MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_020062	CCG	2	6	559039	559044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223469
10502	NC_020062	CCTT	2	8	559134	559141	0 %	50 %	0 %	50 %	440223469
10503	NC_020062	GGC	2	6	559325	559330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223470
10504	NC_020062	TTCG	2	8	559370	559377	0 %	50 %	25 %	25 %	440223470
10505	NC_020062	GCG	2	6	559489	559494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223470
10506	NC_020062	CCG	2	6	559819	559824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223470
10507	NC_020062	TGA	2	6	559967	559972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10508	NC_020062	TCA	2	6	559987	559992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223470
10509	NC_020062	TAG	2	6	560023	560028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10510	NC_020062	GGC	2	6	560039	560044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223470
10511	NC_020062	AGG	2	6	560060	560065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223470
10512	NC_020062	CGT	2	6	560135	560140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10513	NC_020062	GGTGCA	2	12	560154	560165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223470
10514	NC_020062	CGA	2	6	560225	560230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10515	NC_020062	AGG	2	6	560249	560254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223470
10516	NC_020062	GC	3	6	560272	560277	0 %	0 %	50 %	50 %	440223470
10517	NC_020062	CGAG	2	8	560285	560292	25 %	0 %	50 %	25 %	440223470
10518	NC_020062	CAT	2	6	560363	560368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223470
10519	NC_020062	GCC	2	6	560386	560391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223470
10520	NC_020062	TCC	2	6	560409	560414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223470
10521	NC_020062	CTT	2	6	560472	560477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223470
10522	NC_020062	GAT	2	6	560529	560534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10523	NC_020062	GTCGC	2	10	560575	560584	0 %	20 %	40 %	40 %	440223470
10524	NC_020062	GCA	2	6	560585	560590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10525	NC_020062	GC	3	6	560712	560717	0 %	0 %	50 %	50 %	440223470
10526	NC_020062	CG	3	6	560726	560731	0 %	0 %	50 %	50 %	440223470
10527	NC_020062	CGA	2	6	560750	560755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10528	NC_020062	GCC	2	6	560769	560774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223470
10529	NC_020062	CGA	3	9	560834	560842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10530	NC_020062	CTT	2	6	560867	560872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223470
10531	NC_020062	GAC	2	6	560910	560915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10532	NC_020062	CTC	2	6	561021	561026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223470
10533	NC_020062	AGG	2	6	561040	561045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223470
10534	NC_020062	CGG	3	9	561050	561058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223470
10535	NC_020062	GCA	2	6	561095	561100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10536	NC_020062	GCC	3	9	561133	561141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223470
10537	NC_020062	GCC	3	9	561156	561164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223470
10538	NC_020062	GAC	2	6	561168	561173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10539	NC_020062	CG	3	6	561182	561187	0 %	0 %	50 %	50 %	440223470
10540	NC_020062	AGC	2	6	561199	561204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10541	NC_020062	CGT	2	6	561215	561220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10542	NC_020062	TGA	2	6	561236	561241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10543	NC_020062	GAT	2	6	561270	561275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10544	NC_020062	CGA	2	6	561368	561373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223470
10545	NC_020062	GAT	3	9	561429	561437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10546	NC_020062	ATG	2	6	561478	561483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10547	NC_020062	CG	3	6	561497	561502	0 %	0 %	50 %	50 %	440223470
10548	NC_020062	GAT	2	6	561591	561596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223470
10549	NC_020062	CGA	2	6	561647	561652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223471
10550	NC_020062	AGGT	2	8	561700	561707	25 %	25 %	50 %	0 %	440223471
10551	NC_020062	GCGG	2	8	561774	561781	0 %	0 %	75 %	25 %	440223471
10552	NC_020062	TCA	3	9	561794	561802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223471
10553	NC_020062	CGT	2	6	561836	561841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223471
10554	NC_020062	ATC	2	6	561847	561852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223471
10555	NC_020062	GC	3	6	561926	561931	0 %	0 %	50 %	50 %	440223471
10556	NC_020062	GC	3	6	561974	561979	0 %	0 %	50 %	50 %	440223471
10557	NC_020062	GCT	2	6	561995	562000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223471
10558	NC_020062	GCC	2	6	562005	562010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223471
10559	NC_020062	CGAGGT	2	12	562055	562066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440223471
10560	NC_020062	GCA	2	6	562163	562168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223471
10561	NC_020062	ACG	2	6	562186	562191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223471
10562	NC_020062	GAT	2	6	562311	562316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223471
10563	NC_020062	TCA	2	6	562427	562432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223471
10564	NC_020062	GCCG	2	8	562474	562481	0 %	0 %	50 %	50 %	440223472
10565	NC_020062	CCA	2	6	562485	562490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223472
10566	NC_020062	CGA	2	6	562509	562514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10567	NC_020062	ATG	2	6	562538	562543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223472
10568	NC_020062	CGA	2	6	562555	562560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
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10570	NC_020062	CGC	2	6	562596	562601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223472
10571	NC_020062	CGA	2	6	562620	562625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10572	NC_020062	TGC	2	6	562678	562683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10573	NC_020062	GCA	2	6	562689	562694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10574	NC_020062	GAA	3	9	562702	562710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223472
10575	NC_020062	GCA	2	6	562728	562733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10576	NC_020062	CGG	2	6	562779	562784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223472
10577	NC_020062	TGA	2	6	562788	562793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223472
10578	NC_020062	TGA	2	6	562812	562817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223472
10579	NC_020062	GGC	2	6	562855	562860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223472
10580	NC_020062	GCG	2	6	562884	562889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223472
10581	NC_020062	GCA	2	6	562899	562904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10582	NC_020062	GAT	2	6	562951	562956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223472
10583	NC_020062	CAC	2	6	562966	562971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223472
10584	NC_020062	GCC	2	6	562982	562987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223472
10585	NC_020062	GCCA	2	8	563031	563038	25 %	0 %	25 %	50 %	440223472
10586	NC_020062	GAA	2	6	563065	563070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223472
10587	NC_020062	GGGGA	2	10	563114	563123	20 %	0 %	80 %	0 %	440223472
10588	NC_020062	CGA	2	6	563137	563142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10589	NC_020062	AGC	2	6	563162	563167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223472
10590	NC_020062	ATGG	2	8	563183	563190	25 %	25 %	50 %	0 %	440223472
10591	NC_020062	GC	3	6	563203	563208	0 %	0 %	50 %	50 %	440223472
10592	NC_020062	GGC	2	6	563408	563413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223473
10593	NC_020062	CG	3	6	563491	563496	0 %	0 %	50 %	50 %	440223473
10594	NC_020062	GCG	2	6	563541	563546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223473
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10599	NC_020062	GTG	2	6	563939	563944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223473
10600	NC_020062	GGT	2	6	563960	563965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223473
10601	NC_020062	CGC	2	6	563966	563971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223473
10602	NC_020062	GCG	2	6	564067	564072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223473
10603	NC_020062	G	6	6	564072	564077	0 %	0 %	100 %	0 %	440223473
10604	NC_020062	ACG	2	6	564078	564083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223473
10605	NC_020062	TGG	2	6	564085	564090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223473
10606	NC_020062	CCGC	2	8	564114	564121	0 %	0 %	25 %	75 %	440223473
10607	NC_020062	CCCG	2	8	564155	564162	0 %	0 %	25 %	75 %	440223473
10608	NC_020062	CGG	2	6	564193	564198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223473
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10610	NC_020062	CTTC	2	8	564217	564224	0 %	50 %	0 %	50 %	440223473
10611	NC_020062	TGT	2	6	564331	564336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223473
10612	NC_020062	GCG	2	6	564373	564378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223473
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10615	NC_020062	TGC	2	6	564661	564666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223473
10616	NC_020062	GTC	2	6	564681	564686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223473
10617	NC_020062	CTC	2	6	565194	565199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223474
10618	NC_020062	CCGG	2	8	565232	565239	0 %	0 %	50 %	50 %	440223474
10619	NC_020062	ACGC	2	8	565257	565264	25 %	0 %	25 %	50 %	440223474
10620	NC_020062	CCT	2	6	565265	565270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223474
10621	NC_020062	ATC	2	6	565297	565302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223474
10622	NC_020062	ATG	2	6	565353	565358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223474
10623	NC_020062	GAT	2	6	565434	565439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223474
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10626	NC_020062	GGCT	2	8	565564	565571	0 %	25 %	50 %	25 %	440223474
10627	NC_020062	GGC	2	6	565635	565640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223474
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10631	NC_020062	CCGC	2	8	565786	565793	0 %	0 %	25 %	75 %	440223474
10632	NC_020062	GCCA	2	8	565795	565802	25 %	0 %	25 %	50 %	440223474
10633	NC_020062	GGT	2	6	565944	565949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223474
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10636	NC_020062	AGCC	2	8	566109	566116	25 %	0 %	25 %	50 %	440223474
10637	NC_020062	CCTT	2	8	566167	566174	0 %	50 %	0 %	50 %	440223474
10638	NC_020062	CGG	3	9	566192	566200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223474
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10640	NC_020062	CGGCG	2	10	566277	566286	0 %	0 %	60 %	40 %	440223474
10641	NC_020062	CATCA	2	10	566351	566360	40 %	20 %	0 %	40 %	440223475
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10648	NC_020062	CTC	2	6	566512	566517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223475
10649	NC_020062	CTG	2	6	566555	566560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223475
10650	NC_020062	CTT	2	6	566611	566616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223475
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10658	NC_020062	ATGA	2	8	566830	566837	50 %	25 %	25 %	0 %	440223475
10659	NC_020062	GGCC	2	8	566853	566860	0 %	0 %	50 %	50 %	440223475
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10732	NC_020062	TAT	2	6	571632	571637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440223484
10733	NC_020062	CCGGCG	2	12	571696	571707	0 %	0 %	50 %	50 %	440223484
10734	NC_020062	CGG	2	6	571715	571720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223484
10735	NC_020062	GCC	2	6	571735	571740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223484
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10977	NC_020062	CG	3	6	583990	583995	0 %	0 %	50 %	50 %	440223496
10978	NC_020062	ATCG	2	8	584027	584034	25 %	25 %	25 %	25 %	440223496
10979	NC_020062	AGC	2	6	584049	584054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223496
10980	NC_020062	CGG	2	6	584191	584196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223496
10981	NC_020062	GCCAT	2	10	584419	584428	20 %	20 %	20 %	40 %	440223497
10982	NC_020062	CGAT	2	8	584429	584436	25 %	25 %	25 %	25 %	440223497
10983	NC_020062	ATC	2	6	584437	584442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223497
10984	NC_020062	GCGCC	2	10	584455	584464	0 %	0 %	40 %	60 %	440223497
10985	NC_020062	CG	3	6	584484	584489	0 %	0 %	50 %	50 %	440223497
10986	NC_020062	CCG	2	6	584592	584597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223497
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10990	NC_020062	GTCG	2	8	584748	584755	0 %	25 %	50 %	25 %	440223497
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10997	NC_020062	CG	4	8	585055	585062	0 %	0 %	50 %	50 %	440223497
10998	NC_020062	AGC	2	6	585121	585126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223497
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