MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020062	CTTG	2	8	611643	611650	0 %	50 %	25 %	25 %	440223521
11502	NC_020062	GCCG	2	8	611670	611677	0 %	0 %	50 %	50 %	440223521
11503	NC_020062	AT	3	6	611762	611767	50 %	50 %	0 %	0 %	440223521
11504	NC_020062	CGT	2	6	611799	611804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223521
11505	NC_020062	CGG	2	6	611850	611855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223521
11506	NC_020062	CGAT	2	8	611869	611876	25 %	25 %	25 %	25 %	440223521
11507	NC_020062	GCG	2	6	611911	611916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223521
11508	NC_020062	CG	3	6	611915	611920	0 %	0 %	50 %	50 %	440223521
11509	NC_020062	ATATG	2	10	612065	612074	40 %	40 %	20 %	0 %	440223522
11510	NC_020062	TCG	2	6	612109	612114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223522
11511	NC_020062	GCC	2	6	612162	612167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223522
11512	NC_020062	GGC	2	6	612213	612218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223522
11513	NC_020062	CGA	2	6	612260	612265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223522
11514	NC_020062	CAA	2	6	612266	612271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223522
11515	NC_020062	CGA	2	6	612281	612286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223522
11516	NC_020062	GCG	3	9	612288	612296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223522
11517	NC_020062	TCG	3	9	612319	612327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223522
11518	NC_020062	TGG	2	6	612373	612378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223522
11519	NC_020062	CGC	2	6	612389	612394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223522
11520	NC_020062	CG	3	6	612407	612412	0 %	0 %	50 %	50 %	440223522
11521	NC_020062	TCT	2	6	612512	612517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223522
11522	NC_020062	CGAT	2	8	612538	612545	25 %	25 %	25 %	25 %	440223522
11523	NC_020062	TGG	2	6	612558	612563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223522
11524	NC_020062	CAG	2	6	612579	612584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223522
11525	NC_020062	CG	3	6	612587	612592	0 %	0 %	50 %	50 %	440223522
11526	NC_020062	GCCGGC	2	12	612594	612605	0 %	0 %	50 %	50 %	440223522
11527	NC_020062	CTGG	2	8	612635	612642	0 %	25 %	50 %	25 %	440223522
11528	NC_020062	CTG	2	6	612657	612662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223522
11529	NC_020062	ATG	2	6	612675	612680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223522
11530	NC_020062	CGAGAT	2	12	612716	612727	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440223522
11531	NC_020062	AGG	2	6	612748	612753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223522
11532	NC_020062	TC	3	6	612763	612768	0 %	50 %	0 %	50 %	440223522
11533	NC_020062	AAT	2	6	612771	612776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223522
11534	NC_020062	TGG	2	6	612777	612782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223522
11535	NC_020062	GAG	2	6	612795	612800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223522
11536	NC_020062	TC	3	6	612803	612808	0 %	50 %	0 %	50 %	440223522
11537	NC_020062	TTG	2	6	612836	612841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223522
11538	NC_020062	GCC	2	6	612943	612948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223523
11539	NC_020062	AGGTC	2	10	612978	612987	20 %	20 %	40 %	20 %	440223523
11540	NC_020062	CTT	2	6	613039	613044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223523
11541	NC_020062	CAGCG	2	10	613045	613054	20 %	0 %	40 %	40 %	440223523
11542	NC_020062	GCA	2	6	613118	613123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223523
11543	NC_020062	GCG	2	6	613172	613177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223523
11544	NC_020062	TTC	2	6	613199	613204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223523
11545	NC_020062	GCCG	2	8	613234	613241	0 %	0 %	50 %	50 %	440223523
11546	NC_020062	CGC	2	6	613287	613292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223523
11547	NC_020062	GAT	2	6	613294	613299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223523
11548	NC_020062	GAT	2	6	613353	613358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223523
11549	NC_020062	CCG	2	6	613361	613366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223523
11550	NC_020062	GGC	2	6	613480	613485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223523
11551	NC_020062	TCT	2	6	613542	613547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223523
11552	NC_020062	TTC	2	6	613559	613564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223523
11553	NC_020062	ACG	2	6	613583	613588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223523
11554	NC_020062	CTG	2	6	613591	613596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223523
11555	NC_020062	CGA	3	9	613740	613748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223523
11556	NC_020062	CGA	2	6	613764	613769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223523
11557	NC_020062	CAT	2	6	613809	613814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223523
11558	NC_020062	CGC	2	6	613848	613853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223523
11559	NC_020062	TTG	2	6	613859	613864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223523
11560	NC_020062	TTC	2	6	613867	613872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223523
11561	NC_020062	GC	3	6	613884	613889	0 %	0 %	50 %	50 %	440223523
11562	NC_020062	GCG	2	6	613932	613937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223523
11563	NC_020062	AGCGA	2	10	613985	613994	40 %	0 %	40 %	20 %	440223523
11564	NC_020062	GAATGA	2	12	614430	614441	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440223524
11565	NC_020062	CGATC	2	10	614487	614496	20 %	20 %	20 %	40 %	440223524
11566	NC_020062	GGA	2	6	614571	614576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223524
11567	NC_020062	TGG	2	6	614602	614607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223524
11568	NC_020062	CG	4	8	614622	614629	0 %	0 %	50 %	50 %	440223524
11569	NC_020062	GAC	2	6	614713	614718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223524
11570	NC_020062	ATC	2	6	614731	614736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223524
11571	NC_020062	TTCG	2	8	614810	614817	0 %	50 %	25 %	25 %	440223524
11572	NC_020062	TGC	2	6	614879	614884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223524
11573	NC_020062	CGT	2	6	614901	614906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223524
11574	NC_020062	TCA	2	6	614925	614930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223524
11575	NC_020062	GGCT	2	8	614959	614966	0 %	25 %	50 %	25 %	440223524
11576	NC_020062	CGAT	2	8	614969	614976	25 %	25 %	25 %	25 %	440223524
11577	NC_020062	GGCC	2	8	615141	615148	0 %	0 %	50 %	50 %	440223524
11578	NC_020062	GCTG	2	8	615158	615165	0 %	25 %	50 %	25 %	440223524
11579	NC_020062	CGG	2	6	615221	615226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223524
11580	NC_020062	GC	3	6	615285	615290	0 %	0 %	50 %	50 %	440223525
11581	NC_020062	GGGC	2	8	615315	615322	0 %	0 %	75 %	25 %	440223525
11582	NC_020062	GGC	2	6	615360	615365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223525
11583	NC_020062	CTGG	2	8	615369	615376	0 %	25 %	50 %	25 %	440223525
11584	NC_020062	AG	3	6	615423	615428	50 %	0 %	50 %	0 %	440223525
11585	NC_020062	CGA	2	6	615467	615472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223525
11586	NC_020062	TCA	2	6	615515	615520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223525
11587	NC_020062	CGG	2	6	615539	615544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223525
11588	NC_020062	GCG	2	6	615585	615590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223525
11589	NC_020062	CCGG	2	8	615594	615601	0 %	0 %	50 %	50 %	440223525
11590	NC_020062	GCA	2	6	615632	615637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223525
11591	NC_020062	GAT	2	6	615688	615693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223525
11592	NC_020062	GCC	2	6	615732	615737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223525
11593	NC_020062	ACGGC	2	10	615752	615761	20 %	0 %	40 %	40 %	440223525
11594	NC_020062	GAT	2	6	615809	615814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223525
11595	NC_020062	CGC	2	6	615821	615826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223525
11596	NC_020062	TGA	2	6	615839	615844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223525
11597	NC_020062	GAC	2	6	615861	615866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223525
11598	NC_020062	GAAGC	2	10	615902	615911	40 %	0 %	40 %	20 %	440223525
11599	NC_020062	CGA	2	6	616049	616054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223525
11600	NC_020062	GA	3	6	616053	616058	50 %	0 %	50 %	0 %	440223525
11601	NC_020062	CGT	2	6	616071	616076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223525
11602	NC_020062	GGC	2	6	616122	616127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223525
11603	NC_020062	TTG	2	6	616172	616177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223525
11604	NC_020062	CAA	2	6	616271	616276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223525
11605	NC_020062	CA	3	6	616380	616385	50 %	0 %	0 %	50 %	440223525
11606	NC_020062	CGT	2	6	616395	616400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223525
11607	NC_020062	GAT	2	6	616452	616457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223525
11608	NC_020062	CGG	2	6	616529	616534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223525
11609	NC_020062	ACC	4	12	616561	616572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223525
11610	NC_020062	GCG	2	6	616608	616613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223525
11611	NC_020062	CCA	2	6	616715	616720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223526
11612	NC_020062	TTC	2	6	616722	616727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223526
11613	NC_020062	GT	3	6	616792	616797	0 %	50 %	50 %	0 %	440223526
11614	NC_020062	GATG	2	8	616813	616820	25 %	25 %	50 %	0 %	440223526
11615	NC_020062	AAT	2	6	616822	616827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223526
11616	NC_020062	GCA	2	6	616846	616851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223526
11617	NC_020062	TCA	2	6	616875	616880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223526
11618	NC_020062	GGCGT	2	10	616931	616940	0 %	20 %	60 %	20 %	440223526
11619	NC_020062	TGA	3	9	617007	617015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223527
11620	NC_020062	GGA	2	6	617016	617021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223527
11621	NC_020062	AGGCCG	2	12	617063	617074	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223527
11622	NC_020062	GGC	2	6	617098	617103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223527
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11735	NC_020062	GCTC	2	8	621867	621874	0 %	25 %	25 %	50 %	440223531
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11738	NC_020062	TTC	2	6	622037	622042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223531
11739	NC_020062	TCA	2	6	622083	622088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223531
11740	NC_020062	GCC	2	6	622138	622143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223531
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11742	NC_020062	GC	3	6	622189	622194	0 %	0 %	50 %	50 %	440223531
11743	NC_020062	CCGCC	2	10	622284	622293	0 %	0 %	20 %	80 %	440223531
11744	NC_020062	TCG	2	6	622347	622352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223531
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11746	NC_020062	GCGTTC	2	12	622435	622446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223531
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11757	NC_020062	GAC	2	6	623149	623154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223532
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11772	NC_020062	CCGC	2	8	623586	623593	0 %	0 %	25 %	75 %	440223532
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11847	NC_020062	AAAC	2	8	627006	627013	75 %	0 %	0 %	25 %	440223534
11848	NC_020062	AAG	2	6	627171	627176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223535
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11852	NC_020062	GGGCA	2	10	627439	627448	20 %	0 %	60 %	20 %	440223535
11853	NC_020062	TCA	2	6	627472	627477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223535
11854	NC_020062	AGC	2	6	627508	627513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223535
11855	NC_020062	GAC	2	6	627871	627876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223536
11856	NC_020062	GGC	2	6	627920	627925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223536
11857	NC_020062	CCGAT	2	10	627951	627960	20 %	20 %	20 %	40 %	440223536
11858	NC_020062	ATC	2	6	627969	627974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223536
11859	NC_020062	GCA	2	6	628012	628017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223536
11860	NC_020062	GGCA	2	8	628069	628076	25 %	0 %	50 %	25 %	440223536
11861	NC_020062	CGCCTC	2	12	628111	628122	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	440223536
11862	NC_020062	CAT	2	6	628150	628155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223536
11863	NC_020062	GAT	2	6	628162	628167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223536
11864	NC_020062	GAT	2	6	628178	628183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223536
11865	NC_020062	GC	4	8	628184	628191	0 %	0 %	50 %	50 %	440223536
11866	NC_020062	CGA	2	6	628203	628208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223536
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11870	NC_020062	GCTCA	2	10	628598	628607	20 %	20 %	20 %	40 %	440223536
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11872	NC_020062	GCC	2	6	628812	628817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223537
11873	NC_020062	GAT	2	6	628878	628883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223537
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11877	NC_020062	GAT	2	6	629844	629849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223539
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11879	NC_020062	ATGG	2	8	630064	630071	25 %	25 %	50 %	0 %	440223539
11880	NC_020062	GCAAG	2	10	630078	630087	40 %	0 %	40 %	20 %	440223539
11881	NC_020062	GTC	2	6	630121	630126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223539
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11883	NC_020062	TGA	2	6	630179	630184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223539
11884	NC_020062	GAA	2	6	630225	630230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223539
11885	NC_020062	CGC	2	6	630288	630293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223539
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11892	NC_020062	GGC	2	6	630550	630555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223539
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11896	NC_020062	ATC	2	6	630932	630937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223540
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11927	NC_020062	GTC	2	6	632778	632783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223542
11928	NC_020062	TCA	3	9	632878	632886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223542
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11934	NC_020062	CGT	2	6	633356	633361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223542
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11946	NC_020062	CTG	2	6	633727	633732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223542
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11950	NC_020062	ATC	2	6	634062	634067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223543
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11955	NC_020062	CCGG	2	8	634300	634307	0 %	0 %	50 %	50 %	440223543
11956	NC_020062	GAA	2	6	634331	634336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223543
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11959	NC_020062	GC	3	6	634479	634484	0 %	0 %	50 %	50 %	440223543
11960	NC_020062	GAC	2	6	634526	634531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223543
11961	NC_020062	TCG	2	6	634543	634548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223543
11962	NC_020062	GCG	2	6	634565	634570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223543
11963	NC_020062	CAT	2	6	634577	634582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223543
11964	NC_020062	GCAC	2	8	634627	634634	25 %	0 %	25 %	50 %	440223543
11965	NC_020062	TCAGG	2	10	634747	634756	20 %	20 %	40 %	20 %	440223544
11966	NC_020062	ACGA	2	8	634768	634775	50 %	0 %	25 %	25 %	440223544
11967	NC_020062	TCG	2	6	634778	634783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223544
11968	NC_020062	CGA	2	6	634857	634862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223544
11969	NC_020062	CGT	3	9	635022	635030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223544
11970	NC_020062	GAT	2	6	635152	635157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223544
11971	NC_020062	GC	3	6	635215	635220	0 %	0 %	50 %	50 %	440223544
11972	NC_020062	CGC	2	6	635316	635321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223544
11973	NC_020062	AGCCA	2	10	635356	635365	40 %	0 %	20 %	40 %	440223544
11974	NC_020062	TC	3	6	635382	635387	0 %	50 %	0 %	50 %	440223544
11975	NC_020062	GAT	2	6	635431	635436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223544
11976	NC_020062	TC	3	6	635507	635512	0 %	50 %	0 %	50 %	440223544
11977	NC_020062	GAA	2	6	635623	635628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223544
11978	NC_020062	CTC	2	6	635638	635643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223544
11979	NC_020062	CAT	2	6	635691	635696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223544
11980	NC_020062	CAT	2	6	635746	635751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223544
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12000	NC_020062	TCGA	2	8	637049	637056	25 %	25 %	25 %	25 %	440223545

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