MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020062	CGA	2	6	684871	684876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13002	NC_020062	TCG	2	6	684993	684998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13003	NC_020062	GCT	2	6	685004	685009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13004	NC_020062	ATC	2	6	685085	685090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223587
13005	NC_020062	CGA	2	6	685109	685114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13006	NC_020062	TTG	2	6	685164	685169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223587
13007	NC_020062	GAC	2	6	685254	685259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13008	NC_020062	GTC	2	6	685286	685291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13009	NC_020062	TGA	2	6	685306	685311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223587
13010	NC_020062	TGA	3	9	685333	685341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223587
13011	NC_020062	CGC	3	9	685354	685362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223587
13012	NC_020062	GCC	2	6	685379	685384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223587
13013	NC_020062	GCTGCC	2	12	685403	685414	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440223587
13014	NC_020062	TGA	2	6	685420	685425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223587
13015	NC_020062	TGT	2	6	685426	685431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223587
13016	NC_020062	CGT	2	6	685435	685440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13017	NC_020062	ATCC	2	8	685505	685512	25 %	25 %	0 %	50 %	440223587
13018	NC_020062	TTG	2	6	685560	685565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223587
13019	NC_020062	ATA	2	6	685577	685582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223587
13020	NC_020062	GTC	2	6	685586	685591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223587
13021	NC_020062	GCC	2	6	685598	685603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223587
13022	NC_020062	ACC	2	6	686573	686578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223588
13023	NC_020062	GGC	2	6	686580	686585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223588
13024	NC_020062	TAAA	2	8	686656	686663	75 %	25 %	0 %	0 %	440223588
13025	NC_020062	GCG	2	6	686681	686686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223588
13026	NC_020062	TCG	2	6	686794	686799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223588
13027	NC_020062	GCA	2	6	686860	686865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223589
13028	NC_020062	GCAA	2	8	686904	686911	50 %	0 %	25 %	25 %	440223589
13029	NC_020062	GC	3	6	686918	686923	0 %	0 %	50 %	50 %	440223589
13030	NC_020062	TCT	2	6	686959	686964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223589
13031	NC_020062	GA	3	6	686973	686978	50 %	0 %	50 %	0 %	440223589
13032	NC_020062	CCG	2	6	687010	687015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
13033	NC_020062	TCTT	2	8	687036	687043	0 %	75 %	0 %	25 %	440223589
13034	NC_020062	AGA	2	6	687061	687066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223589
13035	NC_020062	CGC	2	6	687205	687210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
13036	NC_020062	GTTC	2	8	687223	687230	0 %	50 %	25 %	25 %	440223589
13037	NC_020062	GCC	2	6	687350	687355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
13038	NC_020062	CGA	2	6	687416	687421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223589
13039	NC_020062	CGG	2	6	687524	687529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223589
13040	NC_020062	GCA	2	6	687618	687623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223589
13041	NC_020062	CTG	2	6	687645	687650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223589
13042	NC_020062	CCGA	2	8	687702	687709	25 %	0 %	25 %	50 %	440223589
13043	NC_020062	GCC	2	6	687767	687772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223589
13044	NC_020062	TCGC	2	8	688105	688112	0 %	25 %	25 %	50 %	440223590
13045	NC_020062	CGG	2	6	688238	688243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223590
13046	NC_020062	CCTA	2	8	688275	688282	25 %	25 %	0 %	50 %	440223590
13047	NC_020062	CTC	2	6	688334	688339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223590
13048	NC_020062	TGCC	2	8	688361	688368	0 %	25 %	25 %	50 %	440223590
13049	NC_020062	CAG	2	6	688392	688397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223590
13050	NC_020062	TTC	2	6	688423	688428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223590
13051	NC_020062	CGG	2	6	688429	688434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223590
13052	NC_020062	GC	3	6	688515	688520	0 %	0 %	50 %	50 %	440223590
13053	NC_020062	GCGA	2	8	688533	688540	25 %	0 %	50 %	25 %	440223590
13054	NC_020062	TCG	2	6	688546	688551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
13055	NC_020062	GAT	2	6	688565	688570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223590
13056	NC_020062	CGT	2	6	688580	688585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
13057	NC_020062	GC	3	6	688707	688712	0 %	0 %	50 %	50 %	440223590
13058	NC_020062	GAT	2	6	688728	688733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223590
13059	NC_020062	CGT	2	6	688817	688822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
13060	NC_020062	CGCAA	2	10	688902	688911	40 %	0 %	20 %	40 %	440223590
13061	NC_020062	TGC	2	6	688964	688969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
13062	NC_020062	GTC	3	9	689052	689060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223590
13063	NC_020062	ATG	2	6	689665	689670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223591
13064	NC_020062	TC	3	6	689679	689684	0 %	50 %	0 %	50 %	440223591
13065	NC_020062	CGA	2	6	689711	689716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223591
13066	NC_020062	GC	3	6	689843	689848	0 %	0 %	50 %	50 %	440223591
13067	NC_020062	ATC	3	9	689856	689864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223591
13068	NC_020062	CGG	2	6	689873	689878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223591
13069	NC_020062	CTT	2	6	689930	689935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223591
13070	NC_020062	CCG	2	6	689956	689961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223591
13071	NC_020062	GTC	2	6	690033	690038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223591
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13074	NC_020062	TCG	2	6	690481	690486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223592
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13076	NC_020062	TCG	2	6	690571	690576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223592
13077	NC_020062	TGGC	2	8	690610	690617	0 %	25 %	50 %	25 %	440223592
13078	NC_020062	GC	3	6	690643	690648	0 %	0 %	50 %	50 %	440223592
13079	NC_020062	GACG	2	8	690722	690729	25 %	0 %	50 %	25 %	440223592
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13084	NC_020062	GGCC	2	8	691236	691243	0 %	0 %	50 %	50 %	440223593
13085	NC_020062	ATC	2	6	691276	691281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223593
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13089	NC_020062	GC	3	6	691560	691565	0 %	0 %	50 %	50 %	440223593
13090	NC_020062	GCA	2	6	691620	691625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223593
13091	NC_020062	TCA	3	9	691637	691645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223593
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13094	NC_020062	GC	3	6	691837	691842	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
13095	NC_020062	CG	3	6	691844	691849	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
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13100	NC_020062	GC	3	6	692043	692048	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
13101	NC_020062	CGG	2	6	692147	692152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223594
13102	NC_020062	GGCGA	2	10	692185	692194	20 %	0 %	60 %	20 %	440223594
13103	NC_020062	GC	3	6	692275	692280	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
13104	NC_020062	TCC	2	6	692281	692286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223594
13105	NC_020062	CGAG	2	8	692321	692328	25 %	0 %	50 %	25 %	440223594
13106	NC_020062	TTCGGC	2	12	692448	692459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223594
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13108	NC_020062	CGC	2	6	692524	692529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223594
13109	NC_020062	GCC	2	6	692634	692639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223594
13110	NC_020062	GC	3	6	692650	692655	0 %	0 %	50 %	50 %	440223594
13111	NC_020062	GGC	2	6	692693	692698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223594
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13113	NC_020062	GACG	2	8	692901	692908	25 %	0 %	50 %	25 %	440223595
13114	NC_020062	GC	3	6	692917	692922	0 %	0 %	50 %	50 %	440223595
13115	NC_020062	GGCG	2	8	692946	692953	0 %	0 %	75 %	25 %	440223595
13116	NC_020062	CGA	2	6	693050	693055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223595
13117	NC_020062	GCTCGC	2	12	693098	693109	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440223595
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13119	NC_020062	TGA	2	6	693290	693295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223595
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13239	NC_020062	CGG	2	6	699251	699256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223601
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13344	NC_020062	GCCC	2	8	704302	704309	0 %	0 %	25 %	75 %	440223606
13345	NC_020062	GTC	2	6	704313	704318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223606
13346	NC_020062	AAG	2	6	704370	704375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223606
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13352	NC_020062	GAA	2	6	704615	704620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223607
13353	NC_020062	TGG	2	6	704623	704628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223607
13354	NC_020062	TCG	2	6	704634	704639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223607
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13475	NC_020062	CTG	2	6	709924	709929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223611
13476	NC_020062	CATG	2	8	709978	709985	25 %	25 %	25 %	25 %	440223611
13477	NC_020062	ACG	2	6	710030	710035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223611
13478	NC_020062	GC	3	6	710092	710097	0 %	0 %	50 %	50 %	440223611
13479	NC_020062	CGC	2	6	710116	710121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223611
13480	NC_020062	ATC	2	6	710160	710165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223611
13481	NC_020062	AGC	2	6	710181	710186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223611
13482	NC_020062	GCG	2	6	710208	710213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223611
13483	NC_020062	GC	3	6	710255	710260	0 %	0 %	50 %	50 %	440223612
13484	NC_020062	GC	3	6	710302	710307	0 %	0 %	50 %	50 %	440223612
13485	NC_020062	CGA	2	6	710357	710362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223612
13486	NC_020062	AGA	2	6	710421	710426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223612
13487	NC_020062	CGA	2	6	710442	710447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223612
13488	NC_020062	CGTCGG	2	12	710463	710474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223612
13489	NC_020062	GC	3	6	710498	710503	0 %	0 %	50 %	50 %	440223612
13490	NC_020062	TCA	2	6	710549	710554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223612
13491	NC_020062	GCCT	2	8	710569	710576	0 %	25 %	25 %	50 %	440223612
13492	NC_020062	TCG	2	6	710642	710647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223612
13493	NC_020062	CGG	2	6	710667	710672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223612
13494	NC_020062	TGCGC	2	10	710736	710745	0 %	20 %	40 %	40 %	440223612
13495	NC_020062	ATG	2	6	710750	710755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223612
13496	NC_020062	AGA	2	6	710765	710770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223612
13497	NC_020062	GCT	2	6	710775	710780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223612
13498	NC_020062	TGGA	2	8	710830	710837	25 %	25 %	50 %	0 %	440223612
13499	NC_020062	TCC	2	6	710879	710884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223612
13500	NC_020062	GCC	2	6	710905	710910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223612

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