MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_020062	CCA	2	6	1374507	1374512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224225
26503	NC_020062	CAT	2	6	1374565	1374570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224225
26504	NC_020062	CCGA	2	8	1374590	1374597	25 %	0 %	25 %	50 %	440224225
26505	NC_020062	GA	3	6	1374596	1374601	50 %	0 %	50 %	0 %	440224225
26506	NC_020062	GCC	2	6	1374607	1374612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224225
26507	NC_020062	TGATC	2	10	1374660	1374669	20 %	40 %	20 %	20 %	440224225
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26509	NC_020062	CCA	2	6	1374825	1374830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224225
26510	NC_020062	GAT	2	6	1375042	1375047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224226
26511	NC_020062	TCGC	2	8	1375071	1375078	0 %	25 %	25 %	50 %	440224226
26512	NC_020062	TGCT	2	8	1375158	1375165	0 %	50 %	25 %	25 %	440224226
26513	NC_020062	GC	3	6	1375257	1375262	0 %	0 %	50 %	50 %	440224226
26514	NC_020062	TTCC	2	8	1375289	1375296	0 %	50 %	0 %	50 %	440224226
26515	NC_020062	GGA	3	9	1375297	1375305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224226
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26517	NC_020062	TCA	2	6	1375470	1375475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224226
26518	NC_020062	CGGCGA	2	12	1375477	1375488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224226
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26520	NC_020062	TCG	2	6	1375560	1375565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224226
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26524	NC_020062	CG	3	6	1375735	1375740	0 %	0 %	50 %	50 %	440224226
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26533	NC_020062	TCG	2	6	1376180	1376185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224227
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26539	NC_020062	GC	3	6	1376524	1376529	0 %	0 %	50 %	50 %	440224227
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26591	NC_020062	GCA	2	6	1378972	1378977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224229
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26616	NC_020062	GCT	2	6	1380651	1380656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224232
26617	NC_020062	GC	3	6	1380686	1380691	0 %	0 %	50 %	50 %	440224232
26618	NC_020062	TTC	2	6	1381593	1381598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224233
26619	NC_020062	CGG	3	9	1381655	1381663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224233
26620	NC_020062	CCG	2	6	1381682	1381687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224233
26621	NC_020062	CTG	2	6	1381720	1381725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224233
26622	NC_020062	CAA	2	6	1381770	1381775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224233
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26624	NC_020062	GTCG	2	8	1381848	1381855	0 %	25 %	50 %	25 %	440224233
26625	NC_020062	ACGC	2	8	1381885	1381892	25 %	0 %	25 %	50 %	440224233
26626	NC_020062	CGA	2	6	1381982	1381987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224233
26627	NC_020062	ACC	2	6	1382008	1382013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224233
26628	NC_020062	CCTT	2	8	1382036	1382043	0 %	50 %	0 %	50 %	440224233
26629	NC_020062	GCCG	2	8	1382115	1382122	0 %	0 %	50 %	50 %	440224233
26630	NC_020062	TCG	2	6	1382180	1382185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224233
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26632	NC_020062	CAT	2	6	1382472	1382477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224234
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26636	NC_020062	TGC	2	6	1382630	1382635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
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26639	NC_020062	TA	3	6	1382770	1382775	50 %	50 %	0 %	0 %	440224234
26640	NC_020062	CGGC	2	8	1382777	1382784	0 %	0 %	50 %	50 %	440224234
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26645	NC_020062	TCG	2	6	1383110	1383115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
26646	NC_020062	GGCT	2	8	1383118	1383125	0 %	25 %	50 %	25 %	440224234
26647	NC_020062	GTTCCG	2	12	1383190	1383201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224234
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26652	NC_020062	CG	3	6	1383462	1383467	0 %	0 %	50 %	50 %	440224234
26653	NC_020062	CGG	2	6	1383510	1383515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224234
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26724	NC_020062	CTT	2	6	1388336	1388341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224240
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26729	NC_020062	TCG	2	6	1388637	1388642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224241
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26731	NC_020062	TGC	2	6	1388662	1388667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224241
26732	NC_020062	GGA	2	6	1388684	1388689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224241
26733	NC_020062	GAG	2	6	1388721	1388726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224241
26734	NC_020062	GCA	2	6	1388746	1388751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224241
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26845	NC_020062	CCGA	2	8	1394936	1394943	25 %	0 %	25 %	50 %	440224246
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26848	NC_020062	TG	3	6	1395141	1395146	0 %	50 %	50 %	0 %	440224246
26849	NC_020062	TGA	2	6	1395278	1395283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224246
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26963	NC_020062	CTC	2	6	1401344	1401349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224251
26964	NC_020062	CGC	2	6	1401364	1401369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224251
26965	NC_020062	CGC	2	6	1401380	1401385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224251
26966	NC_020062	CGG	2	6	1401405	1401410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224251
26967	NC_020062	TCA	2	6	1401426	1401431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224251
26968	NC_020062	AGG	2	6	1401488	1401493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224251
26969	NC_020062	CTA	2	6	1401717	1401722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224252
26970	NC_020062	GT	3	6	1401761	1401766	0 %	50 %	50 %	0 %	440224252
26971	NC_020062	GGT	2	6	1401767	1401772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224252
26972	NC_020062	GCC	2	6	1401823	1401828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224252
26973	NC_020062	GGC	2	6	1401850	1401855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224252
26974	NC_020062	TTC	2	6	1401935	1401940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224252
26975	NC_020062	CTGC	2	8	1401961	1401968	0 %	25 %	25 %	50 %	440224252
26976	NC_020062	ATC	2	6	1401982	1401987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224252
26977	NC_020062	TCA	2	6	1402019	1402024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224252
26978	NC_020062	CAT	2	6	1402026	1402031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224252
26979	NC_020062	TCG	2	6	1402094	1402099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224252
26980	NC_020062	TCG	2	6	1402127	1402132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224252
26981	NC_020062	A	6	6	1402258	1402263	100 %	0 %	0 %	0 %	440224253
26982	NC_020062	CGA	2	6	1402390	1402395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224253
26983	NC_020062	GCAG	2	8	1402504	1402511	25 %	0 %	50 %	25 %	440224253
26984	NC_020062	TCGA	2	8	1402513	1402520	25 %	25 %	25 %	25 %	440224253
26985	NC_020062	CGGAAG	2	12	1402642	1402653	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440224253
26986	NC_020062	GCT	2	6	1402655	1402660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224253
26987	NC_020062	ATCT	2	8	1402705	1402712	25 %	50 %	0 %	25 %	440224253
26988	NC_020062	CAG	2	6	1402719	1402724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224253
26989	NC_020062	GCG	2	6	1402731	1402736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224253
26990	NC_020062	TTG	2	6	1402810	1402815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224253
26991	NC_020062	ATC	2	6	1402935	1402940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224253
26992	NC_020062	GAG	2	6	1402941	1402946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224253
26993	NC_020062	ACA	2	6	1403706	1403711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224254
26994	NC_020062	CGG	2	6	1403775	1403780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
26995	NC_020062	CTG	2	6	1403828	1403833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224254
26996	NC_020062	GCG	2	6	1403861	1403866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224254
26997	NC_020062	CCA	2	6	1403913	1403918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224254
26998	NC_020062	ACC	2	6	1403922	1403927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224254
26999	NC_020062	GCC	2	6	1403984	1403989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224254
27000	NC_020062	CCG	2	6	1404025	1404030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224254

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