MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_020062	TTGCCT	2	12	964563	964574	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440223856
18502	NC_020062	TCG	2	6	964575	964580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223856
18503	NC_020062	CGGA	2	8	964581	964588	25 %	0 %	50 %	25 %	440223856
18504	NC_020062	GCC	2	6	964661	964666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223856
18505	NC_020062	ACG	2	6	964670	964675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223856
18506	NC_020062	CTCG	2	8	964744	964751	0 %	25 %	25 %	50 %	440223856
18507	NC_020062	TCA	2	6	964755	964760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223856
18508	NC_020062	GCG	2	6	964761	964766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223856
18509	NC_020062	CGA	2	6	964864	964869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223856
18510	NC_020062	GAC	2	6	964907	964912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223856
18511	NC_020062	TTC	2	6	964991	964996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223856
18512	NC_020062	GGT	2	6	965044	965049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223856
18513	NC_020062	TCT	2	6	965145	965150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223856
18514	NC_020062	GCC	2	6	965192	965197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223856
18515	NC_020062	TCG	2	6	965229	965234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223856
18516	NC_020062	AGG	3	9	965244	965252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223856
18517	NC_020062	GAG	2	6	965294	965299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223856
18518	NC_020062	CTT	2	6	965320	965325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223856
18519	NC_020062	ATC	2	6	965328	965333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223856
18520	NC_020062	CAA	2	6	965392	965397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223856
18521	NC_020062	AAG	2	6	965423	965428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223856
18522	NC_020062	CGC	2	6	965481	965486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223856
18523	NC_020062	CCT	2	6	965490	965495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223856
18524	NC_020062	ATC	2	6	965528	965533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223856
18525	NC_020062	CGA	2	6	965599	965604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223856
18526	NC_020062	ATC	2	6	965682	965687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223856
18527	NC_020062	CAT	2	6	965788	965793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223857
18528	NC_020062	CGC	2	6	965833	965838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223857
18529	NC_020062	ATC	2	6	965852	965857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223857
18530	NC_020062	GCT	2	6	965932	965937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223857
18531	NC_020062	ACG	2	6	965952	965957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223857
18532	NC_020062	GCA	2	6	966018	966023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223857
18533	NC_020062	GCCG	2	8	966208	966215	0 %	0 %	50 %	50 %	440223857
18534	NC_020062	TGT	2	6	966243	966248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223857
18535	NC_020062	CGG	2	6	966315	966320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223857
18536	NC_020062	CCGGC	2	10	966339	966348	0 %	0 %	40 %	60 %	440223857
18537	NC_020062	TCA	2	6	966372	966377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223857
18538	NC_020062	GGGC	2	8	966391	966398	0 %	0 %	75 %	25 %	440223857
18539	NC_020062	TCA	2	6	966450	966455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223857
18540	NC_020062	CGT	2	6	966469	966474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223857
18541	NC_020062	CGGT	2	8	966513	966520	0 %	25 %	50 %	25 %	440223857
18542	NC_020062	CGTG	2	8	966580	966587	0 %	25 %	50 %	25 %	440223857
18543	NC_020062	GC	5	10	966638	966647	0 %	0 %	50 %	50 %	440223857
18544	NC_020062	GCGA	2	8	966800	966807	25 %	0 %	50 %	25 %	440223857
18545	NC_020062	CTG	2	6	966821	966826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223857
18546	NC_020062	TCG	2	6	966852	966857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223857
18547	NC_020062	GC	3	6	966870	966875	0 %	0 %	50 %	50 %	440223857
18548	NC_020062	CAT	2	6	966910	966915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223857
18549	NC_020062	ACGA	2	8	966979	966986	50 %	0 %	25 %	25 %	440223857
18550	NC_020062	CG	3	6	967025	967030	0 %	0 %	50 %	50 %	440223858
18551	NC_020062	CGA	2	6	967044	967049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223858
18552	NC_020062	GGC	2	6	967101	967106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223858
18553	NC_020062	CCG	2	6	967126	967131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223858
18554	NC_020062	CGG	3	9	967191	967199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223858
18555	NC_020062	CCG	2	6	967226	967231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223858
18556	NC_020062	CGT	2	6	967264	967269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223858
18557	NC_020062	GCT	2	6	967287	967292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223858
18558	NC_020062	GGC	2	6	967311	967316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223858
18559	NC_020062	CGC	2	6	967330	967335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223858
18560	NC_020062	GAC	2	6	967344	967349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223858
18561	NC_020062	CAA	2	6	967386	967391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223858
18562	NC_020062	GCCT	2	8	967442	967449	0 %	25 %	25 %	50 %	440223858
18563	NC_020062	GCA	2	6	967506	967511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223858
18564	NC_020062	GAC	2	6	967585	967590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18565	NC_020062	TCGA	2	8	967605	967612	25 %	25 %	25 %	25 %	440223859
18566	NC_020062	GCC	2	6	967622	967627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223859
18567	NC_020062	ATT	2	6	967641	967646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223859
18568	NC_020062	CCG	2	6	967686	967691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223859
18569	NC_020062	GTC	2	6	967721	967726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18570	NC_020062	TGGGGC	2	12	967754	967765	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	440223859
18571	NC_020062	GCT	2	6	967819	967824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18572	NC_020062	TGC	2	6	967837	967842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18573	NC_020062	CT	3	6	967913	967918	0 %	50 %	0 %	50 %	440223859
18574	NC_020062	GCT	2	6	967933	967938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223859
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18578	NC_020062	TGC	2	6	968074	968079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18579	NC_020062	CTT	2	6	968113	968118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223859
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18584	NC_020062	CTG	2	6	968372	968377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18585	NC_020062	TGG	2	6	968379	968384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223859
18586	NC_020062	TCA	2	6	968403	968408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223859
18587	NC_020062	GTGCG	2	10	968460	968469	0 %	20 %	60 %	20 %	440223859
18588	NC_020062	TTC	2	6	968498	968503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223859
18589	NC_020062	CGC	2	6	968563	968568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223859
18590	NC_020062	CGA	2	6	968656	968661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223859
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18592	NC_020062	ATC	2	6	968699	968704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223859
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18601	NC_020062	CGA	2	6	969115	969120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18602	NC_020062	GC	3	6	969182	969187	0 %	0 %	50 %	50 %	440223859
18603	NC_020062	ACG	2	6	969194	969199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223859
18604	NC_020062	TCGTCA	2	12	969201	969212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440223859
18605	NC_020062	GGC	2	6	969266	969271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223859
18606	NC_020062	CA	3	6	969295	969300	50 %	0 %	0 %	50 %	440223859
18607	NC_020062	CG	3	6	969330	969335	0 %	0 %	50 %	50 %	440223859
18608	NC_020062	CATT	2	8	969456	969463	25 %	50 %	0 %	25 %	440223860
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18610	NC_020062	AT	3	6	969475	969480	50 %	50 %	0 %	0 %	440223860
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18614	NC_020062	CTAC	2	8	969681	969688	25 %	25 %	0 %	50 %	440223860
18615	NC_020062	CGAC	2	8	969690	969697	25 %	0 %	25 %	50 %	440223860
18616	NC_020062	GTC	2	6	969707	969712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223860
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18974	NC_020062	ATCC	2	8	988723	988730	25 %	25 %	0 %	50 %	440223879
18975	NC_020062	CGA	2	6	988822	988827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223879
18976	NC_020062	GCG	2	6	988935	988940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223879
18977	NC_020062	TGC	2	6	988942	988947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223879
18978	NC_020062	TTC	2	6	989025	989030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223879
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18983	NC_020062	TGCA	2	8	989151	989158	25 %	25 %	25 %	25 %	440223879
18984	NC_020062	CTG	2	6	989180	989185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223879
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18986	NC_020062	CGT	2	6	989220	989225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223879
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18997	NC_020062	CTG	2	6	990052	990057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223881
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19000	NC_020062	TTCT	2	8	990264	990271	0 %	75 %	0 %	25 %	440223882

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