426727	0 %	0 %	50 %	50 %	440224272
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