MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_020062	TGG	2	6	1216695	1216700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224086
23503	NC_020062	GCC	2	6	1216786	1216791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086
23504	NC_020062	GA	4	8	1216804	1216811	50 %	0 %	50 %	0 %	440224086
23505	NC_020062	CCG	2	6	1216859	1216864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086
23506	NC_020062	CCG	2	6	1216907	1216912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086
23507	NC_020062	GA	3	6	1216978	1216983	50 %	0 %	50 %	0 %	440224086
23508	NC_020062	GAA	2	6	1217096	1217101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224086
23509	NC_020062	CAC	2	6	1217416	1217421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224087
23510	NC_020062	ATCG	2	8	1217440	1217447	25 %	25 %	25 %	25 %	440224087
23511	NC_020062	GCCG	2	8	1217646	1217653	0 %	0 %	50 %	50 %	440224087
23512	NC_020062	GGC	2	6	1217692	1217697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224087
23513	NC_020062	CG	3	6	1217719	1217724	0 %	0 %	50 %	50 %	440224087
23514	NC_020062	CGGG	2	8	1217783	1217790	0 %	0 %	75 %	25 %	440224087
23515	NC_020062	GCA	2	6	1217812	1217817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224087
23516	NC_020062	CAG	2	6	1217840	1217845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224087
23517	NC_020062	AGC	2	6	1217847	1217852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224087
23518	NC_020062	GCGA	2	8	1217900	1217907	25 %	0 %	50 %	25 %	440224087
23519	NC_020062	CG	3	6	1217988	1217993	0 %	0 %	50 %	50 %	440224087
23520	NC_020062	TGC	2	6	1218001	1218006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224087
23521	NC_020062	GCCG	2	8	1218117	1218124	0 %	0 %	50 %	50 %	440224087
23522	NC_020062	GCC	2	6	1218163	1218168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224087
23523	NC_020062	CG	3	6	1218180	1218185	0 %	0 %	50 %	50 %	440224087
23524	NC_020062	TGG	2	6	1218199	1218204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224087
23525	NC_020062	CAC	2	6	1218255	1218260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224087
23526	NC_020062	GCAA	2	8	1218275	1218282	50 %	0 %	25 %	25 %	440224087
23527	NC_020062	TAG	2	6	1218341	1218346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224087
23528	NC_020062	GCA	2	6	1218417	1218422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224088
23529	NC_020062	GGT	2	6	1218508	1218513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224088
23530	NC_020062	ATC	2	6	1218530	1218535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224088
23531	NC_020062	GGC	2	6	1218561	1218566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224088
23532	NC_020062	TGG	2	6	1218567	1218572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224088
23533	NC_020062	TGC	2	6	1218597	1218602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224088
23534	NC_020062	GCC	2	6	1218634	1218639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224088
23535	NC_020062	CTG	2	6	1218671	1218676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224088
23536	NC_020062	GATGCT	2	12	1218706	1218717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440224088
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23539	NC_020062	GC	3	6	1218760	1218765	0 %	0 %	50 %	50 %	440224088
23540	NC_020062	TCT	2	6	1218829	1218834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224088
23541	NC_020062	GCT	2	6	1218895	1218900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224088
23542	NC_020062	GGC	2	6	1218908	1218913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224088
23543	NC_020062	CGA	2	6	1218933	1218938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224088
23544	NC_020062	GGC	2	6	1218955	1218960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224088
23545	NC_020062	CGCC	2	8	1218964	1218971	0 %	0 %	25 %	75 %	440224088
23546	NC_020062	CG	3	6	1219020	1219025	0 %	0 %	50 %	50 %	440224088
23547	NC_020062	CG	3	6	1219120	1219125	0 %	0 %	50 %	50 %	440224088
23548	NC_020062	GAC	2	6	1219160	1219165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224088
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23550	NC_020062	CGAG	2	8	1219251	1219258	25 %	0 %	50 %	25 %	440224088
23551	NC_020062	CAT	2	6	1219276	1219281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224088
23552	NC_020062	GCC	2	6	1219307	1219312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224088
23553	NC_020062	TTC	2	6	1219313	1219318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224088
23554	NC_020062	GCC	2	6	1219328	1219333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224088
23555	NC_020062	ATG	2	6	1219526	1219531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224088
23556	NC_020062	GTC	2	6	1219600	1219605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224088
23557	NC_020062	GTTTCC	2	12	1219621	1219632	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440224088
23558	NC_020062	TCT	2	6	1219668	1219673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224088
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23560	NC_020062	GCCG	2	8	1219831	1219838	0 %	0 %	50 %	50 %	440224088
23561	NC_020062	GCC	2	6	1219929	1219934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224088
23562	NC_020062	TTC	2	6	1219937	1219942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224088
23563	NC_020062	ATC	2	6	1219961	1219966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224088
23564	NC_020062	GTC	2	6	1220027	1220032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224088
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23569	NC_020062	CGC	2	6	1220132	1220137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224088
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23574	NC_020062	AT	3	6	1220359	1220364	50 %	50 %	0 %	0 %	440224088
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23579	NC_020062	CAT	2	6	1220464	1220469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224088
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23589	NC_020062	ATCT	2	8	1221016	1221023	25 %	50 %	0 %	25 %	440224089
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23596	NC_020062	GCCG	2	8	1221325	1221332	0 %	0 %	50 %	50 %	440224089
23597	NC_020062	CGA	2	6	1221350	1221355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224089
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23599	NC_020062	TCG	2	6	1221410	1221415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224089
23600	NC_020062	GAC	2	6	1221438	1221443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224089
23601	NC_020062	CGG	2	6	1221572	1221577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224089
23602	NC_020062	CAG	2	6	1221658	1221663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224089
23603	NC_020062	CTT	3	9	1221664	1221672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224089
23604	NC_020062	TCCT	2	8	1221681	1221688	0 %	50 %	0 %	50 %	440224089
23605	NC_020062	TGG	2	6	1221716	1221721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224089
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23607	NC_020062	CG	3	6	1221736	1221741	0 %	0 %	50 %	50 %	440224089
23608	NC_020062	CTG	2	6	1221760	1221765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224089
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23610	NC_020062	GGCGA	2	10	1221925	1221934	20 %	0 %	60 %	20 %	440224089
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23614	NC_020062	GC	3	6	1222151	1222156	0 %	0 %	50 %	50 %	440224089
23615	NC_020062	ACG	2	6	1222174	1222179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224089
23616	NC_020062	GGC	2	6	1222254	1222259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224089
23617	NC_020062	CGC	2	6	1222302	1222307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224089
23618	NC_020062	CCG	2	6	1222379	1222384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224089
23619	NC_020062	ACCG	2	8	1222404	1222411	25 %	0 %	25 %	50 %	440224089
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23621	NC_020062	AGG	2	6	1222742	1222747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224089
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23627	NC_020062	CGC	2	6	1222968	1222973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224089
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23629	NC_020062	GAC	2	6	1223129	1223134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224090
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23640	NC_020062	TCA	2	6	1223620	1223625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224090
23641	NC_020062	ATCC	2	8	1223626	1223633	25 %	25 %	0 %	50 %	440224090
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23713	NC_020062	AATG	2	8	1227479	1227486	50 %	25 %	25 %	0 %	440224092
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23715	NC_020062	G	6	6	1227623	1227628	0 %	0 %	100 %	0 %	440224092
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23717	NC_020062	GCG	2	6	1227646	1227651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224092
23718	NC_020062	TCGTC	2	10	1227671	1227680	0 %	40 %	20 %	40 %	440224092
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23720	NC_020062	GA	3	6	1227811	1227816	50 %	0 %	50 %	0 %	440224092
23721	NC_020062	GGTCG	2	10	1227825	1227834	0 %	20 %	60 %	20 %	440224092
23722	NC_020062	TCCG	2	8	1227849	1227856	0 %	25 %	25 %	50 %	440224092
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23724	NC_020062	CGTG	2	8	1227939	1227946	0 %	25 %	50 %	25 %	440224092
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23726	NC_020062	CG	3	6	1227995	1228000	0 %	0 %	50 %	50 %	440224092
23727	NC_020062	GC	3	6	1228025	1228030	0 %	0 %	50 %	50 %	440224092
23728	NC_020062	CCCG	2	8	1228047	1228054	0 %	0 %	25 %	75 %	440224092
23729	NC_020062	GCA	2	6	1228064	1228069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224092
23730	NC_020062	CTC	2	6	1228158	1228163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224092
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23732	NC_020062	CCG	2	6	1228296	1228301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224093
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23963	NC_020062	CCG	2	6	1238384	1238389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224101
23964	NC_020062	CGT	2	6	1238408	1238413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
23965	NC_020062	CCTT	2	8	1238479	1238486	0 %	50 %	0 %	50 %	440224101
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23968	NC_020062	CGT	2	6	1238627	1238632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224101
23969	NC_020062	ACG	2	6	1238673	1238678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
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23973	NC_020062	CTC	2	6	1238768	1238773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224101
23974	NC_020062	GCA	2	6	1238930	1238935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224101
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23985	NC_020062	GT	3	6	1239805	1239810	0 %	50 %	50 %	0 %	440224102
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23989	NC_020062	GCGG	2	8	1240064	1240071	0 %	0 %	75 %	25 %	440224103
23990	NC_020062	CTT	2	6	1240081	1240086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224103
23991	NC_020062	CGA	2	6	1240108	1240113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224103
23992	NC_020062	CGG	2	6	1240142	1240147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224103
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23994	NC_020062	CGA	2	6	1240165	1240170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224103
23995	NC_020062	GCAG	2	8	1240203	1240210	25 %	0 %	50 %	25 %	440224103
23996	NC_020062	CTTGC	2	10	1240217	1240226	0 %	40 %	20 %	40 %	440224103
23997	NC_020062	GGT	2	6	1240252	1240257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224103
23998	NC_020062	TCG	2	6	1240341	1240346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224103
23999	NC_020062	AGT	2	6	1240700	1240705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224104
24000	NC_020062	GCA	2	6	1240790	1240795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224104

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