MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020062	GGCG	2	8	761058	761065	0 %	0 %	75 %	25 %	440223658
14502	NC_020062	TC	3	6	761228	761233	0 %	50 %	0 %	50 %	440223658
14503	NC_020062	GAG	2	6	761248	761253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223658
14504	NC_020062	CGC	2	6	761256	761261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223658
14505	NC_020062	GAGCT	2	10	761263	761272	20 %	20 %	40 %	20 %	440223658
14506	NC_020062	GC	3	6	761323	761328	0 %	0 %	50 %	50 %	440223658
14507	NC_020062	GCAGC	2	10	761374	761383	20 %	0 %	40 %	40 %	440223658
14508	NC_020062	AGC	2	6	761455	761460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223658
14509	NC_020062	CGG	2	6	761568	761573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223658
14510	NC_020062	TGG	2	6	761627	761632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223658
14511	NC_020062	GGT	2	6	761766	761771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223658
14512	NC_020062	CCTG	2	8	761812	761819	0 %	25 %	25 %	50 %	440223658
14513	NC_020062	TCC	2	6	761859	761864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223658
14514	NC_020062	GGC	2	6	761895	761900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223658
14515	NC_020062	CGG	2	6	762042	762047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
14516	NC_020062	GGC	3	9	762104	762112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
14517	NC_020062	CGG	2	6	762140	762145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
14518	NC_020062	CGG	2	6	762193	762198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223659
14519	NC_020062	GTT	2	6	762248	762253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223659
14520	NC_020062	TCG	2	6	762258	762263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223659
14521	NC_020062	GCCG	2	8	762275	762282	0 %	0 %	50 %	50 %	440223659
14522	NC_020062	GAT	2	6	762425	762430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223659
14523	NC_020062	CAGCGC	2	12	762500	762511	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223659
14524	NC_020062	ATG	2	6	762581	762586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223659
14525	NC_020062	CGT	2	6	762625	762630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223659
14526	NC_020062	CCA	2	6	762634	762639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223659
14527	NC_020062	GCA	2	6	762676	762681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223659
14528	NC_020062	TCG	3	9	762738	762746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223659
14529	NC_020062	CTCGC	2	10	762765	762774	0 %	20 %	20 %	60 %	440223659
14530	NC_020062	GCA	2	6	762829	762834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223659
14531	NC_020062	GATG	2	8	762999	763006	25 %	25 %	50 %	0 %	440223660
14532	NC_020062	CAGG	2	8	763069	763076	25 %	0 %	50 %	25 %	440223660
14533	NC_020062	CGC	3	9	763086	763094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
14534	NC_020062	GGCAGG	2	12	763241	763252	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	440223660
14535	NC_020062	CGA	2	6	763335	763340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
14536	NC_020062	CGGT	2	8	763351	763358	0 %	25 %	50 %	25 %	440223660
14537	NC_020062	GC	3	6	763374	763379	0 %	0 %	50 %	50 %	440223660
14538	NC_020062	GCC	2	6	763396	763401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
14539	NC_020062	GCA	2	6	763404	763409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
14540	NC_020062	TCG	3	9	763464	763472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223660
14541	NC_020062	CGC	2	6	763503	763508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
14542	NC_020062	TCG	2	6	763550	763555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223660
14543	NC_020062	CGCTGG	2	12	763604	763615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223660
14544	NC_020062	CCG	2	6	763616	763621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223660
14545	NC_020062	AGGC	2	8	763633	763640	25 %	0 %	50 %	25 %	440223660
14546	NC_020062	CAG	2	6	763645	763650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
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14548	NC_020062	TTTCAG	2	12	763717	763728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440223660
14549	NC_020062	CG	3	6	763806	763811	0 %	0 %	50 %	50 %	440223660
14550	NC_020062	GCCG	2	8	763833	763840	0 %	0 %	50 %	50 %	440223660
14551	NC_020062	GCA	2	6	763887	763892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
14552	NC_020062	GAC	2	6	763927	763932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223660
14553	NC_020062	GCCG	2	8	764071	764078	0 %	0 %	50 %	50 %	440223661
14554	NC_020062	GAT	2	6	764089	764094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223661
14555	NC_020062	GA	3	6	764279	764284	50 %	0 %	50 %	0 %	440223661
14556	NC_020062	CGA	3	9	764292	764300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223661
14557	NC_020062	GCCGG	2	10	764302	764311	0 %	0 %	60 %	40 %	440223661
14558	NC_020062	CGC	2	6	764368	764373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223661
14559	NC_020062	CTC	2	6	764374	764379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223661
14560	NC_020062	CGT	2	6	764392	764397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223661
14561	NC_020062	GAC	2	6	764422	764427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223661
14562	NC_020062	GAC	2	6	764440	764445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223661
14563	NC_020062	GATG	2	8	764448	764455	25 %	25 %	50 %	0 %	440223661
14564	NC_020062	CAG	2	6	764500	764505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223661
14565	NC_020062	AGGA	2	8	764519	764526	50 %	0 %	50 %	0 %	440223661
14566	NC_020062	GCGA	2	8	764542	764549	25 %	0 %	50 %	25 %	440223661
14567	NC_020062	ATG	2	6	764552	764557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223661
14568	NC_020062	CG	3	6	764585	764590	0 %	0 %	50 %	50 %	440223661
14569	NC_020062	GAA	2	6	764674	764679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223661
14570	NC_020062	CGG	2	6	764740	764745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223661
14571	NC_020062	CAGCGA	2	12	764773	764784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223661
14572	NC_020062	ATC	2	6	764786	764791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223661
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14574	NC_020062	GAT	2	6	764821	764826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223661
14575	NC_020062	GAA	2	6	764836	764841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223661
14576	NC_020062	TTCG	2	8	764901	764908	0 %	50 %	25 %	25 %	440223662
14577	NC_020062	CAT	2	6	764915	764920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223662
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14581	NC_020062	GTA	2	6	764993	764998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223662
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14585	NC_020062	GAT	2	6	765110	765115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223662
14586	NC_020062	ATC	2	6	765123	765128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223662
14587	NC_020062	ATC	2	6	765141	765146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223662
14588	NC_020062	CG	3	6	765214	765219	0 %	0 %	50 %	50 %	440223662
14589	NC_020062	ACC	2	6	765233	765238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223662
14590	NC_020062	GCG	2	6	765259	765264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223662
14591	NC_020062	GAGG	2	8	765290	765297	25 %	0 %	75 %	0 %	440223662
14592	NC_020062	CAG	2	6	765353	765358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223662
14593	NC_020062	CAT	2	6	765389	765394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223662
14594	NC_020062	CAT	2	6	765428	765433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223662
14595	NC_020062	GCC	2	6	765495	765500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223662
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14598	NC_020062	CGA	2	6	765613	765618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223662
14599	NC_020062	CGG	2	6	765691	765696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223662
14600	NC_020062	AGT	2	6	765730	765735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223662
14601	NC_020062	TCCT	2	8	765760	765767	0 %	50 %	0 %	50 %	440223662
14602	NC_020062	GCC	2	6	765883	765888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223663
14603	NC_020062	GAT	2	6	765940	765945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223663
14604	NC_020062	GA	3	6	765963	765968	50 %	0 %	50 %	0 %	440223663
14605	NC_020062	TCC	2	6	766037	766042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223663
14606	NC_020062	GGAT	2	8	766044	766051	25 %	25 %	50 %	0 %	440223663
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14609	NC_020062	GGC	2	6	766132	766137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
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14611	NC_020062	CCG	2	6	766155	766160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223663
14612	NC_020062	GTC	2	6	766181	766186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223663
14613	NC_020062	CTGC	2	8	766191	766198	0 %	25 %	25 %	50 %	440223663
14614	NC_020062	CGA	2	6	766239	766244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223663
14615	NC_020062	CGG	2	6	766270	766275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
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14617	NC_020062	GGC	2	6	766402	766407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223663
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14619	NC_020062	GTC	2	6	766484	766489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223663
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14857	NC_020062	CTG	2	6	778669	778674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223675
14858	NC_020062	CAT	2	6	778785	778790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223675
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14975	NC_020062	CGT	2	6	783815	783820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
14976	NC_020062	TCG	2	6	783840	783845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
14977	NC_020062	GC	3	6	783855	783860	0 %	0 %	50 %	50 %	440223679
14978	NC_020062	GAAGA	2	10	783975	783984	60 %	0 %	40 %	0 %	440223679
14979	NC_020062	CCG	2	6	783987	783992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223679
14980	NC_020062	AGGA	2	8	784044	784051	50 %	0 %	50 %	0 %	440223679
14981	NC_020062	AAT	2	6	784090	784095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223679
14982	NC_020062	CGG	2	6	784117	784122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223679
14983	NC_020062	GCT	2	6	784225	784230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
14984	NC_020062	CGC	2	6	784255	784260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223679
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14986	NC_020062	GTC	2	6	784392	784397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223679
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14990	NC_020062	GCT	2	6	784653	784658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
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14996	NC_020062	TCG	2	6	784808	784813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223680
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14999	NC_020062	GACC	2	8	784882	784889	25 %	0 %	25 %	50 %	440223680
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