MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020062	TCG	2	6	810061	810066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223705
15502	NC_020062	CGT	2	6	810067	810072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223705
15503	NC_020062	AGC	2	6	810126	810131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223705
15504	NC_020062	ATG	2	6	810270	810275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223705
15505	NC_020062	CG	3	6	810289	810294	0 %	0 %	50 %	50 %	440223705
15506	NC_020062	AGCGC	2	10	810325	810334	20 %	0 %	40 %	40 %	440223705
15507	NC_020062	GCA	2	6	810394	810399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223705
15508	NC_020062	CGG	2	6	810416	810421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223705
15509	NC_020062	CGGC	2	8	810438	810445	0 %	0 %	50 %	50 %	440223705
15510	NC_020062	TGA	2	6	810478	810483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223705
15511	NC_020062	GCC	2	6	810515	810520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223705
15512	NC_020062	AAT	2	6	810523	810528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223705
15513	NC_020062	ACCG	2	8	810593	810600	25 %	0 %	25 %	50 %	440223705
15514	NC_020062	GGTTGA	2	12	810601	810612	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440223705
15515	NC_020062	AAT	2	6	810613	810618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223705
15516	NC_020062	CGG	2	6	810644	810649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223705
15517	NC_020062	ATC	2	6	810654	810659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223705
15518	NC_020062	GTC	2	6	810728	810733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223705
15519	NC_020062	GAT	2	6	810734	810739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223705
15520	NC_020062	CCA	2	6	811003	811008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223705
15521	NC_020062	CGA	2	6	811046	811051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223705
15522	NC_020062	CGG	2	6	811258	811263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15523	NC_020062	TCG	2	6	811265	811270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15524	NC_020062	CGG	2	6	811277	811282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15525	NC_020062	CAG	2	6	811306	811311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15526	NC_020062	GGC	2	6	811401	811406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15527	NC_020062	TGA	2	6	811488	811493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223706
15528	NC_020062	TGA	2	6	811539	811544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223706
15529	NC_020062	GAT	2	6	811591	811596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223706
15530	NC_020062	GC	3	6	811617	811622	0 %	0 %	50 %	50 %	440223706
15531	NC_020062	GCC	2	6	811648	811653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223706
15532	NC_020062	GCG	2	6	811726	811731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15533	NC_020062	ATG	2	6	811751	811756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223706
15534	NC_020062	CGAG	2	8	811809	811816	25 %	0 %	50 %	25 %	440223706
15535	NC_020062	GGC	2	6	811882	811887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15536	NC_020062	TCG	2	6	811956	811961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15537	NC_020062	GCCGGA	2	12	811966	811977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223706
15538	NC_020062	CGA	2	6	811983	811988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15539	NC_020062	TTC	2	6	812069	812074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223706
15540	NC_020062	GCT	2	6	812118	812123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15541	NC_020062	GCGG	2	8	812131	812138	0 %	0 %	75 %	25 %	440223706
15542	NC_020062	CTC	2	6	812152	812157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223706
15543	NC_020062	CGA	2	6	812160	812165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15544	NC_020062	CGC	2	6	812175	812180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223706
15545	NC_020062	TGC	2	6	812229	812234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15546	NC_020062	GCG	2	6	812249	812254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15547	NC_020062	TGC	2	6	812276	812281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15548	NC_020062	CTT	2	6	812320	812325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223706
15549	NC_020062	CAT	2	6	812346	812351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223706
15550	NC_020062	TGA	2	6	812385	812390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223706
15551	NC_020062	ATG	2	6	812429	812434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223706
15552	NC_020062	CGT	2	6	812470	812475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15553	NC_020062	GGCA	2	8	812505	812512	25 %	0 %	50 %	25 %	440223706
15554	NC_020062	GCC	2	6	812545	812550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223706
15555	NC_020062	GGC	2	6	812581	812586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15556	NC_020062	GGC	2	6	812635	812640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223706
15557	NC_020062	GAA	3	9	812661	812669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223706
15558	NC_020062	GC	3	6	812762	812767	0 %	0 %	50 %	50 %	440223706
15559	NC_020062	TGC	2	6	812814	812819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15560	NC_020062	GC	4	8	812830	812837	0 %	0 %	50 %	50 %	440223706
15561	NC_020062	CAT	2	6	812839	812844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223706
15562	NC_020062	GCCGGA	2	12	812884	812895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223706
15563	NC_020062	CGA	2	6	812901	812906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223706
15564	NC_020062	GTC	2	6	813509	813514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223707
15565	NC_020062	CCG	2	6	813546	813551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223707
15566	NC_020062	GGC	2	6	813610	813615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223707
15567	NC_020062	GAG	2	6	813623	813628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223707
15568	NC_020062	GCT	2	6	813667	813672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223707
15569	NC_020062	TGC	2	6	813687	813692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223707
15570	NC_020062	CGA	2	6	813738	813743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223707
15571	NC_020062	TCG	2	6	813763	813768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223707
15572	NC_020062	GCC	2	6	813833	813838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223707
15573	NC_020062	GCC	2	6	813845	813850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223707
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15578	NC_020062	CGACC	2	10	814352	814361	20 %	0 %	20 %	60 %	440223708
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15582	NC_020062	GTC	3	9	814506	814514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223708
15583	NC_020062	ATG	3	9	814560	814568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223708
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15585	NC_020062	GCTC	2	8	814672	814679	0 %	25 %	25 %	50 %	440223708
15586	NC_020062	GCT	2	6	814685	814690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223708
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15589	NC_020062	TTGC	2	8	814812	814819	0 %	50 %	25 %	25 %	440223708
15590	NC_020062	GGC	3	9	814925	814933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223708
15591	NC_020062	CGC	2	6	814975	814980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223708
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15593	NC_020062	TTGG	2	8	815100	815107	0 %	50 %	50 %	0 %	440223708
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15601	NC_020062	ATT	2	6	815434	815439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223708
15602	NC_020062	CTTGC	2	10	815481	815490	0 %	40 %	20 %	40 %	440223708
15603	NC_020062	CTT	2	6	815495	815500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223708
15604	NC_020062	TCGT	2	8	815529	815536	0 %	50 %	25 %	25 %	440223708
15605	NC_020062	GC	3	6	815616	815621	0 %	0 %	50 %	50 %	440223709
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15607	NC_020062	CGAA	2	8	815711	815718	50 %	0 %	25 %	25 %	440223709
15608	NC_020062	CG	3	6	815925	815930	0 %	0 %	50 %	50 %	440223709
15609	NC_020062	GTT	2	6	815959	815964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223709
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15739	NC_020062	GTC	2	6	823358	823363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223718
15740	NC_020062	GCTGC	2	10	823366	823375	0 %	20 %	40 %	40 %	440223718
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15844	NC_020062	GC	3	6	828351	828356	0 %	0 %	50 %	50 %	440223722
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15846	NC_020062	GC	3	6	828421	828426	0 %	0 %	50 %	50 %	440223722
15847	NC_020062	AT	3	6	828642	828647	50 %	50 %	0 %	0 %	440223723
15848	NC_020062	GCA	3	9	828658	828666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15849	NC_020062	AGGC	2	8	828674	828681	25 %	0 %	50 %	25 %	440223723
15850	NC_020062	GTC	2	6	828783	828788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15851	NC_020062	TCG	2	6	828822	828827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15852	NC_020062	GTTCGC	2	12	828923	828934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15853	NC_020062	TCG	2	6	828951	828956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15854	NC_020062	GAT	2	6	828974	828979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223723
15855	NC_020062	AGC	2	6	829038	829043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15856	NC_020062	GCG	2	6	829064	829069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223723
15857	NC_020062	GGT	2	6	829080	829085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223723
15858	NC_020062	TGG	2	6	829111	829116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223723
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15861	NC_020062	TGC	2	6	829230	829235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223723
15862	NC_020062	GCC	2	6	829313	829318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223723
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15866	NC_020062	TCA	2	6	829453	829458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223723
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15875	NC_020062	TCG	2	6	830124	830129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223724
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15884	NC_020062	CG	3	6	830643	830648	0 %	0 %	50 %	50 %	440223724
15885	NC_020062	CCA	2	6	830656	830661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223724
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15926	NC_020062	TGA	2	6	832104	832109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223725
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15936	NC_020062	GTCC	2	8	832625	832632	0 %	25 %	25 %	50 %	440223726
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15942	NC_020062	TCGG	2	8	833078	833085	0 %	25 %	50 %	25 %	440223727
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15944	NC_020062	TCCG	2	8	833124	833131	0 %	25 %	25 %	50 %	440223727
15945	NC_020062	CG	3	6	833138	833143	0 %	0 %	50 %	50 %	440223727
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15950	NC_020062	GAC	2	6	833335	833340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223727
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15955	NC_020062	TGGAA	2	10	833445	833454	40 %	20 %	40 %	0 %	440223727
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15957	NC_020062	CGAGC	2	10	833521	833530	20 %	0 %	40 %	40 %	440223727
15958	NC_020062	CGA	2	6	833541	833546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223727
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15961	NC_020062	ATC	3	9	833666	833674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223727
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15969	NC_020062	CATC	2	8	833997	834004	25 %	25 %	0 %	50 %	440223727
15970	NC_020062	GCC	2	6	834016	834021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223727
15971	NC_020062	TCG	2	6	834056	834061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223727
15972	NC_020062	GTG	2	6	834096	834101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223727
15973	NC_020062	TCA	2	6	834117	834122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223727
15974	NC_020062	GTA	2	6	834171	834176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223728
15975	NC_020062	GCA	2	6	834199	834204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223728
15976	NC_020062	GC	3	6	834212	834217	0 %	0 %	50 %	50 %	440223728
15977	NC_020062	GGC	2	6	834231	834236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223728
15978	NC_020062	GAGCG	2	10	834252	834261	20 %	0 %	60 %	20 %	440223728
15979	NC_020062	CA	3	6	834270	834275	50 %	0 %	0 %	50 %	440223728
15980	NC_020062	TCGG	2	8	834281	834288	0 %	25 %	50 %	25 %	440223728
15981	NC_020062	GCC	2	6	834310	834315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223728
15982	NC_020062	TGA	2	6	834320	834325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223728
15983	NC_020062	ATG	2	6	834349	834354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223728
15984	NC_020062	TGC	2	6	834366	834371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223728
15985	NC_020062	GCA	2	6	834392	834397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223728
15986	NC_020062	GGAAG	2	10	834512	834521	40 %	0 %	60 %	0 %	440223728
15987	NC_020062	CGA	2	6	834536	834541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223728
15988	NC_020062	GC	3	6	834551	834556	0 %	0 %	50 %	50 %	440223728
15989	NC_020062	GA	3	6	834607	834612	50 %	0 %	50 %	0 %	440223728
15990	NC_020062	TGA	2	6	834647	834652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223728
15991	NC_020062	GC	3	6	834681	834686	0 %	0 %	50 %	50 %	440223728
15992	NC_020062	GCGA	2	8	834696	834703	25 %	0 %	50 %	25 %	440223728
15993	NC_020062	GCCGA	2	10	834715	834724	20 %	0 %	40 %	40 %	440223728
15994	NC_020062	GCG	2	6	834732	834737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223728
15995	NC_020062	CGA	2	6	834755	834760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223728
15996	NC_020062	CGT	2	6	834790	834795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223728
15997	NC_020062	GC	3	6	834812	834817	0 %	0 %	50 %	50 %	440223728
15998	NC_020062	GCGA	2	8	834822	834829	25 %	0 %	50 %	25 %	440223728
15999	NC_020062	CCT	2	6	834845	834850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223728
16000	NC_020062	TCG	2	6	835302	835307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223729

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