MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_020062	CGGC	2	8	940008	940015	0 %	0 %	50 %	50 %	440223834
18002	NC_020062	AAG	2	6	940055	940060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223834
18003	NC_020062	TCG	2	6	940134	940139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223834
18004	NC_020062	GC	3	6	940194	940199	0 %	0 %	50 %	50 %	440223834
18005	NC_020062	AT	3	6	940267	940272	50 %	50 %	0 %	0 %	440223834
18006	NC_020062	TCG	2	6	940290	940295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223834
18007	NC_020062	GGC	2	6	940382	940387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223834
18008	NC_020062	GGCC	2	8	940411	940418	0 %	0 %	50 %	50 %	440223834
18009	NC_020062	CAT	2	6	940468	940473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223834
18010	NC_020062	GCT	2	6	940480	940485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223834
18011	NC_020062	ACCTCA	2	12	940491	940502	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440223834
18012	NC_020062	CCG	2	6	940507	940512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223834
18013	NC_020062	GTC	2	6	940568	940573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223834
18014	NC_020062	TTG	2	6	940650	940655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223834
18015	NC_020062	AAG	2	6	940661	940666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223834
18016	NC_020062	CAC	2	6	940684	940689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223834
18017	NC_020062	CGGC	2	8	940692	940699	0 %	0 %	50 %	50 %	440223834
18018	NC_020062	ACC	2	6	940703	940708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223834
18019	NC_020062	TCT	2	6	940717	940722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223834
18020	NC_020062	GAA	2	6	940763	940768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223834
18021	NC_020062	GA	3	6	940834	940839	50 %	0 %	50 %	0 %	440223834
18022	NC_020062	GAT	2	6	940970	940975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223835
18023	NC_020062	TGA	2	6	940977	940982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223835
18024	NC_020062	GGC	2	6	940991	940996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
18025	NC_020062	CAC	2	6	941027	941032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223835
18026	NC_020062	CAG	2	6	941139	941144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18027	NC_020062	TTCG	3	12	941220	941231	0 %	50 %	25 %	25 %	440223835
18028	NC_020062	AGC	2	6	941244	941249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18029	NC_020062	AGC	3	9	941319	941327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18030	NC_020062	GCC	2	6	941460	941465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
18031	NC_020062	CATGCA	2	12	941488	941499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223835
18032	NC_020062	GTT	2	6	941510	941515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223835
18033	NC_020062	GCG	2	6	941568	941573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
18034	NC_020062	GAC	2	6	941621	941626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18035	NC_020062	GCTC	2	8	941634	941641	0 %	25 %	25 %	50 %	440223835
18036	NC_020062	AGC	2	6	941696	941701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18037	NC_020062	CGG	2	6	941773	941778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
18038	NC_020062	CAG	2	6	941789	941794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18039	NC_020062	GTC	2	6	941832	941837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18040	NC_020062	GCA	2	6	941844	941849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18041	NC_020062	GCC	2	6	941982	941987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
18042	NC_020062	CCG	2	6	942041	942046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
18043	NC_020062	CAC	2	6	942080	942085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223835
18044	NC_020062	TCGCG	2	10	942090	942099	0 %	20 %	40 %	40 %	440223835
18045	NC_020062	CG	3	6	942149	942154	0 %	0 %	50 %	50 %	440223835
18046	NC_020062	AGG	2	6	942193	942198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223835
18047	NC_020062	ATCGAA	2	12	942218	942229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440223835
18048	NC_020062	GGC	2	6	942269	942274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
18049	NC_020062	GAT	2	6	942290	942295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223835
18050	NC_020062	CGC	2	6	942493	942498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
18051	NC_020062	ACG	2	6	942519	942524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18052	NC_020062	TGG	2	6	942552	942557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223835
18053	NC_020062	GCA	2	6	942592	942597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18054	NC_020062	GGC	2	6	942674	942679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
18055	NC_020062	CGA	2	6	942709	942714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18056	NC_020062	GC	3	6	942762	942767	0 %	0 %	50 %	50 %	440223835
18057	NC_020062	GCC	2	6	942834	942839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
18058	NC_020062	TCA	2	6	942846	942851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223835
18059	NC_020062	GCG	2	6	942855	942860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223835
18060	NC_020062	TCG	2	6	942888	942893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18061	NC_020062	CGA	2	6	942913	942918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18062	NC_020062	AAG	2	6	942957	942962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223835
18063	NC_020062	TGC	2	6	942970	942975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18064	NC_020062	TCG	2	6	943014	943019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18065	NC_020062	CCA	2	6	943048	943053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223835
18066	NC_020062	TGA	2	6	943102	943107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223835
18067	NC_020062	GCA	2	6	943129	943134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18068	NC_020062	AAGC	2	8	943159	943166	50 %	0 %	25 %	25 %	440223835
18069	NC_020062	CGT	2	6	943210	943215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18070	NC_020062	CGC	2	6	943274	943279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
18071	NC_020062	ACG	2	6	943314	943319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18072	NC_020062	CCGAT	2	10	943332	943341	20 %	20 %	20 %	40 %	440223835
18073	NC_020062	CG	3	6	943345	943350	0 %	0 %	50 %	50 %	440223835
18074	NC_020062	TCC	2	6	943359	943364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223835
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18083	NC_020062	CGA	3	9	943660	943668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223835
18084	NC_020062	CGTT	2	8	943690	943697	0 %	50 %	25 %	25 %	440223835
18085	NC_020062	CGC	2	6	943708	943713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
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18087	NC_020062	GTCG	2	8	943832	943839	0 %	25 %	50 %	25 %	440223835
18088	NC_020062	CGC	2	6	943876	943881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223835
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18090	NC_020062	ACG	2	6	944220	944225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223836
18091	NC_020062	ATC	2	6	944277	944282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223836
18092	NC_020062	GTC	2	6	944295	944300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223836
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18095	NC_020062	CAGCG	2	10	944456	944465	20 %	0 %	40 %	40 %	440223836
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18102	NC_020062	CAGC	2	8	944804	944811	25 %	0 %	25 %	50 %	440223836
18103	NC_020062	CGC	3	9	944896	944904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223836
18104	NC_020062	CGA	2	6	944911	944916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223836
18105	NC_020062	AGG	2	6	944926	944931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223836
18106	NC_020062	GAT	2	6	944948	944953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223836
18107	NC_020062	TCG	2	6	944958	944963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223836
18108	NC_020062	GCC	2	6	945015	945020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223836
18109	NC_020062	TCG	2	6	945030	945035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223836
18110	NC_020062	CTT	2	6	945083	945088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223836
18111	NC_020062	TTTCG	2	10	945119	945128	0 %	60 %	20 %	20 %	440223836
18112	NC_020062	CGAT	2	8	945132	945139	25 %	25 %	25 %	25 %	440223836
18113	NC_020062	GGC	2	6	945140	945145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223836
18114	NC_020062	CTTC	2	8	945154	945161	0 %	50 %	0 %	50 %	440223836
18115	NC_020062	ATG	2	6	945204	945209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223836
18116	NC_020062	GC	5	10	945240	945249	0 %	0 %	50 %	50 %	440223836
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18233	NC_020062	GCTG	2	8	950496	950503	0 %	25 %	50 %	25 %	440223841
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18238	NC_020062	GCC	2	6	950712	950717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223841
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18240	NC_020062	CGA	2	6	950750	950755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223841
18241	NC_020062	ATGCC	2	10	950785	950794	20 %	20 %	20 %	40 %	440223841
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18476	NC_020062	GAA	2	6	963497	963502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223855
18477	NC_020062	ATC	2	6	963510	963515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223855
18478	NC_020062	ATA	2	6	963537	963542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223855
18479	NC_020062	TCT	2	6	963586	963591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223855
18480	NC_020062	CGG	2	6	963622	963627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223855
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18484	NC_020062	AAGAA	2	10	963777	963786	80 %	0 %	20 %	0 %	440223855
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18488	NC_020062	CTTC	2	8	963892	963899	0 %	50 %	0 %	50 %	440223855
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