MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020062	CAGG	2	8	735361	735368	25 %	0 %	50 %	25 %	440223630
14002	NC_020062	GGC	2	6	735405	735410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223630
14003	NC_020062	CTG	2	6	735505	735510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223631
14004	NC_020062	TGA	3	9	735538	735546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223631
14005	NC_020062	CGG	2	6	735560	735565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223631
14006	NC_020062	ACGA	2	8	735602	735609	50 %	0 %	25 %	25 %	440223631
14007	NC_020062	GC	3	6	735612	735617	0 %	0 %	50 %	50 %	440223631
14008	NC_020062	TGCG	2	8	735627	735634	0 %	25 %	50 %	25 %	440223631
14009	NC_020062	AGT	2	6	735819	735824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223632
14010	NC_020062	GC	3	6	735919	735924	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
14011	NC_020062	CAC	2	6	735936	735941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223632
14012	NC_020062	CGC	2	6	735943	735948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223632
14013	NC_020062	TTA	2	6	735975	735980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223632
14014	NC_020062	CG	3	6	736052	736057	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
14015	NC_020062	TCG	2	6	736070	736075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
14016	NC_020062	AAT	2	6	736168	736173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223632
14017	NC_020062	TGATC	2	10	736179	736188	20 %	40 %	20 %	20 %	440223632
14018	NC_020062	GCG	2	6	736279	736284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223632
14019	NC_020062	CGGC	2	8	736308	736315	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
14020	NC_020062	GGC	2	6	736367	736372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223632
14021	NC_020062	CAC	2	6	736440	736445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223632
14022	NC_020062	TGC	2	6	736496	736501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
14023	NC_020062	GGC	2	6	736518	736523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223632
14024	NC_020062	GCCG	2	8	736534	736541	0 %	0 %	50 %	50 %	440223632
14025	NC_020062	TGC	2	6	736625	736630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
14026	NC_020062	TCG	2	6	736649	736654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223632
14027	NC_020062	AGC	2	6	736786	736791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14028	NC_020062	CGG	2	6	736839	736844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
14029	NC_020062	CGGCT	2	10	736868	736877	0 %	20 %	40 %	40 %	440223633
14030	NC_020062	CGC	2	6	736884	736889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
14031	NC_020062	CGG	2	6	736890	736895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
14032	NC_020062	TGC	3	9	736929	736937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14033	NC_020062	CGC	2	6	736987	736992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
14034	NC_020062	ATCCAG	2	12	737009	737020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223633
14035	NC_020062	CCG	2	6	737046	737051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
14036	NC_020062	TCG	2	6	737100	737105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14037	NC_020062	ATC	2	6	737115	737120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223633
14038	NC_020062	GCA	2	6	737133	737138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14039	NC_020062	CGG	2	6	737152	737157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
14040	NC_020062	CGT	2	6	737167	737172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14041	NC_020062	GGC	2	6	737227	737232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
14042	NC_020062	CCG	2	6	737241	737246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223633
14043	NC_020062	GC	3	6	737258	737263	0 %	0 %	50 %	50 %	440223633
14044	NC_020062	TCG	2	6	737289	737294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14045	NC_020062	GCG	2	6	737307	737312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
14046	NC_020062	CATCG	2	10	737376	737385	20 %	20 %	20 %	40 %	440223633
14047	NC_020062	ATGAA	2	10	737415	737424	60 %	20 %	20 %	0 %	440223633
14048	NC_020062	GCT	2	6	737434	737439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223633
14049	NC_020062	CGG	2	6	737488	737493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223633
14050	NC_020062	CG	3	6	737577	737582	0 %	0 %	50 %	50 %	440223633
14051	NC_020062	AGG	2	6	737592	737597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223633
14052	NC_020062	TGA	2	6	737601	737606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223633
14053	NC_020062	TGGC	2	8	737839	737846	0 %	25 %	50 %	25 %	440223634
14054	NC_020062	AGC	2	6	737851	737856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223634
14055	NC_020062	CCG	2	6	737962	737967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
14056	NC_020062	GACC	2	8	737970	737977	25 %	0 %	25 %	50 %	440223634
14057	NC_020062	ATC	2	6	737980	737985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223634
14058	NC_020062	TGG	2	6	738025	738030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223634
14059	NC_020062	GCC	2	6	738064	738069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
14060	NC_020062	AGG	2	6	738082	738087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223634
14061	NC_020062	TC	3	6	738142	738147	0 %	50 %	0 %	50 %	440223634
14062	NC_020062	AGA	2	6	738220	738225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223634
14063	NC_020062	GCC	2	6	738235	738240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
14064	NC_020062	TTCC	2	8	738294	738301	0 %	50 %	0 %	50 %	440223634
14065	NC_020062	GCG	2	6	738400	738405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223634
14066	NC_020062	CGGC	2	8	738451	738458	0 %	0 %	50 %	50 %	440223634
14067	NC_020062	TCC	2	6	738514	738519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223634
14068	NC_020062	CGG	2	6	738545	738550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223634
14069	NC_020062	GCC	3	9	738568	738576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
14070	NC_020062	GCC	2	6	738601	738606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223634
14071	NC_020062	CCG	2	6	738791	738796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223635
14072	NC_020062	GAG	2	6	738802	738807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223635
14073	NC_020062	C	6	6	738820	738825	0 %	0 %	0 %	100 %	440223635
14074	NC_020062	GTC	2	6	738829	738834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14075	NC_020062	GAACG	2	10	738840	738849	40 %	0 %	40 %	20 %	440223635
14076	NC_020062	GCC	2	6	738852	738857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223635
14077	NC_020062	TGC	2	6	738872	738877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14078	NC_020062	GGCAA	2	10	738882	738891	40 %	0 %	40 %	20 %	440223635
14079	NC_020062	TCG	2	6	738917	738922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14080	NC_020062	GGC	2	6	738934	738939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223635
14081	NC_020062	TTC	2	6	738964	738969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223635
14082	NC_020062	GC	3	6	738989	738994	0 %	0 %	50 %	50 %	440223635
14083	NC_020062	TGC	2	6	739020	739025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14084	NC_020062	TGTCGG	2	12	739080	739091	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440223635
14085	NC_020062	CGA	2	6	739133	739138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14086	NC_020062	GCT	2	6	739233	739238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14087	NC_020062	GAC	2	6	739246	739251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14088	NC_020062	TGC	2	6	739261	739266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14089	NC_020062	TCCA	2	8	739309	739316	25 %	25 %	0 %	50 %	440223635
14090	NC_020062	ACG	2	6	739337	739342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223635
14091	NC_020062	CG	3	6	739373	739378	0 %	0 %	50 %	50 %	440223635
14092	NC_020062	CCA	2	6	739383	739388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223635
14093	NC_020062	TTC	2	6	739435	739440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223635
14094	NC_020062	GATC	2	8	739446	739453	25 %	25 %	25 %	25 %	440223635
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14097	NC_020062	GCCA	2	8	739754	739761	25 %	0 %	25 %	50 %	440223636
14098	NC_020062	GCG	2	6	739811	739816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223636
14099	NC_020062	GCC	2	6	739854	739859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223636
14100	NC_020062	CGC	2	6	739907	739912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223636
14101	NC_020062	GAT	3	9	739922	739930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223636
14102	NC_020062	GAC	2	6	739931	739936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223636
14103	NC_020062	CGT	2	6	739973	739978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223636
14104	NC_020062	CTGTGC	2	12	739983	739994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223636
14105	NC_020062	GCT	2	6	739995	740000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223636
14106	NC_020062	GCC	2	6	740016	740021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223636
14107	NC_020062	TCT	2	6	740057	740062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223636
14108	NC_020062	CGC	2	6	740255	740260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223637
14109	NC_020062	GCC	2	6	740372	740377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223637
14110	NC_020062	GC	3	6	740405	740410	0 %	0 %	50 %	50 %	440223637
14111	NC_020062	CCGAT	2	10	740421	740430	20 %	20 %	20 %	40 %	440223637
14112	NC_020062	GCA	2	6	740508	740513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223637
14113	NC_020062	GA	3	6	740583	740588	50 %	0 %	50 %	0 %	440223637
14114	NC_020062	CGG	2	6	740590	740595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223637
14115	NC_020062	TCC	2	6	740604	740609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223637
14116	NC_020062	GATG	2	8	740617	740624	25 %	25 %	50 %	0 %	440223637
14117	NC_020062	CTC	2	6	740636	740641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223637
14118	NC_020062	GCG	2	6	740688	740693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223637
14119	NC_020062	GATC	2	8	740830	740837	25 %	25 %	25 %	25 %	440223637
14120	NC_020062	CG	3	6	740889	740894	0 %	0 %	50 %	50 %	440223638
14121	NC_020062	CGGC	2	8	740924	740931	0 %	0 %	50 %	50 %	440223638
14122	NC_020062	CTG	2	6	740988	740993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223638
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14126	NC_020062	CGGCC	2	10	741127	741136	0 %	0 %	40 %	60 %	440223638
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14132	NC_020062	CTG	2	6	741399	741404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223638
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14239	NC_020062	ATG	2	6	748250	748255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223646
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14241	NC_020062	TCG	2	6	748278	748283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223646
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14358	NC_020062	GGC	2	6	753655	753660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223651
14359	NC_020062	CAAAG	2	10	753667	753676	60 %	0 %	20 %	20 %	440223651
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14361	NC_020062	TGA	2	6	753952	753957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223652
14362	NC_020062	TTCG	2	8	753960	753967	0 %	50 %	25 %	25 %	440223652
14363	NC_020062	CCG	2	6	754008	754013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223652
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14385	NC_020062	CGAT	2	8	754772	754779	25 %	25 %	25 %	25 %	440223653
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14389	NC_020062	ATG	2	6	755029	755034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223653
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14392	NC_020062	GGC	2	6	755259	755264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223653
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14460	NC_020062	CGGC	2	8	758541	758548	0 %	0 %	50 %	50 %	440223655
14461	NC_020062	GCGAC	2	10	758661	758670	20 %	0 %	40 %	40 %	440223655
14462	NC_020062	CGA	3	9	758771	758779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223656
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14465	NC_020062	GA	3	6	758946	758951	50 %	0 %	50 %	0 %	440223656
14466	NC_020062	CTC	2	6	758955	758960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223656
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14474	NC_020062	TTC	3	9	759354	759362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223657
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14476	NC_020062	GCG	2	6	759490	759495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223657
14477	NC_020062	CCTGA	2	10	759536	759545	20 %	20 %	20 %	40 %	440223657
14478	NC_020062	CGT	2	6	759571	759576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223657
14479	NC_020062	CGA	2	6	759580	759585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223657
14480	NC_020062	GGC	2	6	759626	759631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223657
14481	NC_020062	GCA	2	6	759681	759686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223657
14482	NC_020062	GCCGC	2	10	759688	759697	0 %	0 %	40 %	60 %	440223657
14483	NC_020062	GCC	2	6	759717	759722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223657
14484	NC_020062	GCC	2	6	759740	759745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223657
14485	NC_020062	TCT	2	6	759760	759765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223657
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