MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_020062	AGC	2	6	1113943	1113948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21502	NC_020062	CGA	2	6	1113995	1114000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21503	NC_020062	CCG	2	6	1114006	1114011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223996
21504	NC_020062	GC	3	6	1114069	1114074	0 %	0 %	50 %	50 %	440223996
21505	NC_020062	GCG	2	6	1114127	1114132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223996
21506	NC_020062	TTG	2	6	1114165	1114170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223996
21507	NC_020062	CCG	2	6	1114431	1114436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223997
21508	NC_020062	CGA	2	6	1114458	1114463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223997
21509	NC_020062	CGA	2	6	1114482	1114487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223997
21510	NC_020062	GGCC	2	8	1114533	1114540	0 %	0 %	50 %	50 %	440223997
21511	NC_020062	TGC	2	6	1114541	1114546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223997
21512	NC_020062	GGC	2	6	1114555	1114560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223997
21513	NC_020062	GCC	2	6	1114640	1114645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223997
21514	NC_020062	TTG	2	6	1114646	1114651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223997
21515	NC_020062	CGT	4	12	1114653	1114664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223997
21516	NC_020062	T	6	6	1114699	1114704	0 %	100 %	0 %	0 %	440223997
21517	NC_020062	TCC	2	6	1114709	1114714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223997
21518	NC_020062	GGT	2	6	1114738	1114743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223997
21519	NC_020062	GC	4	8	1114808	1114815	0 %	0 %	50 %	50 %	440223997
21520	NC_020062	CCG	2	6	1114826	1114831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223997
21521	NC_020062	CAT	2	6	1114941	1114946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223997
21522	NC_020062	GCC	2	6	1115068	1115073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223997
21523	NC_020062	CTT	2	6	1115182	1115187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223997
21524	NC_020062	TG	3	6	1115198	1115203	0 %	50 %	50 %	0 %	440223997
21525	NC_020062	GCG	2	6	1115266	1115271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223997
21526	NC_020062	ATT	2	6	1115504	1115509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223998
21527	NC_020062	CAC	2	6	1115722	1115727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223998
21528	NC_020062	GCA	2	6	1115752	1115757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223998
21529	NC_020062	GAT	2	6	1115808	1115813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223998
21530	NC_020062	GCCG	2	8	1115823	1115830	0 %	0 %	50 %	50 %	440223998
21531	NC_020062	AAT	2	6	1115841	1115846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223998
21532	NC_020062	TGC	2	6	1115914	1115919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223998
21533	NC_020062	GGC	2	6	1115990	1115995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223998
21534	NC_020062	CCG	2	6	1116176	1116181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21535	NC_020062	CGC	2	6	1116201	1116206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21536	NC_020062	CGC	2	6	1116221	1116226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21537	NC_020062	TCG	2	6	1116251	1116256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223998
21538	NC_020062	TGC	2	6	1116273	1116278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223998
21539	NC_020062	CAT	2	6	1116320	1116325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223998
21540	NC_020062	CCT	2	6	1116350	1116355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223998
21541	NC_020062	CGAC	2	8	1116365	1116372	25 %	0 %	25 %	50 %	440223998
21542	NC_020062	AGGGC	2	10	1116447	1116456	20 %	0 %	60 %	20 %	440223998
21543	NC_020062	CGC	2	6	1116495	1116500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21544	NC_020062	GCC	2	6	1116540	1116545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21545	NC_020062	GCC	2	6	1116594	1116599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21546	NC_020062	TGC	2	6	1116626	1116631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223998
21547	NC_020062	GAC	2	6	1116645	1116650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223998
21548	NC_020062	GCC	2	6	1116664	1116669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21549	NC_020062	CGC	2	6	1116676	1116681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21550	NC_020062	AG	3	6	1116696	1116701	50 %	0 %	50 %	0 %	440223998
21551	NC_020062	GCC	2	6	1116711	1116716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21552	NC_020062	ATCGAC	2	12	1116735	1116746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223998
21553	NC_020062	GC	5	10	1116794	1116803	0 %	0 %	50 %	50 %	440223998
21554	NC_020062	TCGG	2	8	1116838	1116845	0 %	25 %	50 %	25 %	440223998
21555	NC_020062	GCC	2	6	1116912	1116917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223998
21556	NC_020062	GC	3	6	1116950	1116955	0 %	0 %	50 %	50 %	440223999
21557	NC_020062	CGAG	2	8	1117074	1117081	25 %	0 %	50 %	25 %	440223999
21558	NC_020062	CGGC	2	8	1117103	1117110	0 %	0 %	50 %	50 %	440223999
21559	NC_020062	CGA	2	6	1117240	1117245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21560	NC_020062	TGC	2	6	1117296	1117301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21561	NC_020062	CGA	2	6	1117305	1117310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21562	NC_020062	AG	3	6	1117313	1117318	50 %	0 %	50 %	0 %	440223999
21563	NC_020062	TCA	2	6	1117349	1117354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223999
21564	NC_020062	ACG	2	6	1117379	1117384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21565	NC_020062	AGA	2	6	1117388	1117393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223999
21566	NC_020062	CGC	2	6	1117450	1117455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223999
21567	NC_020062	GCC	2	6	1117489	1117494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223999
21568	NC_020062	GC	3	6	1117519	1117524	0 %	0 %	50 %	50 %	440223999
21569	NC_020062	CAG	2	6	1117600	1117605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21570	NC_020062	ATC	2	6	1117630	1117635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223999
21571	NC_020062	CGA	2	6	1117665	1117670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21572	NC_020062	CTTG	2	8	1117684	1117691	0 %	50 %	25 %	25 %	440223999
21573	NC_020062	AGCG	2	8	1117698	1117705	25 %	0 %	50 %	25 %	440223999
21574	NC_020062	CTGC	2	8	1117746	1117753	0 %	25 %	25 %	50 %	440223999
21575	NC_020062	CAT	2	6	1117813	1117818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223999
21576	NC_020062	CTG	2	6	1117840	1117845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21577	NC_020062	GTC	2	6	1117865	1117870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223999
21578	NC_020062	AC	3	6	1118115	1118120	50 %	0 %	0 %	50 %	440224000
21579	NC_020062	CGACGG	2	12	1118186	1118197	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440224000
21580	NC_020062	TGC	2	6	1118207	1118212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21581	NC_020062	GATC	2	8	1118250	1118257	25 %	25 %	25 %	25 %	440224000
21582	NC_020062	CCG	2	6	1118264	1118269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224000
21583	NC_020062	TGC	2	6	1118280	1118285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21584	NC_020062	TCA	2	6	1118335	1118340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224000
21585	NC_020062	GC	3	6	1118351	1118356	0 %	0 %	50 %	50 %	440224000
21586	NC_020062	CGG	2	6	1118499	1118504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224000
21587	NC_020062	GCA	2	6	1118508	1118513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21588	NC_020062	GCG	2	6	1118515	1118520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224000
21589	NC_020062	GGC	2	6	1118553	1118558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224000
21590	NC_020062	TTC	2	6	1118604	1118609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440224000
21591	NC_020062	CAG	2	6	1118650	1118655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21592	NC_020062	TCG	2	6	1118690	1118695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21593	NC_020062	GCA	2	6	1118713	1118718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21594	NC_020062	TGC	2	6	1118777	1118782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224000
21595	NC_020062	GAG	2	6	1118827	1118832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224000
21596	NC_020062	GAT	2	6	1118835	1118840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224000
21597	NC_020062	CAA	2	6	1118854	1118859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224000
21598	NC_020062	GGCAA	2	10	1118902	1118911	40 %	0 %	40 %	20 %	440224000
21599	NC_020062	CAC	2	6	1119004	1119009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224000
21600	NC_020062	GATC	2	8	1119019	1119026	25 %	25 %	25 %	25 %	440224000
21601	NC_020062	CGG	2	6	1119168	1119173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224001
21602	NC_020062	ATG	2	6	1119175	1119180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224001
21603	NC_020062	GAC	2	6	1119318	1119323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224001
21604	NC_020062	TCG	2	6	1119334	1119339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224001
21605	NC_020062	AGC	2	6	1119404	1119409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224001
21606	NC_020062	GCC	2	6	1119430	1119435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224001
21607	NC_020062	CCG	2	6	1119490	1119495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224001
21608	NC_020062	CGG	2	6	1119527	1119532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224001
21609	NC_020062	GC	3	6	1119629	1119634	0 %	0 %	50 %	50 %	440224001
21610	NC_020062	ACA	2	6	1119643	1119648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224001
21611	NC_020062	GCA	2	6	1119658	1119663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224001
21612	NC_020062	CGC	2	6	1119731	1119736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224001
21613	NC_020062	CGC	2	6	1119800	1119805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224001
21614	NC_020062	GC	3	6	1119858	1119863	0 %	0 %	50 %	50 %	440224001
21615	NC_020062	GGCG	2	8	1119987	1119994	0 %	0 %	75 %	25 %	440224001
21616	NC_020062	GCC	2	6	1120004	1120009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224001
21617	NC_020062	CGT	2	6	1120023	1120028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224001
21618	NC_020062	CAGC	2	8	1120139	1120146	25 %	0 %	25 %	50 %	440224001
21619	NC_020062	CGG	2	6	1120163	1120168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224001
21620	NC_020062	GGC	2	6	1120213	1120218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224001
21621	NC_020062	CCG	2	6	1120263	1120268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224001
21622	NC_020062	GCG	2	6	1120294	1120299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224001
21623	NC_020062	CGA	2	6	1120322	1120327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224001
21624	NC_020062	TGA	2	6	1120328	1120333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224001
21625	NC_020062	GC	3	6	1120423	1120428	0 %	0 %	50 %	50 %	440224002
21626	NC_020062	GTC	2	6	1120487	1120492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224002
21627	NC_020062	TCG	3	9	1120557	1120565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224002
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21630	NC_020062	GC	3	6	1121071	1121076	0 %	0 %	50 %	50 %	440224003
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21635	NC_020062	GCG	2	6	1121453	1121458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224003
21636	NC_020062	ATG	4	12	1121521	1121532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224003
21637	NC_020062	ATG	2	6	1121569	1121574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224003
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21642	NC_020062	GGC	2	6	1121889	1121894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224003
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21644	NC_020062	TTG	2	6	1122001	1122006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440224003
21645	NC_020062	CGC	2	6	1122017	1122022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224003
21646	NC_020062	GTC	2	6	1122048	1122053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224003
21647	NC_020062	GAA	2	6	1122433	1122438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224004
21648	NC_020062	TCGCG	2	10	1122510	1122519	0 %	20 %	40 %	40 %	440224004
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21652	NC_020062	CGT	2	6	1122655	1122660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224004
21653	NC_020062	GGA	2	6	1122663	1122668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440224004
21654	NC_020062	CTG	2	6	1122679	1122684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224004
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21660	NC_020062	TTTC	2	8	1122956	1122963	0 %	75 %	0 %	25 %	440224004
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21672	NC_020062	TCG	3	9	1123442	1123450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224005
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21700	NC_020062	ACG	2	6	1124615	1124620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224006
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21703	NC_020062	CAGGG	2	10	1124703	1124712	20 %	0 %	60 %	20 %	440224006
21704	NC_020062	CTGC	2	8	1124749	1124756	0 %	25 %	25 %	50 %	440224006
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21706	NC_020062	GCGTG	2	10	1125032	1125041	0 %	20 %	60 %	20 %	440224007
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21708	NC_020062	GC	3	6	1125090	1125095	0 %	0 %	50 %	50 %	440224007
21709	NC_020062	CCCGA	2	10	1125207	1125216	20 %	0 %	20 %	60 %	440224007
21710	NC_020062	GGC	2	6	1125254	1125259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224007
21711	NC_020062	CTCGGT	2	12	1125375	1125386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224007
21712	NC_020062	GACC	2	8	1125393	1125400	25 %	0 %	25 %	50 %	440224007
21713	NC_020062	ATG	2	6	1125409	1125414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224007
21714	NC_020062	GTC	2	6	1125501	1125506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224007
21715	NC_020062	CAA	2	6	1125555	1125560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224007
21716	NC_020062	TGG	2	6	1125574	1125579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224007
21717	NC_020062	TCG	2	6	1125591	1125596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224007
21718	NC_020062	CGCC	2	8	1125614	1125621	0 %	0 %	25 %	75 %	440224007
21719	NC_020062	TTA	2	6	1125641	1125646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440224007
21720	NC_020062	ACC	2	6	1125757	1125762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440224007
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21722	NC_020062	GGC	2	6	1125792	1125797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224007
21723	NC_020062	CATC	2	8	1125851	1125858	25 %	25 %	0 %	50 %	440224007
21724	NC_020062	CGGC	2	8	1125892	1125899	0 %	0 %	50 %	50 %	440224007
21725	NC_020062	ATCGTC	2	12	1126074	1126085	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440224008
21726	NC_020062	CCT	2	6	1126091	1126096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224008
21727	NC_020062	TCC	2	6	1126134	1126139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440224008
21728	NC_020062	GCA	2	6	1126174	1126179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224008
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21730	NC_020062	GGCT	2	8	1126311	1126318	0 %	25 %	50 %	25 %	440224008
21731	NC_020062	CTAT	2	8	1126388	1126395	25 %	50 %	0 %	25 %	440224008
21732	NC_020062	TGGT	2	8	1126512	1126519	0 %	50 %	50 %	0 %	440224008
21733	NC_020062	CGA	2	6	1126586	1126591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224008
21734	NC_020062	CCGA	2	8	1126681	1126688	25 %	0 %	25 %	50 %	440224008
21735	NC_020062	TGA	2	6	1126702	1126707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224008
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21738	NC_020062	CGC	2	6	1126773	1126778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440224008
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21758	NC_020062	GCTG	2	8	1127638	1127645	0 %	25 %	50 %	25 %	440224009
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21829	NC_020062	CGA	2	6	1131110	1131115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224011
21830	NC_020062	TAC	2	6	1131153	1131158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224011
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21833	NC_020062	ATTG	2	8	1131278	1131285	25 %	50 %	25 %	0 %	440224011
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21840	NC_020062	T	6	6	1131510	1131515	0 %	100 %	0 %	0 %	440224011
21841	NC_020062	TCA	2	6	1131564	1131569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440224011
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21843	NC_020062	GAA	2	6	1131578	1131583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224011
21844	NC_020062	ATA	2	6	1131600	1131605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440224011
21845	NC_020062	GAA	2	6	1131626	1131631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440224011
21846	NC_020062	GGC	2	6	1132038	1132043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224012
21847	NC_020062	TGG	2	6	1132144	1132149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440224012
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21850	NC_020062	AGC	2	6	1132319	1132324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224012
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21852	NC_020062	GACG	2	8	1132450	1132457	25 %	0 %	50 %	25 %	440224012
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21854	NC_020062	CGG	2	6	1132557	1132562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440224012
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21856	NC_020062	CGT	2	6	1132874	1132879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224013
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21859	NC_020062	GAT	2	6	1132953	1132958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440224013
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21863	NC_020062	CG	3	6	1133222	1133227	0 %	0 %	50 %	50 %	440224013
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21872	NC_020062	AG	3	6	1133492	1133497	50 %	0 %	50 %	0 %	440224013
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21950	NC_020062	CAG	3	9	1137977	1137985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224016
21951	NC_020062	GT	3	6	1138000	1138005	0 %	50 %	50 %	0 %	440224016
21952	NC_020062	CCTTG	2	10	1138021	1138030	0 %	40 %	20 %	40 %	440224016
21953	NC_020062	ACG	2	6	1138080	1138085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440224016
21954	NC_020062	TCGG	2	8	1138122	1138129	0 %	25 %	50 %	25 %	440224016
21955	NC_020062	TCG	2	6	1138179	1138184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440224016
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21958	NC_020062	AGCA	2	8	1138704	1138711	50 %	0 %	25 %	25 %	440224017
21959	NC_020062	CAA	2	6	1138845	1138850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440224017
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