MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_020062	GTC	3	9	1012930	1012938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223899
19502	NC_020062	GGC	2	6	1012965	1012970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19503	NC_020062	GC	3	6	1012969	1012974	0 %	0 %	50 %	50 %	440223899
19504	NC_020062	AGC	2	6	1013017	1013022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223899
19505	NC_020062	CGG	2	6	1013028	1013033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19506	NC_020062	CGC	2	6	1013062	1013067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223899
19507	NC_020062	GAT	2	6	1013073	1013078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223899
19508	NC_020062	TCG	2	6	1013084	1013089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223899
19509	NC_020062	GGC	2	6	1013093	1013098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19510	NC_020062	ACG	2	6	1013135	1013140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223899
19511	NC_020062	GCG	2	6	1013231	1013236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19512	NC_020062	CCT	3	9	1013249	1013257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223899
19513	NC_020062	TGC	2	6	1013297	1013302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223899
19514	NC_020062	ACG	2	6	1013306	1013311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223899
19515	NC_020062	CGG	2	6	1013336	1013341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19516	NC_020062	GGC	2	6	1013359	1013364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19517	NC_020062	CTT	2	6	1013394	1013399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223899
19518	NC_020062	GGC	2	6	1013413	1013418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19519	NC_020062	GAA	2	6	1013454	1013459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223899
19520	NC_020062	GCG	2	6	1013562	1013567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223899
19521	NC_020062	GGT	2	6	1013577	1013582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223899
19522	NC_020062	ATG	2	6	1013606	1013611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223899
19523	NC_020062	CAT	2	6	1013633	1013638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223899
19524	NC_020062	ATTG	2	8	1013670	1013677	25 %	50 %	25 %	0 %	440223899
19525	NC_020062	CGC	2	6	1013687	1013692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223899
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19527	NC_020062	CAGA	2	8	1014077	1014084	50 %	0 %	25 %	25 %	440223900
19528	NC_020062	TCTG	2	8	1014093	1014100	0 %	50 %	25 %	25 %	440223900
19529	NC_020062	CAG	2	6	1014107	1014112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223900
19530	NC_020062	CGA	2	6	1014171	1014176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223900
19531	NC_020062	TGG	2	6	1014216	1014221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223900
19532	NC_020062	GAT	2	6	1014235	1014240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223900
19533	NC_020062	T	6	6	1014366	1014371	0 %	100 %	0 %	0 %	440223900
19534	NC_020062	GC	3	6	1014394	1014399	0 %	0 %	50 %	50 %	440223900
19535	NC_020062	GAA	2	6	1014460	1014465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223901
19536	NC_020062	CGA	2	6	1014597	1014602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19537	NC_020062	TCT	2	6	1014647	1014652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223901
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19540	NC_020062	GCG	2	6	1014843	1014848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223901
19541	NC_020062	GCA	2	6	1014876	1014881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19542	NC_020062	CGA	2	6	1014882	1014887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19543	NC_020062	TCG	2	6	1014939	1014944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19544	NC_020062	GC	3	6	1014977	1014982	0 %	0 %	50 %	50 %	440223901
19545	NC_020062	CGCTGG	2	12	1015076	1015087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223901
19546	NC_020062	CCG	2	6	1015088	1015093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223901
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19548	NC_020062	GCT	2	6	1015145	1015150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19549	NC_020062	GC	3	6	1015175	1015180	0 %	0 %	50 %	50 %	440223901
19550	NC_020062	ACC	2	6	1015298	1015303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223901
19551	NC_020062	CCG	2	6	1015325	1015330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223901
19552	NC_020062	ATC	2	6	1015352	1015357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223901
19553	NC_020062	GCA	2	6	1015359	1015364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19554	NC_020062	CGA	2	6	1015392	1015397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223901
19555	NC_020062	GAT	2	6	1015441	1015446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223901
19556	NC_020062	TGA	2	6	1015479	1015484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223901
19557	NC_020062	GACAT	2	10	1015493	1015502	40 %	20 %	20 %	20 %	440223901
19558	NC_020062	CTT	2	6	1015521	1015526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223902
19559	NC_020062	GGC	2	6	1015575	1015580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223902
19560	NC_020062	GCC	2	6	1015590	1015595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223902
19561	NC_020062	CTT	2	6	1015644	1015649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223902
19562	NC_020062	GAT	2	6	1015680	1015685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223902
19563	NC_020062	CG	4	8	1015778	1015785	0 %	0 %	50 %	50 %	440223902
19564	NC_020062	GAC	2	6	1015842	1015847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223902
19565	NC_020062	GAG	2	6	1015857	1015862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223902
19566	NC_020062	CGC	2	6	1015895	1015900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223902
19567	NC_020062	CGC	2	6	1015907	1015912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223902
19568	NC_020062	CAGAT	2	10	1015924	1015933	40 %	20 %	20 %	20 %	440223902
19569	NC_020062	GCC	2	6	1015971	1015976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223902
19570	NC_020062	GAT	2	6	1016040	1016045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223902
19571	NC_020062	TCG	2	6	1016065	1016070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223902
19572	NC_020062	ACA	2	6	1016074	1016079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223902
19573	NC_020062	TGCG	2	8	1016107	1016114	0 %	25 %	50 %	25 %	440223902
19574	NC_020062	GAT	2	6	1016162	1016167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223902
19575	NC_020062	TCG	2	6	1016177	1016182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223902
19576	NC_020062	ATGG	2	8	1016193	1016200	25 %	25 %	50 %	0 %	440223902
19577	NC_020062	TGC	2	6	1016257	1016262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223902
19578	NC_020062	GAAG	2	8	1016279	1016286	50 %	0 %	50 %	0 %	440223902
19579	NC_020062	CCA	2	6	1016307	1016312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223902
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19582	NC_020062	TCC	2	6	1016506	1016511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223902
19583	NC_020062	TTG	2	6	1016599	1016604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223902
19584	NC_020062	TTC	2	6	1016614	1016619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223902
19585	NC_020062	CGA	2	6	1016777	1016782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223902
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19587	NC_020062	ATG	2	6	1017028	1017033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223902
19588	NC_020062	GCA	2	6	1017142	1017147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19589	NC_020062	GCA	3	9	1017247	1017255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19590	NC_020062	CAG	2	6	1017302	1017307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
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19592	NC_020062	GGCA	2	8	1017321	1017328	25 %	0 %	50 %	25 %	440223903
19593	NC_020062	CGG	2	6	1017345	1017350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223903
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19595	NC_020062	CGAG	2	8	1017502	1017509	25 %	0 %	50 %	25 %	440223903
19596	NC_020062	GCG	2	6	1017526	1017531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223903
19597	NC_020062	ATC	2	6	1017552	1017557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223903
19598	NC_020062	ACG	2	6	1017567	1017572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19599	NC_020062	AGC	2	6	1017579	1017584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19600	NC_020062	GGC	2	6	1017623	1017628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223903
19601	NC_020062	TGA	2	6	1017670	1017675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223903
19602	NC_020062	AAT	2	6	1017727	1017732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223903
19603	NC_020062	GCG	2	6	1017751	1017756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223903
19604	NC_020062	CGC	2	6	1017839	1017844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223903
19605	NC_020062	GAC	2	6	1017845	1017850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19606	NC_020062	CAG	2	6	1017851	1017856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19607	NC_020062	ATG	2	6	1017906	1017911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223903
19608	NC_020062	GTC	2	6	1017920	1017925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223903
19609	NC_020062	CCT	2	6	1017963	1017968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223904
19610	NC_020062	CGATGG	2	12	1018002	1018013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223904
19611	NC_020062	TGA	2	6	1018014	1018019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223904
19612	NC_020062	GCA	2	6	1018020	1018025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19613	NC_020062	GAC	2	6	1018027	1018032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19614	NC_020062	GCA	2	6	1018040	1018045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19615	NC_020062	CAGCAC	2	12	1018177	1018188	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440223904
19616	NC_020062	CGT	2	6	1018198	1018203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19617	NC_020062	GCGG	2	8	1018261	1018268	0 %	0 %	75 %	25 %	440223904
19618	NC_020062	CCA	2	6	1018272	1018277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223904
19619	NC_020062	CGA	2	6	1018350	1018355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19620	NC_020062	GAA	2	6	1018447	1018452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223904
19621	NC_020062	GAT	2	6	1018498	1018503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223904
19622	NC_020062	AGA	2	6	1018515	1018520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223904
19623	NC_020062	CAG	2	6	1018570	1018575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19624	NC_020062	CA	4	8	1018600	1018607	50 %	0 %	0 %	50 %	440223904
19625	NC_020062	AGA	2	6	1018644	1018649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223904
19626	NC_020062	CGA	2	6	1018689	1018694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223904
19627	NC_020062	ACC	2	6	1018739	1018744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223904
19628	NC_020062	GCT	2	6	1018968	1018973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19629	NC_020062	GCA	2	6	1018976	1018981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19630	NC_020062	CGGC	2	8	1018983	1018990	0 %	0 %	50 %	50 %	440223905
19631	NC_020062	TTG	2	6	1019150	1019155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223905
19632	NC_020062	CTG	2	6	1019188	1019193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19633	NC_020062	TCG	2	6	1019199	1019204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19634	NC_020062	GGC	2	6	1019227	1019232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223905
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19636	NC_020062	TCG	2	6	1019301	1019306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19637	NC_020062	TCG	2	6	1019327	1019332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19638	NC_020062	TGC	2	6	1019343	1019348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19639	NC_020062	GCTG	2	8	1019355	1019362	0 %	25 %	50 %	25 %	440223905
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19641	NC_020062	CAT	2	6	1019383	1019388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223905
19642	NC_020062	CGCGG	2	10	1019389	1019398	0 %	0 %	60 %	40 %	440223905
19643	NC_020062	CGA	2	6	1019403	1019408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19644	NC_020062	CTG	2	6	1019422	1019427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223905
19645	NC_020062	GTCG	2	8	1019494	1019501	0 %	25 %	50 %	25 %	440223905
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19729	NC_020062	CCT	2	6	1023050	1023055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223908
19730	NC_020062	T	6	6	1023128	1023133	0 %	100 %	0 %	0 %	440223908
19731	NC_020062	AGGC	2	8	1023156	1023163	25 %	0 %	50 %	25 %	440223908
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19734	NC_020062	GCT	2	6	1023423	1023428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223908
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19738	NC_020062	GC	3	6	1023618	1023623	0 %	0 %	50 %	50 %	440223908
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19742	NC_020062	ATCGCG	2	12	1023699	1023710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223908
19743	NC_020062	CAT	2	6	1023746	1023751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223908
19744	NC_020062	AGTC	2	8	1023804	1023811	25 %	25 %	25 %	25 %	440223908
19745	NC_020062	CGG	2	6	1023816	1023821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223908
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19759	NC_020062	CGA	2	6	1024699	1024704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223909
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19833	NC_020062	TGG	2	6	1027992	1027997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223912
19834	NC_020062	GCA	2	6	1027998	1028003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223912
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19840	NC_020062	TTG	2	6	1028381	1028386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223913
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19842	NC_020062	GCC	2	6	1028527	1028532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223913
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19844	NC_020062	CGGC	2	8	1028594	1028601	0 %	0 %	50 %	50 %	440223913
19845	NC_020062	GTC	2	6	1028761	1028766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223913
19846	NC_020062	CGT	2	6	1028772	1028777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223913
19847	NC_020062	CGA	2	6	1028823	1028828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223913
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19851	NC_020062	CTT	2	6	1028986	1028991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223913
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19939	NC_020062	CG	3	6	1032759	1032764	0 %	0 %	50 %	50 %	440223916
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19943	NC_020062	TGA	2	6	1033166	1033171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223917
19944	NC_020062	TGT	2	6	1033351	1033356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223917
19945	NC_020062	TCT	2	6	1033399	1033404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223917
19946	NC_020062	GC	3	6	1033436	1033441	0 %	0 %	50 %	50 %	440223917
19947	NC_020062	AAGA	2	8	1033446	1033453	75 %	0 %	25 %	0 %	440223917
19948	NC_020062	ATC	2	6	1033473	1033478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223917
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19950	NC_020062	CG	4	8	1033750	1033757	0 %	0 %	50 %	50 %	440223917
19951	NC_020062	TGA	2	6	1033874	1033879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223918
19952	NC_020062	TTTC	2	8	1033884	1033891	0 %	75 %	0 %	25 %	440223918
19953	NC_020062	CGG	2	6	1033928	1033933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223918
19954	NC_020062	TGC	2	6	1033988	1033993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223918
19955	NC_020062	TCC	2	6	1034024	1034029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223918
19956	NC_020062	GGA	2	6	1034073	1034078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223918
19957	NC_020062	CGT	2	6	1034363	1034368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223919
19958	NC_020062	GCT	2	6	1034384	1034389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223919
19959	NC_020062	GCTGG	2	10	1034432	1034441	0 %	20 %	60 %	20 %	440223919
19960	NC_020062	GCA	2	6	1034481	1034486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223919
19961	NC_020062	GCG	2	6	1034490	1034495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223919
19962	NC_020062	CTG	3	9	1034637	1034645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223919
19963	NC_020062	TCC	2	6	1034649	1034654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223919
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19967	NC_020062	GGC	2	6	1034894	1034899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223919
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19969	NC_020062	TCG	2	6	1035019	1035024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223919
19970	NC_020062	GCA	2	6	1035025	1035030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223919
19971	NC_020062	TCA	2	6	1035040	1035045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223919
19972	NC_020062	TGGGC	2	10	1035148	1035157	0 %	20 %	60 %	20 %	440223919
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19975	NC_020062	CGG	2	6	1035388	1035393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223920
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19982	NC_020062	GCC	2	6	1035776	1035781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223920
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19999	NC_020062	CCCG	2	8	1036437	1036444	0 %	0 %	25 %	75 %	440223921
20000	NC_020062	GGCG	2	8	1036452	1036459	0 %	0 %	75 %	25 %	440223921

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