MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 40408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_020062	CGG	2	6	379036	379041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223298
7003	NC_020062	CTG	2	6	379121	379126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7004	NC_020062	CGT	2	6	379159	379164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7005	NC_020062	CGTG	2	8	379195	379202	0 %	25 %	50 %	25 %	440223298
7006	NC_020062	TCG	2	6	379260	379265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7007	NC_020062	CG	3	6	379276	379281	0 %	0 %	50 %	50 %	440223298
7008	NC_020062	TCT	2	6	379299	379304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223298
7009	NC_020062	GCC	2	6	379356	379361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223298
7010	NC_020062	TCA	2	6	379365	379370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223298
7011	NC_020062	CAG	2	6	379376	379381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7012	NC_020062	CGA	2	6	379522	379527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7013	NC_020062	GC	5	10	379558	379567	0 %	0 %	50 %	50 %	440223298
7014	NC_020062	TCG	2	6	379572	379577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7015	NC_020062	GGTC	2	8	379612	379619	0 %	25 %	50 %	25 %	440223298
7016	NC_020062	CCA	2	6	379678	379683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440223298
7017	NC_020062	GCC	2	6	379715	379720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223298
7018	NC_020062	GAG	2	6	379722	379727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223298
7019	NC_020062	CGA	2	6	379754	379759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223298
7020	NC_020062	GC	3	6	380121	380126	0 %	0 %	50 %	50 %	440223299
7021	NC_020062	TGC	2	6	380143	380148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223299
7022	NC_020062	GTG	2	6	380218	380223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223299
7023	NC_020062	GA	3	6	380259	380264	50 %	0 %	50 %	0 %	440223299
7024	NC_020062	GGA	2	6	380332	380337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223300
7025	NC_020062	GTC	2	6	380348	380353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223300
7026	NC_020062	GCG	2	6	380461	380466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223300
7027	NC_020062	GC	3	6	380470	380475	0 %	0 %	50 %	50 %	440223300
7028	NC_020062	CGC	2	6	380480	380485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223300
7029	NC_020062	CGA	2	6	380557	380562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223300
7030	NC_020062	GC	3	6	380600	380605	0 %	0 %	50 %	50 %	440223300
7031	NC_020062	GC	3	6	380608	380613	0 %	0 %	50 %	50 %	440223300
7032	NC_020062	GCGCC	2	10	380620	380629	0 %	0 %	40 %	60 %	440223300
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7034	NC_020062	CGTTT	2	10	380692	380701	0 %	60 %	20 %	20 %	440223300
7035	NC_020062	CTT	2	6	380741	380746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223300
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7038	NC_020062	GTC	2	6	380849	380854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223300
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7044	NC_020062	ATC	2	6	380992	380997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223301
7045	NC_020062	GAG	2	6	381079	381084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440223301
7046	NC_020062	CTG	2	6	381094	381099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223301
7047	NC_020062	GCG	2	6	381100	381105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223301
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7051	NC_020062	GCCC	2	8	381265	381272	0 %	0 %	25 %	75 %	440223301
7052	NC_020062	GCGA	2	8	381285	381292	25 %	0 %	50 %	25 %	440223301
7053	NC_020062	TCT	2	6	381321	381326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223301
7054	NC_020062	CGAT	2	8	381337	381344	25 %	25 %	25 %	25 %	440223301
7055	NC_020062	TCG	2	6	381374	381379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223301
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7057	NC_020062	GC	3	6	381418	381423	0 %	0 %	50 %	50 %	440223301
7058	NC_020062	CTT	2	6	381429	381434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223301
7059	NC_020062	GC	3	6	381531	381536	0 %	0 %	50 %	50 %	440223301
7060	NC_020062	GCT	2	6	381627	381632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223301
7061	NC_020062	GC	4	8	381667	381674	0 %	0 %	50 %	50 %	440223301
7062	NC_020062	GC	3	6	381727	381732	0 %	0 %	50 %	50 %	440223301
7063	NC_020062	GCC	2	6	381844	381849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223301
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7068	NC_020062	GCC	2	6	381951	381956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223301
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7070	NC_020062	CGA	2	6	381975	381980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223301
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7087	NC_020062	CACTC	2	10	382788	382797	20 %	20 %	0 %	60 %	440223302
7088	NC_020062	ATC	2	6	382799	382804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223302
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7092	NC_020062	TCG	2	6	382880	382885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223302
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7096	NC_020062	GGCC	2	8	383574	383581	0 %	0 %	50 %	50 %	440223303
7097	NC_020062	GC	3	6	383631	383636	0 %	0 %	50 %	50 %	440223303
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7101	NC_020062	TGG	2	6	383780	383785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223303
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7104	NC_020062	CCG	2	6	383910	383915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223303
7105	NC_020062	TGA	2	6	384002	384007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223303
7106	NC_020062	CGG	2	6	384023	384028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223303
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7109	NC_020062	CGT	2	6	384123	384128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223303
7110	NC_020062	GCT	2	6	384129	384134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223303
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7113	NC_020062	TGTCGA	2	12	384162	384173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440223303
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7119	NC_020062	TC	3	6	384591	384596	0 %	50 %	0 %	50 %	440223303
7120	NC_020062	TCGA	2	8	384718	384725	25 %	25 %	25 %	25 %	440223303
7121	NC_020062	GAC	2	6	384752	384757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223303
7122	NC_020062	CTG	2	6	384772	384777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223303
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7124	NC_020062	TCGA	2	8	384902	384909	25 %	25 %	25 %	25 %	440223303
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7242	NC_020062	CGC	2	6	389844	389849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223309
7243	NC_020062	GCAT	2	8	389882	389889	25 %	25 %	25 %	25 %	440223309
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7331	NC_020062	AGC	2	6	393953	393958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223312
7332	NC_020062	TGA	2	6	393972	393977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223312
7333	NC_020062	TGA	2	6	393987	393992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223312
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7345	NC_020062	GCA	2	6	394484	394489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223313
7346	NC_020062	GAT	2	6	394542	394547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223313
7347	NC_020062	TTG	2	6	394561	394566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440223313
7348	NC_020062	AAGA	2	8	394575	394582	75 %	0 %	25 %	0 %	440223313
7349	NC_020062	GCG	3	9	394615	394623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223313
7350	NC_020062	TCG	2	6	394648	394653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223313
7351	NC_020062	AAG	2	6	394701	394706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223313
7352	NC_020062	GAA	2	6	394776	394781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440223313
7353	NC_020062	CTG	2	6	394812	394817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223313
7354	NC_020062	AGC	2	6	394825	394830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223313
7355	NC_020062	GCG	2	6	394847	394852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223313
7356	NC_020062	GCC	2	6	394855	394860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223313
7357	NC_020062	GAT	2	6	394878	394883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223313
7358	NC_020062	TTC	2	6	394888	394893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440223313
7359	NC_020062	CCCA	2	8	394945	394952	25 %	0 %	0 %	75 %	440223313
7360	NC_020062	GAT	3	9	395016	395024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440223313
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7362	NC_020062	GC	5	10	395225	395234	0 %	0 %	50 %	50 %	440223314
7363	NC_020062	T	6	6	395236	395241	0 %	100 %	0 %	0 %	440223314
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7482	NC_020062	TGG	2	6	401653	401658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223320
7483	NC_020062	CCGC	2	8	402098	402105	0 %	0 %	25 %	75 %	440223321
7484	NC_020062	TC	3	6	402208	402213	0 %	50 %	0 %	50 %	440223321
7485	NC_020062	TCA	3	9	402257	402265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440223321
7486	NC_020062	CCG	2	6	402269	402274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223321
7487	NC_020062	TCG	3	9	402317	402325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440223321
7488	NC_020062	TCC	2	6	402330	402335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223321
7489	NC_020062	CCG	2	6	402394	402399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223321
7490	NC_020062	GCAA	2	8	402538	402545	50 %	0 %	25 %	25 %	440223321
7491	NC_020062	GGC	2	6	402654	402659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223321
7492	NC_020062	TCATT	2	10	402681	402690	20 %	60 %	0 %	20 %	440223321
7493	NC_020062	GCC	2	6	402717	402722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223321
7494	NC_020062	A	6	6	402761	402766	100 %	0 %	0 %	0 %	440223321
7495	NC_020062	GCC	2	6	403296	403301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440223322
7496	NC_020062	GCG	2	6	403305	403310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440223322
7497	NC_020062	TGCC	2	8	403330	403337	0 %	25 %	25 %	50 %	440223322
7498	NC_020062	TGG	2	6	403410	403415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440223322
7499	NC_020062	CGA	2	6	403416	403421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440223322
7500	NC_020062	TCC	2	6	403426	403431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440223322

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