MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_020062	TCT	2	6	1089798	1089803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223974
21003	NC_020062	CGG	2	6	1089840	1089845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223974
21004	NC_020062	TCA	2	6	1089846	1089851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223974
21005	NC_020062	CGG	2	6	1089874	1089879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223974
21006	NC_020062	CGT	3	9	1090009	1090017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21007	NC_020062	GCT	2	6	1090021	1090026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21008	NC_020062	GCCTT	2	10	1090032	1090041	0 %	40 %	20 %	40 %	440223974
21009	NC_020062	CGC	2	6	1090043	1090048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223974
21010	NC_020062	TCG	2	6	1090095	1090100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21011	NC_020062	CATC	2	8	1090104	1090111	25 %	25 %	0 %	50 %	440223974
21012	NC_020062	CGT	2	6	1090132	1090137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21013	NC_020062	CAG	2	6	1090142	1090147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21014	NC_020062	GGC	2	6	1090148	1090153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223974
21015	NC_020062	TCC	2	6	1090172	1090177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223974
21016	NC_020062	GC	3	6	1090185	1090190	0 %	0 %	50 %	50 %	440223974
21017	NC_020062	GAG	2	6	1090262	1090267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223974
21018	NC_020062	TGC	2	6	1090317	1090322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21019	NC_020062	GAT	2	6	1090324	1090329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223974
21020	NC_020062	TGA	2	6	1090398	1090403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223974
21021	NC_020062	GAC	2	6	1090447	1090452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21022	NC_020062	ACG	2	6	1090460	1090465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223974
21023	NC_020062	CAT	2	6	1090513	1090518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223974
21024	NC_020062	GCC	3	9	1090551	1090559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223974
21025	NC_020062	CTG	2	6	1090587	1090592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223975
21026	NC_020062	ACC	2	6	1090608	1090613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223975
21027	NC_020062	GGC	2	6	1090631	1090636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223975
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21030	NC_020062	TAT	2	6	1090719	1090724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223975
21031	NC_020062	TGC	2	6	1090750	1090755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223975
21032	NC_020062	GA	3	6	1090767	1090772	50 %	0 %	50 %	0 %	440223975
21033	NC_020062	CGC	2	6	1090790	1090795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223975
21034	NC_020062	ATC	2	6	1090797	1090802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223975
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21038	NC_020062	TG	3	6	1090867	1090872	0 %	50 %	50 %	0 %	440223975
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21041	NC_020062	GTG	2	6	1090917	1090922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223975
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21044	NC_020062	GCGG	2	8	1091060	1091067	0 %	0 %	75 %	25 %	440223975
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21052	NC_020062	GCA	2	6	1091543	1091548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223976
21053	NC_020062	CGA	2	6	1091558	1091563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223976
21054	NC_020062	CGC	2	6	1091571	1091576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223976
21055	NC_020062	ACG	2	6	1091646	1091651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223976
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21058	NC_020062	GC	3	6	1091728	1091733	0 %	0 %	50 %	50 %	440223976
21059	NC_020062	CTT	2	6	1091757	1091762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223976
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21064	NC_020062	CGA	2	6	1091927	1091932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223976
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21066	NC_020062	GC	3	6	1092050	1092055	0 %	0 %	50 %	50 %	440223976
21067	NC_020062	TGCT	2	8	1092085	1092092	0 %	50 %	25 %	25 %	440223976
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21089	NC_020062	CTGC	2	8	1092924	1092931	0 %	25 %	25 %	50 %	440223977
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21104	NC_020062	AT	3	6	1093632	1093637	50 %	50 %	0 %	0 %	440223977
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21113	NC_020062	AAT	2	6	1094060	1094065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223977
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21115	NC_020062	GAT	3	9	1094085	1094093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223977
21116	NC_020062	CGA	2	6	1094102	1094107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223977
21117	NC_020062	GCG	2	6	1094114	1094119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223977
21118	NC_020062	AAT	2	6	1094126	1094131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223977
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21120	NC_020062	GCA	2	6	1094215	1094220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223977
21121	NC_020062	GCA	2	6	1094284	1094289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223977
21122	NC_020062	GTCGT	2	10	1094293	1094302	0 %	40 %	40 %	20 %	440223977
21123	NC_020062	ATA	2	6	1094304	1094309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223977
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21222	NC_020062	GTC	2	6	1099324	1099329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223982
21223	NC_020062	AG	3	6	1099438	1099443	50 %	0 %	50 %	0 %	440223982
21224	NC_020062	GC	3	6	1099499	1099504	0 %	0 %	50 %	50 %	440223982
21225	NC_020062	CG	3	6	1099556	1099561	0 %	0 %	50 %	50 %	440223982
21226	NC_020062	GTC	2	6	1099576	1099581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223982
21227	NC_020062	TCA	2	6	1099653	1099658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223982
21228	NC_020062	TTGC	2	8	1099682	1099689	0 %	50 %	25 %	25 %	440223982
21229	NC_020062	GGC	2	6	1099732	1099737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223982
21230	NC_020062	CGC	2	6	1099743	1099748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223982
21231	NC_020062	AGA	2	6	1099754	1099759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223982
21232	NC_020062	GCC	2	6	1099765	1099770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223982
21233	NC_020062	GGC	2	6	1099822	1099827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223982
21234	NC_020062	CGG	2	6	1099893	1099898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223982
21235	NC_020062	GGA	2	6	1099933	1099938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223982
21236	NC_020062	GCA	2	6	1099983	1099988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223982
21237	NC_020062	TTGC	2	8	1099995	1100002	0 %	50 %	25 %	25 %	440223982
21238	NC_020062	CGG	2	6	1100046	1100051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223982
21239	NC_020062	CGG	2	6	1100109	1100114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223982
21240	NC_020062	AGCGC	2	10	1100157	1100166	20 %	0 %	40 %	40 %	440223982
21241	NC_020062	CCG	2	6	1100189	1100194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223982
21242	NC_020062	GCC	2	6	1100221	1100226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223982
21243	NC_020062	GGT	2	6	1100227	1100232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223982
21244	NC_020062	TTC	2	6	1100261	1100266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223982
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21246	NC_020062	CTG	3	9	1100506	1100514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223982
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21248	NC_020062	CG	3	6	1100536	1100541	0 %	0 %	50 %	50 %	440223982
21249	NC_020062	TCG	2	6	1100546	1100551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223982
21250	NC_020062	GTC	2	6	1100552	1100557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223982
21251	NC_020062	GCCG	2	8	1100641	1100648	0 %	0 %	50 %	50 %	440223982
21252	NC_020062	AGCG	2	8	1100689	1100696	25 %	0 %	50 %	25 %	440223982
21253	NC_020062	ATC	2	6	1100726	1100731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223982
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21259	NC_020062	CGC	2	6	1101047	1101052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223983
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21261	NC_020062	CTG	2	6	1101131	1101136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223983
21262	NC_020062	CGG	2	6	1101157	1101162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223983
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21264	NC_020062	GC	4	8	1101228	1101235	0 %	0 %	50 %	50 %	440223983
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21269	NC_020062	GCA	2	6	1101483	1101488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223983
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21324	NC_020062	TGA	2	6	1104955	1104960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223988
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21329	NC_020062	ACGCC	2	10	1105146	1105155	20 %	0 %	20 %	60 %	440223988
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21332	NC_020062	GGC	2	6	1105229	1105234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223988
21333	NC_020062	GTC	2	6	1105262	1105267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223988
21334	NC_020062	TGA	2	6	1105297	1105302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223988
21335	NC_020062	GCAGG	2	10	1105324	1105333	20 %	0 %	60 %	20 %	440223988
21336	NC_020062	CTG	2	6	1105355	1105360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223988
21337	NC_020062	CCG	2	6	1105386	1105391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223988
21338	NC_020062	CGTT	2	8	1105420	1105427	0 %	50 %	25 %	25 %	440223988
21339	NC_020062	AGCAGA	2	12	1105459	1105470	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440223988
21340	NC_020062	TGG	2	6	1105504	1105509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223988
21341	NC_020062	TTC	2	6	1105590	1105595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223988
21342	NC_020062	CGA	2	6	1105645	1105650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223988
21343	NC_020062	GAA	2	6	1105660	1105665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223988
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21345	NC_020062	GCC	2	6	1105977	1105982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223989
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21462	NC_020062	GCC	2	6	1112378	1112383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223995
21463	NC_020062	CAA	2	6	1112440	1112445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223995
21464	NC_020062	GAC	2	6	1112459	1112464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223995
21465	NC_020062	TGA	2	6	1112545	1112550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223995
21466	NC_020062	GCC	2	6	1112663	1112668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223995
21467	NC_020062	GC	3	6	1112732	1112737	0 %	0 %	50 %	50 %	440223995
21468	NC_020062	CTT	2	6	1112786	1112791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223995
21469	NC_020062	GCG	2	6	1112893	1112898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223995
21470	NC_020062	CGG	2	6	1112945	1112950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223995
21471	NC_020062	ATC	2	6	1112973	1112978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223995
21472	NC_020062	GTC	2	6	1112979	1112984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223995
21473	NC_020062	GAC	2	6	1113032	1113037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223995
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21477	NC_020062	ATG	3	9	1113172	1113180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223996
21478	NC_020062	GAT	2	6	1113279	1113284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223996
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21480	NC_020062	GCC	2	6	1113312	1113317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223996
21481	NC_020062	GAC	2	6	1113321	1113326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21482	NC_020062	CGCC	2	8	1113356	1113363	0 %	0 %	25 %	75 %	440223996
21483	NC_020062	CTG	2	6	1113374	1113379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21484	NC_020062	TGC	2	6	1113387	1113392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21485	NC_020062	GCC	2	6	1113402	1113407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223996
21486	NC_020062	GA	3	6	1113427	1113432	50 %	0 %	50 %	0 %	440223996
21487	NC_020062	GCA	2	6	1113443	1113448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21488	NC_020062	CGGCG	2	10	1113470	1113479	0 %	0 %	60 %	40 %	440223996
21489	NC_020062	CG	3	6	1113478	1113483	0 %	0 %	50 %	50 %	440223996
21490	NC_020062	CAG	2	6	1113537	1113542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21491	NC_020062	ATG	2	6	1113550	1113555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223996
21492	NC_020062	GTG	2	6	1113649	1113654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223996
21493	NC_020062	CCG	2	6	1113655	1113660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223996
21494	NC_020062	AGG	2	6	1113742	1113747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223996
21495	NC_020062	TGA	2	6	1113752	1113757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223996
21496	NC_020062	CGG	2	6	1113770	1113775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223996
21497	NC_020062	GCG	2	6	1113853	1113858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223996
21498	NC_020062	ACG	2	6	1113859	1113864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223996
21499	NC_020062	ATG	2	6	1113877	1113882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223996
21500	NC_020062	GAT	2	6	1113912	1113917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223996

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