MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020062	CGG	2	6	637167	637172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223545
12003	NC_020062	GCC	2	6	637181	637186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223545
12004	NC_020062	GTT	2	6	637192	637197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223545
12005	NC_020062	CCG	2	6	637208	637213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223545
12006	NC_020062	TGCG	2	8	637312	637319	0 %	25 %	50 %	25 %	440223545
12007	NC_020062	GGGAA	2	10	637375	637384	40 %	0 %	60 %	0 %	440223545
12008	NC_020062	GATC	2	8	637389	637396	25 %	25 %	25 %	25 %	440223545
12009	NC_020062	GCA	2	6	637434	637439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223545
12010	NC_020062	GCC	2	6	637447	637452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223545
12011	NC_020062	GCT	2	6	637567	637572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223546
12012	NC_020062	CCTG	2	8	637656	637663	0 %	25 %	25 %	50 %	440223546
12013	NC_020062	GAT	2	6	637699	637704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223546
12014	NC_020062	TGA	2	6	637716	637721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223546
12015	NC_020062	TGG	2	6	637757	637762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223546
12016	NC_020062	CCT	2	6	637773	637778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223546
12017	NC_020062	GTG	2	6	637820	637825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223546
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12030	NC_020062	TCG	2	6	638383	638388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223547
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12064	NC_020062	GCC	3	9	640090	640098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223548
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12105	NC_020062	GGA	2	6	642059	642064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223550
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12109	NC_020062	ACC	2	6	642171	642176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223550
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12120	NC_020062	GCC	2	6	642471	642476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223550
12121	NC_020062	TCGT	2	8	642502	642509	0 %	50 %	25 %	25 %	440223550
12122	NC_020062	TCC	2	6	642577	642582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223550
12123	NC_020062	TCG	2	6	642589	642594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223550
12124	NC_020062	GCC	2	6	642605	642610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223550
12125	NC_020062	TCGC	2	8	642614	642621	0 %	25 %	25 %	50 %	440223550
12126	NC_020062	GCCC	2	8	642645	642652	0 %	0 %	25 %	75 %	440223550
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12232	NC_020062	CGA	2	6	647350	647355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223556
12233	NC_020062	CGA	2	6	647458	647463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223556
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12235	NC_020062	ACC	2	6	647622	647627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223556
12236	NC_020062	GCAA	2	8	647646	647653	50 %	0 %	25 %	25 %	440223556
12237	NC_020062	TGC	2	6	647666	647671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223556
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12239	NC_020062	AAG	2	6	647732	647737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223557
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12342	NC_020062	TC	3	6	652663	652668	0 %	50 %	0 %	50 %	440223562
12343	NC_020062	ACT	2	6	652713	652718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223562
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12345	NC_020062	CAGC	2	8	652952	652959	25 %	0 %	25 %	50 %	440223563
12346	NC_020062	TGC	2	6	652988	652993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223563
12347	NC_020062	ACG	2	6	653011	653016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223563
12348	NC_020062	GAG	2	6	653022	653027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223563
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12350	NC_020062	GAA	2	6	653039	653044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223563
12351	NC_020062	GAG	2	6	653064	653069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223563
12352	NC_020062	A	7	7	653081	653087	100 %	0 %	0 %	0 %	440223563
12353	NC_020062	GGC	2	6	654066	654071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223564
12354	NC_020062	CG	3	6	654114	654119	0 %	0 %	50 %	50 %	440223564
12355	NC_020062	GGC	2	6	654124	654129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223564
12356	NC_020062	TCG	2	6	654163	654168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223564
12357	NC_020062	GCC	2	6	654220	654225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223564
12358	NC_020062	TGC	2	6	654247	654252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223564
12359	NC_020062	CG	4	8	654270	654277	0 %	0 %	50 %	50 %	440223564
12360	NC_020062	CGA	2	6	654287	654292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223564
12361	NC_020062	CTG	2	6	654384	654389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223564
12362	NC_020062	CAG	2	6	654399	654404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223564
12363	NC_020062	GC	3	6	654485	654490	0 %	0 %	50 %	50 %	440223564
12364	NC_020062	GCGCTG	2	12	654504	654515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440223564
12365	NC_020062	GCC	2	6	654516	654521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223564
12366	NC_020062	TCA	2	6	654545	654550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223564
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12369	NC_020062	CAG	2	6	654647	654652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223564
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12463	NC_020062	GAG	2	6	658580	658585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223567
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12468	NC_020062	GAT	2	6	658742	658747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223567
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12473	NC_020062	TGA	2	6	658993	658998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223567
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12480	NC_020062	TCG	2	6	659184	659189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223567
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