MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 7982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020061	GTT	3	9	274859	274867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222714
4002	NC_020061	TCA	2	6	274944	274949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222714
4003	NC_020061	GCC	2	6	274952	274957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222714
4004	NC_020061	TCT	2	6	274977	274982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222714
4005	NC_020061	GATC	2	8	275061	275068	25 %	25 %	25 %	25 %	440222714
4006	NC_020061	ATC	2	6	275138	275143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222714
4007	NC_020061	TGC	2	6	275150	275155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222714
4008	NC_020061	ATC	2	6	275182	275187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222714
4009	NC_020061	CAA	2	6	275196	275201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222714
4010	NC_020061	CG	3	6	275479	275484	0 %	0 %	50 %	50 %	440222715
4011	NC_020061	GCT	2	6	275601	275606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222715
4012	NC_020061	TGC	2	6	275639	275644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222715
4013	NC_020061	CG	3	6	275744	275749	0 %	0 %	50 %	50 %	440222715
4014	NC_020061	GCG	2	6	275819	275824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222715
4015	NC_020061	AAG	2	6	275848	275853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222715
4016	NC_020061	CAT	2	6	275874	275879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222715
4017	NC_020061	GGC	2	6	276010	276015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222715
4018	NC_020061	GCCGC	2	10	276114	276123	0 %	0 %	40 %	60 %	440222715
4019	NC_020061	GTG	2	6	276127	276132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222715
4020	NC_020061	CCG	2	6	276200	276205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222715
4021	NC_020061	CGG	2	6	276244	276249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222715
4022	NC_020061	AAGATA	2	12	276255	276266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440222715
4023	NC_020061	GCG	2	6	276316	276321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222716
4024	NC_020061	TCG	2	6	276406	276411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222716
4025	NC_020061	GCG	3	9	276478	276486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222716
4026	NC_020061	GAT	2	6	276570	276575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222716
4027	NC_020061	CGAA	2	8	276658	276665	50 %	0 %	25 %	25 %	440222716
4028	NC_020061	GAT	2	6	276672	276677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222716
4029	NC_020061	CGG	2	6	276727	276732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222716
4030	NC_020061	TGG	2	6	276771	276776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222716
4031	NC_020061	CCG	2	6	276783	276788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222716
4032	NC_020061	TTG	2	6	276886	276891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222716
4033	NC_020061	GCC	2	6	276935	276940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222716
4034	NC_020061	TGA	2	6	277004	277009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222716
4035	NC_020061	TG	3	6	277041	277046	0 %	50 %	50 %	0 %	440222716
4036	NC_020061	CTG	2	6	277057	277062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222716
4037	NC_020061	CAA	2	6	277067	277072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222716
4038	NC_020061	CAGC	2	8	277092	277099	25 %	0 %	25 %	50 %	440222716
4039	NC_020061	CAG	2	6	277137	277142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222716
4040	NC_020061	CG	3	6	277327	277332	0 %	0 %	50 %	50 %	440222716
4041	NC_020061	CG	4	8	277456	277463	0 %	0 %	50 %	50 %	440222716
4042	NC_020061	GAG	2	6	277467	277472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222716
4043	NC_020061	ACCAGG	2	12	277570	277581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222716
4044	NC_020061	ACG	2	6	277619	277624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222716
4045	NC_020061	ACCCG	2	10	277659	277668	20 %	0 %	20 %	60 %	440222716
4046	NC_020061	AGG	2	6	278859	278864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222717
4047	NC_020061	GATC	2	8	278890	278897	25 %	25 %	25 %	25 %	440222717
4048	NC_020061	AGG	2	6	278905	278910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222717
4049	NC_020061	CAT	2	6	278918	278923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222717
4050	NC_020061	GAC	2	6	279542	279547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222718
4051	NC_020061	GCC	2	6	279637	279642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222718
4052	NC_020061	AAC	2	6	279775	279780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222718
4053	NC_020061	CGC	2	6	279784	279789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222718
4054	NC_020061	GGC	2	6	279796	279801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222718
4055	NC_020061	TCGA	2	8	279881	279888	25 %	25 %	25 %	25 %	440222718
4056	NC_020061	ATGGC	2	10	280071	280080	20 %	20 %	40 %	20 %	440222718
4057	NC_020061	GC	3	6	280097	280102	0 %	0 %	50 %	50 %	440222718
4058	NC_020061	CGC	2	6	280138	280143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222718
4059	NC_020061	CCG	2	6	280203	280208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222718
4060	NC_020061	GATC	2	8	280291	280298	25 %	25 %	25 %	25 %	440222718
4061	NC_020061	TGGC	2	8	280334	280341	0 %	25 %	50 %	25 %	440222718
4062	NC_020061	GGA	2	6	280370	280375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222718
4063	NC_020061	GC	3	6	280431	280436	0 %	0 %	50 %	50 %	440222718
4064	NC_020061	CTT	2	6	280486	280491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222718
4065	NC_020061	CTC	2	6	280520	280525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222718
4066	NC_020061	GAC	2	6	280563	280568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222718
4067	NC_020061	CGA	2	6	280608	280613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222718
4068	NC_020061	CGC	3	9	280692	280700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222718
4069	NC_020061	CGT	2	6	280747	280752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222718
4070	NC_020061	AAT	2	6	280831	280836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222718
4071	NC_020061	ACGGAA	2	12	280863	280874	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440222718
4072	NC_020061	CGG	2	6	280966	280971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222718
4073	NC_020061	GTG	2	6	280979	280984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222718
4074	NC_020061	CGG	2	6	280996	281001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222718
4075	NC_020061	GCC	2	6	281081	281086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222718
4076	NC_020061	CGGA	2	8	281116	281123	25 %	0 %	50 %	25 %	440222718
4077	NC_020061	CGT	2	6	281231	281236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222718
4078	NC_020061	CTC	2	6	281246	281251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222718
4079	NC_020061	GGA	2	6	281296	281301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222718
4080	NC_020061	GAC	2	6	281390	281395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222718
4081	NC_020061	GCAC	2	8	281410	281417	25 %	0 %	25 %	50 %	440222718
4082	NC_020061	GGT	2	6	281480	281485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222718
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4087	NC_020061	ATC	2	6	282106	282111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222719
4088	NC_020061	GAAG	2	8	282130	282137	50 %	0 %	50 %	0 %	440222719
4089	NC_020061	TCG	2	6	282168	282173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222719
4090	NC_020061	CCA	2	6	282181	282186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222719
4091	NC_020061	GTG	2	6	282194	282199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222719
4092	NC_020061	GCC	2	6	282214	282219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222719
4093	NC_020061	AGC	2	6	282245	282250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222719
4094	NC_020061	ACG	2	6	282269	282274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222719
4095	NC_020061	TGG	2	6	282302	282307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222719
4096	NC_020061	ACC	2	6	282330	282335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222719
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4098	NC_020061	CGTG	2	8	282589	282596	0 %	25 %	50 %	25 %	440222719
4099	NC_020061	CAG	2	6	282598	282603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222719
4100	NC_020061	CGA	2	6	282671	282676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222719
4101	NC_020061	GC	3	6	282691	282696	0 %	0 %	50 %	50 %	440222719
4102	NC_020061	GTTT	2	8	283055	283062	0 %	75 %	25 %	0 %	440222720
4103	NC_020061	CGG	2	6	283341	283346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222721
4104	NC_020061	CGG	2	6	283359	283364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222721
4105	NC_020061	CAG	2	6	283807	283812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4106	NC_020061	AGCC	2	8	283833	283840	25 %	0 %	25 %	50 %	440222722
4107	NC_020061	CG	3	6	283859	283864	0 %	0 %	50 %	50 %	440222722
4108	NC_020061	CGA	2	6	283883	283888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4109	NC_020061	GCT	2	6	284026	284031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4110	NC_020061	ATC	2	6	284037	284042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222722
4111	NC_020061	GTC	2	6	284079	284084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4112	NC_020061	GAC	2	6	284139	284144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4113	NC_020061	CTC	2	6	284154	284159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222722
4114	NC_020061	GCG	2	6	284164	284169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222722
4115	NC_020061	TGC	2	6	284219	284224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4116	NC_020061	CGA	2	6	284231	284236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4117	NC_020061	GTA	2	6	284257	284262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222722
4118	NC_020061	AGC	2	6	284269	284274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4119	NC_020061	GTG	2	6	284406	284411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222722
4120	NC_020061	ACCG	2	8	284448	284455	25 %	0 %	25 %	50 %	440222722
4121	NC_020061	GCA	2	6	284483	284488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4122	NC_020061	ACG	2	6	284499	284504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222722
4123	NC_020061	CAT	2	6	284513	284518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222722
4124	NC_020061	GCTTCC	2	12	284522	284533	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	440222722
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4131	NC_020061	GCCG	2	8	285615	285622	0 %	0 %	50 %	50 %	440222723
4132	NC_020061	TCA	2	6	285628	285633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222723
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4139	NC_020061	ACA	2	6	285961	285966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222723
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4151	NC_020061	ATT	2	6	286637	286642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222724
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4229	NC_020061	CAT	2	6	290815	290820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222726
4230	NC_020061	TGG	2	6	290843	290848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222726
4231	NC_020061	GATC	2	8	290862	290869	25 %	25 %	25 %	25 %	440222726
4232	NC_020061	GAAG	2	8	290937	290944	50 %	0 %	50 %	0 %	440222726
4233	NC_020061	AGCGAG	2	12	290962	290973	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	440222726
4234	NC_020061	TCG	2	6	290995	291000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222726
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4236	NC_020061	GTG	2	6	291026	291031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222726
4237	NC_020061	CGG	3	9	291070	291078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222727
4238	NC_020061	TCG	2	6	291093	291098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222727
4239	NC_020061	CGA	2	6	291253	291258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222727
4240	NC_020061	CGG	2	6	291263	291268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222727
4241	NC_020061	CTC	2	6	291291	291296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222727
4242	NC_020061	ACG	2	6	291339	291344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222727
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4245	NC_020061	GGC	2	6	291525	291530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222727
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4249	NC_020061	GAC	2	6	291681	291686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222727
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4262	NC_020061	GC	3	6	292152	292157	0 %	0 %	50 %	50 %	440222727
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4275	NC_020061	ATCGC	2	10	292646	292655	20 %	20 %	20 %	40 %	440222728
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4332	NC_020061	CG	3	6	295971	295976	0 %	0 %	50 %	50 %	440222734
4333	NC_020061	CAG	2	6	296094	296099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222734
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4341	NC_020061	AGAA	2	8	296975	296982	75 %	0 %	25 %	0 %	440222735
4342	NC_020061	TCGCCG	2	12	297036	297047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440222735
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4347	NC_020061	TAT	2	6	297297	297302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440222736
4348	NC_020061	AGG	2	6	297349	297354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222736
4349	NC_020061	AGT	2	6	297487	297492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222736
4350	NC_020061	TCA	2	6	297551	297556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222736
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4353	NC_020061	GGA	2	6	297729	297734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222736
4354	NC_020061	TCGC	2	8	297754	297761	0 %	25 %	25 %	50 %	440222736
4355	NC_020061	AGC	2	6	297784	297789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222736
4356	NC_020061	TG	3	6	297822	297827	0 %	50 %	50 %	0 %	440222736
4357	NC_020061	AAC	2	6	297850	297855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222736
4358	NC_020061	TGA	2	6	298127	298132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222737
4359	NC_020061	ACC	2	6	298237	298242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222737
4360	NC_020061	TGA	2	6	298289	298294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222737
4361	NC_020061	CGC	2	6	298327	298332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222737
4362	NC_020061	CCA	2	6	298354	298359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222737
4363	NC_020061	GGAT	2	8	298397	298404	25 %	25 %	50 %	0 %	440222737
4364	NC_020061	GACC	2	8	298460	298467	25 %	0 %	25 %	50 %	440222737
4365	NC_020061	CGA	2	6	298484	298489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222737
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4393	NC_020061	TGC	2	6	300602	300607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222739
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4483	NC_020061	GCC	2	6	306261	306266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222742
4484	NC_020061	CG	3	6	306318	306323	0 %	0 %	50 %	50 %	440222742
4485	NC_020061	GCG	2	6	306375	306380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222742
4486	NC_020061	CG	3	6	306414	306419	0 %	0 %	50 %	50 %	440222742
4487	NC_020061	CTG	2	6	306423	306428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222742
4488	NC_020061	GC	3	6	306445	306450	0 %	0 %	50 %	50 %	440222742
4489	NC_020061	GAC	2	6	306480	306485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222742
4490	NC_020061	GGC	2	6	306581	306586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222742
4491	NC_020061	TTG	2	6	306588	306593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222742
4492	NC_020061	ACCA	2	8	306609	306616	50 %	0 %	0 %	50 %	440222742
4493	NC_020061	ACG	2	6	306686	306691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222742
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4495	NC_020061	CA	3	6	306748	306753	50 %	0 %	0 %	50 %	440222742
4496	NC_020061	GCAC	2	8	306827	306834	25 %	0 %	25 %	50 %	440222742
4497	NC_020061	CCA	2	6	306841	306846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222742
4498	NC_020061	GCC	2	6	306858	306863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222742
4499	NC_020061	GAT	2	6	306875	306880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222742
4500	NC_020061	CTG	2	6	306957	306962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222742

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