MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_020062	CGC	2	6	1271163	1271168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224130
24502	NC_020062	TGG	2	6	1271174	1271179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224130
24503	NC_020062	ATCC	2	8	1271192	1271199	25 %	25 %	0 %	50 %	440224130
24504	NC_020062	CGC	2	6	1271223	1271228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224130
24505	NC_020062	TGGAT	2	10	1271238	1271247	20 %	40 %	40 %	0 %	440224130
24506	NC_020062	ACACG	2	10	1271282	1271291	40 %	0 %	20 %	40 %	440224130
24507	NC_020062	A	6	6	1271330	1271335	100 %	0 %	0 %	0 %	440224130
24508	NC_020062	GAC	2	6	1271346	1271351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224130
24509	NC_020062	CCGG	2	8	1271373	1271380	0 %	0 %	50 %	50 %	440224130
24510	NC_020062	TCG	2	6	1271450	1271455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224130
24511	NC_020062	CCA	2	6	1271544	1271549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224130
24512	NC_020062	CCA	2	6	1271592	1271597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224130
24513	NC_020062	GCC	2	6	1271650	1271655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224130
24514	NC_020062	CAG	2	6	1271674	1271679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224130
24515	NC_020062	CGAT	2	8	1271685	1271692	25 %	25 %	25 %	25 %	440224130
24516	NC_020062	GAC	2	6	1271693	1271698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224130
24517	NC_020062	CGTG	2	8	1271795	1271802	0 %	25 %	50 %	25 %	440224131
24518	NC_020062	ATG	2	6	1271815	1271820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224131
24519	NC_020062	CCG	2	6	1271841	1271846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224131
24520	NC_020062	GTC	2	6	1271853	1271858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224131
24521	NC_020062	CGG	2	6	1271869	1271874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224131
24522	NC_020062	TCG	2	6	1271890	1271895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224131
24523	NC_020062	CCT	2	6	1271944	1271949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224131
24524	NC_020062	GCC	2	6	1271964	1271969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224131
24525	NC_020062	AGGC	2	8	1272052	1272059	25 %	0 %	50 %	25 %	440224131
24526	NC_020062	CCGCA	2	10	1272248	1272257	20 %	0 %	20 %	60 %	440224131
24527	NC_020062	TGGG	2	8	1272303	1272310	0 %	25 %	75 %	0 %	440224131
24528	NC_020062	CGT	2	6	1272374	1272379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224131
24529	NC_020062	TTG	2	6	1272430	1272435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224131
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24531	NC_020062	CGG	2	6	1272646	1272651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224131
24532	NC_020062	AGGC	2	8	1272659	1272666	25 %	0 %	50 %	25 %	440224131
24533	NC_020062	GGCA	2	8	1272670	1272677	25 %	0 %	50 %	25 %	440224131
24534	NC_020062	AT	3	6	1272685	1272690	50 %	50 %	0 %	0 %	440224131
24535	NC_020062	TGCGC	2	10	1272704	1272713	0 %	20 %	40 %	40 %	440224131
24536	NC_020062	TCG	2	6	1272763	1272768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224131
24537	NC_020062	TGC	2	6	1272779	1272784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224131
24538	NC_020062	GA	3	6	1272797	1272802	50 %	0 %	50 %	0 %	440224131
24539	NC_020062	CCG	2	6	1272874	1272879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224131
24540	NC_020062	TCG	2	6	1272997	1273002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224131
24541	NC_020062	CAT	2	6	1273064	1273069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224131
24542	NC_020062	CCG	2	6	1273104	1273109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224131
24543	NC_020062	CGC	2	6	1273199	1273204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224132
24544	NC_020062	CGG	2	6	1273244	1273249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24545	NC_020062	GGATC	2	10	1273292	1273301	20 %	20 %	40 %	20 %	440224132
24546	NC_020062	TCG	2	6	1273306	1273311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24547	NC_020062	CGG	2	6	1273342	1273347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24548	NC_020062	ATC	3	9	1273383	1273391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224132
24549	NC_020062	TGC	2	6	1273412	1273417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24550	NC_020062	CGG	2	6	1273486	1273491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24551	NC_020062	GCA	2	6	1273589	1273594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24552	NC_020062	GGC	2	6	1273654	1273659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24553	NC_020062	GC	4	8	1273755	1273762	0 %	0 %	50 %	50 %	440224132
24554	NC_020062	GGC	2	6	1273787	1273792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24555	NC_020062	CCG	2	6	1273810	1273815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224132
24556	NC_020062	CCA	2	6	1273816	1273821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224132
24557	NC_020062	GCT	2	6	1273919	1273924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24558	NC_020062	TCG	2	6	1273972	1273977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24559	NC_020062	GGC	2	6	1273989	1273994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24560	NC_020062	TGC	2	6	1274029	1274034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24561	NC_020062	CGC	3	9	1274042	1274050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224132
24562	NC_020062	TCG	2	6	1274074	1274079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224132
24563	NC_020062	CAT	2	6	1274105	1274110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224132
24564	NC_020062	GCG	3	9	1274176	1274184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224132
24565	NC_020062	GCC	3	9	1274294	1274302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224132
24566	NC_020062	CCCG	2	8	1274350	1274357	0 %	0 %	25 %	75 %	440224132
24567	NC_020062	GAG	2	6	1274402	1274407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224133
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24569	NC_020062	TCG	2	6	1274526	1274531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
24570	NC_020062	TCG	2	6	1274565	1274570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
24571	NC_020062	TCG	2	6	1274697	1274702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224133
24572	NC_020062	GACA	2	8	1274846	1274853	50 %	0 %	25 %	25 %	440224133
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24575	NC_020062	GCC	2	6	1275023	1275028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224133
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24585	NC_020062	ACG	2	6	1275362	1275367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224133
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24587	NC_020062	AGGC	2	8	1275425	1275432	25 %	0 %	50 %	25 %	440224134
24588	NC_020062	CTG	2	6	1275433	1275438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224134
24589	NC_020062	TTTCG	2	10	1275467	1275476	0 %	60 %	20 %	20 %	440224134
24590	NC_020062	GCA	2	6	1275535	1275540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224134
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24597	NC_020062	CGC	2	6	1275771	1275776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224134
24598	NC_020062	CAATA	2	10	1275792	1275801	60 %	20 %	0 %	20 %	440224134
24599	NC_020062	AC	3	6	1275856	1275861	50 %	0 %	0 %	50 %	440224134
24600	NC_020062	CTTGC	2	10	1275868	1275877	0 %	40 %	20 %	40 %	440224134
24601	NC_020062	GCC	2	6	1276054	1276059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224134
24602	NC_020062	TCG	2	6	1276079	1276084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224134
24603	NC_020062	TGG	2	6	1276217	1276222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224134
24604	NC_020062	TGA	2	6	1276235	1276240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224134
24605	NC_020062	GAA	2	6	1276257	1276262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224134
24606	NC_020062	CCA	2	6	1276268	1276273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224134
24607	NC_020062	AGC	2	6	1276314	1276319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224134
24608	NC_020062	ATG	2	6	1276323	1276328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224134
24609	NC_020062	GCC	2	6	1276383	1276388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224135
24610	NC_020062	GCA	2	6	1276441	1276446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24611	NC_020062	GCT	2	6	1276466	1276471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24612	NC_020062	TGAT	2	8	1276516	1276523	25 %	50 %	25 %	0 %	440224135
24613	NC_020062	CGA	2	6	1276659	1276664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24614	NC_020062	CGG	2	6	1276778	1276783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224135
24615	NC_020062	CTG	2	6	1276803	1276808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24616	NC_020062	TGC	2	6	1276819	1276824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24617	NC_020062	CTT	2	6	1276836	1276841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224135
24618	NC_020062	CGA	2	6	1276844	1276849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24619	NC_020062	GCA	2	6	1276875	1276880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224135
24620	NC_020062	GC	3	6	1276881	1276886	0 %	0 %	50 %	50 %	440224135
24621	NC_020062	CGG	2	6	1276900	1276905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224135
24622	NC_020062	AGCG	2	8	1276911	1276918	25 %	0 %	50 %	25 %	440224135
24623	NC_020062	CAC	2	6	1276928	1276933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224135
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24633	NC_020062	GC	3	6	1277426	1277431	0 %	0 %	50 %	50 %	440224136
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24637	NC_020062	GTGG	2	8	1277687	1277694	0 %	25 %	75 %	0 %	440224136
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24642	NC_020062	TCC	2	6	1278029	1278034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224137
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24644	NC_020062	CG	3	6	1278069	1278074	0 %	0 %	50 %	50 %	440224137
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24646	NC_020062	ATG	2	6	1278113	1278118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224137
24647	NC_020062	GC	3	6	1278203	1278208	0 %	0 %	50 %	50 %	440224137
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24722	NC_020062	CTT	2	6	1282584	1282589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224140
24723	NC_020062	GCCA	2	8	1282598	1282605	25 %	0 %	25 %	50 %	440224140
24724	NC_020062	ATC	2	6	1282650	1282655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224140
24725	NC_020062	TGC	2	6	1282685	1282690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224140
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24727	NC_020062	GAC	2	6	1282770	1282775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224140
24728	NC_020062	TGGA	2	8	1282852	1282859	25 %	25 %	50 %	0 %	440224140
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24730	NC_020062	TCC	2	6	1283002	1283007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224141
24731	NC_020062	GCT	2	6	1283123	1283128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224141
24732	NC_020062	TTC	2	6	1283151	1283156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224141
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24830	NC_020062	GTTCC	2	10	1289705	1289714	0 %	40 %	20 %	40 %	440224151
24831	NC_020062	ACG	2	6	1289725	1289730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224151
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24833	NC_020062	GAA	2	6	1289749	1289754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224151
24834	NC_020062	GGT	2	6	1289757	1289762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224151
24835	NC_020062	GC	3	6	1289765	1289770	0 %	0 %	50 %	50 %	440224151
24836	NC_020062	GC	4	8	1289772	1289779	0 %	0 %	50 %	50 %	440224151
24837	NC_020062	CAT	2	6	1289928	1289933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224152
24838	NC_020062	GCA	2	6	1289972	1289977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224152
24839	NC_020062	CCG	2	6	1289978	1289983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224152
24840	NC_020062	GAA	2	6	1290052	1290057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224152
24841	NC_020062	TGA	2	6	1290147	1290152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224152
24842	NC_020062	CAA	2	6	1290189	1290194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224152
24843	NC_020062	TTC	2	6	1290253	1290258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224152
24844	NC_020062	CGCC	2	8	1290288	1290295	0 %	0 %	25 %	75 %	440224152
24845	NC_020062	ATC	2	6	1290334	1290339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224152
24846	NC_020062	GC	3	6	1290421	1290426	0 %	0 %	50 %	50 %	440224152
24847	NC_020062	CG	3	6	1290494	1290499	0 %	0 %	50 %	50 %	440224152
24848	NC_020062	CGT	2	6	1290501	1290506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224152
24849	NC_020062	TCG	2	6	1290512	1290517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224152
24850	NC_020062	GGAA	2	8	1290534	1290541	50 %	0 %	50 %	0 %	440224152
24851	NC_020062	TTC	2	6	1290568	1290573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224152
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24853	NC_020062	GCA	2	6	1290679	1290684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224152
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24885	NC_020062	CGCT	2	8	1292376	1292383	0 %	25 %	25 %	50 %	440224155
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24955	NC_020062	TCG	2	6	1295370	1295375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224158
24956	NC_020062	GCT	2	6	1295425	1295430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224158
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24960	NC_020062	CGTC	2	8	1295647	1295654	0 %	25 %	25 %	50 %	440224158
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24964	NC_020062	ATC	2	6	1295882	1295887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224159
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24994	NC_020062	GC	3	6	1297156	1297161	0 %	0 %	50 %	50 %	440224160
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24999	NC_020062	GGC	2	6	1297274	1297279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224160
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