MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_020062	AGCG	2	8	1324483	1324490	25 %	0 %	50 %	25 %	440224182
25502	NC_020062	TTC	2	6	1324518	1324523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224182
25503	NC_020062	CG	3	6	1324532	1324537	0 %	0 %	50 %	50 %	440224182
25504	NC_020062	GGC	2	6	1324596	1324601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224182
25505	NC_020062	GCC	2	6	1324656	1324661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224182
25506	NC_020062	CGAT	2	8	1324706	1324713	25 %	25 %	25 %	25 %	440224182
25507	NC_020062	CGGTGG	2	12	1324718	1324729	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440224182
25508	NC_020062	TTG	2	6	1324747	1324752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224182
25509	NC_020062	CAG	2	6	1324857	1324862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224182
25510	NC_020062	GCG	2	6	1324871	1324876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224182
25511	NC_020062	TCC	2	6	1324879	1324884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224182
25512	NC_020062	TGC	2	6	1324944	1324949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224182
25513	NC_020062	GAT	2	6	1324968	1324973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224182
25514	NC_020062	CGA	2	6	1324979	1324984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224182
25515	NC_020062	CGG	2	6	1324999	1325004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224182
25516	NC_020062	GCA	2	6	1325084	1325089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224182
25517	NC_020062	CGT	2	6	1325101	1325106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224182
25518	NC_020062	TTG	2	6	1325107	1325112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224182
25519	NC_020062	CGC	2	6	1325265	1325270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224182
25520	NC_020062	CGG	2	6	1325291	1325296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224182
25521	NC_020062	GGC	2	6	1325370	1325375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224182
25522	NC_020062	GCC	2	6	1325385	1325390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224182
25523	NC_020062	GCC	2	6	1325409	1325414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224182
25524	NC_020062	GCC	2	6	1325428	1325433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224182
25525	NC_020062	GGA	2	6	1325598	1325603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224183
25526	NC_020062	G	6	6	1325647	1325652	0 %	0 %	100 %	0 %	440224183
25527	NC_020062	TCG	2	6	1325684	1325689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224183
25528	NC_020062	TCG	2	6	1325711	1325716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224183
25529	NC_020062	CGG	2	6	1325729	1325734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224183
25530	NC_020062	GCA	2	6	1325751	1325756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224183
25531	NC_020062	GTCG	2	8	1325763	1325770	0 %	25 %	50 %	25 %	440224183
25532	NC_020062	CGG	2	6	1325841	1325846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224183
25533	NC_020062	CAA	2	6	1325862	1325867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224183
25534	NC_020062	GCC	2	6	1325883	1325888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224183
25535	NC_020062	GGA	2	6	1325898	1325903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224183
25536	NC_020062	GC	4	8	1325965	1325972	0 %	0 %	50 %	50 %	440224183
25537	NC_020062	TGC	2	6	1325975	1325980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224183
25538	NC_020062	CG	3	6	1326100	1326105	0 %	0 %	50 %	50 %	440224183
25539	NC_020062	CGA	2	6	1326204	1326209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224183
25540	NC_020062	TCG	2	6	1326224	1326229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224183
25541	NC_020062	CCA	2	6	1326230	1326235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224183
25542	NC_020062	CGC	3	9	1326276	1326284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224183
25543	NC_020062	GGC	2	6	1326340	1326345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224183
25544	NC_020062	CTG	2	6	1326566	1326571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224184
25545	NC_020062	CGA	2	6	1326649	1326654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224184
25546	NC_020062	ATC	2	6	1326689	1326694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224184
25547	NC_020062	CGCA	2	8	1326707	1326714	25 %	0 %	25 %	50 %	440224184
25548	NC_020062	GCC	2	6	1326737	1326742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224184
25549	NC_020062	AAG	2	6	1326743	1326748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224184
25550	NC_020062	GCT	2	6	1326762	1326767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224184
25551	NC_020062	ATC	2	6	1326881	1326886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224184
25552	NC_020062	GCGG	2	8	1326929	1326936	0 %	0 %	75 %	25 %	440224184
25553	NC_020062	CCG	2	6	1326948	1326953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224184
25554	NC_020062	TCG	2	6	1326990	1326995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224184
25555	NC_020062	GCT	2	6	1327120	1327125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224184
25556	NC_020062	GAA	2	6	1327210	1327215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224184
25557	NC_020062	CTT	2	6	1327222	1327227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224184
25558	NC_020062	CAA	2	6	1327231	1327236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224184
25559	NC_020062	CGC	2	6	1327359	1327364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224184
25560	NC_020062	CGC	2	6	1327392	1327397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224184
25561	NC_020062	CGG	2	6	1327402	1327407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224184
25562	NC_020062	GAA	2	6	1327415	1327420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224184
25563	NC_020062	GGAAG	2	10	1327436	1327445	40 %	0 %	60 %	0 %	440224184
25564	NC_020062	GCC	2	6	1327519	1327524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224184
25565	NC_020062	CG	3	6	1327605	1327610	0 %	0 %	50 %	50 %	440224184
25566	NC_020062	TCG	2	6	1327620	1327625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224184
25567	NC_020062	TCA	2	6	1328017	1328022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224185
25568	NC_020062	ATG	2	6	1328158	1328163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224185
25569	NC_020062	CCAGC	2	10	1328222	1328231	20 %	0 %	20 %	60 %	440224185
25570	NC_020062	GCTGA	2	10	1328319	1328328	20 %	20 %	40 %	20 %	440224185
25571	NC_020062	GCAT	2	8	1328395	1328402	25 %	25 %	25 %	25 %	440224185
25572	NC_020062	GCA	2	6	1328486	1328491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224186
25573	NC_020062	C	6	6	1328499	1328504	0 %	0 %	0 %	100 %	440224186
25574	NC_020062	CTTCG	2	10	1328579	1328588	0 %	40 %	20 %	40 %	440224186
25575	NC_020062	ACC	2	6	1328598	1328603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224186
25576	NC_020062	TCG	2	6	1328650	1328655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224186
25577	NC_020062	GCT	2	6	1328753	1328758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224186
25578	NC_020062	CCTGC	2	10	1328771	1328780	0 %	20 %	20 %	60 %	440224186
25579	NC_020062	TGG	2	6	1328783	1328788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224186
25580	NC_020062	GGA	2	6	1328838	1328843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224186
25581	NC_020062	GAC	2	6	1328844	1328849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224186
25582	NC_020062	GAT	2	6	1328850	1328855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224186
25583	NC_020062	GCC	3	9	1328859	1328867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224186
25584	NC_020062	CATTC	2	10	1328939	1328948	20 %	40 %	0 %	40 %	440224186
25585	NC_020062	TCG	2	6	1328962	1328967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224186
25586	NC_020062	ACG	2	6	1329004	1329009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224186
25587	NC_020062	GCCG	2	8	1329017	1329024	0 %	0 %	50 %	50 %	440224186
25588	NC_020062	CG	3	6	1329028	1329033	0 %	0 %	50 %	50 %	440224186
25589	NC_020062	GAG	2	6	1329084	1329089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224186
25590	NC_020062	GCC	2	6	1329094	1329099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224186
25591	NC_020062	GGA	2	6	1329132	1329137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224186
25592	NC_020062	CTTC	2	8	1329143	1329150	0 %	50 %	0 %	50 %	440224186
25593	NC_020062	TCC	2	6	1329181	1329186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224186
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25595	NC_020062	AGCC	2	8	1330020	1330027	25 %	0 %	25 %	50 %	440224187
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25597	NC_020062	CAAG	2	8	1330125	1330132	50 %	0 %	25 %	25 %	440224187
25598	NC_020062	TCG	2	6	1330199	1330204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224187
25599	NC_020062	CAT	2	6	1330218	1330223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224187
25600	NC_020062	GAT	2	6	1330305	1330310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224187
25601	NC_020062	CAA	2	6	1330353	1330358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224187
25602	NC_020062	AGA	2	6	1330389	1330394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224187
25603	NC_020062	AGC	2	6	1330399	1330404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224187
25604	NC_020062	CGA	2	6	1330410	1330415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224187
25605	NC_020062	GCC	2	6	1330447	1330452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224187
25606	NC_020062	CGC	2	6	1330488	1330493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224187
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25608	NC_020062	CCG	2	6	1330544	1330549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224187
25609	NC_020062	GGTC	2	8	1330581	1330588	0 %	25 %	50 %	25 %	440224187
25610	NC_020062	GGC	3	9	1330593	1330601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224187
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25613	NC_020062	TCG	2	6	1330811	1330816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224187
25614	NC_020062	GGAT	2	8	1330835	1330842	25 %	25 %	50 %	0 %	440224187
25615	NC_020062	GAG	2	6	1330867	1330872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224187
25616	NC_020062	GGT	2	6	1330894	1330899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224187
25617	NC_020062	GCC	2	6	1330909	1330914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224187
25618	NC_020062	CGA	2	6	1330941	1330946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224187
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25620	NC_020062	GGC	2	6	1330971	1330976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224187
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25622	NC_020062	CGG	2	6	1330991	1330996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224187
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25626	NC_020062	GC	3	6	1331070	1331075	0 %	0 %	50 %	50 %	440224187
25627	NC_020062	CAT	2	6	1331166	1331171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224187
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25643	NC_020062	T	6	6	1332086	1332091	0 %	100 %	0 %	0 %	440224188
25644	NC_020062	CGA	2	6	1332238	1332243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224188
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25727	NC_020062	GCT	2	6	1335714	1335719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224192
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25729	NC_020062	GCAA	2	8	1335821	1335828	50 %	0 %	25 %	25 %	440224192
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25731	NC_020062	GAC	2	6	1335898	1335903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224192
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25734	NC_020062	TCG	3	9	1336005	1336013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224192
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25736	NC_020062	GC	3	6	1336066	1336071	0 %	0 %	50 %	50 %	440224192
25737	NC_020062	AGGCC	2	10	1336095	1336104	20 %	0 %	40 %	40 %	440224192
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25841	NC_020062	CCGGCA	2	12	1340984	1340995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440224197
25842	NC_020062	GGCCA	2	10	1341001	1341010	20 %	0 %	40 %	40 %	440224197
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