MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_020062	CCT	2	6	1036614	1036619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223921
20003	NC_020062	TGG	2	6	1036638	1036643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223921
20004	NC_020062	CGC	2	6	1036644	1036649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223921
20005	NC_020062	CCG	2	6	1036656	1036661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223921
20006	NC_020062	CCA	2	6	1036674	1036679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223921
20007	NC_020062	AGC	2	6	1036697	1036702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223921
20008	NC_020062	TGC	2	6	1036746	1036751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223921
20009	NC_020062	CCTG	2	8	1036849	1036856	0 %	25 %	25 %	50 %	440223922
20010	NC_020062	CGGCAA	2	12	1036862	1036873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
20011	NC_020062	ATC	2	6	1036908	1036913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223922
20012	NC_020062	GCC	2	6	1036921	1036926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223922
20013	NC_020062	CGA	2	6	1036937	1036942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
20014	NC_020062	CCG	2	6	1037149	1037154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223922
20015	NC_020062	GAT	2	6	1037163	1037168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223922
20016	NC_020062	CGA	2	6	1037230	1037235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
20017	NC_020062	TCG	2	6	1037383	1037388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223922
20018	NC_020062	CTT	3	9	1037390	1037398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223922
20019	NC_020062	CGG	2	6	1037426	1037431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223922
20020	NC_020062	CGA	2	6	1037462	1037467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223922
20021	NC_020062	CG	3	6	1037996	1038001	0 %	0 %	50 %	50 %	440223923
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20031	NC_020062	GC	3	6	1039093	1039098	0 %	0 %	50 %	50 %	440223924
20032	NC_020062	CGG	3	9	1039106	1039114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223924
20033	NC_020062	CGA	2	6	1039141	1039146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223924
20034	NC_020062	CGAT	2	8	1039159	1039166	25 %	25 %	25 %	25 %	440223924
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20037	NC_020062	ATCC	2	8	1039426	1039433	25 %	25 %	0 %	50 %	440223924
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20043	NC_020062	GCT	2	6	1039807	1039812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223925
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20050	NC_020062	GGCG	2	8	1040158	1040165	0 %	0 %	75 %	25 %	440223925
20051	NC_020062	TGA	2	6	1040181	1040186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223925
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20115	NC_020062	TCC	3	9	1043487	1043495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223927
20116	NC_020062	TCC	2	6	1043520	1043525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223927
20117	NC_020062	TTC	2	6	1043552	1043557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223927
20118	NC_020062	CG	3	6	1043559	1043564	0 %	0 %	50 %	50 %	440223927
20119	NC_020062	GCA	2	6	1043608	1043613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223927
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20221	NC_020062	TGGG	2	8	1049995	1050002	0 %	25 %	75 %	0 %	440223934
20222	NC_020062	GGGT	2	8	1050046	1050053	0 %	25 %	75 %	0 %	440223934
20223	NC_020062	TTGA	2	8	1050130	1050137	25 %	50 %	25 %	0 %	440223935
20224	NC_020062	CAA	2	6	1050150	1050155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223935
20225	NC_020062	CGG	2	6	1050186	1050191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223935
20226	NC_020062	CAG	2	6	1050264	1050269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223935
20227	NC_020062	TCG	2	6	1050272	1050277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223935
20228	NC_020062	GC	3	6	1050284	1050289	0 %	0 %	50 %	50 %	440223935
20229	NC_020062	ACG	2	6	1050298	1050303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223935
20230	NC_020062	ACCTAT	2	12	1050370	1050381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223935
20231	NC_020062	TCG	2	6	1050572	1050577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223935
20232	NC_020062	CGGC	2	8	1050665	1050672	0 %	0 %	50 %	50 %	440223935
20233	NC_020062	GCT	2	6	1050719	1050724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223935
20234	NC_020062	GGAG	2	8	1050753	1050760	25 %	0 %	75 %	0 %	440223935
20235	NC_020062	TCAC	2	8	1050800	1050807	25 %	25 %	0 %	50 %	440223935
20236	NC_020062	GTCG	2	8	1050832	1050839	0 %	25 %	50 %	25 %	440223935
20237	NC_020062	TC	3	6	1050944	1050949	0 %	50 %	0 %	50 %	440223935
20238	NC_020062	GGA	2	6	1050969	1050974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223935
20239	NC_020062	CAC	2	6	1051008	1051013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223935
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20241	NC_020062	AGC	2	6	1051067	1051072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223935
20242	NC_020062	ACCT	2	8	1051108	1051115	25 %	25 %	0 %	50 %	440223935
20243	NC_020062	TCCT	2	8	1051135	1051142	0 %	50 %	0 %	50 %	440223935
20244	NC_020062	TCC	2	6	1051212	1051217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223935
20245	NC_020062	TTC	2	6	1051568	1051573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223936
20246	NC_020062	ATC	2	6	1051718	1051723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223936
20247	NC_020062	CGC	2	6	1051724	1051729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223936
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20250	NC_020062	GAG	2	6	1051844	1051849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223936
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20252	NC_020062	TTCG	2	8	1051919	1051926	0 %	50 %	25 %	25 %	440223936
20253	NC_020062	CG	3	6	1051936	1051941	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
20254	NC_020062	ATC	2	6	1051986	1051991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223936
20255	NC_020062	TC	3	6	1051990	1051995	0 %	50 %	0 %	50 %	440223936
20256	NC_020062	GAC	2	6	1052006	1052011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223936
20257	NC_020062	GCAGAC	2	12	1052034	1052045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223936
20258	NC_020062	GAT	2	6	1052126	1052131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223936
20259	NC_020062	AAT	2	6	1052168	1052173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223936
20260	NC_020062	C	6	6	1052222	1052227	0 %	0 %	0 %	100 %	440223936
20261	NC_020062	CAT	2	6	1052233	1052238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223936
20262	NC_020062	CG	3	6	1052267	1052272	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
20263	NC_020062	CCG	2	6	1052283	1052288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223936
20264	NC_020062	TGG	2	6	1052295	1052300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223936
20265	NC_020062	TGC	2	6	1052346	1052351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223936
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20269	NC_020062	GC	3	6	1052515	1052520	0 %	0 %	50 %	50 %	440223936
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20299	NC_020062	CCCGC	2	10	1053981	1053990	0 %	0 %	20 %	80 %	440223937
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20306	NC_020062	CG	3	6	1054223	1054228	0 %	0 %	50 %	50 %	440223937
20307	NC_020062	GCT	2	6	1054259	1054264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223937
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20310	NC_020062	GAT	2	6	1054397	1054402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223937
20311	NC_020062	GCTG	2	8	1054465	1054472	0 %	25 %	50 %	25 %	440223937
20312	NC_020062	GCA	2	6	1054489	1054494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223937
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20314	NC_020062	GTTC	2	8	1054612	1054619	0 %	50 %	25 %	25 %	440223937
20315	NC_020062	GT	4	8	1054629	1054636	0 %	50 %	50 %	0 %	440223937
20316	NC_020062	GCTG	2	8	1054705	1054712	0 %	25 %	50 %	25 %	440223937
20317	NC_020062	GCG	2	6	1054733	1054738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223937
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20322	NC_020062	GCG	2	6	1054874	1054879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223938
20323	NC_020062	GCC	2	6	1054880	1054885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223938
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20326	NC_020062	CG	3	6	1054918	1054923	0 %	0 %	50 %	50 %	440223938
20327	NC_020062	GCG	2	6	1054979	1054984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223938
20328	NC_020062	CGA	2	6	1055020	1055025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223938
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20330	NC_020062	CGA	2	6	1055332	1055337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223938
20331	NC_020062	TGC	2	6	1055452	1055457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223938
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20333	NC_020062	AGCC	2	8	1055636	1055643	25 %	0 %	25 %	50 %	440223939
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20335	NC_020062	TCG	2	6	1055714	1055719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223939
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20337	NC_020062	CGG	2	6	1055762	1055767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223939
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20339	NC_020062	TTG	2	6	1055816	1055821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223939
20340	NC_020062	TGC	2	6	1055918	1055923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20341	NC_020062	GCA	2	6	1055930	1055935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20342	NC_020062	GT	3	6	1056006	1056011	0 %	50 %	50 %	0 %	440223939
20343	NC_020062	TGA	2	6	1056036	1056041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223939
20344	NC_020062	GATC	2	8	1056042	1056049	25 %	25 %	25 %	25 %	440223939
20345	NC_020062	ATC	2	6	1056077	1056082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223939
20346	NC_020062	GCT	2	6	1056132	1056137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20347	NC_020062	CTG	2	6	1056142	1056147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20348	NC_020062	CGC	2	6	1056177	1056182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223939
20349	NC_020062	GTT	2	6	1056190	1056195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223939
20350	NC_020062	CGC	2	6	1056213	1056218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223939
20351	NC_020062	ATG	2	6	1056231	1056236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223939
20352	NC_020062	GTC	2	6	1056272	1056277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20353	NC_020062	GTG	2	6	1056296	1056301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223939
20354	NC_020062	CTGC	2	8	1056396	1056403	0 %	25 %	25 %	50 %	440223939
20355	NC_020062	AT	3	6	1056470	1056475	50 %	50 %	0 %	0 %	440223939
20356	NC_020062	AG	3	6	1056530	1056535	50 %	0 %	50 %	0 %	440223939
20357	NC_020062	GAT	2	6	1056548	1056553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223939
20358	NC_020062	GCC	2	6	1056560	1056565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223939
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20360	NC_020062	AGG	2	6	1056579	1056584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223939
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20362	NC_020062	TA	3	6	1056661	1056666	50 %	50 %	0 %	0 %	440223939
20363	NC_020062	GCT	2	6	1056759	1056764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20364	NC_020062	GCCATG	2	12	1056806	1056817	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223939
20365	NC_020062	GC	3	6	1056994	1056999	0 %	0 %	50 %	50 %	440223940
20366	NC_020062	GAT	2	6	1057127	1057132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223940
20367	NC_020062	GCT	2	6	1057163	1057168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223940
20368	NC_020062	ATC	2	6	1057294	1057299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223940
20369	NC_020062	TCA	2	6	1057369	1057374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223940
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20372	NC_020062	TTCG	2	8	1057466	1057473	0 %	50 %	25 %	25 %	440223940
20373	NC_020062	TCG	2	6	1057516	1057521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223940
20374	NC_020062	CCG	2	6	1057533	1057538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223940
20375	NC_020062	TTC	2	6	1057572	1057577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223940
20376	NC_020062	TGG	2	6	1057579	1057584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223940
20377	NC_020062	ACG	2	6	1057690	1057695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223940
20378	NC_020062	TGC	2	6	1057713	1057718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223940
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20382	NC_020062	GCA	2	6	1057863	1057868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223941
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20407	NC_020062	T	7	7	1059323	1059329	0 %	100 %	0 %	0 %	440223942
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20414	NC_020062	TGA	2	6	1059895	1059900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223942
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20419	NC_020062	GCA	2	6	1060180	1060185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223943
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20426	NC_020062	GCA	2	6	1060661	1060666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223943
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20429	NC_020062	CTG	2	6	1060812	1060817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223943
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20432	NC_020062	A	6	6	1060970	1060975	100 %	0 %	0 %	0 %	440223943
20433	NC_020062	CCAG	2	8	1060997	1061004	25 %	0 %	25 %	50 %	440223943
20434	NC_020062	GCA	2	6	1061066	1061071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223943
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20445	NC_020062	CGA	2	6	1061587	1061592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223944
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20450	NC_020062	TCG	2	6	1061820	1061825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
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20453	NC_020062	TGC	2	6	1061937	1061942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20454	NC_020062	GAT	2	6	1061948	1061953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223944
20455	NC_020062	CGG	2	6	1061973	1061978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223944
20456	NC_020062	CAG	2	6	1061987	1061992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20457	NC_020062	GGA	2	6	1062002	1062007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223944
20458	NC_020062	CGT	2	6	1062037	1062042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20459	NC_020062	GGCC	2	8	1062052	1062059	0 %	0 %	50 %	50 %	440223944
20460	NC_020062	GCG	2	6	1062112	1062117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223944
20461	NC_020062	GAC	2	6	1062146	1062151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20462	NC_020062	CAT	2	6	1062187	1062192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223944
20463	NC_020062	GGC	2	6	1062282	1062287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223944
20464	NC_020062	CGAG	2	8	1062289	1062296	25 %	0 %	50 %	25 %	440223944
20465	NC_020062	TCCT	2	8	1062374	1062381	0 %	50 %	0 %	50 %	440223944
20466	NC_020062	CGGGAG	2	12	1062382	1062393	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	440223944
20467	NC_020062	TTG	2	6	1062447	1062452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223944
20468	NC_020062	GCT	2	6	1062476	1062481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20469	NC_020062	TCG	2	6	1062488	1062493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20470	NC_020062	CG	3	6	1062500	1062505	0 %	0 %	50 %	50 %	440223944
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20473	NC_020062	GAG	2	6	1062572	1062577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223944
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20480	NC_020062	GAT	2	6	1062965	1062970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223944
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20482	NC_020062	TCG	2	6	1063065	1063070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
20483	NC_020062	TC	3	6	1063145	1063150	0 %	50 %	0 %	50 %	440223944
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20485	NC_020062	GTC	2	6	1063265	1063270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223944
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20492	NC_020062	AGCA	2	8	1063505	1063512	50 %	0 %	25 %	25 %	440223944
20493	NC_020062	CG	3	6	1063515	1063520	0 %	0 %	50 %	50 %	440223944
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20497	NC_020062	GCC	2	6	1063771	1063776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223945
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