MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020062	GCC	2	6	784960	784965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223680
15002	NC_020062	CAT	2	6	784986	784991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223680
15003	NC_020062	GTC	2	6	784999	785004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
15004	NC_020062	GC	4	8	785022	785029	0 %	0 %	50 %	50 %	440223680
15005	NC_020062	CTT	2	6	785185	785190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223680
15006	NC_020062	GCCT	2	8	785218	785225	0 %	25 %	25 %	50 %	440223680
15007	NC_020062	CG	3	6	785252	785257	0 %	0 %	50 %	50 %	440223680
15008	NC_020062	GGCT	2	8	785306	785313	0 %	25 %	50 %	25 %	440223680
15009	NC_020062	GAT	2	6	785335	785340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223680
15010	NC_020062	TGC	2	6	785447	785452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
15011	NC_020062	CTT	2	6	785491	785496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223680
15012	NC_020062	TTG	2	6	785519	785524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223680
15013	NC_020062	TCG	2	6	785621	785626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
15014	NC_020062	TCA	2	6	785682	785687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223680
15015	NC_020062	CG	3	6	785691	785696	0 %	0 %	50 %	50 %	440223680
15016	NC_020062	GCC	2	6	785701	785706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223680
15017	NC_020062	GAC	2	6	785722	785727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223680
15018	NC_020062	CGC	2	6	785784	785789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223680
15019	NC_020062	T	6	6	785831	785836	0 %	100 %	0 %	0 %	440223680
15020	NC_020062	TCG	2	6	785840	785845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
15021	NC_020062	GTC	2	6	785983	785988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
15022	NC_020062	ACAG	2	8	786020	786027	50 %	0 %	25 %	25 %	440223680
15023	NC_020062	GC	4	8	786124	786131	0 %	0 %	50 %	50 %	440223680
15024	NC_020062	CCA	2	6	786246	786251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223680
15025	NC_020062	CCA	2	6	786305	786310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223680
15026	NC_020062	GCG	2	6	786372	786377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223680
15027	NC_020062	CAC	2	6	786420	786425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223680
15028	NC_020062	CGC	2	6	786507	786512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223680
15029	NC_020062	GAT	2	6	786743	786748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223681
15030	NC_020062	CT	3	6	786753	786758	0 %	50 %	0 %	50 %	440223681
15031	NC_020062	CAT	2	6	786800	786805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223681
15032	NC_020062	TCG	2	6	786817	786822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223681
15033	NC_020062	GAT	2	6	786824	786829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223681
15034	NC_020062	GCCT	2	8	786859	786866	0 %	25 %	25 %	50 %	440223681
15035	NC_020062	TGT	2	6	786908	786913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223681
15036	NC_020062	TGC	2	6	787094	787099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223681
15037	NC_020062	GC	3	6	787098	787103	0 %	0 %	50 %	50 %	440223681
15038	NC_020062	TGA	2	6	787115	787120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223681
15039	NC_020062	GCC	2	6	787174	787179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223681
15040	NC_020062	ACG	2	6	787207	787212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223681
15041	NC_020062	CAGCCT	2	12	787301	787312	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	440223681
15042	NC_020062	CG	3	6	787379	787384	0 %	0 %	50 %	50 %	440223681
15043	NC_020062	ATG	2	6	787609	787614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223682
15044	NC_020062	CG	3	6	787633	787638	0 %	0 %	50 %	50 %	440223682
15045	NC_020062	TCG	2	6	787687	787692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15046	NC_020062	CCG	2	6	787739	787744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223682
15047	NC_020062	TGC	2	6	787841	787846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15048	NC_020062	CCG	2	6	787861	787866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223682
15049	NC_020062	CGC	2	6	787895	787900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223682
15050	NC_020062	TCG	2	6	787957	787962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15051	NC_020062	CGA	2	6	787991	787996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15052	NC_020062	CGA	2	6	788044	788049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15053	NC_020062	TGC	2	6	788059	788064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15054	NC_020062	GC	3	6	788098	788103	0 %	0 %	50 %	50 %	440223682
15055	NC_020062	GCG	2	6	788145	788150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223682
15056	NC_020062	CGC	2	6	788240	788245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223682
15057	NC_020062	CAA	2	6	788261	788266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223682
15058	NC_020062	CGT	2	6	788321	788326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15059	NC_020062	AGG	2	6	788329	788334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223682
15060	NC_020062	TGA	2	6	788393	788398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223682
15061	NC_020062	GAA	2	6	788409	788414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223682
15062	NC_020062	TGC	2	6	788425	788430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223682
15063	NC_020062	ACG	2	6	788536	788541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223683
15064	NC_020062	GC	3	6	788684	788689	0 %	0 %	50 %	50 %	440223683
15065	NC_020062	ATT	2	6	788703	788708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223683
15066	NC_020062	CCGG	2	8	788738	788745	0 %	0 %	50 %	50 %	440223683
15067	NC_020062	ACC	2	6	788944	788949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223683
15068	NC_020062	CG	3	6	788979	788984	0 %	0 %	50 %	50 %	440223683
15069	NC_020062	CG	3	6	789026	789031	0 %	0 %	50 %	50 %	440223683
15070	NC_020062	GATC	2	8	789032	789039	25 %	25 %	25 %	25 %	440223683
15071	NC_020062	GAG	2	6	789065	789070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223683
15072	NC_020062	TCA	2	6	789091	789096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223683
15073	NC_020062	CGC	2	6	789113	789118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223683
15074	NC_020062	TCG	2	6	789133	789138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223683
15075	NC_020062	TCG	2	6	789148	789153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223683
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15077	NC_020062	GTC	2	6	789198	789203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223683
15078	NC_020062	GCG	3	9	789241	789249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223683
15079	NC_020062	GCT	2	6	789620	789625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223684
15080	NC_020062	CGT	2	6	789629	789634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223684
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15082	NC_020062	GC	3	6	789751	789756	0 %	0 %	50 %	50 %	440223684
15083	NC_020062	CTG	2	6	789850	789855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223684
15084	NC_020062	GC	3	6	789866	789871	0 %	0 %	50 %	50 %	440223684
15085	NC_020062	CAT	2	6	789903	789908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223684
15086	NC_020062	TCGTG	2	10	790308	790317	0 %	40 %	40 %	20 %	440223685
15087	NC_020062	ACG	2	6	790342	790347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223685
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15089	NC_020062	TTC	2	6	790405	790410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223685
15090	NC_020062	CTT	2	6	790459	790464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223685
15091	NC_020062	AATG	2	8	790466	790473	50 %	25 %	25 %	0 %	440223685
15092	NC_020062	CGGC	2	8	790561	790568	0 %	0 %	50 %	50 %	440223686
15093	NC_020062	GAC	2	6	790584	790589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223686
15094	NC_020062	TCGGC	2	10	790627	790636	0 %	20 %	40 %	40 %	440223686
15095	NC_020062	ATCCC	2	10	790721	790730	20 %	20 %	0 %	60 %	440223686
15096	NC_020062	GC	3	6	790743	790748	0 %	0 %	50 %	50 %	440223686
15097	NC_020062	AGC	2	6	790756	790761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223686
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15101	NC_020062	GC	3	6	790868	790873	0 %	0 %	50 %	50 %	440223686
15102	NC_020062	GCG	2	6	790903	790908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223686
15103	NC_020062	CG	3	6	790907	790912	0 %	0 %	50 %	50 %	440223686
15104	NC_020062	CGG	2	6	790918	790923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223686
15105	NC_020062	GTC	2	6	790989	790994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223686
15106	NC_020062	GCC	2	6	791050	791055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223686
15107	NC_020062	CGGC	2	8	791064	791071	0 %	0 %	50 %	50 %	440223686
15108	NC_020062	AGC	3	9	791236	791244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223686
15109	NC_020062	TG	3	6	791250	791255	0 %	50 %	50 %	0 %	440223686
15110	NC_020062	GATC	2	8	791309	791316	25 %	25 %	25 %	25 %	440223686
15111	NC_020062	CAAAA	2	10	791321	791330	80 %	0 %	0 %	20 %	440223686
15112	NC_020062	GAGG	2	8	791388	791395	25 %	0 %	75 %	0 %	440223686
15113	NC_020062	ACC	2	6	791398	791403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223686
15114	NC_020062	GCA	2	6	791482	791487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223686
15115	NC_020062	AGC	2	6	791506	791511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223686
15116	NC_020062	CGG	2	6	791624	791629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223686
15117	NC_020062	GGGC	2	8	791754	791761	0 %	0 %	75 %	25 %	440223686
15118	NC_020062	GGAG	2	8	791984	791991	25 %	0 %	75 %	0 %	440223687
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15120	NC_020062	TGC	2	6	792204	792209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223687
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15224	NC_020062	GGCG	2	8	796327	796334	0 %	0 %	75 %	25 %	440223690
15225	NC_020062	TCA	2	6	796359	796364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223690
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15232	NC_020062	TTC	2	6	796730	796735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223690
15233	NC_020062	GAG	2	6	796817	796822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223690
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15239	NC_020062	GGCC	2	8	797182	797189	0 %	0 %	50 %	50 %	440223690
15240	NC_020062	AT	3	6	797200	797205	50 %	50 %	0 %	0 %	440223690
15241	NC_020062	TGC	2	6	797300	797305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223690
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15243	NC_020062	GCT	3	9	797343	797351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223691
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15246	NC_020062	CTG	2	6	797461	797466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223691
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15258	NC_020062	CAT	2	6	797882	797887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223692
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15339	NC_020062	ATG	2	6	803043	803048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223698
15340	NC_020062	TGC	2	6	803049	803054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223698
15341	NC_020062	CAT	2	6	803075	803080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223698
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15343	NC_020062	CGA	2	6	803149	803154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223698
15344	NC_020062	CTG	2	6	803156	803161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223698
15345	NC_020062	CGAA	2	8	803172	803179	50 %	0 %	25 %	25 %	440223698
15346	NC_020062	CGG	2	6	803195	803200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223698
15347	NC_020062	ATA	2	6	803220	803225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223698
15348	NC_020062	CAG	2	6	803243	803248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223698
15349	NC_020062	GAT	2	6	803367	803372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223699
15350	NC_020062	GCA	2	6	803383	803388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223699
15351	NC_020062	GCAGG	2	10	803390	803399	20 %	0 %	60 %	20 %	440223699
15352	NC_020062	TGCGAA	2	12	803468	803479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440223699
15353	NC_020062	CGA	2	6	803525	803530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223699
15354	NC_020062	CGC	2	6	803546	803551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223699
15355	NC_020062	GCT	2	6	803556	803561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223699
15356	NC_020062	CCA	2	6	803596	803601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223699
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15473	NC_020062	TGA	2	6	808861	808866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223704
15474	NC_020062	GCGA	2	8	808931	808938	25 %	0 %	50 %	25 %	440223704
15475	NC_020062	AT	3	6	808944	808949	50 %	50 %	0 %	0 %	440223704
15476	NC_020062	CCG	2	6	809026	809031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223704
15477	NC_020062	CAGC	2	8	809072	809079	25 %	0 %	25 %	50 %	440223704
15478	NC_020062	ACA	2	6	809095	809100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223704
15479	NC_020062	CAT	2	6	809105	809110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223704
15480	NC_020062	GCCA	2	8	809115	809122	25 %	0 %	25 %	50 %	440223704
15481	NC_020062	GGAA	2	8	809131	809138	50 %	0 %	50 %	0 %	440223704
15482	NC_020062	AGC	2	6	809145	809150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223704
15483	NC_020062	GA	3	6	809151	809156	50 %	0 %	50 %	0 %	440223704
15484	NC_020062	CG	3	6	809185	809190	0 %	0 %	50 %	50 %	440223704
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15492	NC_020062	GCA	2	6	809530	809535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223704
15493	NC_020062	TGA	2	6	809542	809547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223704
15494	NC_020062	GC	3	6	809790	809795	0 %	0 %	50 %	50 %	440223705
15495	NC_020062	CGT	2	6	809834	809839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223705
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15500	NC_020062	TGG	2	6	810001	810006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223705

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