MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_020062	TTCCG	2	10	403456	403465	0 %	40 %	20 %	40 %	440223322
7502	NC_020062	GCC	2	6	403517	403522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223322
7503	NC_020062	GAC	2	6	403562	403567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223322
7504	NC_020062	GTC	2	6	403599	403604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223322
7505	NC_020062	AGC	2	6	403610	403615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223322
7506	NC_020062	GAG	2	6	403616	403621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223322
7507	NC_020062	AGC	2	6	403624	403629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223322
7508	NC_020062	CGG	2	6	403809	403814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7509	NC_020062	CGG	2	6	403839	403844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7510	NC_020062	CGC	2	6	403848	403853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223323
7511	NC_020062	CGC	2	6	403857	403862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223323
7512	NC_020062	GGCGCA	2	12	403881	403892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223323
7513	NC_020062	CGG	3	9	403902	403910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7514	NC_020062	GCC	2	6	403921	403926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223323
7515	NC_020062	CG	3	6	404122	404127	0 %	0 %	50 %	50 %	440223323
7516	NC_020062	GCG	2	6	404135	404140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7517	NC_020062	GGT	2	6	404215	404220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223323
7518	NC_020062	GGC	2	6	404314	404319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7519	NC_020062	ACGGGA	2	12	404461	404472	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440223323
7520	NC_020062	GCC	2	6	404494	404499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223323
7521	NC_020062	CAAAC	2	10	404507	404516	60 %	0 %	0 %	40 %	440223323
7522	NC_020062	TGC	2	6	404619	404624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7523	NC_020062	CTCG	2	8	404640	404647	0 %	25 %	25 %	50 %	440223323
7524	NC_020062	ACC	2	6	404659	404664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223323
7525	NC_020062	GCAG	2	8	404706	404713	25 %	0 %	50 %	25 %	440223323
7526	NC_020062	GGT	2	6	404722	404727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223323
7527	NC_020062	CAA	2	6	404790	404795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7528	NC_020062	GTG	2	6	404807	404812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223323
7529	NC_020062	GCG	2	6	404849	404854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7530	NC_020062	CCACGG	2	12	404861	404872	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440223323
7531	NC_020062	AAC	2	6	404938	404943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7532	NC_020062	AGCG	2	8	405012	405019	25 %	0 %	50 %	25 %	440223323
7533	NC_020062	GGTT	2	8	405078	405085	0 %	50 %	50 %	0 %	440223323
7534	NC_020062	CGTT	2	8	405109	405116	0 %	50 %	25 %	25 %	440223323
7535	NC_020062	GGC	2	6	405121	405126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7536	NC_020062	TGA	2	6	405147	405152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223323
7537	NC_020062	GCCATT	2	12	405154	405165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440223323
7538	NC_020062	ACG	2	6	405169	405174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7539	NC_020062	CCG	2	6	405257	405262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223323
7540	NC_020062	CTCA	2	8	405264	405271	25 %	25 %	0 %	50 %	440223323
7541	NC_020062	GGC	2	6	405313	405318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7542	NC_020062	GTCG	2	8	405321	405328	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
7543	NC_020062	CGG	2	6	405414	405419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7544	NC_020062	CAA	2	6	405423	405428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7545	NC_020062	CCG	2	6	405461	405466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223323
7546	NC_020062	CAA	4	12	405498	405509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7547	NC_020062	TCG	2	6	405569	405574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7548	NC_020062	GCGACG	2	12	405598	405609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	440223323
7549	NC_020062	TCG	2	6	405643	405648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7550	NC_020062	CGG	2	6	405656	405661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7551	NC_020062	CGG	2	6	405684	405689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7552	NC_020062	CGG	2	6	405776	405781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7553	NC_020062	CAA	2	6	405789	405794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7554	NC_020062	GACG	2	8	405801	405808	25 %	0 %	50 %	25 %	440223323
7555	NC_020062	CAG	2	6	405841	405846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7556	NC_020062	CAC	2	6	405900	405905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223323
7557	NC_020062	GGC	2	6	405910	405915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7558	NC_020062	CGA	2	6	406049	406054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7559	NC_020062	CGG	2	6	406055	406060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7560	NC_020062	ACC	2	6	406105	406110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223323
7561	NC_020062	CGG	2	6	406112	406117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7562	NC_020062	TCGG	2	8	406126	406133	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
7563	NC_020062	CGG	2	6	406185	406190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7564	NC_020062	CCA	2	6	406226	406231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223323
7565	NC_020062	ACG	2	6	406255	406260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7566	NC_020062	CAC	2	6	406263	406268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223323
7567	NC_020062	CGG	2	6	406272	406277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7568	NC_020062	CAA	2	6	406305	406310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7569	NC_020062	CGA	2	6	406328	406333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7570	NC_020062	CTC	2	6	406404	406409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223323
7571	NC_020062	CGCTTG	2	12	406469	406480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7572	NC_020062	TCG	2	6	406502	406507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7573	NC_020062	CGG	2	6	406574	406579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7574	NC_020062	CAATA	2	10	406597	406606	60 %	20 %	0 %	20 %	440223323
7575	NC_020062	TCGG	2	8	406636	406643	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
7576	NC_020062	GCA	2	6	406685	406690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7577	NC_020062	GC	3	6	406691	406696	0 %	0 %	50 %	50 %	440223323
7578	NC_020062	CGA	2	6	406829	406834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7579	NC_020062	GGCATC	2	12	406855	406866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7580	NC_020062	CGT	2	6	406878	406883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7581	NC_020062	GCTG	2	8	406935	406942	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
7582	NC_020062	GCTG	2	8	406968	406975	0 %	25 %	50 %	25 %	440223323
7583	NC_020062	GGCGCG	2	12	406999	407010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7584	NC_020062	CAA	2	6	407016	407021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7585	NC_020062	GAC	2	6	407055	407060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7586	NC_020062	TCGGC	2	10	407132	407141	0 %	20 %	40 %	40 %	440223323
7587	NC_020062	CAGC	2	8	407205	407212	25 %	0 %	25 %	50 %	440223323
7588	NC_020062	CGG	2	6	407247	407252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7589	NC_020062	ACG	2	6	407257	407262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7590	NC_020062	GATC	2	8	407276	407283	25 %	25 %	25 %	25 %	440223323
7591	NC_020062	CAA	2	6	407310	407315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7592	NC_020062	ATG	2	6	407330	407335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223323
7593	NC_020062	GGC	3	9	407377	407385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7594	NC_020062	GCG	2	6	407474	407479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7595	NC_020062	AGC	2	6	407482	407487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
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7597	NC_020062	CTG	2	6	407507	407512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7598	NC_020062	CAGGG	2	10	407516	407525	20 %	0 %	60 %	20 %	440223323
7599	NC_020062	GC	3	6	407546	407551	0 %	0 %	50 %	50 %	440223323
7600	NC_020062	CAA	2	6	407556	407561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7601	NC_020062	ATG	2	6	407567	407572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223323
7602	NC_020062	CTC	2	6	407589	407594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223323
7603	NC_020062	GCT	2	6	407602	407607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7604	NC_020062	GCCG	2	8	407725	407732	0 %	0 %	50 %	50 %	440223323
7605	NC_020062	TTC	2	6	407736	407741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223323
7606	NC_020062	GCA	2	6	407864	407869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223323
7607	NC_020062	AGA	2	6	407870	407875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223323
7608	NC_020062	GCG	2	6	407894	407899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7609	NC_020062	GGT	2	6	407913	407918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223323
7610	NC_020062	CAA	2	6	408042	408047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440223323
7611	NC_020062	AGGCA	2	10	408104	408113	40 %	0 %	40 %	20 %	440223323
7612	NC_020062	GGC	2	6	408114	408119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223323
7613	NC_020062	ATG	2	6	408152	408157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223323
7614	NC_020062	GGCGA	2	10	408200	408209	20 %	0 %	60 %	20 %	440223323
7615	NC_020062	GC	3	6	408384	408389	0 %	0 %	50 %	50 %	440223324
7616	NC_020062	TGC	2	6	408421	408426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223324
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7618	NC_020062	ATC	2	6	408581	408586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223324
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7620	NC_020062	CGA	2	6	408630	408635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223324
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7724	NC_020062	GAC	2	6	414157	414162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223331
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7728	NC_020062	CGA	2	6	414307	414312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223331
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7732	NC_020062	GCC	2	6	414531	414536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223332
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7734	NC_020062	GCCT	2	8	414567	414574	0 %	25 %	25 %	50 %	440223332
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7738	NC_020062	GCA	2	6	414722	414727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223332
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7863	NC_020062	CGG	2	6	421062	421067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223339
7864	NC_020062	GCC	2	6	421078	421083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223339
7865	NC_020062	GCC	2	6	421184	421189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223339
7866	NC_020062	GCC	2	6	421225	421230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223339
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7979	NC_020062	TGCG	2	8	427843	427850	0 %	25 %	50 %	25 %	440223345
7980	NC_020062	TCA	2	6	427864	427869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223345
7981	NC_020062	CGCT	2	8	427924	427931	0 %	25 %	25 %	50 %	440223345
7982	NC_020062	CGAT	2	8	428071	428078	25 %	25 %	25 %	25 %	440223345
7983	NC_020062	GC	3	6	428119	428124	0 %	0 %	50 %	50 %	440223345
7984	NC_020062	GTC	2	6	428238	428243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223345
7985	NC_020062	TCG	3	9	428341	428349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223345
7986	NC_020062	GCC	2	6	428497	428502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223346
7987	NC_020062	CGT	2	6	428518	428523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223346
7988	NC_020062	CGCA	2	8	428620	428627	25 %	0 %	25 %	50 %	440223346
7989	NC_020062	AAG	2	6	428651	428656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223346
7990	NC_020062	GCC	2	6	428669	428674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223346
7991	NC_020062	TGC	2	6	428752	428757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223346
7992	NC_020062	GAG	2	6	428765	428770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223346
7993	NC_020062	GGC	2	6	428809	428814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223346
7994	NC_020062	GGA	2	6	428890	428895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223346
7995	NC_020062	GTC	2	6	428969	428974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223346
7996	NC_020062	CGCC	2	8	429001	429008	0 %	0 %	25 %	75 %	440223346
7997	NC_020062	TCA	2	6	429024	429029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223346
7998	NC_020062	GA	4	8	429127	429134	50 %	0 %	50 %	0 %	440223346
7999	NC_020062	CACG	2	8	429159	429166	25 %	0 %	25 %	50 %	440223346
8000	NC_020062	CCG	2	6	429194	429199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223346

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