MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_020062	GATC	2	8	1190970	1190977	25 %	25 %	25 %	25 %	440224068
23002	NC_020062	CGC	2	6	1190985	1190990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224068
23003	NC_020062	CGG	2	6	1191015	1191020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224068
23004	NC_020062	ATC	2	6	1191047	1191052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224068
23005	NC_020062	CGA	2	6	1191171	1191176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224068
23006	NC_020062	CCT	2	6	1191317	1191322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224068
23007	NC_020062	ATC	2	6	1191391	1191396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224068
23008	NC_020062	GGC	2	6	1191406	1191411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224068
23009	NC_020062	CGG	3	9	1191510	1191518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224068
23010	NC_020062	GCT	2	6	1191609	1191614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224068
23011	NC_020062	CCG	2	6	1191632	1191637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224068
23012	NC_020062	GC	3	6	1191704	1191709	0 %	0 %	50 %	50 %	440224068
23013	NC_020062	TC	3	6	1191750	1191755	0 %	50 %	0 %	50 %	440224068
23014	NC_020062	CCG	2	6	1191768	1191773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224068
23015	NC_020062	CTG	2	6	1191796	1191801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224068
23016	NC_020062	CGC	2	6	1191834	1191839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224068
23017	NC_020062	CGT	2	6	1191888	1191893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224068
23018	NC_020062	GAA	2	6	1191931	1191936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224068
23019	NC_020062	GGC	2	6	1191948	1191953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224068
23020	NC_020062	GCG	2	6	1191961	1191966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224068
23021	NC_020062	ATC	2	6	1191972	1191977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224068
23022	NC_020062	ATC	2	6	1192306	1192311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224069
23023	NC_020062	GCG	2	6	1192345	1192350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224069
23024	NC_020062	CGT	2	6	1192401	1192406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224069
23025	NC_020062	CAG	2	6	1192422	1192427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224069
23026	NC_020062	CGC	2	6	1192443	1192448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224069
23027	NC_020062	TCA	2	6	1192475	1192480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224069
23028	NC_020062	GCCA	2	8	1192499	1192506	25 %	0 %	25 %	50 %	440224069
23029	NC_020062	GGA	2	6	1192647	1192652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224069
23030	NC_020062	TTCGG	2	10	1192660	1192669	0 %	40 %	40 %	20 %	440224069
23031	NC_020062	TGC	2	6	1192704	1192709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224069
23032	NC_020062	TCT	2	6	1192710	1192715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224069
23033	NC_020062	CCGC	2	8	1192736	1192743	0 %	0 %	25 %	75 %	440224069
23034	NC_020062	ATC	2	6	1192750	1192755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224069
23035	NC_020062	GTC	2	6	1192804	1192809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224069
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23039	NC_020062	GACG	2	8	1193010	1193017	25 %	0 %	50 %	25 %	440224069
23040	NC_020062	GGCC	2	8	1193098	1193105	0 %	0 %	50 %	50 %	440224069
23041	NC_020062	TGC	2	6	1193183	1193188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224069
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23054	NC_020062	GCT	2	6	1194404	1194409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224070
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23058	NC_020062	AGCC	2	8	1194508	1194515	25 %	0 %	25 %	50 %	440224070
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23063	NC_020062	CGG	2	6	1194916	1194921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224071
23064	NC_020062	GCCG	2	8	1194945	1194952	0 %	0 %	50 %	50 %	440224071
23065	NC_020062	TCGGCC	2	12	1195080	1195091	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224071
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23069	NC_020062	GGCC	2	8	1195300	1195307	0 %	0 %	50 %	50 %	440224071
23070	NC_020062	TGG	2	6	1195315	1195320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224071
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23084	NC_020062	GC	3	6	1196024	1196029	0 %	0 %	50 %	50 %	440224071
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23099	NC_020062	CCCT	2	8	1196873	1196880	0 %	25 %	0 %	75 %	440224072
23100	NC_020062	CAGA	2	8	1196889	1196896	50 %	0 %	25 %	25 %	440224072
23101	NC_020062	CCG	3	9	1196897	1196905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224072
23102	NC_020062	CGA	2	6	1197018	1197023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224072
23103	NC_020062	CCT	2	6	1197057	1197062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224072
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23105	NC_020062	CGC	2	6	1197099	1197104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224072
23106	NC_020062	GCA	2	6	1197195	1197200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224072
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23111	NC_020062	CGAG	2	8	1197351	1197358	25 %	0 %	50 %	25 %	440224072
23112	NC_020062	GCCT	2	8	1197376	1197383	0 %	25 %	25 %	50 %	440224072
23113	NC_020062	GCG	3	9	1197466	1197474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224072
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23115	NC_020062	GCG	2	6	1197501	1197506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224072
23116	NC_020062	GCA	2	6	1197518	1197523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224072
23117	NC_020062	GC	3	6	1197525	1197530	0 %	0 %	50 %	50 %	440224072
23118	NC_020062	CGG	2	6	1197676	1197681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224073
23119	NC_020062	GC	3	6	1197767	1197772	0 %	0 %	50 %	50 %	440224073
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23220	NC_020062	CAG	2	6	1202334	1202339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224076
23221	NC_020062	CGC	2	6	1202371	1202376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224076
23222	NC_020062	CGG	2	6	1202383	1202388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224076
23223	NC_020062	A	6	6	1202390	1202395	100 %	0 %	0 %	0 %	440224076
23224	NC_020062	CGA	2	6	1202402	1202407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224076
23225	NC_020062	GTC	2	6	1202444	1202449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224076
23226	NC_020062	GCG	2	6	1202495	1202500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224076
23227	NC_020062	GCC	2	6	1202562	1202567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224076
23228	NC_020062	ACC	2	6	1202730	1202735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224076
23229	NC_020062	CTC	2	6	1202751	1202756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224076
23230	NC_020062	GCAA	2	8	1202783	1202790	50 %	0 %	25 %	25 %	440224076
23231	NC_020062	CGAA	2	8	1202794	1202801	50 %	0 %	25 %	25 %	440224076
23232	NC_020062	CCG	2	6	1202826	1202831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224076
23233	NC_020062	GC	3	6	1202832	1202837	0 %	0 %	50 %	50 %	440224076
23234	NC_020062	CATC	2	8	1202872	1202879	25 %	25 %	0 %	50 %	440224076
23235	NC_020062	GCATCG	2	12	1202890	1202901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440224076
23236	NC_020062	CGA	2	6	1202948	1202953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224076
23237	NC_020062	GAC	2	6	1203075	1203080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224076
23238	NC_020062	CGG	2	6	1203120	1203125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224076
23239	NC_020062	GCC	2	6	1203186	1203191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224076
23240	NC_020062	GGCT	2	8	1203196	1203203	0 %	25 %	50 %	25 %	440224076
23241	NC_020062	ATCG	2	8	1203263	1203270	25 %	25 %	25 %	25 %	440224076
23242	NC_020062	ATC	2	6	1203276	1203281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224076
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23244	NC_020062	GGC	2	6	1203306	1203311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224076
23245	NC_020062	ATC	2	6	1203334	1203339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224076
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23247	NC_020062	CTCG	2	8	1203380	1203387	0 %	25 %	25 %	50 %	440224076
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23320	NC_020062	GCAG	2	8	1207024	1207031	25 %	0 %	50 %	25 %	440224077
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23330	NC_020062	AGAA	2	8	1207521	1207528	75 %	0 %	25 %	0 %	440224078
23331	NC_020062	GCA	2	6	1207729	1207734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224078
23332	NC_020062	TCT	2	6	1207752	1207757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224078
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23335	NC_020062	CGG	2	6	1208199	1208204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224079
23336	NC_020062	GAG	2	6	1208314	1208319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224079
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23339	NC_020062	GC	3	6	1208375	1208380	0 %	0 %	50 %	50 %	440224079
23340	NC_020062	CGC	2	6	1208421	1208426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224079
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23342	NC_020062	GC	3	6	1208750	1208755	0 %	0 %	50 %	50 %	440224080
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23345	NC_020062	CGCGC	2	10	1208897	1208906	0 %	0 %	40 %	60 %	440224080
23346	NC_020062	TCT	2	6	1209013	1209018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224080
23347	NC_020062	TTC	2	6	1209198	1209203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224081
23348	NC_020062	CAGA	2	8	1209295	1209302	50 %	0 %	25 %	25 %	440224081
23349	NC_020062	GCC	2	6	1209341	1209346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224081
23350	NC_020062	GC	4	8	1209371	1209378	0 %	0 %	50 %	50 %	440224081
23351	NC_020062	CGG	2	6	1209408	1209413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224081
23352	NC_020062	TCG	2	6	1209435	1209440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224081
23353	NC_020062	TGG	2	6	1209552	1209557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224081
23354	NC_020062	CGG	2	6	1209568	1209573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224081
23355	NC_020062	CTGC	2	8	1209622	1209629	0 %	25 %	25 %	50 %	440224081
23356	NC_020062	CGA	2	6	1209634	1209639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224081
23357	NC_020062	CCA	2	6	1209664	1209669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224081
23358	NC_020062	ATC	2	6	1209768	1209773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224081
23359	NC_020062	CGC	2	6	1209897	1209902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224081
23360	NC_020062	CGC	2	6	1209948	1209953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224082
23361	NC_020062	GCT	2	6	1209956	1209961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224082
23362	NC_020062	GCC	2	6	1209963	1209968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224082
23363	NC_020062	GCG	2	6	1209969	1209974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224082
23364	NC_020062	T	6	6	1209975	1209980	0 %	100 %	0 %	0 %	440224082
23365	NC_020062	CTG	2	6	1210059	1210064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224082
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23367	NC_020062	TCGCT	2	10	1210090	1210099	0 %	40 %	20 %	40 %	440224082
23368	NC_020062	GTC	2	6	1210119	1210124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224082
23369	NC_020062	CTG	2	6	1210138	1210143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224082
23370	NC_020062	CGT	2	6	1210145	1210150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224082
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23372	NC_020062	CGGC	2	8	1210352	1210359	0 %	0 %	50 %	50 %	440224082
23373	NC_020062	GAA	2	6	1210371	1210376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224082
23374	NC_020062	TTC	2	6	1210398	1210403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224082
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23378	NC_020062	CG	3	6	1210775	1210780	0 %	0 %	50 %	50 %	440224082
23379	NC_020062	CTCGC	2	10	1210886	1210895	0 %	20 %	20 %	60 %	440224083
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23382	NC_020062	CTCGC	2	10	1211063	1211072	0 %	20 %	20 %	60 %	440224083
23383	NC_020062	TTG	2	6	1211112	1211117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224083
23384	NC_020062	GCCGCT	2	12	1211183	1211194	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440224083
23385	NC_020062	CGT	2	6	1211197	1211202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224083
23386	NC_020062	TCG	2	6	1211262	1211267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224083
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23402	NC_020062	GC	3	6	1211805	1211810	0 %	0 %	50 %	50 %	440224083
23403	NC_020062	CCTCTC	2	12	1211811	1211822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224083
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23406	NC_020062	TCT	2	6	1211907	1211912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224083
23407	NC_020062	GC	3	6	1211917	1211922	0 %	0 %	50 %	50 %	440224083
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23411	NC_020062	CGT	2	6	1212028	1212033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224083
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23417	NC_020062	CG	3	6	1212321	1212326	0 %	0 %	50 %	50 %	440224083
23418	NC_020062	CGA	2	6	1212393	1212398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224083
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23421	NC_020062	GCC	3	9	1212530	1212538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224083
23422	NC_020062	GCC	2	6	1212548	1212553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224083
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23424	NC_020062	GC	3	6	1212605	1212610	0 %	0 %	50 %	50 %	440224083
23425	NC_020062	GCTTG	2	10	1212613	1212622	0 %	40 %	40 %	20 %	440224083
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23427	NC_020062	GCA	2	6	1212650	1212655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224083
23428	NC_020062	CGG	2	6	1212661	1212666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224083
23429	NC_020062	GAT	2	6	1212700	1212705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224083
23430	NC_020062	TCG	2	6	1212747	1212752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224083
23431	NC_020062	GCT	2	6	1212760	1212765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224083
23432	NC_020062	TGA	2	6	1212777	1212782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224083
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23435	NC_020062	CAT	2	6	1212992	1212997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224084
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23439	NC_020062	AG	3	6	1213214	1213219	50 %	0 %	50 %	0 %	440224084
23440	NC_020062	CTC	2	6	1213220	1213225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224084
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23443	NC_020062	TCG	2	6	1213342	1213347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224084
23444	NC_020062	TCA	2	6	1213450	1213455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224084
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23446	NC_020062	GATGG	2	10	1213530	1213539	20 %	20 %	60 %	0 %	440224084
23447	NC_020062	GGC	2	6	1213794	1213799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224085
23448	NC_020062	CAT	2	6	1213902	1213907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224085
23449	NC_020062	ATC	2	6	1213990	1213995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224085
23450	NC_020062	CAC	2	6	1214067	1214072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224085
23451	NC_020062	GGC	2	6	1214101	1214106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224085
23452	NC_020062	CGAG	2	8	1214175	1214182	25 %	0 %	50 %	25 %	440224085
23453	NC_020062	CGA	2	6	1214205	1214210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23454	NC_020062	TTC	2	6	1214222	1214227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224085
23455	NC_020062	CCA	2	6	1214229	1214234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224085
23456	NC_020062	GAT	2	6	1214235	1214240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224085
23457	NC_020062	GGC	2	6	1214273	1214278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224085
23458	NC_020062	GC	3	6	1214415	1214420	0 %	0 %	50 %	50 %	440224085
23459	NC_020062	TTG	2	6	1214444	1214449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224085
23460	NC_020062	TGG	2	6	1214484	1214489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224085
23461	NC_020062	GTCG	2	8	1214491	1214498	0 %	25 %	50 %	25 %	440224085
23462	NC_020062	GCC	2	6	1214521	1214526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224085
23463	NC_020062	TGC	2	6	1214582	1214587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23464	NC_020062	GTC	2	6	1214681	1214686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23465	NC_020062	CATC	2	8	1214688	1214695	25 %	25 %	0 %	50 %	440224085
23466	NC_020062	CCG	2	6	1214823	1214828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224085
23467	NC_020062	CGCGC	2	10	1214830	1214839	0 %	0 %	40 %	60 %	440224085
23468	NC_020062	GA	3	6	1214898	1214903	50 %	0 %	50 %	0 %	440224085
23469	NC_020062	GCC	2	6	1214929	1214934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224085
23470	NC_020062	CTG	3	9	1214965	1214973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23471	NC_020062	CGTC	2	8	1215060	1215067	0 %	25 %	25 %	50 %	440224085
23472	NC_020062	TCG	2	6	1215102	1215107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23473	NC_020062	GTC	2	6	1215109	1215114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23474	NC_020062	TCG	2	6	1215152	1215157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23475	NC_020062	CGA	2	6	1215195	1215200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23476	NC_020062	TCGG	2	8	1215311	1215318	0 %	25 %	50 %	25 %	440224085
23477	NC_020062	CCCG	2	8	1215343	1215350	0 %	0 %	25 %	75 %	440224085
23478	NC_020062	TGA	2	6	1215387	1215392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224085
23479	NC_020062	GTCG	2	8	1215478	1215485	0 %	25 %	50 %	25 %	440224085
23480	NC_020062	CAT	2	6	1215489	1215494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224085
23481	NC_020062	CGG	2	6	1215555	1215560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224085
23482	NC_020062	CGA	2	6	1215576	1215581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23483	NC_020062	CTC	2	6	1215607	1215612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224085
23484	NC_020062	CAC	2	6	1215619	1215624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224085
23485	NC_020062	CGAG	2	8	1215631	1215638	25 %	0 %	50 %	25 %	440224085
23486	NC_020062	TGG	2	6	1215666	1215671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224085
23487	NC_020062	CTT	2	6	1215682	1215687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224085
23488	NC_020062	GAC	2	6	1215733	1215738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224085
23489	NC_020062	CAT	2	6	1215765	1215770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224085
23490	NC_020062	GCC	2	6	1215841	1215846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224085
23491	NC_020062	CAT	2	6	1216217	1216222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224086
23492	NC_020062	CA	3	6	1216223	1216228	50 %	0 %	0 %	50 %	440224086
23493	NC_020062	GCT	2	6	1216265	1216270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224086
23494	NC_020062	CATT	2	8	1216271	1216278	25 %	50 %	0 %	25 %	440224086
23495	NC_020062	ATC	2	6	1216301	1216306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224086
23496	NC_020062	TCTT	2	8	1216316	1216323	0 %	75 %	0 %	25 %	440224086
23497	NC_020062	CCG	2	6	1216345	1216350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086
23498	NC_020062	CCG	2	6	1216400	1216405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086
23499	NC_020062	CGC	2	6	1216532	1216537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086
23500	NC_020062	CCG	2	6	1216552	1216557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224086

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