MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020062	GCG	2	6	710913	710918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223612
13502	NC_020062	GCC	2	6	710935	710940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223612
13503	NC_020062	CG	3	6	710984	710989	0 %	0 %	50 %	50 %	440223612
13504	NC_020062	CTGC	2	8	710991	710998	0 %	25 %	25 %	50 %	440223612
13505	NC_020062	CGC	3	9	711543	711551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223613
13506	NC_020062	TCAA	2	8	711554	711561	50 %	25 %	0 %	25 %	440223613
13507	NC_020062	TCG	2	6	711563	711568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223613
13508	NC_020062	GCC	2	6	711669	711674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223613
13509	NC_020062	GTC	2	6	711682	711687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223613
13510	NC_020062	CGG	2	6	711699	711704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223613
13511	NC_020062	GCG	2	6	711717	711722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223613
13512	NC_020062	TCGA	2	8	711724	711731	25 %	25 %	25 %	25 %	440223613
13513	NC_020062	GGA	2	6	711738	711743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223613
13514	NC_020062	GTC	2	6	711802	711807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223613
13515	NC_020062	CAT	2	6	711909	711914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223613
13516	NC_020062	GAC	2	6	712023	712028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223613
13517	NC_020062	CAA	2	6	712089	712094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223613
13518	NC_020062	GC	4	8	712105	712112	0 %	0 %	50 %	50 %	440223613
13519	NC_020062	CAG	2	6	712147	712152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223613
13520	NC_020062	GC	3	6	712156	712161	0 %	0 %	50 %	50 %	440223613
13521	NC_020062	ACG	2	6	712184	712189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223613
13522	NC_020062	GAA	2	6	712231	712236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223613
13523	NC_020062	TGAAAG	2	12	712380	712391	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440223614
13524	NC_020062	GCAG	2	8	712468	712475	25 %	0 %	50 %	25 %	440223614
13525	NC_020062	CTG	2	6	712553	712558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13526	NC_020062	AGC	2	6	712650	712655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13527	NC_020062	GCCAAA	2	12	712673	712684	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440223614
13528	NC_020062	CCT	2	6	712725	712730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223614
13529	NC_020062	TGC	2	6	712879	712884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13530	NC_020062	CGT	2	6	712885	712890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13531	NC_020062	CCG	2	6	712908	712913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223614
13532	NC_020062	TGC	2	6	713049	713054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13533	NC_020062	GCT	2	6	713107	713112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13534	NC_020062	GCC	2	6	713288	713293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223614
13535	NC_020062	GC	3	6	713352	713357	0 %	0 %	50 %	50 %	440223614
13536	NC_020062	AC	3	6	713367	713372	50 %	0 %	0 %	50 %	440223614
13537	NC_020062	GAA	2	6	713389	713394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223614
13538	NC_020062	CGC	2	6	713443	713448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223614
13539	NC_020062	GCC	2	6	713458	713463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223614
13540	NC_020062	CGG	2	6	713602	713607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223614
13541	NC_020062	CGA	2	6	713683	713688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223614
13542	NC_020062	TGA	2	6	714057	714062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223615
13543	NC_020062	TCTTCG	2	12	714093	714104	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440223615
13544	NC_020062	GCGAT	2	10	714126	714135	20 %	20 %	40 %	20 %	440223615
13545	NC_020062	CTG	2	6	714164	714169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223615
13546	NC_020062	AGC	2	6	714177	714182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223615
13547	NC_020062	GCC	2	6	714194	714199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223615
13548	NC_020062	GCT	2	6	714244	714249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223615
13549	NC_020062	ATC	2	6	714308	714313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223615
13550	NC_020062	CGG	2	6	714384	714389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223615
13551	NC_020062	GCC	2	6	714398	714403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223615
13552	NC_020062	TCG	2	6	714441	714446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223615
13553	NC_020062	CGGC	2	8	714507	714514	0 %	0 %	50 %	50 %	440223615
13554	NC_020062	TGC	2	6	714522	714527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223615
13555	NC_020062	CTTCGC	2	12	714610	714621	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440223615
13556	NC_020062	GGC	2	6	714726	714731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223615
13557	NC_020062	GTG	2	6	714758	714763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223615
13558	NC_020062	GCG	2	6	714771	714776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223615
13559	NC_020062	CGG	2	6	714796	714801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223615
13560	NC_020062	CG	3	6	714969	714974	0 %	0 %	50 %	50 %	440223615
13561	NC_020062	CGG	2	6	715038	715043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223616
13562	NC_020062	GCTTG	2	10	715086	715095	0 %	40 %	40 %	20 %	440223616
13563	NC_020062	CGC	2	6	715097	715102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223616
13564	NC_020062	CG	3	6	715113	715118	0 %	0 %	50 %	50 %	440223616
13565	NC_020062	CTG	2	6	715174	715179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223616
13566	NC_020062	AGCC	2	8	715191	715198	25 %	0 %	25 %	50 %	440223616
13567	NC_020062	TGA	2	6	715202	715207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223616
13568	NC_020062	CTT	2	6	715236	715241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223616
13569	NC_020062	GCTTG	2	10	715275	715284	0 %	40 %	40 %	20 %	440223616
13570	NC_020062	CCG	2	6	715286	715291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223616
13571	NC_020062	TCA	2	6	715319	715324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223616
13572	NC_020062	TGC	2	6	715340	715345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223616
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13574	NC_020062	ATC	2	6	715378	715383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223616
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13577	NC_020062	GGCCC	2	10	715465	715474	0 %	0 %	40 %	60 %	440223616
13578	NC_020062	GC	3	6	715486	715491	0 %	0 %	50 %	50 %	440223616
13579	NC_020062	TCG	2	6	715496	715501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223616
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13584	NC_020062	TCG	2	6	715945	715950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223617
13585	NC_020062	TCAA	2	8	715986	715993	50 %	25 %	0 %	25 %	440223617
13586	NC_020062	TCG	2	6	715999	716004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223617
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13589	NC_020062	ACA	2	6	716056	716061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223617
13590	NC_020062	GCGA	2	8	716082	716089	25 %	0 %	50 %	25 %	440223617
13591	NC_020062	GTG	2	6	716110	716115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223617
13592	NC_020062	CGG	2	6	716219	716224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223617
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13599	NC_020062	CGA	2	6	716389	716394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223617
13600	NC_020062	GCT	2	6	716432	716437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223617
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13602	NC_020062	TCA	2	6	716476	716481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223617
13603	NC_020062	GGTGAT	2	12	716519	716530	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	440223617
13604	NC_020062	ATC	2	6	716578	716583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223617
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13607	NC_020062	TCGA	2	8	716744	716751	25 %	25 %	25 %	25 %	440223617
13608	NC_020062	TCG	2	6	716815	716820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223617
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13612	NC_020062	GC	3	6	717024	717029	0 %	0 %	50 %	50 %	440223617
13613	NC_020062	TGC	2	6	717061	717066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223617
13614	NC_020062	CGG	2	6	717122	717127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223617
13615	NC_020062	CG	4	8	717149	717156	0 %	0 %	50 %	50 %	440223617
13616	NC_020062	TCCG	2	8	717170	717177	0 %	25 %	25 %	50 %	440223617
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13618	NC_020062	CATCG	2	10	717321	717330	20 %	20 %	20 %	40 %	440223617
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13733	NC_020062	GC	3	6	722497	722502	0 %	0 %	50 %	50 %	440223621
13734	NC_020062	TCGATG	2	12	722523	722534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440223621
13735	NC_020062	CG	3	6	722545	722550	0 %	0 %	50 %	50 %	440223621
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13737	NC_020062	TCA	2	6	722653	722658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223621
13738	NC_020062	AGATCG	2	12	722683	722694	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440223621
13739	NC_020062	GGC	2	6	722739	722744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223621
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13752	NC_020062	GAT	2	6	723520	723525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223622
13753	NC_020062	CCGTC	2	10	723575	723584	0 %	20 %	20 %	60 %	440223622
13754	NC_020062	CGA	2	6	723638	723643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223622
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13776	NC_020062	CATA	2	8	725013	725020	50 %	25 %	0 %	25 %	440223623
13777	NC_020062	CCGA	2	8	725027	725034	25 %	0 %	25 %	50 %	440223623
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13852	NC_020062	GAT	2	6	728167	728172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223626
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13973	NC_020062	GCC	2	6	733697	733702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
13974	NC_020062	CAT	2	6	733804	733809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223628
13975	NC_020062	CGG	2	6	733832	733837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
13976	NC_020062	GCG	2	6	733877	733882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
13977	NC_020062	GCC	2	6	733888	733893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
13978	NC_020062	GAC	2	6	733924	733929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
13979	NC_020062	GCC	3	9	733966	733974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
13980	NC_020062	CGC	2	6	733992	733997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
13981	NC_020062	CG	3	6	734025	734030	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
13982	NC_020062	GCA	2	6	734049	734054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
13983	NC_020062	GC	3	6	734147	734152	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
13984	NC_020062	CAG	2	6	734184	734189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223628
13985	NC_020062	CG	4	8	734193	734200	0 %	0 %	50 %	50 %	440223628
13986	NC_020062	CGC	2	6	734215	734220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223628
13987	NC_020062	GGCA	2	8	734234	734241	25 %	0 %	50 %	25 %	440223628
13988	NC_020062	GGC	2	6	734263	734268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223628
13989	NC_020062	TTC	2	6	734347	734352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223628
13990	NC_020062	TCG	2	6	734617	734622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223629
13991	NC_020062	GAG	2	6	734808	734813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223629
13992	NC_020062	CAA	2	6	734828	734833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223629
13993	NC_020062	CGC	2	6	734922	734927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223629
13994	NC_020062	GCCT	2	8	734959	734966	0 %	25 %	25 %	50 %	440223629
13995	NC_020062	GCGACC	2	12	735186	735197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223630
13996	NC_020062	TTG	2	6	735198	735203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223630
13997	NC_020062	GGCGA	2	10	735268	735277	20 %	0 %	60 %	20 %	440223630
13998	NC_020062	GA	3	6	735276	735281	50 %	0 %	50 %	0 %	440223630
13999	NC_020062	GCA	2	6	735315	735320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223630
14000	NC_020062	CGC	2	6	735331	735336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223630

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