MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020062	GTT	2	6	585516	585521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223497
11002	NC_020062	CAC	2	6	585578	585583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223497
11003	NC_020062	CGC	2	6	585602	585607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223497
11004	NC_020062	ATCG	2	8	585628	585635	25 %	25 %	25 %	25 %	440223497
11005	NC_020062	GCG	2	6	585653	585658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223497
11006	NC_020062	AGT	2	6	585676	585681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223497
11007	NC_020062	ATCT	2	8	585682	585689	25 %	50 %	0 %	25 %	440223497
11008	NC_020062	GGC	2	6	585718	585723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223497
11009	NC_020062	GCTGGA	2	12	585744	585755	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223497
11010	NC_020062	CGC	2	6	585776	585781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223497
11011	NC_020062	GCG	2	6	585793	585798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223497
11012	NC_020062	GGC	2	6	585976	585981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223498
11013	NC_020062	GCATCG	2	12	586031	586042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11014	NC_020062	GCT	2	6	586055	586060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11015	NC_020062	GCTT	2	8	586101	586108	0 %	50 %	25 %	25 %	440223498
11016	NC_020062	ACC	2	6	586112	586117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223498
11017	NC_020062	ACG	2	6	586170	586175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11018	NC_020062	CGC	2	6	586195	586200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223498
11019	NC_020062	GAGG	2	8	586220	586227	25 %	0 %	75 %	0 %	440223498
11020	NC_020062	CGA	2	6	586236	586241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11021	NC_020062	CGA	2	6	586353	586358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11022	NC_020062	CG	4	8	586435	586442	0 %	0 %	50 %	50 %	440223498
11023	NC_020062	CCG	2	6	586443	586448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223498
11024	NC_020062	GTCGAC	2	12	586453	586464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11025	NC_020062	GAC	2	6	586558	586563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11026	NC_020062	GCG	2	6	586638	586643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223498
11027	NC_020062	GAT	2	6	586660	586665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223498
11028	NC_020062	CG	3	6	586685	586690	0 %	0 %	50 %	50 %	440223498
11029	NC_020062	GAC	2	6	586729	586734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223498
11030	NC_020062	GGC	2	6	586777	586782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223498
11031	NC_020062	CG	3	6	586803	586808	0 %	0 %	50 %	50 %	440223498
11032	NC_020062	CG	5	10	586896	586905	0 %	0 %	50 %	50 %	440223498
11033	NC_020062	CCGC	2	8	586943	586950	0 %	0 %	25 %	75 %	440223498
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11039	NC_020062	TCGG	2	8	587248	587255	0 %	25 %	50 %	25 %	440223499
11040	NC_020062	TCG	2	6	587312	587317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223499
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11042	NC_020062	GAT	2	6	587394	587399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223499
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11052	NC_020062	GCA	2	6	587861	587866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223499
11053	NC_020062	CGA	2	6	587906	587911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223499
11054	NC_020062	GAT	2	6	588006	588011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223499
11055	NC_020062	CAA	2	6	588050	588055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223499
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11060	NC_020062	GGC	2	6	588186	588191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223499
11061	NC_020062	GTC	2	6	588220	588225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223499
11062	NC_020062	CGA	2	6	588236	588241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223499
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11064	NC_020062	GCT	2	6	588369	588374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223499
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11067	NC_020062	CTG	2	6	588753	588758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223500
11068	NC_020062	GCTT	2	8	588761	588768	0 %	50 %	25 %	25 %	440223500
11069	NC_020062	TGG	2	6	588775	588780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223500
11070	NC_020062	GATC	2	8	588815	588822	25 %	25 %	25 %	25 %	440223500
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11088	NC_020062	GC	3	6	589796	589801	0 %	0 %	50 %	50 %	440223500
11089	NC_020062	AGG	2	6	589837	589842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223500
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11099	NC_020062	TTGGCC	2	12	590311	590322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223500
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11102	NC_020062	CAGAT	2	10	590668	590677	40 %	20 %	20 %	20 %	440223500
11103	NC_020062	CGAT	2	8	590742	590749	25 %	25 %	25 %	25 %	440223500
11104	NC_020062	ACG	2	6	590761	590766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223500
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11106	NC_020062	GCT	2	6	590876	590881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223501
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11109	NC_020062	CG	3	6	590931	590936	0 %	0 %	50 %	50 %	440223501
11110	NC_020062	TGGCG	2	10	590971	590980	0 %	20 %	60 %	20 %	440223501
11111	NC_020062	ACC	2	6	591074	591079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223501
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11114	NC_020062	TTG	2	6	591275	591280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223501
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11117	NC_020062	TCA	2	6	591481	591486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223501
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11119	NC_020062	CGC	2	6	591555	591560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223501
11120	NC_020062	CAG	2	6	591566	591571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223501
11121	NC_020062	GGC	2	6	591607	591612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223501
11122	NC_020062	CGC	2	6	591661	591666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223501
11123	NC_020062	ATG	2	6	591716	591721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223501
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11126	NC_020062	CAT	2	6	591850	591855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223501
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11129	NC_020062	TTCG	2	8	592043	592050	0 %	50 %	25 %	25 %	440223502
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11143	NC_020062	TGC	2	6	592946	592951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223502
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11182	NC_020062	CAGT	2	8	595402	595409	25 %	25 %	25 %	25 %	440223504
11183	NC_020062	TGACC	2	10	595465	595474	20 %	20 %	20 %	40 %	440223504
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11222	NC_020062	ATGA	2	8	597472	597479	50 %	25 %	25 %	0 %	440223507
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11225	NC_020062	ACGC	2	8	597552	597559	25 %	0 %	25 %	50 %	440223507
11226	NC_020062	TGC	2	6	597594	597599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223507
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11228	NC_020062	AGAT	2	8	597638	597645	50 %	25 %	25 %	0 %	440223507
11229	NC_020062	CAT	2	6	597718	597723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223507
11230	NC_020062	CGATGC	2	12	597747	597758	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223507
11231	NC_020062	GCC	2	6	597781	597786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223507
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11233	NC_020062	AT	3	6	597855	597860	50 %	50 %	0 %	0 %	440223507
11234	NC_020062	GTC	2	6	597863	597868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223507
11235	NC_020062	GAAG	2	8	598141	598148	50 %	0 %	50 %	0 %	440223508
11236	NC_020062	CGG	3	9	598161	598169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223508
11237	NC_020062	TGC	2	6	598176	598181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223508
11238	NC_020062	AGG	2	6	598254	598259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223508
11239	NC_020062	AACG	2	8	598301	598308	50 %	0 %	25 %	25 %	440223508
11240	NC_020062	CCG	2	6	598309	598314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223508
11241	NC_020062	CCG	2	6	598368	598373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223508
11242	NC_020062	TCG	2	6	598467	598472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223508
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11244	NC_020062	TCC	2	6	598889	598894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223509
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11247	NC_020062	GGC	2	6	598980	598985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223509
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11257	NC_020062	CGAC	2	8	599421	599428	25 %	0 %	25 %	50 %	440223509
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11271	NC_020062	CTT	2	6	600019	600024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223510
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11344	NC_020062	CGA	2	6	603746	603751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223513
11345	NC_020062	GCAT	2	8	603770	603777	25 %	25 %	25 %	25 %	440223513
11346	NC_020062	TGC	2	6	603782	603787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223513
11347	NC_020062	GTTTC	2	10	603855	603864	0 %	60 %	20 %	20 %	440223513
11348	NC_020062	TTC	2	6	603880	603885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223513
11349	NC_020062	CGA	2	6	603999	604004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223513
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11351	NC_020062	ATC	2	6	604073	604078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223513
11352	NC_020062	CTCG	2	8	604127	604134	0 %	25 %	25 %	50 %	440223513
11353	NC_020062	CTG	2	6	604141	604146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223513
11354	NC_020062	GAC	2	6	604147	604152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223513
11355	NC_020062	CGC	2	6	604215	604220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223513
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11357	NC_020062	CCG	2	6	604279	604284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223514
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11361	NC_020062	GCC	3	9	604436	604444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223514
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11475	NC_020062	GA	3	6	610816	610821	50 %	0 %	50 %	0 %	440223521
11476	NC_020062	GCC	2	6	610855	610860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223521
11477	NC_020062	CGG	2	6	610901	610906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223521
11478	NC_020062	TCA	2	6	610911	610916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223521
11479	NC_020062	CGT	2	6	610926	610931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223521
11480	NC_020062	TGC	2	6	610935	610940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223521
11481	NC_020062	CGT	2	6	610947	610952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223521
11482	NC_020062	TGGCG	2	10	611049	611058	0 %	20 %	60 %	20 %	440223521
11483	NC_020062	GCG	2	6	611102	611107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223521
11484	NC_020062	TGCACA	2	12	611121	611132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440223521
11485	NC_020062	GCC	2	6	611137	611142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223521
11486	NC_020062	ATC	2	6	611186	611191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223521
11487	NC_020062	CGAT	2	8	611213	611220	25 %	25 %	25 %	25 %	440223521
11488	NC_020062	AGGGC	2	10	611262	611271	20 %	0 %	60 %	20 %	440223521
11489	NC_020062	GCC	4	12	611305	611316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223521
11490	NC_020062	GAT	2	6	611326	611331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223521
11491	NC_020062	GGTCA	2	10	611359	611368	20 %	20 %	40 %	20 %	440223521
11492	NC_020062	TCA	2	6	611378	611383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223521
11493	NC_020062	GGCTC	2	10	611390	611399	0 %	20 %	40 %	40 %	440223521
11494	NC_020062	CCG	2	6	611435	611440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223521
11495	NC_020062	ACCGCG	2	12	611461	611472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223521
11496	NC_020062	ATC	2	6	611473	611478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223521
11497	NC_020062	GCT	2	6	611517	611522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223521
11498	NC_020062	CGG	2	6	611551	611556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223521
11499	NC_020062	CGA	2	6	611586	611591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223521
11500	NC_020062	CGA	2	6	611619	611624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223521

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