MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_020062	GC	3	6	506496	506501	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
9502	NC_020062	CGA	2	6	506559	506564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9503	NC_020062	GCC	2	6	506612	506617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
9504	NC_020062	ACG	2	6	506687	506692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9505	NC_020062	TGC	2	6	506706	506711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9506	NC_020062	GAC	2	6	506776	506781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9507	NC_020062	TGC	2	6	506784	506789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9508	NC_020062	GCC	2	6	506796	506801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
9509	NC_020062	TCCA	2	8	506893	506900	25 %	25 %	0 %	50 %	440223415
9510	NC_020062	GCA	2	6	506922	506927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9511	NC_020062	GTC	2	6	506995	507000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9512	NC_020062	TG	3	6	507050	507055	0 %	50 %	50 %	0 %	440223415
9513	NC_020062	CGT	2	6	507063	507068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9514	NC_020062	GC	3	6	507161	507166	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
9515	NC_020062	CGC	2	6	507222	507227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
9516	NC_020062	ATCTGC	2	12	507230	507241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440223415
9517	NC_020062	GC	3	6	507251	507256	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
9518	NC_020062	TTGCC	2	10	507294	507303	0 %	40 %	20 %	40 %	440223415
9519	NC_020062	GCTG	2	8	507312	507319	0 %	25 %	50 %	25 %	440223415
9520	NC_020062	GCA	2	6	507354	507359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223415
9521	NC_020062	CCT	2	6	507405	507410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223415
9522	NC_020062	GCG	2	6	507421	507426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223415
9523	NC_020062	GATC	2	8	507459	507466	25 %	25 %	25 %	25 %	440223415
9524	NC_020062	AAG	2	6	507497	507502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223415
9525	NC_020062	CG	3	6	507522	507527	0 %	0 %	50 %	50 %	440223415
9526	NC_020062	GAA	2	6	507583	507588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223415
9527	NC_020062	GCC	3	9	507611	507619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
9528	NC_020062	GCC	2	6	507701	507706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223415
9529	NC_020062	CAT	3	9	508019	508027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223416
9530	NC_020062	GCA	2	6	508074	508079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9531	NC_020062	GC	3	6	508116	508121	0 %	0 %	50 %	50 %	440223416
9532	NC_020062	GAC	2	6	508137	508142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9533	NC_020062	TCGC	2	8	508174	508181	0 %	25 %	25 %	50 %	440223416
9534	NC_020062	GCT	2	6	508197	508202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9535	NC_020062	CTG	2	6	508224	508229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9536	NC_020062	AC	3	6	508248	508253	50 %	0 %	0 %	50 %	440223416
9537	NC_020062	GCT	2	6	508299	508304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9538	NC_020062	GCA	2	6	508342	508347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9539	NC_020062	TCG	2	6	508394	508399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9540	NC_020062	CGA	2	6	508407	508412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9541	NC_020062	CTCG	2	8	508473	508480	0 %	25 %	25 %	50 %	440223416
9542	NC_020062	GCTGGT	2	12	508491	508502	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440223416
9543	NC_020062	CAC	2	6	508514	508519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223416
9544	NC_020062	GTG	2	6	508547	508552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223416
9545	NC_020062	CA	3	6	508626	508631	50 %	0 %	0 %	50 %	440223416
9546	NC_020062	GGA	2	6	508638	508643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223416
9547	NC_020062	GGC	2	6	508756	508761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
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9549	NC_020062	AG	3	6	508894	508899	50 %	0 %	50 %	0 %	440223416
9550	NC_020062	CTTG	2	8	508947	508954	0 %	50 %	25 %	25 %	440223416
9551	NC_020062	CCG	2	6	509012	509017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223416
9552	NC_020062	TCA	2	6	509100	509105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223416
9553	NC_020062	TGC	2	6	509133	509138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9554	NC_020062	CCG	2	6	509153	509158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223416
9555	NC_020062	GGC	2	6	509165	509170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
9556	NC_020062	CCA	2	6	509180	509185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223416
9557	NC_020062	CGG	2	6	509190	509195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
9558	NC_020062	GGC	2	6	509292	509297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
9559	NC_020062	GCG	2	6	509305	509310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
9560	NC_020062	GCC	2	6	509344	509349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223416
9561	NC_020062	CGATC	2	10	509352	509361	20 %	20 %	20 %	40 %	440223416
9562	NC_020062	GTG	2	6	509380	509385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223416
9563	NC_020062	TCC	2	6	509390	509395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223416
9564	NC_020062	ATGGA	2	10	509468	509477	40 %	20 %	40 %	0 %	440223416
9565	NC_020062	TCAT	2	8	509480	509487	25 %	50 %	0 %	25 %	440223416
9566	NC_020062	CGG	2	6	509589	509594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
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9568	NC_020062	CGG	2	6	509795	509800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
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9570	NC_020062	GC	3	6	509997	510002	0 %	0 %	50 %	50 %	440223416
9571	NC_020062	TGC	2	6	510005	510010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223416
9572	NC_020062	GCAG	2	8	510072	510079	25 %	0 %	50 %	25 %	440223416
9573	NC_020062	CATT	2	8	510108	510115	25 %	50 %	0 %	25 %	440223416
9574	NC_020062	TCT	2	6	510137	510142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223416
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9577	NC_020062	ATG	2	6	510205	510210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223416
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9581	NC_020062	CGG	2	6	510485	510490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223416
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9588	NC_020062	CGA	2	6	511055	511060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223417
9589	NC_020062	CGG	2	6	511103	511108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
9590	NC_020062	TGCG	2	8	511115	511122	0 %	25 %	50 %	25 %	440223417
9591	NC_020062	TCT	2	6	511144	511149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223417
9592	NC_020062	CGG	2	6	511202	511207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
9593	NC_020062	CAT	2	6	511319	511324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223417
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9599	NC_020062	CCGC	2	8	511635	511642	0 %	0 %	25 %	75 %	440223417
9600	NC_020062	CGG	2	6	511684	511689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
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9603	NC_020062	CCG	2	6	511891	511896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223417
9604	NC_020062	CGT	2	6	511916	511921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223417
9605	NC_020062	GCA	2	6	511973	511978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223417
9606	NC_020062	GGC	2	6	511980	511985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
9607	NC_020062	GAGC	2	8	511990	511997	25 %	0 %	50 %	25 %	440223417
9608	NC_020062	GACGGC	2	12	512001	512012	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223417
9609	NC_020062	GCC	2	6	512140	512145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223417
9610	NC_020062	GCG	2	6	512146	512151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
9611	NC_020062	CGC	2	6	512227	512232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223417
9612	NC_020062	GGC	2	6	512247	512252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
9613	NC_020062	TCT	2	6	512270	512275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223417
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9616	NC_020062	ATC	2	6	512358	512363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223417
9617	NC_020062	CGG	5	15	512366	512380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223417
9618	NC_020062	CG	3	6	512392	512397	0 %	0 %	50 %	50 %	440223417
9619	NC_020062	CCG	2	6	512417	512422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223417
9620	NC_020062	GC	3	6	512457	512462	0 %	0 %	50 %	50 %	440223417
9621	NC_020062	TCG	2	6	512538	512543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
9622	NC_020062	ATG	2	6	512547	512552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223418
9623	NC_020062	GAC	2	6	512587	512592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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9625	NC_020062	GC	3	6	512660	512665	0 %	0 %	50 %	50 %	440223418
9626	NC_020062	TTC	2	6	512675	512680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223418
9627	NC_020062	TCA	2	6	512700	512705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223418
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9634	NC_020062	CGG	2	6	513286	513291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223418
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9640	NC_020062	TCG	2	6	513477	513482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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9644	NC_020062	GGCC	2	8	513570	513577	0 %	0 %	50 %	50 %	440223418
9645	NC_020062	GGGCG	2	10	513584	513593	0 %	0 %	80 %	20 %	440223418
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9649	NC_020062	TCG	2	6	513756	513761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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9652	NC_020062	TGC	2	6	513871	513876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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9656	NC_020062	GCA	2	6	513981	513986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223418
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9685	NC_020062	TCG	2	6	515386	515391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223419
9686	NC_020062	AAT	2	6	515444	515449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440223419
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9688	NC_020062	GTTT	2	8	515583	515590	0 %	75 %	25 %	0 %	440223419
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9742	NC_020062	GCT	2	6	518070	518075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223422
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9754	NC_020062	GCT	2	6	518595	518600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223422
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9772	NC_020062	ATG	2	6	519773	519778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223425
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9982	NC_020062	CCAC	2	8	531588	531595	25 %	0 %	0 %	75 %	440223435
9983	NC_020062	ACCG	2	8	531598	531605	25 %	0 %	25 %	50 %	440223435
9984	NC_020062	TCG	2	6	531608	531613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223435
9985	NC_020062	AT	3	6	531681	531686	50 %	50 %	0 %	0 %	440223436
9986	NC_020062	AGG	2	6	531689	531694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223436
9987	NC_020062	CTC	2	6	531705	531710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223436
9988	NC_020062	TCG	2	6	531767	531772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223436
9989	NC_020062	CCG	2	6	531791	531796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223436
9990	NC_020062	ATC	2	6	531808	531813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223436
9991	NC_020062	GCA	2	6	531847	531852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223436
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9993	NC_020062	CCA	2	6	531939	531944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223436
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9995	NC_020062	CAGG	2	8	531990	531997	25 %	0 %	50 %	25 %	440223436
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9999	NC_020062	GC	3	6	532108	532113	0 %	0 %	50 %	50 %	440223436
10000	NC_020062	GCC	2	6	532186	532191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223436

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